Doublet Group distance statistics: 50110

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.003, 0.022, 0.040, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.014, 0.035, 0.055, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.035 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.004, 0.027, 0.051, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.027 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.053, 0.144, 0.234, 0.227 max_d=0.227 avg_d=0.144 std_dev=0.091
C2'	A	0, 0.067, 0.181, 0.295, 0.285 max_d=0.285 avg_d=0.181 std_dev=0.114
OP2	A	0, 0.115, 0.288, 0.461, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.288 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.085, 0.260, 0.435, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.260 std_dev=0.175
O2'	B	0, 0.147, 0.356, 0.565, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.356 std_dev=0.209
C1'	B	0, 0.151, 0.362, 0.574, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.362 std_dev=0.211
C3'	A	0, 0.103, 0.319, 0.535, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.319 std_dev=0.216
O2'	A	0, 0.074, 0.294, 0.514, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.294 std_dev=0.220
O4'	B	0, 0.186, 0.442, 0.698, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.442 std_dev=0.256
C2'	B	0, 0.166, 0.472, 0.777, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.472 std_dev=0.306
C5'	A	0, 0.158, 0.471, 0.785, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.471 std_dev=0.313
O5'	A	0, 0.200, 0.532, 0.863, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.532 std_dev=0.332
O3'	A	0, 0.164, 0.518, 0.873, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.518 std_dev=0.354
P	A	0, 0.242, 0.761, 1.280, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.761 std_dev=0.519
N9	B	0, 0.251, 0.941, 1.631, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.941 std_dev=0.690
C4'	B	0, 0.231, 0.954, 1.677, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.954 std_dev=0.723
C3'	B	0, 0.197, 0.949, 1.701, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.949 std_dev=0.752
O3'	B	0, 0.253, 1.104, 1.955, 1.933 max_d=1.933 avg_d=1.104 std_dev=0.851
OP1	A	0, 0.300, 1.245, 2.190, 2.162 max_d=2.162 avg_d=1.245 std_dev=0.945
C5'	B	0, 0.208, 1.247, 2.286, 2.291 max_d=2.291 avg_d=1.247 std_dev=1.039
C8	B	0, 0.274, 1.394, 2.514, 2.499 max_d=2.499 avg_d=1.394 std_dev=1.120
C4	B	0, 0.263, 1.542, 2.821, 2.808 max_d=2.808 avg_d=1.542 std_dev=1.279
O5'	B	0, 0.172, 1.561, 2.951, 2.975 max_d=2.975 avg_d=1.561 std_dev=1.389
N3	B	0, 0.264, 1.850, 3.436, 3.426 max_d=3.426 avg_d=1.850 std_dev=1.586
N7	B	0, 0.287, 2.002, 3.717, 3.710 max_d=3.710 avg_d=2.002 std_dev=1.715
C5	B	0, 0.275, 2.051, 3.827, 3.820 max_d=3.820 avg_d=2.051 std_dev=1.776
C2	B	0, 0.266, 2.497, 4.727, 4.721 max_d=4.721 avg_d=2.497 std_dev=2.231
P	B	0, 0.151, 2.547, 4.943, 4.953 max_d=4.953 avg_d=2.547 std_dev=2.396
C6	B	0, 0.276, 2.701, 5.125, 5.120 max_d=5.120 avg_d=2.701 std_dev=2.425
N1	B	0, 0.269, 2.867, 5.465, 5.461 max_d=5.461 avg_d=2.867 std_dev=2.598
OP2	B	0, 0.183, 2.952, 5.721, 5.733 max_d=5.733 avg_d=2.952 std_dev=2.769
N6	B	0, 0.295, 3.280, 6.264, 6.262 max_d=6.262 avg_d=3.280 std_dev=2.985
OP1	B	0, 0.127, 3.122, 6.117, 6.126 max_d=6.126 avg_d=3.122 std_dev=2.995

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.04	0.02
C2	0.02	0.00	0.09	0.04	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.10	0.04	0.11	0.15	0.09	0.09
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.15	0.11	0.03
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.06	0.17	0.02	0.06	0.09	0.16	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.17	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.02	0.12	0.09	0.08	0.10
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.07	0.12	0.04	0.01	0.08	0.12	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.02
C5	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.18	0.04	0.13	0.18
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.14	0.19	0.11	0.05	0.17	0.20	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.05	0.02
C6	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.02	0.18	0.06	0.14	0.19
C8	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.12	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.01	0.21	0.08	0.09	0.19
N1	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.04	0.04	0.15	0.12	0.13	0.15
N3	0.01	0.01	0.10	0.06	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.12	0.04	0.08	0.15	0.07	0.06
N6	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.21	0.04	0.16	0.23
N7	0.01	0.00	0.06	0.16	0.00	0.12	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.18	0.00	0.24	0.07	0.15	0.25
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.11	0.04	0.06	0.09
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03	0.01	0.06	0.05	0.09	0.13	0.04	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.08	0.11	0.02
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.05	0.18	0.04	0.12	0.10	0.18	0.05	0.05	0.00	0.01	0.02	0.15	0.28	0.02
O4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.03	0.11	0.04
O5'	0.03	0.11	0.01	0.01	0.12	0.02	0.18	0.01	0.18	0.21	0.15	0.08	0.21	0.24	0.11	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.15	0.15	0.16	0.09	0.04	0.04	0.16	0.06	0.08	0.12	0.15	0.04	0.07	0.04	0.08	0.15	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.09	0.11	0.17	0.08	0.05	0.13	0.05	0.14	0.09	0.13	0.07	0.16	0.15	0.06	0.11	0.28	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.09	0.03	0.03	0.10	0.02	0.18	0.02	0.19	0.19	0.15	0.06	0.23	0.25	0.09	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	1.30	0.01	0.35	0.92	0.35	1.44	0.13	1.91	0.89	1.89	0.74	2.29	1.35	0.58	0.07	0.63	0.16	0.24	0.04	0.89	0.45
C2	0.16	0.35	0.09	0.09	0.20	0.13	0.82	0.22	0.94	0.77	0.34	0.43	1.46	1.13	0.26	0.08	0.35	0.18	0.65	0.83	1.49	1.04
C2'	0.03	1.12	0.02	0.34	0.83	0.33	1.35	0.10	1.79	0.86	1.71	0.63	2.22	1.31	0.54	0.09	0.63	0.16	0.25	0.05	0.90	0.45
C3'	0.08	1.24	0.16	0.51	0.80	0.50	1.25	0.32	1.71	0.68	1.73	0.72	2.07	1.13	0.44	0.20	0.78	0.27	0.03	0.35	0.52	0.10
C4	0.06	0.68	0.03	0.23	0.65	0.24	1.20	0.03	1.52	0.82	1.29	0.30	1.86	1.22	0.45	0.07	0.49	0.16	0.39	0.33	1.05	0.64
C4'	0.06	1.49	0.18	0.58	0.92	0.57	1.36	0.41	1.87	0.72	1.97	0.90	2.22	1.19	0.50	0.20	0.84	0.30	0.10	0.49	0.45	0.02
C5	0.05	0.60	0.05	0.18	0.62	0.17	1.06	0.06	1.27	0.74	1.05	0.30	1.49	1.07	0.43	0.06	0.40	0.11	0.36	0.27	0.91	0.56
C5'	0.17	1.53	0.34	0.76	0.85	0.76	1.22	0.66	1.73	0.53	1.91	0.94	2.02	0.98	0.38	0.31	1.00	0.44	0.39	0.90	0.06	0.37
C6	0.10	0.10	0.11	0.04	0.24	0.06	0.72	0.22	0.75	0.67	0.35	0.24	1.01	0.92	0.27	0.06	0.25	0.09	0.54	0.59	1.14	0.80
C8	0.08	1.40	0.01	0.33	0.96	0.30	1.31	0.14	1.67	0.77	1.73	0.93	1.85	1.14	0.59	0.05	0.57	0.10	0.12	0.18	0.58	0.22
N1	0.17	0.58	0.12	0.04	0.07	0.05	0.59	0.29	0.57	0.69	0.06	0.60	0.98	0.96	0.18	0.07	0.25	0.13	0.69	0.89	1.46	1.05
N3	0.12	0.25	0.05	0.19	0.46	0.21	1.09	0.10	1.38	0.83	0.96	0.08	1.88	1.24	0.37	0.08	0.46	0.19	0.52	0.58	1.31	0.86
N6	0.07	0.29	0.17	0.11	0.04	0.09	0.36	0.33	0.29	0.49	0.02	0.34	0.46	0.61	0.16	0.06	0.08	0.03	0.57	0.63	1.02	0.77
N7	0.08	1.10	0.02	0.25	0.84	0.22	1.13	0.06	1.38	0.70	1.37	0.77	1.51	1.01	0.53	0.04	0.46	0.07	0.17	0.09	0.57	0.26
N9	0.03	1.20	0.00	0.31	0.87	0.31	1.35	0.09	1.76	0.84	1.72	0.69	2.05	1.26	0.55	0.07	0.57	0.15	0.25	0.06	0.84	0.43
O2'	0.05	1.13	0.02	0.32	0.89	0.31	1.46	0.06	1.92	0.96	1.79	0.64	2.43	1.45	0.60	0.07	0.63	0.13	0.34	0.17	1.07	0.59
O3'	0.10	1.21	0.19	0.54	0.78	0.51	1.24	0.33	1.71	0.68	1.71	0.69	2.10	1.13	0.42	0.23	0.81	0.28	0.05	0.40	0.50	0.08
O4'	0.03	1.56	0.07	0.45	1.01	0.46	1.47	0.28	1.96	0.84	2.06	0.95	2.29	1.30	0.60	0.08	0.72	0.21	0.07	0.25	0.66	0.22
O5'	0.21	1.45	0.40	0.80	0.76	0.79	1.06	0.72	1.53	0.38	1.73	0.90	1.75	0.80	0.29	0.35	1.02	0.48	0.51	1.03	0.14	0.52
OP1	0.17	1.45	0.34	0.79	0.77	0.83	1.03	0.81	1.50	0.35	1.71	0.94	1.71	0.76	0.29	0.22	1.00	0.49	0.65	1.32	0.37	0.76
OP2	0.04	1.48	0.26	0.59	0.81	0.52	0.94	0.55	1.33	0.32	1.58	1.06	1.42	0.64	0.36	0.21	0.70	0.21	0.54	1.21	0.45	0.70
P	0.28	1.40	0.50	0.92	0.66	0.91	0.89	0.90	1.35	0.20	1.60	0.88	1.52	0.59	0.18	0.41	1.10	0.56	0.77	1.42	0.53	0.88

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.10	0.02	0.21	0.14
C2	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.22	0.31	0.08	0.13	0.16	0.43	0.28
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.08	0.08	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.16	0.01	0.06
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.03	0.06	0.07	0.09	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.39	0.22	0.27
C4	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.22	0.05	0.14	0.18	0.41	0.29
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.05	0.02	0.08	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.04
C5	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.18	0.04	0.14	0.26	0.49	0.34
C5'	0.00	0.08	0.02	0.03	0.07	0.00	0.10	0.00	0.12	0.07	0.11	0.06	0.14	0.10	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.00	0.00	0.06	0.03	0.00	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.22	0.07	0.14	0.27	0.51	0.34
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.16	0.27	0.45	0.34
N1	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.28	0.08	0.13	0.22	0.48	0.32
N3	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.29	0.07	0.13	0.13	0.38	0.25
N6	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.19	0.20	0.07	0.13	0.32	0.53	0.36
N7	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.08	0.11	0.02	0.15	0.32	0.52	0.37
N9	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.14	0.01	0.14	0.16	0.36	0.26
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.14	0.01	0.14	0.01	0.19	0.03	0.22	0.18	0.19	0.08	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.26	0.04	0.11
O3'	0.15	0.31	0.05	0.00	0.22	0.01	0.18	0.04	0.22	0.07	0.28	0.29	0.20	0.11	0.14	0.04	0.00	0.08	0.18	0.55	0.23	0.32
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.07	0.03	0.08	0.07	0.07	0.02	0.01	0.00	0.08	0.00	0.17	0.12	0.27	0.23
O5'	0.10	0.13	0.03	0.19	0.14	0.02	0.14	0.01	0.14	0.16	0.13	0.13	0.13	0.15	0.14	0.06	0.18	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.16	0.16	0.39	0.18	0.11	0.26	0.06	0.27	0.27	0.22	0.13	0.32	0.32	0.16	0.26	0.55	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.43	0.01	0.22	0.41	0.00	0.49	0.02	0.51	0.45	0.48	0.38	0.53	0.52	0.36	0.04	0.23	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.28	0.06	0.27	0.29	0.04	0.34	0.02	0.34	0.34	0.32	0.25	0.36	0.37	0.26	0.11	0.32	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00