Doublet Group distance statistics: 50112

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.000, 0.033, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.033 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N6	A	0, 0.000, 0.068, 0.137, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.068 std_dev=0.068
C2'	B	0, 0.000, 0.317, 0.634, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.317 std_dev=0.317
C4'	B	0, 0.000, 0.373, 0.745, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.373 std_dev=0.373
C3'	B	0, 0.000, 0.379, 0.759, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.379 std_dev=0.379
O4'	B	0, 0.000, 0.381, 0.763, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.381 std_dev=0.381
C1'	B	0, 0.000, 0.410, 0.820, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.410 std_dev=0.410
O2'	B	0, 0.000, 0.427, 0.854, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.427 std_dev=0.427
O3'	B	0, 0.000, 0.441, 0.882, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.441 std_dev=0.441
N9	B	0, 0.000, 0.520, 1.039, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.520 std_dev=0.520
C8	B	0, 0.000, 0.558, 1.117, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.558 std_dev=0.558
O5'	B	0, 0.000, 0.588, 1.177, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.588 std_dev=0.588
C5'	B	0, 0.000, 0.600, 1.200, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.600 std_dev=0.600
C4	B	0, 0.000, 0.604, 1.207, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.604 std_dev=0.604
N7	B	0, 0.000, 0.638, 1.276, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.638 std_dev=0.638
N3	B	0, 0.000, 0.642, 1.285, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.642 std_dev=0.642
C5	B	0, 0.000, 0.653, 1.307, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.653 std_dev=0.653
C2	B	0, 0.000, 0.721, 1.441, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.721 std_dev=0.721
C6	B	0, 0.000, 0.731, 1.462, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.731 std_dev=0.731
O4'	A	0, 0.000, 0.747, 1.494, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.747 std_dev=0.747
N1	B	0, 0.000, 0.762, 1.524, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.762 std_dev=0.762
N6	B	0, 0.000, 0.775, 1.550, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.775 std_dev=0.775
C2'	A	0, 0.000, 0.879, 1.757, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.879 std_dev=0.879
C3'	A	0, 0.000, 0.912, 1.825, 1.825 max_d=1.825 avg_d=0.912 std_dev=0.912
C4'	A	0, 0.000, 0.953, 1.906, 1.906 max_d=1.906 avg_d=0.953 std_dev=0.953
O3'	A	0, 0.000, 0.978, 1.956, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.978 std_dev=0.978
O5'	A	0, 0.000, 1.316, 2.632, 2.632 max_d=2.632 avg_d=1.316 std_dev=1.316
P	B	0, 0.000, 1.350, 2.699, 2.699 max_d=2.699 avg_d=1.350 std_dev=1.350
C5'	A	0, 0.000, 1.438, 2.877, 2.877 max_d=2.877 avg_d=1.438 std_dev=1.438
OP2	A	0, 0.000, 1.468, 2.936, 2.936 max_d=2.936 avg_d=1.468 std_dev=1.468
O2'	A	0, 0.000, 1.493, 2.986, 2.986 max_d=2.986 avg_d=1.493 std_dev=1.493
OP2	B	0, 0.000, 1.559, 3.119, 3.119 max_d=3.119 avg_d=1.559 std_dev=1.559
OP1	B	0, 0.000, 1.579, 3.158, 3.158 max_d=3.158 avg_d=1.579 std_dev=1.579
P	A	0, 0.000, 1.630, 3.260, 3.260 max_d=3.260 avg_d=1.630 std_dev=1.630
OP1	A	0, 0.000, 1.885, 3.770, 3.770 max_d=3.770 avg_d=1.885 std_dev=1.885

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.29	0.00	0.11	0.06	0.05	0.15
C2	0.03	0.00	0.25	0.04	0.01	0.23	0.00	0.40	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.35	0.29	0.32	0.27	0.41	0.27	0.41
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.11	0.01	0.03	0.19	0.09	0.17	0.18	0.24	0.04	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.40	0.36	0.42	0.47
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.08	0.01	0.13	0.00	0.12	0.18	0.08	0.02	0.14	0.18	0.10	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.06	0.05
C4	0.01	0.01	0.11	0.08	0.00	0.10	0.01	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.22	0.18	0.16	0.19	0.17	0.27
C4'	0.01	0.23	0.01	0.01	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.14	0.18	0.22	0.08	0.08	0.02	0.27	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.01
C5	0.00	0.00	0.03	0.13	0.01	0.05	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.09	0.09	0.10	0.17	0.23
C5'	0.07	0.40	0.19	0.00	0.24	0.00	0.19	0.00	0.27	0.06	0.36	0.36	0.25	0.03	0.09	0.07	0.19	0.01	0.00	0.20	0.21	0.01
C6	0.00	0.00	0.09	0.12	0.00	0.10	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.16	0.16	0.15	0.21	0.24	0.31
C8	0.02	0.01	0.17	0.18	0.00	0.14	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.50	0.04	0.16	0.10	0.21	0.01	0.01
N1	0.02	0.00	0.18	0.08	0.00	0.18	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.23	0.25	0.22	0.35	0.28	0.38
N3	0.03	0.00	0.24	0.02	0.00	0.22	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.37	0.31	0.32	0.25	0.36	0.23	0.37
N6	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.08	0.01	0.25	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.17	0.12	0.12	0.12	0.17	0.26	0.30
N7	0.01	0.00	0.11	0.18	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.43	0.05	0.07	0.05	0.14	0.08	0.08
N9	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.16	0.17	0.00	0.06	0.03	0.08	0.16
O2'	0.03	0.35	0.00	0.02	0.06	0.27	0.15	0.07	0.05	0.50	0.18	0.37	0.17	0.43	0.16	0.00	0.04	0.16	0.32	0.29	0.33	0.42
O3'	0.29	0.29	0.01	0.00	0.22	0.00	0.14	0.19	0.16	0.04	0.23	0.31	0.12	0.05	0.17	0.04	0.00	0.19	0.15	0.09	0.27	0.19
O4'	0.00	0.32	0.01	0.02	0.18	0.00	0.09	0.01	0.16	0.16	0.25	0.32	0.12	0.07	0.00	0.16	0.19	0.00	0.10	0.07	0.22	0.08
O5'	0.11	0.27	0.40	0.05	0.16	0.01	0.09	0.00	0.15	0.10	0.22	0.25	0.12	0.05	0.06	0.32	0.15	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.41	0.36	0.04	0.19	0.08	0.10	0.20	0.21	0.21	0.35	0.36	0.17	0.14	0.03	0.29	0.09	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.05	0.27	0.42	0.06	0.17	0.15	0.17	0.21	0.24	0.01	0.28	0.23	0.26	0.08	0.08	0.33	0.27	0.22	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.41	0.47	0.05	0.27	0.01	0.23	0.01	0.31	0.01	0.38	0.37	0.30	0.08	0.16	0.42	0.19	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.26	0.07	0.13	0.26	0.25	0.33	0.38	0.36	0.27	0.34	0.21	0.36	0.33	0.22	0.11	0.19	0.08	0.25	0.48	0.44	0.50
C2	0.10	0.21	0.01	0.14	0.07	0.25	0.00	0.25	0.07	0.09	0.18	0.17	0.03	0.12	0.01	0.09	0.18	0.22	0.12	0.23	0.22	0.26
C2'	0.02	0.01	0.01	0.09	0.05	0.16	0.04	0.23	0.00	0.08	0.03	0.03	0.04	0.07	0.07	0.01	0.16	0.04	0.13	0.30	0.32	0.35
C3'	0.26	0.08	0.30	0.49	0.07	0.56	0.05	0.64	0.11	0.01	0.06	0.15	0.18	0.07	0.10	0.32	0.61	0.36	0.46	0.70	0.59	0.69
C4	0.01	0.02	0.03	0.16	0.13	0.27	0.22	0.34	0.20	0.21	0.11	0.02	0.22	0.26	0.13	0.08	0.21	0.16	0.21	0.37	0.36	0.40
C4'	0.10	0.08	0.13	0.37	0.13	0.45	0.27	0.55	0.32	0.21	0.24	0.02	0.41	0.31	0.10	0.14	0.51	0.22	0.35	0.66	0.50	0.62
C5	0.03	0.01	0.01	0.17	0.10	0.27	0.18	0.33	0.14	0.19	0.06	0.01	0.15	0.23	0.12	0.05	0.22	0.17	0.20	0.34	0.33	0.38
C5'	0.04	0.12	0.09	0.34	0.19	0.39	0.34	0.47	0.38	0.30	0.28	0.06	0.47	0.40	0.17	0.14	0.53	0.13	0.26	0.63	0.42	0.54
C6	0.11	0.17	0.02	0.17	0.07	0.25	0.00	0.23	0.05	0.09	0.13	0.16	0.02	0.11	0.01	0.04	0.20	0.23	0.12	0.21	0.21	0.23
C8	0.09	0.27	0.05	0.15	0.29	0.25	0.33	0.40	0.33	0.28	0.31	0.25	0.31	0.33	0.25	0.06	0.22	0.05	0.26	0.48	0.43	0.50
N1	0.13	0.25	0.01	0.15	0.14	0.24	0.08	0.20	0.16	0.04	0.23	0.22	0.12	0.05	0.06	0.07	0.18	0.24	0.08	0.16	0.16	0.18
N3	0.05	0.09	0.03	0.15	0.04	0.27	0.14	0.31	0.10	0.17	0.02	0.07	0.15	0.22	0.07	0.09	0.20	0.19	0.17	0.32	0.31	0.35
N6	0.16	0.20	0.06	0.17	0.14	0.20	0.10	0.13	0.14	0.01	0.17	0.20	0.12	0.02	0.10	0.01	0.19	0.23	0.04	0.09	0.10	0.10
N7	0.05	0.15	0.02	0.18	0.23	0.27	0.26	0.38	0.24	0.25	0.19	0.15	0.22	0.28	0.21	0.03	0.24	0.09	0.25	0.43	0.39	0.46
N9	0.06	0.20	0.05	0.15	0.24	0.26	0.31	0.37	0.32	0.26	0.28	0.17	0.32	0.32	0.21	0.08	0.21	0.10	0.24	0.45	0.42	0.48
O2'	0.55	0.49	0.55	0.48	0.49	0.38	0.35	0.23	0.24	0.43	0.29	0.58	0.06	0.34	0.51	0.57	0.50	0.46	0.26	0.13	0.02	0.01
O3'	0.02	0.21	0.06	0.28	0.23	0.38	0.38	0.47	0.47	0.30	0.41	0.12	0.58	0.41	0.18	0.07	0.43	0.14	0.25	0.49	0.32	0.46
O4'	0.01	0.22	0.03	0.30	0.25	0.41	0.41	0.54	0.47	0.33	0.40	0.14	0.56	0.44	0.21	0.01	0.42	0.17	0.34	0.66	0.51	0.63
O5'	0.14	0.08	0.23	0.46	0.10	0.48	0.23	0.58	0.28	0.17	0.22	0.01	0.36	0.27	0.06	0.29	0.65	0.21	0.38	0.77	0.55	0.67
OP1	0.26	0.02	0.37	0.66	0.04	0.64	0.21	0.74	0.27	0.13	0.19	0.08	0.38	0.26	0.01	0.45	0.89	0.32	0.52	1.03	0.70	0.85
OP2	0.05	0.19	0.05	0.26	0.24	0.24	0.32	0.35	0.34	0.30	0.28	0.16	0.38	0.36	0.22	0.13	0.45	0.02	0.20	0.65	0.45	0.53
P	0.03	0.16	0.13	0.37	0.21	0.35	0.33	0.45	0.37	0.29	0.30	0.10	0.44	0.38	0.18	0.23	0.60	0.06	0.25	0.70	0.44	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.20	0.16	0.12
C2	0.05	0.00	0.02	0.08	0.01	0.18	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.13	0.11	0.07	0.10	0.16
C2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.08	0.05	0.10	0.01	0.03	0.07	0.10	0.05	0.00	0.01	0.02	0.12	0.35	0.37	0.30
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.06	0.07	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.25	0.20	0.16
C4	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.10	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.07	0.02
C4'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.17	0.16	0.13	0.03	0.02	0.03	0.07	0.01	0.01	0.14	0.06	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.09	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.04	0.09	0.03	0.11	0.09	0.04
C5'	0.02	0.20	0.08	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.12	0.09	0.18	0.16	0.12	0.03	0.03	0.04	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00
C6	0.03	0.00	0.05	0.02	0.01	0.13	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.01	0.12	0.03	0.02	0.00	0.05
C8	0.00	0.01	0.10	0.06	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.18	0.09	0.03	0.16	0.28	0.30	0.24
N1	0.04	0.00	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.14	0.09	0.05	0.08	0.14
N3	0.05	0.00	0.03	0.07	0.01	0.16	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.11	0.08	0.02	0.05	0.10
N6	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.13	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.03	0.13	0.02	0.02	0.00	0.05
N7	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.08	0.06	0.11	0.22	0.23	0.17
N9	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.05	0.03	0.09	0.20	0.19	0.14
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.14	0.04	0.14	0.18	0.07	0.01	0.18	0.20	0.09	0.00	0.01	0.00	0.12	0.41	0.49	0.35
O3'	0.04	0.07	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.11	0.01	0.09	0.04	0.06	0.03	0.08	0.05	0.01	0.00	0.01	0.08	0.18	0.16	0.08
O4'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.08	0.01	0.09	0.00	0.12	0.03	0.14	0.11	0.13	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00
O5'	0.05	0.11	0.12	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.16	0.09	0.08	0.02	0.11	0.09	0.12	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00
OP1	0.20	0.07	0.35	0.25	0.09	0.14	0.11	0.04	0.02	0.28	0.05	0.02	0.02	0.22	0.20	0.41	0.18	0.08	0.04	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.10	0.37	0.20	0.07	0.06	0.09	0.00	0.00	0.30	0.08	0.05	0.00	0.23	0.19	0.49	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.16	0.30	0.16	0.02	0.05	0.04	0.00	0.05	0.24	0.14	0.10	0.05	0.17	0.14	0.35	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00