Doublet Group distance statistics: 50113

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C6	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C1'	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N9	A	0, 0.000, 0.053, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.053 std_dev=0.053
N6	A	0, 0.000, 0.100, 0.200, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.100 std_dev=0.100
N3	B	0, 0.000, 0.133, 0.266, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.133 std_dev=0.133
C2	B	0, 0.000, 0.140, 0.280, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.140 std_dev=0.140
N1	B	0, 0.000, 0.274, 0.548, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.274 std_dev=0.274
C4	B	0, 0.000, 0.289, 0.579, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.289 std_dev=0.289
C6	B	0, 0.000, 0.366, 0.733, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.366 std_dev=0.366
C5	B	0, 0.000, 0.388, 0.777, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.388 std_dev=0.388
N9	B	0, 0.000, 0.462, 0.924, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.462 std_dev=0.462
O2'	B	0, 0.000, 0.483, 0.966, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.483 std_dev=0.483
N6	B	0, 0.000, 0.520, 1.041, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.520 std_dev=0.520
C1'	B	0, 0.000, 0.546, 1.093, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.546 std_dev=0.546
N7	B	0, 0.000, 0.583, 1.165, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.583 std_dev=0.583
C8	B	0, 0.000, 0.602, 1.204, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.602 std_dev=0.602
O4'	B	0, 0.000, 0.674, 1.348, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.674 std_dev=0.674
C2'	B	0, 0.000, 0.689, 1.379, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.689 std_dev=0.689
C3'	B	0, 0.000, 0.984, 1.967, 1.967 max_d=1.967 avg_d=0.984 std_dev=0.984
C4'	B	0, 0.000, 1.002, 2.005, 2.005 max_d=2.005 avg_d=1.002 std_dev=1.002
O3'	B	0, 0.000, 1.004, 2.009, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.004 std_dev=1.004
O4'	A	0, 0.000, 1.231, 2.462, 2.462 max_d=2.462 avg_d=1.231 std_dev=1.231
C5'	B	0, 0.000, 1.253, 2.507, 2.507 max_d=2.507 avg_d=1.253 std_dev=1.253
O5'	B	0, 0.000, 1.348, 2.697, 2.697 max_d=2.697 avg_d=1.348 std_dev=1.348
C2'	A	0, 0.000, 1.370, 2.740, 2.740 max_d=2.740 avg_d=1.370 std_dev=1.370
P	B	0, 0.000, 1.611, 3.223, 3.223 max_d=3.223 avg_d=1.611 std_dev=1.611
C4'	A	0, 0.000, 1.670, 3.340, 3.340 max_d=3.340 avg_d=1.670 std_dev=1.670
OP1	B	0, 0.000, 1.719, 3.438, 3.438 max_d=3.438 avg_d=1.719 std_dev=1.719
C3'	A	0, 0.000, 1.819, 3.637, 3.637 max_d=3.637 avg_d=1.819 std_dev=1.819
OP2	B	0, 0.000, 1.908, 3.817, 3.817 max_d=3.817 avg_d=1.908 std_dev=1.908
O3'	A	0, 0.000, 1.915, 3.829, 3.829 max_d=3.829 avg_d=1.915 std_dev=1.915
O2'	A	0, 0.000, 2.046, 4.093, 4.093 max_d=4.093 avg_d=2.046 std_dev=2.046
C5'	A	0, 0.000, 3.133, 6.267, 6.267 max_d=6.267 avg_d=3.133 std_dev=3.133
O5'	A	0, 0.000, 3.820, 7.639, 7.639 max_d=7.639 avg_d=3.820 std_dev=3.820
P	A	0, 0.000, 5.237, 10.474, 10.474 max_d=10.474 avg_d=5.237 std_dev=5.237
OP2	A	0, 0.000, 5.371, 10.743, 10.743 max_d=10.743 avg_d=5.371 std_dev=5.371
OP1	A	0, 0.000, 6.187, 12.375, 12.375 max_d=12.375 avg_d=6.187 std_dev=6.187

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.09	0.04	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.24	0.00	0.06	0.11	0.30	0.18
C2	0.02	0.00	0.15	0.33	0.01	0.62	0.01	1.28	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.25	0.39	1.21	1.39	1.48	1.39
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.19	0.03	0.09	0.10	0.15	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.30	0.33	0.24	0.27
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.03	0.42	0.18	0.33	0.14	0.36	0.15	0.02	0.00	0.02	0.29	0.29	0.06	0.21
C4	0.03	0.01	0.05	0.04	0.00	0.25	0.00	0.61	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.12	0.19	0.44	0.40	0.32	0.39
C4'	0.01	0.62	0.00	0.01	0.25	0.00	0.09	0.01	0.23	0.32	0.46	0.58	0.12	0.20	0.03	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.07
C5	0.03	0.01	0.00	0.13	0.00	0.09	0.00	0.37	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.16	0.01	0.07	0.21	0.11	0.00	0.12
C5'	0.09	1.28	0.19	0.01	0.61	0.01	0.37	0.00	0.64	0.35	1.05	1.17	0.49	0.14	0.12	0.04	0.20	0.00	0.00	0.11	0.13	0.02
C6	0.04	0.00	0.03	0.03	0.02	0.23	0.01	0.64	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.02	0.15	0.51	0.50	0.46	0.52
C8	0.01	0.02	0.09	0.42	0.01	0.32	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.00	0.25	0.10	0.22	0.52	0.75	1.01	0.77
N1	0.03	0.00	0.10	0.18	0.00	0.46	0.00	1.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.14	0.29	0.96	1.10	1.15	1.10
N3	0.02	0.00	0.15	0.33	0.01	0.58	0.00	1.17	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.27	0.39	1.03	1.11	1.14	1.11
N6	0.07	0.01	0.02	0.14	0.04	0.12	0.04	0.49	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.06	0.06	0.15	0.07	0.07	0.36	0.31	0.26	0.34
N7	0.02	0.01	0.07	0.36	0.01	0.20	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02	0.26	0.12	0.12	0.31	0.55	0.77	0.54
N9	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.03	0.02	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.12	0.08	0.00	0.06	0.17	0.36	0.20
O2'	0.02	0.03	0.00	0.02	0.06	0.23	0.16	0.04	0.13	0.25	0.05	0.07	0.15	0.26	0.12	0.00	0.03	0.15	0.06	0.17	0.20	0.10
O3'	0.24	0.25	0.01	0.00	0.12	0.01	0.01	0.20	0.02	0.10	0.14	0.27	0.07	0.12	0.08	0.03	0.00	0.20	0.11	0.12	0.08	0.05
O4'	0.00	0.39	0.01	0.02	0.19	0.01	0.07	0.00	0.15	0.22	0.29	0.39	0.07	0.12	0.00	0.15	0.20	0.00	0.27	0.33	0.58	0.41
O5'	0.06	1.21	0.30	0.29	0.44	0.01	0.21	0.00	0.51	0.52	0.96	1.03	0.36	0.31	0.06	0.06	0.11	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.11	1.39	0.33	0.29	0.40	0.02	0.11	0.11	0.50	0.75	1.10	1.11	0.31	0.55	0.17	0.17	0.12	0.33	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	1.48	0.24	0.06	0.32	0.21	0.00	0.13	0.46	1.01	1.15	1.14	0.26	0.77	0.36	0.20	0.08	0.58	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.18	1.39	0.27	0.21	0.39	0.07	0.12	0.02	0.52	0.77	1.10	1.11	0.34	0.54	0.20	0.10	0.05	0.41	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.06	0.40	0.42	0.18	0.43	0.16	0.56	0.02	0.39	0.12	0.07	0.08	0.33	0.31	0.29	0.28	0.34	0.68	0.71	0.94	0.74
C2	0.10	0.07	0.13	0.08	0.09	0.10	0.13	0.18	0.07	0.17	0.03	0.01	0.10	0.19	0.13	0.08	0.07	0.10	0.28	0.28	0.45	0.31
C2'	0.71	0.32	0.69	0.73	0.66	0.88	0.78	1.09	0.61	0.96	0.36	0.44	0.68	1.03	0.78	0.42	0.51	0.84	1.22	1.33	1.47	1.34
C3'	0.95	0.15	1.04	1.13	0.70	1.25	0.77	1.53	0.41	1.23	0.10	0.41	0.37	1.18	0.97	0.75	0.86	1.11	1.71	1.91	2.13	1.92
C4	0.20	0.11	0.26	0.25	0.10	0.25	0.08	0.34	0.06	0.24	0.15	0.00	0.08	0.20	0.20	0.19	0.12	0.20	0.43	0.43	0.61	0.45
C4'	0.40	0.57	0.63	0.69	0.01	0.68	0.01	0.96	0.41	0.59	0.69	0.26	0.52	0.45	0.35	0.47	0.44	0.47	1.19	1.40	1.78	1.43
C5	0.17	0.11	0.23	0.21	0.05	0.21	0.00	0.26	0.11	0.14	0.15	0.01	0.12	0.08	0.14	0.18	0.11	0.17	0.32	0.32	0.43	0.31
C5'	0.21	1.18	0.58	0.66	0.35	0.62	0.33	1.01	0.90	0.50	1.33	0.75	0.98	0.29	0.14	0.38	0.32	0.32	1.32	1.69	2.17	1.70
C6	0.07	0.09	0.10	0.06	0.02	0.08	0.00	0.12	0.05	0.06	0.09	0.03	0.04	0.04	0.06	0.08	0.04	0.07	0.17	0.17	0.26	0.17
C8	0.28	0.12	0.38	0.41	0.06	0.39	0.03	0.47	0.18	0.24	0.20	0.00	0.24	0.09	0.22	0.29	0.30	0.29	0.54	0.56	0.71	0.55
N1	0.05	0.07	0.07	0.01	0.05	0.03	0.07	0.10	0.03	0.10	0.03	0.02	0.06	0.11	0.07	0.04	0.12	0.05	0.17	0.17	0.30	0.19
N3	0.16	0.10	0.21	0.18	0.12	0.20	0.14	0.29	0.03	0.24	0.09	0.00	0.05	0.24	0.18	0.15	0.03	0.17	0.40	0.40	0.60	0.44
N6	0.00	0.08	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.08	0.06	0.05	0.03	0.02	0.02	0.10	0.00	0.04	0.05	0.10	0.03
N7	0.23	0.11	0.32	0.33	0.02	0.31	0.08	0.35	0.18	0.12	0.18	0.01	0.22	0.01	0.15	0.26	0.25	0.23	0.38	0.39	0.47	0.35
N9	0.27	0.11	0.36	0.37	0.11	0.37	0.07	0.47	0.12	0.30	0.18	0.02	0.17	0.22	0.25	0.27	0.24	0.28	0.56	0.58	0.78	0.60
O2'	0.49	0.50	0.36	0.41	0.62	0.62	0.79	0.81	0.81	0.75	0.64	0.48	1.02	0.89	0.61	0.07	0.21	0.65	0.89	1.00	1.05	1.00
O3'	0.90	0.29	0.91	1.04	0.70	1.21	0.77	1.49	0.50	1.12	0.26	0.48	0.50	1.10	0.91	0.60	0.79	1.09	1.63	1.86	1.99	1.85
O4'	0.14	0.64	0.39	0.42	0.22	0.33	0.30	0.51	0.66	0.19	0.79	0.39	0.83	0.02	0.06	0.32	0.23	0.14	0.71	0.81	1.20	0.85
O5'	0.29	1.16	0.70	0.78	0.29	0.70	0.26	1.09	0.83	0.56	1.29	0.71	0.91	0.34	0.21	0.53	0.43	0.37	1.40	1.80	2.29	1.80
OP1	0.48	1.36	1.02	1.14	0.27	1.01	0.25	1.50	0.92	0.76	1.49	0.80	1.00	0.45	0.34	0.83	0.73	0.58	1.85	2.43	2.95	2.37
OP2	0.64	1.25	1.18	1.27	0.12	1.15	0.07	1.62	0.75	0.95	1.35	0.68	0.78	0.66	0.52	0.98	0.84	0.74	1.98	2.47	3.01	2.44
P	0.36	1.40	0.89	0.97	0.34	0.83	0.31	1.27	0.97	0.65	1.53	0.85	1.03	0.37	0.25	0.73	0.58	0.43	1.63	2.10	2.66	2.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00
C2	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.03	0.14	0.08	0.22	0.13
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.04	0.06
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.03	0.07	0.05
C4	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.14	0.07	0.21	0.12
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.03	0.00	0.08	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.20	0.13	0.30	0.19
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.13	0.12	0.09	0.04	0.16	0.13	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.04	0.22	0.15	0.34	0.22
C8	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.20	0.12	0.27	0.16
N1	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.03	0.19	0.11	0.29	0.18
N3	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.13	0.02	0.11	0.05	0.17	0.09
N6	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.08	0.03	0.16	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.05	0.05	0.27	0.19	0.41	0.27
N7	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.13	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.23	0.15	0.34	0.21
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.13	0.06	0.17	0.09
O2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.09
O3'	0.07	0.13	0.02	0.01	0.10	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.12	0.13	0.05	0.04	0.06	0.01	0.00	0.03	0.07	0.03	0.08	0.05
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03
O5'	0.03	0.14	0.05	0.07	0.14	0.03	0.20	0.01	0.22	0.20	0.19	0.11	0.27	0.23	0.13	0.07	0.07	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.01	0.08	0.00	0.03	0.07	0.00	0.13	0.00	0.15	0.12	0.11	0.05	0.19	0.15	0.06	0.00	0.03	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01
OP2	0.04	0.22	0.04	0.07	0.21	0.04	0.30	0.03	0.34	0.27	0.29	0.17	0.41	0.34	0.17	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.00	0.13	0.06	0.05	0.12	0.03	0.19	0.01	0.22	0.16	0.18	0.09	0.27	0.21	0.09	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00