Doublet Group distance statistics: 50116

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 19, 52, 45, 23, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.009, 0.025, 0.042, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.016, 0.040, 0.065, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.040 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.016, 0.042, 0.067, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.042 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.019, 0.050, 0.081, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.050 std_dev=0.031
O2'	B	0, 0.190, 0.309, 0.427, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.309 std_dev=0.119
C2'	B	0, 0.170, 0.296, 0.422, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.296 std_dev=0.126
C2'	A	0, 0.094, 0.223, 0.351, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.223 std_dev=0.128
O4'	A	0, 0.090, 0.226, 0.362, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.226 std_dev=0.136
O2'	A	0, 0.094, 0.253, 0.412, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.253 std_dev=0.159
C4'	A	0, 0.145, 0.355, 0.565, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.355 std_dev=0.210
C3'	A	0, 0.153, 0.372, 0.591, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.372 std_dev=0.219
C1'	B	0, 0.296, 0.520, 0.744, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.520 std_dev=0.224
C3'	B	0, 0.240, 0.490, 0.741, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.490 std_dev=0.251
O5'	A	0, 0.140, 0.431, 0.723, 2.031 max_d=2.031 avg_d=0.431 std_dev=0.292
N3	B	0, 0.389, 0.703, 1.017, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.703 std_dev=0.314
C4'	B	0, 0.327, 0.648, 0.969, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.648 std_dev=0.321
O3'	B	0, 0.258, 0.580, 0.903, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.580 std_dev=0.322
N9	B	0, 0.356, 0.681, 1.005, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.681 std_dev=0.325
C5'	A	0, 0.230, 0.555, 0.879, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.555 std_dev=0.325
O4'	B	0, 0.344, 0.674, 1.005, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.674 std_dev=0.330
O3'	A	0, 0.216, 0.560, 0.904, 2.258 max_d=2.258 avg_d=0.560 std_dev=0.344
C4	B	0, 0.381, 0.733, 1.084, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.733 std_dev=0.352
P	A	0, 0.084, 0.468, 0.852, 3.281 max_d=3.281 avg_d=0.468 std_dev=0.384
C2	B	0, 0.442, 0.831, 1.219, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.831 std_dev=0.389
N2	B	0, 0.486, 0.897, 1.308, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.897 std_dev=0.411
C8	B	0, 0.427, 0.860, 1.292, 2.053 max_d=2.053 avg_d=0.860 std_dev=0.432
C5	B	0, 0.443, 0.901, 1.359, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.901 std_dev=0.458
N1	B	0, 0.471, 0.952, 1.433, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.952 std_dev=0.481
OP1	A	0, 0.070, 0.562, 1.054, 4.335 max_d=4.335 avg_d=0.562 std_dev=0.492
N7	B	0, 0.483, 0.988, 1.492, 2.271 max_d=2.271 avg_d=0.988 std_dev=0.505
C5'	B	0, 0.506, 1.017, 1.528, 2.367 max_d=2.367 avg_d=1.017 std_dev=0.511
OP2	A	0, -0.040, 0.477, 0.993, 5.711 max_d=5.711 avg_d=0.477 std_dev=0.517
C6	B	0, 0.483, 1.009, 1.535, 2.031 max_d=2.031 avg_d=1.009 std_dev=0.526
O5'	B	0, 0.580, 1.158, 1.737, 2.345 max_d=2.345 avg_d=1.158 std_dev=0.578
O6	B	0, 0.555, 1.179, 1.804, 2.426 max_d=2.426 avg_d=1.179 std_dev=0.625
P	B	0, 0.816, 1.716, 2.616, 3.436 max_d=3.436 avg_d=1.716 std_dev=0.900
OP2	B	0, 0.909, 1.896, 2.883, 4.251 max_d=4.251 avg_d=1.896 std_dev=0.987
OP1	B	0, 0.915, 1.936, 2.957, 4.068 max_d=4.068 avg_d=1.936 std_dev=1.021

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.07	0.07	0.12	0.09
C2	0.03	0.00	0.12	0.13	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.05	0.12	0.11	0.21	0.14
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.05	0.08	0.05	0.10	0.12	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.11	0.12	0.07
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.11	0.07	0.12	0.12	0.11	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.13	0.15	0.14	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.09	0.03	0.12	0.11	0.21	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.07	0.02	0.00	0.02	0.07	0.14	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.03	0.15	0.14	0.28	0.19
C5'	0.04	0.07	0.05	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.09	0.07	0.12	0.12	0.08	0.05	0.06	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.12	0.03	0.15	0.15	0.30	0.19
C8	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.06	0.03	0.16	0.14	0.26	0.18
N1	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.15	0.04	0.14	0.13	0.26	0.17
N3	0.03	0.00	0.12	0.12	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.11	0.09	0.18	0.12
N6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.13	0.04	0.17	0.18	0.35	0.22
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.17	0.17	0.33	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.12	0.10	0.18	0.13
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.08	0.07	0.07	0.05	0.10	0.05	0.12	0.11	0.10	0.06	0.04	0.00	0.05	0.05	0.08	0.10	0.12	0.06
O3'	0.05	0.16	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.06	0.12	0.06	0.15	0.14	0.13	0.08	0.04	0.05	0.00	0.06	0.14	0.20	0.19	0.13
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.07	0.10	0.13	0.11
O5'	0.07	0.12	0.08	0.13	0.12	0.02	0.15	0.01	0.15	0.16	0.14	0.11	0.17	0.17	0.12	0.08	0.14	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.11	0.11	0.15	0.11	0.07	0.14	0.10	0.15	0.14	0.13	0.09	0.18	0.17	0.10	0.10	0.20	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.21	0.12	0.14	0.21	0.14	0.28	0.11	0.30	0.26	0.26	0.18	0.35	0.33	0.18	0.12	0.19	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.07	0.10	0.14	0.05	0.19	0.02	0.19	0.18	0.17	0.12	0.22	0.21	0.13	0.06	0.13	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.40	0.13	0.15	0.39	0.12	0.46	0.14	0.51	0.40	0.47	0.36	0.35	0.46	0.35	0.10	0.23	0.22	0.22	0.55	0.17	0.35	0.24
C2	0.26	0.45	0.11	0.13	0.36	0.15	0.38	0.16	0.43	0.30	0.46	0.49	0.39	0.34	0.30	0.12	0.25	0.25	0.14	0.45	0.21	0.18	0.15
C2'	0.30	0.52	0.16	0.16	0.48	0.18	0.58	0.20	0.65	0.50	0.63	0.47	0.43	0.58	0.42	0.11	0.19	0.29	0.29	0.71	0.23	0.44	0.34
C3'	0.28	0.38	0.17	0.19	0.43	0.20	0.56	0.24	0.62	0.51	0.54	0.27	0.33	0.59	0.41	0.13	0.19	0.29	0.35	0.70	0.31	0.51	0.40
C4	0.24	0.40	0.11	0.12	0.35	0.11	0.38	0.11	0.41	0.31	0.42	0.40	0.36	0.36	0.30	0.10	0.23	0.21	0.14	0.43	0.14	0.23	0.15
C4'	0.25	0.26	0.15	0.17	0.34	0.16	0.46	0.21	0.48	0.45	0.37	0.24	0.24	0.51	0.35	0.11	0.18	0.24	0.30	0.56	0.25	0.46	0.34
C5	0.23	0.33	0.11	0.11	0.30	0.12	0.31	0.12	0.33	0.27	0.33	0.32	0.31	0.29	0.27	0.11	0.21	0.21	0.13	0.34	0.16	0.19	0.14
C5'	0.26	0.24	0.18	0.19	0.31	0.20	0.41	0.25	0.40	0.45	0.27	0.36	0.23	0.50	0.34	0.16	0.16	0.26	0.34	0.47	0.31	0.49	0.38
C6	0.25	0.34	0.12	0.13	0.29	0.17	0.29	0.18	0.32	0.25	0.34	0.36	0.32	0.27	0.26	0.13	0.22	0.25	0.16	0.32	0.23	0.17	0.17
C8	0.23	0.27	0.13	0.14	0.30	0.12	0.34	0.13	0.35	0.33	0.31	0.23	0.26	0.36	0.29	0.10	0.20	0.19	0.19	0.36	0.14	0.29	0.20
N1	0.26	0.40	0.12	0.14	0.32	0.18	0.33	0.19	0.37	0.27	0.40	0.43	0.36	0.30	0.28	0.14	0.24	0.27	0.16	0.38	0.26	0.18	0.18
N3	0.25	0.45	0.11	0.12	0.37	0.12	0.40	0.12	0.46	0.32	0.48	0.48	0.39	0.37	0.31	0.11	0.24	0.23	0.14	0.48	0.16	0.21	0.14
N6	0.25	0.28	0.15	0.16	0.26	0.22	0.25	0.23	0.26	0.25	0.28	0.30	0.27	0.25	0.25	0.16	0.21	0.28	0.20	0.26	0.29	0.20	0.23
N7	0.21	0.24	0.11	0.11	0.26	0.10	0.27	0.11	0.27	0.26	0.25	0.22	0.24	0.28	0.25	0.10	0.18	0.18	0.14	0.28	0.13	0.21	0.15
N9	0.24	0.37	0.12	0.14	0.35	0.11	0.40	0.12	0.43	0.35	0.41	0.34	0.33	0.40	0.32	0.10	0.22	0.20	0.18	0.46	0.14	0.29	0.20
O2'	0.31	0.53	0.15	0.16	0.49	0.17	0.59	0.20	0.68	0.50	0.65	0.50	0.44	0.59	0.43	0.12	0.21	0.30	0.28	0.76	0.21	0.44	0.33
O3'	0.29	0.38	0.18	0.21	0.45	0.22	0.60	0.28	0.68	0.54	0.58	0.26	0.32	0.64	0.42	0.13	0.19	0.31	0.39	0.80	0.37	0.58	0.47
O4'	0.23	0.26	0.14	0.18	0.32	0.14	0.41	0.18	0.42	0.39	0.35	0.24	0.25	0.44	0.31	0.11	0.23	0.20	0.26	0.48	0.22	0.39	0.28
O5'	0.27	0.21	0.21	0.24	0.28	0.24	0.39	0.29	0.34	0.45	0.21	0.38	0.19	0.48	0.34	0.18	0.22	0.28	0.37	0.40	0.35	0.50	0.41
OP1	0.32	0.42	0.28	0.35	0.31	0.36	0.38	0.43	0.36	0.51	0.42	0.56	0.31	0.53	0.37	0.23	0.31	0.36	0.51	0.40	0.53	0.66	0.57
OP2	0.47	0.43	0.49	0.55	0.38	0.54	0.38	0.58	0.32	0.56	0.39	0.50	0.39	0.50	0.47	0.43	0.54	0.51	0.63	0.30	0.63	0.67	0.64
P	0.32	0.33	0.31	0.36	0.25	0.35	0.31	0.40	0.24	0.46	0.28	0.47	0.26	0.45	0.34	0.27	0.34	0.34	0.47	0.26	0.47	0.57	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.02	0.08	0.15	0.11
C2	0.03	0.00	0.14	0.15	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.20	0.05	0.17	0.01	0.18	0.30	0.22
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.08	0.07	0.11	0.17	0.14	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.07	0.09	0.12	0.06
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.12	0.10	0.14	0.18	0.14	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.10	0.12	0.13	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.17	0.01	0.18	0.28	0.21
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.07	0.05	0.07	0.05	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.07	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.21	0.01	0.25	0.35	0.27
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.13	0.10	0.08	0.06	0.14	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.14	0.06	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.03	0.22	0.01	0.27	0.39	0.29
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.04	0.20	0.02	0.23	0.29	0.25
N1	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.04	0.20	0.01	0.23	0.36	0.26
N2	0.04	0.01	0.17	0.18	0.02	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.18	0.24	0.06	0.16	0.02	0.17	0.29	0.20
N3	0.03	0.01	0.14	0.14	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.17	0.05	0.15	0.01	0.15	0.26	0.19
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.23	0.02	0.29	0.37	0.31
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.15	0.02	0.15	0.23	0.18
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.05	0.12	0.18	0.13	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.08	0.11	0.10	0.06
O3'	0.01	0.20	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.04	0.15	0.12	0.18	0.24	0.17	0.12	0.06	0.04	0.00	0.02	0.12	0.16	0.22	0.17	0.14
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.03	0.11	0.14	0.12
O5'	0.08	0.17	0.07	0.10	0.17	0.02	0.21	0.01	0.22	0.20	0.20	0.16	0.15	0.23	0.15	0.05	0.12	0.08	0.00	0.25	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.16	0.03	0.25	0.00	0.31	0.43	0.33
OP1	0.08	0.18	0.09	0.13	0.18	0.07	0.25	0.06	0.27	0.23	0.23	0.17	0.15	0.29	0.15	0.11	0.22	0.11	0.02	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.30	0.12	0.12	0.28	0.07	0.35	0.06	0.39	0.29	0.36	0.29	0.26	0.37	0.23	0.10	0.17	0.14	0.01	0.43	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.22	0.06	0.09	0.21	0.03	0.27	0.02	0.29	0.25	0.26	0.20	0.19	0.31	0.18	0.06	0.14	0.12	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00