Doublet Group distance statistics: 50117

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 8, 15, 26, 17, 22, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.009, 0.020, 0.030, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.012, 0.032, 0.051, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.032 std_dev=0.020
O2'	B	0, 0.323, 0.471, 0.619, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.471 std_dev=0.148
C2'	B	0, 0.299, 0.464, 0.630, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.464 std_dev=0.165
O4'	A	0, 0.008, 0.195, 0.382, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.195 std_dev=0.187
C2'	A	0, 0.007, 0.196, 0.385, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.196 std_dev=0.189
C3'	A	0, 0.068, 0.324, 0.579, 2.390 max_d=2.390 avg_d=0.324 std_dev=0.256
O3'	A	0, 0.186, 0.467, 0.749, 2.402 max_d=2.402 avg_d=0.467 std_dev=0.282
O2'	A	0, -0.054, 0.228, 0.510, 2.712 max_d=2.712 avg_d=0.228 std_dev=0.282
C3'	B	0, 0.314, 0.600, 0.887, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.600 std_dev=0.286
C4'	A	0, 0.029, 0.318, 0.608, 2.734 max_d=2.734 avg_d=0.318 std_dev=0.289
C1'	B	0, 0.277, 0.626, 0.975, 3.017 max_d=3.017 avg_d=0.626 std_dev=0.349
O3'	B	0, 0.238, 0.673, 1.108, 4.012 max_d=4.012 avg_d=0.673 std_dev=0.435
C4'	B	0, 0.286, 0.750, 1.214, 4.104 max_d=4.104 avg_d=0.750 std_dev=0.464
N9	B	0, 0.336, 0.804, 1.272, 4.005 max_d=4.005 avg_d=0.804 std_dev=0.468
C5'	A	0, 0.024, 0.509, 0.994, 4.476 max_d=4.476 avg_d=0.509 std_dev=0.485
O4'	B	0, 0.293, 0.786, 1.279, 4.301 max_d=4.301 avg_d=0.786 std_dev=0.493
O5'	A	0, -0.076, 0.465, 1.006, 4.560 max_d=4.560 avg_d=0.465 std_dev=0.541
C8	B	0, 0.488, 1.049, 1.610, 4.249 max_d=4.249 avg_d=1.049 std_dev=0.561
O5'	B	0, 0.509, 1.095, 1.681, 4.849 max_d=4.849 avg_d=1.095 std_dev=0.586
C4	B	0, 0.264, 0.875, 1.485, 5.717 max_d=5.717 avg_d=0.875 std_dev=0.611
C5'	B	0, 0.373, 1.030, 1.688, 5.947 max_d=5.947 avg_d=1.030 std_dev=0.658
N3	B	0, 0.106, 0.781, 1.455, 6.529 max_d=6.529 avg_d=0.781 std_dev=0.675
N7	B	0, 0.548, 1.237, 1.925, 5.582 max_d=5.582 avg_d=1.237 std_dev=0.689
P	A	0, -0.079, 0.644, 1.368, 5.865 max_d=5.865 avg_d=0.644 std_dev=0.724
C5	B	0, 0.414, 1.160, 1.905, 6.795 max_d=6.795 avg_d=1.160 std_dev=0.745
OP2	B	0, 0.830, 1.581, 2.332, 4.382 max_d=4.382 avg_d=1.581 std_dev=0.751
OP1	A	0, 0.030, 0.829, 1.628, 7.094 max_d=7.094 avg_d=0.829 std_dev=0.799
P	B	0, 0.732, 1.539, 2.346, 6.143 max_d=6.143 avg_d=1.539 std_dev=0.807
C2	B	0, 0.109, 1.023, 1.937, 8.813 max_d=8.813 avg_d=1.023 std_dev=0.914
OP2	A	0, -0.264, 0.670, 1.604, 6.090 max_d=6.090 avg_d=0.670 std_dev=0.934
C6	B	0, 0.420, 1.392, 2.365, 9.132 max_d=9.132 avg_d=1.392 std_dev=0.973
OP1	B	0, 0.794, 1.775, 2.756, 7.827 max_d=7.827 avg_d=1.775 std_dev=0.981
N1	B	0, 0.252, 1.304, 2.357, 10.081 max_d=10.081 avg_d=1.304 std_dev=1.053
N2	B	0, 0.018, 1.071, 2.125, 10.118 max_d=10.118 avg_d=1.071 std_dev=1.054
O6	B	0, 0.564, 1.689, 2.814, 10.436 max_d=10.436 avg_d=1.689 std_dev=1.125

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.09	0.07	0.15	0.12
C2	0.03	0.00	0.15	0.13	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.18	0.13	0.18	0.15	0.37	0.26
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.03	0.09	0.06	0.12	0.15	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.14	0.18	0.12
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.10	0.00	0.12	0.02	0.13	0.11	0.13	0.12	0.13	0.12	0.08	0.02	0.01	0.02	0.12	0.16	0.14	0.09
C4	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.07	0.19	0.16	0.38	0.27
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.07	0.10	0.06	0.10	0.04	0.08	0.02	0.00	0.02	0.07	0.13	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.04	0.26	0.25	0.52	0.37
C5'	0.02	0.14	0.03	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.20	0.12	0.13	0.14	0.19	0.09	0.06	0.06	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.06	0.25	0.26	0.55	0.38
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.12	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.14	0.08	0.08	0.31	0.29	0.49	0.40
N1	0.02	0.00	0.12	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.10	0.21	0.20	0.47	0.32
N3	0.02	0.00	0.15	0.12	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.13	0.16	0.13	0.31	0.22
N6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.14	0.05	0.28	0.33	0.64	0.44
N7	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.12	0.09	0.05	0.33	0.34	0.61	0.45
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.19	0.15	0.33	0.25
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.08	0.07	0.06	0.08	0.14	0.11	0.14	0.08	0.12	0.06	0.00	0.05	0.06	0.07	0.13	0.19	0.09
O3'	0.07	0.18	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.06	0.13	0.08	0.16	0.16	0.14	0.09	0.06	0.05	0.00	0.04	0.11	0.20	0.21	0.11
O4'	0.00	0.13	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.08	0.10	0.13	0.05	0.05	0.01	0.06	0.04	0.00	0.05	0.10	0.12	0.11
O5'	0.09	0.18	0.13	0.12	0.19	0.02	0.26	0.01	0.25	0.31	0.21	0.16	0.28	0.33	0.19	0.07	0.11	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.15	0.14	0.16	0.16	0.07	0.25	0.09	0.26	0.29	0.20	0.13	0.33	0.34	0.15	0.13	0.20	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.37	0.18	0.14	0.38	0.13	0.52	0.11	0.55	0.49	0.47	0.31	0.64	0.61	0.33	0.19	0.21	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.26	0.12	0.09	0.27	0.04	0.37	0.01	0.38	0.40	0.32	0.22	0.44	0.45	0.25	0.09	0.11	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.74	0.13	0.20	0.51	0.28	0.60	0.37	0.75	0.39	0.81	0.83	0.57	0.51	0.36	0.15	0.34	0.21	0.30	0.81	0.42	0.28	0.33
C2	0.24	0.52	0.14	0.15	0.37	0.20	0.40	0.22	0.48	0.28	0.53	0.59	0.43	0.34	0.29	0.15	0.24	0.24	0.19	0.51	0.26	0.22	0.20
C2'	0.26	0.85	0.15	0.29	0.57	0.38	0.68	0.50	0.87	0.45	0.95	0.96	0.64	0.59	0.40	0.16	0.45	0.29	0.44	0.94	0.59	0.42	0.49
C3'	0.31	0.98	0.22	0.19	0.70	0.27	0.84	0.39	1.04	0.55	1.11	1.08	0.76	0.73	0.51	0.19	0.30	0.24	0.36	1.13	0.50	0.37	0.40
C4	0.23	0.58	0.13	0.15	0.41	0.21	0.46	0.25	0.55	0.31	0.60	0.65	0.47	0.39	0.31	0.14	0.26	0.21	0.21	0.58	0.28	0.22	0.22
C4'	0.26	0.87	0.23	0.18	0.63	0.25	0.75	0.35	0.94	0.50	0.98	0.96	0.67	0.66	0.45	0.21	0.26	0.20	0.30	1.03	0.43	0.31	0.33
C5	0.23	0.47	0.13	0.14	0.36	0.18	0.38	0.20	0.44	0.28	0.48	0.51	0.41	0.33	0.29	0.14	0.23	0.21	0.18	0.46	0.23	0.21	0.19
C5'	0.33	0.92	0.35	0.28	0.69	0.28	0.82	0.37	0.99	0.57	1.03	1.01	0.73	0.74	0.51	0.30	0.30	0.25	0.34	1.09	0.44	0.36	0.36
C6	0.25	0.39	0.16	0.15	0.32	0.19	0.32	0.20	0.36	0.26	0.39	0.43	0.35	0.29	0.27	0.15	0.22	0.25	0.19	0.37	0.23	0.22	0.19
C8	0.22	0.60	0.13	0.18	0.45	0.24	0.50	0.30	0.59	0.35	0.63	0.64	0.50	0.43	0.34	0.15	0.32	0.20	0.25	0.61	0.33	0.25	0.26
N1	0.25	0.44	0.16	0.16	0.33	0.20	0.34	0.21	0.40	0.27	0.44	0.49	0.38	0.30	0.28	0.16	0.24	0.26	0.20	0.41	0.25	0.23	0.20
N3	0.23	0.59	0.13	0.15	0.41	0.21	0.46	0.25	0.56	0.30	0.62	0.67	0.47	0.38	0.30	0.14	0.26	0.22	0.21	0.59	0.29	0.22	0.22
N6	0.27	0.31	0.19	0.19	0.28	0.23	0.28	0.23	0.29	0.26	0.30	0.32	0.29	0.27	0.27	0.18	0.23	0.29	0.23	0.29	0.27	0.25	0.23
N7	0.23	0.46	0.12	0.14	0.37	0.19	0.40	0.21	0.45	0.30	0.47	0.47	0.41	0.35	0.30	0.14	0.25	0.19	0.19	0.46	0.24	0.22	0.20
N9	0.22	0.66	0.13	0.18	0.47	0.25	0.53	0.31	0.64	0.35	0.70	0.72	0.53	0.45	0.33	0.15	0.31	0.20	0.25	0.68	0.35	0.25	0.27
O2'	0.26	0.76	0.20	0.39	0.50	0.46	0.62	0.58	0.81	0.43	0.88	0.87	0.55	0.55	0.37	0.22	0.57	0.35	0.53	0.90	0.69	0.50	0.57
O3'	0.31	1.00	0.21	0.22	0.73	0.29	0.90	0.39	1.13	0.61	1.18	1.09	0.76	0.80	0.53	0.18	0.34	0.26	0.39	1.26	0.52	0.43	0.44
O4'	0.21	0.73	0.18	0.17	0.52	0.25	0.62	0.35	0.77	0.40	0.82	0.80	0.57	0.54	0.36	0.18	0.27	0.18	0.26	0.84	0.39	0.27	0.29
O5'	0.43	0.96	0.46	0.38	0.75	0.36	0.84	0.42	0.99	0.61	1.04	1.04	0.80	0.75	0.58	0.42	0.38	0.34	0.39	1.05	0.48	0.39	0.40
OP1	0.59	1.12	0.62	0.58	0.92	0.50	1.06	0.54	1.22	0.84	1.25	1.18	0.94	1.00	0.77	0.51	0.55	0.50	0.61	1.31	0.62	0.66	0.60
OP2	0.83	1.03	0.91	0.87	0.96	0.79	0.98	0.79	1.02	0.89	1.06	1.04	0.97	0.93	0.90	0.84	0.86	0.76	0.78	1.02	0.80	0.72	0.74
P	0.61	1.01	0.68	0.63	0.84	0.55	0.92	0.57	1.04	0.75	1.08	1.06	0.87	0.86	0.72	0.62	0.63	0.52	0.58	1.08	0.62	0.58	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.09	0.02	0.10	0.14	0.08
C2	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.16	0.04	0.21	0.01	0.22	0.28	0.20
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.06	0.09	0.13	0.11	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.10	0.08	0.16	0.12	0.09
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.13	0.11	0.13	0.15	0.12	0.11	0.07	0.02	0.01	0.02	0.15	0.14	0.21	0.12	0.13
C4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.11	0.02	0.21	0.01	0.21	0.25	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.05	0.04	0.09	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.09	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.13	0.02	0.28	0.01	0.29	0.33	0.27
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.15	0.11	0.06	0.06	0.17	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.17	0.09	0.14	0.02
C6	0.02	0.00	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.02	0.29	0.01	0.32	0.37	0.30
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.04	0.27	0.02	0.26	0.25	0.24
N1	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.03	0.26	0.01	0.28	0.34	0.26
N2	0.04	0.01	0.13	0.15	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.19	0.05	0.18	0.02	0.20	0.27	0.18
N3	0.03	0.01	0.11	0.12	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.18	0.01	0.18	0.23	0.16
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.14	0.03	0.31	0.02	0.32	0.34	0.31
N9	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.19	0.01	0.18	0.20	0.16
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.07	0.06	0.07	0.05	0.10	0.05	0.12	0.15	0.11	0.06	0.03	0.00	0.04	0.05	0.05	0.11	0.13	0.10	0.05
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.03	0.16	0.13	0.17	0.19	0.14	0.14	0.08	0.04	0.00	0.02	0.16	0.18	0.28	0.18	0.18
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.03	0.09	0.18	0.11
O5'	0.09	0.21	0.10	0.15	0.21	0.02	0.28	0.01	0.29	0.27	0.26	0.18	0.18	0.31	0.19	0.05	0.16	0.09	0.00	0.32	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.18	0.03	0.32	0.00	0.36	0.42	0.34
OP1	0.10	0.22	0.16	0.21	0.21	0.09	0.29	0.09	0.32	0.26	0.28	0.20	0.18	0.32	0.18	0.13	0.28	0.09	0.02	0.36	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.28	0.12	0.12	0.25	0.11	0.33	0.14	0.37	0.25	0.34	0.27	0.23	0.34	0.20	0.10	0.18	0.18	0.02	0.42	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.20	0.09	0.13	0.19	0.02	0.27	0.02	0.30	0.24	0.26	0.18	0.16	0.31	0.16	0.05	0.18	0.11	0.00	0.34	0.01	0.00	0.00