Doublet Group distance statistics: 50120

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 3, 7, 7, 3, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.011, 0.027, 0.044, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.015, 0.033, 0.052, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.006, 0.024, 0.043, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.018, 0.041, 0.063, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.041 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.008, 0.035, 0.061, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.035 std_dev=0.026
O4'	A	0, -0.016, 0.127, 0.269, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.127 std_dev=0.143
O2'	B	0, 0.141, 0.285, 0.429, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.285 std_dev=0.144
C2'	A	0, -0.005, 0.141, 0.286, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.141 std_dev=0.145
C4	B	0, 0.164, 0.320, 0.477, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.320 std_dev=0.157
C2'	B	0, 0.170, 0.332, 0.494, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.332 std_dev=0.162
O2'	A	0, 0.047, 0.216, 0.385, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.216 std_dev=0.169
C1'	B	0, 0.156, 0.351, 0.547, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.351 std_dev=0.196
C4'	A	0, 0.010, 0.225, 0.439, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.225 std_dev=0.214
N9	B	0, 0.152, 0.370, 0.587, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.370 std_dev=0.217
C5	B	0, 0.155, 0.377, 0.599, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.377 std_dev=0.222
C3'	A	0, 0.009, 0.233, 0.458, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.233 std_dev=0.225
O3'	A	0, 0.044, 0.359, 0.675, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.359 std_dev=0.316
C3'	B	0, 0.175, 0.497, 0.819, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.497 std_dev=0.322
C6	B	0, 0.148, 0.471, 0.794, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.471 std_dev=0.323
O6	B	0, 0.152, 0.520, 0.888, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.520 std_dev=0.368
C4'	B	0, 0.171, 0.543, 0.915, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.543 std_dev=0.372
O4'	B	0, 0.131, 0.512, 0.893, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.512 std_dev=0.381
C5'	A	0, 0.013, 0.394, 0.775, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.394 std_dev=0.381
N3	B	0, 0.105, 0.488, 0.871, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.488 std_dev=0.383
O3'	B	0, 0.197, 0.580, 0.964, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.580 std_dev=0.383
N7	B	0, 0.093, 0.543, 0.994, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.543 std_dev=0.451
C8	B	0, 0.069, 0.572, 1.075, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.572 std_dev=0.503
N1	B	0, 0.073, 0.641, 1.208, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.641 std_dev=0.568
C5'	B	0, 0.145, 0.729, 1.312, 2.234 max_d=2.234 avg_d=0.729 std_dev=0.583
O5'	B	0, 0.150, 0.747, 1.343, 2.052 max_d=2.052 avg_d=0.747 std_dev=0.596
P	B	0, 0.177, 0.799, 1.421, 2.099 max_d=2.099 avg_d=0.799 std_dev=0.622
C2	B	0, 0.031, 0.668, 1.304, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.668 std_dev=0.637
OP2	B	0, 0.151, 0.852, 1.554, 2.216 max_d=2.216 avg_d=0.852 std_dev=0.701
OP1	B	0, 0.144, 0.867, 1.589, 2.871 max_d=2.871 avg_d=0.867 std_dev=0.723
O5'	A	0, -0.101, 0.777, 1.655, 2.979 max_d=2.979 avg_d=0.777 std_dev=0.878
P	A	0, -0.140, 0.809, 1.758, 3.613 max_d=3.613 avg_d=0.809 std_dev=0.949
OP1	A	0, -0.045, 0.934, 1.913, 3.771 max_d=3.771 avg_d=0.934 std_dev=0.979
N2	B	0, -0.098, 0.915, 1.929, 2.856 max_d=2.856 avg_d=0.915 std_dev=1.014
OP2	A	0, -0.130, 1.066, 2.262, 4.129 max_d=4.129 avg_d=1.066 std_dev=1.196

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.21	0.16	0.55	0.11
C2	0.04	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.04	0.49	0.24	0.51	0.28
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.09	0.12	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.21	0.35	0.14
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.11	0.12	0.13	0.13	0.12	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.35	0.29	0.23	0.23
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.11	0.03	0.49	0.21	0.50	0.26
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.04	0.05	0.07	0.08	0.03	0.07	0.03	0.00	0.01	0.11	0.44	0.08
C5	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.61	0.28	0.55	0.39
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.14	0.08	0.04	0.14	0.15	0.07	0.07	0.04	0.01	0.01	0.10	0.33	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.04	0.63	0.31	0.58	0.42
C8	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04	0.59	0.25	0.53	0.34
N1	0.03	0.00	0.09	0.13	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.04	0.58	0.29	0.55	0.37
N3	0.04	0.00	0.12	0.13	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.16	0.04	0.42	0.20	0.49	0.21
N6	0.02	0.01	0.05	0.12	0.02	0.07	0.01	0.14	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.16	0.05	0.69	0.38	0.65	0.51
N7	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.14	0.04	0.66	0.31	0.57	0.44
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.44	0.18	0.51	0.21
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.09	0.11	0.06	0.05	0.03	0.00	0.04	0.07	0.07	0.20	0.42	0.08
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.11	0.03	0.12	0.04	0.15	0.13	0.17	0.16	0.16	0.14	0.07	0.04	0.00	0.02	0.24	0.35	0.18	0.22
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.10	0.21	0.67	0.20
O5'	0.21	0.49	0.28	0.35	0.49	0.01	0.61	0.01	0.63	0.59	0.58	0.42	0.69	0.66	0.44	0.07	0.24	0.10	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.16	0.24	0.21	0.29	0.21	0.11	0.28	0.10	0.31	0.25	0.29	0.20	0.38	0.31	0.18	0.20	0.35	0.21	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.55	0.51	0.35	0.23	0.50	0.44	0.55	0.33	0.58	0.53	0.55	0.49	0.65	0.57	0.51	0.42	0.18	0.67	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.28	0.14	0.23	0.26	0.08	0.39	0.01	0.42	0.34	0.37	0.21	0.51	0.44	0.21	0.08	0.22	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.37	0.10	0.12	0.12	0.21	0.12	0.24	0.21	0.19	0.34	0.56	0.24	0.12	0.14	0.13	0.22	0.34	0.24	0.22	0.27	0.29	0.24
C2	0.21	0.48	0.13	0.13	0.16	0.20	0.16	0.23	0.27	0.19	0.43	0.76	0.31	0.13	0.15	0.16	0.20	0.30	0.27	0.27	0.30	0.32	0.27
C2'	0.17	0.34	0.11	0.14	0.13	0.17	0.14	0.18	0.23	0.14	0.33	0.49	0.22	0.11	0.11	0.12	0.27	0.28	0.18	0.25	0.20	0.24	0.18
C3'	0.11	0.31	0.15	0.19	0.15	0.13	0.17	0.14	0.25	0.09	0.32	0.41	0.21	0.12	0.09	0.14	0.33	0.21	0.13	0.27	0.17	0.17	0.12
C4	0.20	0.37	0.10	0.12	0.12	0.20	0.12	0.22	0.21	0.17	0.33	0.56	0.24	0.11	0.13	0.14	0.20	0.31	0.24	0.21	0.27	0.29	0.24
C4'	0.15	0.31	0.10	0.13	0.12	0.15	0.13	0.17	0.21	0.12	0.31	0.45	0.21	0.08	0.09	0.11	0.27	0.28	0.15	0.22	0.20	0.19	0.15
C5	0.19	0.30	0.10	0.12	0.11	0.18	0.11	0.19	0.17	0.15	0.26	0.44	0.20	0.10	0.12	0.14	0.20	0.28	0.21	0.17	0.25	0.27	0.21
C5'	0.16	0.28	0.15	0.18	0.15	0.18	0.15	0.20	0.21	0.14	0.28	0.37	0.20	0.12	0.13	0.16	0.32	0.27	0.18	0.22	0.24	0.14	0.17
C6	0.19	0.32	0.12	0.13	0.12	0.17	0.12	0.19	0.18	0.14	0.28	0.48	0.22	0.10	0.12	0.16	0.19	0.26	0.22	0.18	0.26	0.27	0.22
C8	0.18	0.25	0.10	0.13	0.10	0.19	0.10	0.20	0.15	0.15	0.23	0.37	0.17	0.10	0.12	0.12	0.23	0.29	0.20	0.15	0.24	0.27	0.20
N1	0.20	0.45	0.14	0.14	0.16	0.19	0.15	0.22	0.24	0.17	0.38	0.70	0.30	0.12	0.15	0.17	0.19	0.28	0.26	0.24	0.29	0.30	0.26
N3	0.21	0.45	0.11	0.12	0.15	0.21	0.14	0.24	0.25	0.19	0.40	0.69	0.28	0.13	0.15	0.14	0.20	0.32	0.27	0.25	0.29	0.31	0.26
N6	0.17	0.22	0.13	0.13	0.10	0.16	0.10	0.16	0.14	0.11	0.19	0.29	0.16	0.09	0.11	0.17	0.19	0.22	0.20	0.14	0.25	0.26	0.20
N7	0.17	0.22	0.10	0.13	0.10	0.17	0.10	0.18	0.14	0.14	0.20	0.32	0.15	0.10	0.11	0.12	0.22	0.27	0.19	0.14	0.23	0.27	0.19
N9	0.19	0.33	0.10	0.12	0.11	0.20	0.11	0.22	0.19	0.17	0.30	0.50	0.22	0.11	0.13	0.13	0.22	0.32	0.23	0.19	0.26	0.28	0.23
O2'	0.23	0.38	0.13	0.15	0.16	0.22	0.16	0.25	0.25	0.21	0.37	0.57	0.25	0.16	0.17	0.14	0.25	0.35	0.24	0.26	0.26	0.29	0.24
O3'	0.11	0.34	0.20	0.25	0.20	0.14	0.24	0.16	0.31	0.14	0.36	0.42	0.24	0.19	0.14	0.18	0.40	0.18	0.15	0.34	0.17	0.19	0.14
O4'	0.20	0.35	0.10	0.12	0.14	0.22	0.14	0.24	0.22	0.20	0.33	0.52	0.24	0.14	0.15	0.12	0.22	0.34	0.23	0.22	0.27	0.27	0.23
O5'	0.59	0.91	0.77	0.79	0.76	0.61	0.76	0.64	0.83	0.61	0.90	1.00	0.83	0.68	0.65	0.74	0.92	0.50	0.61	0.84	0.65	0.65	0.63
OP1	0.36	0.49	0.46	0.50	0.41	0.42	0.42	0.45	0.46	0.38	0.50	0.55	0.44	0.39	0.37	0.43	0.63	0.39	0.45	0.48	0.54	0.36	0.45
OP2	0.67	0.69	0.72	0.74	0.67	0.67	0.68	0.67	0.69	0.66	0.70	0.71	0.68	0.67	0.67	0.70	0.86	0.69	0.66	0.69	0.73	0.61	0.66
P	0.45	0.67	0.60	0.64	0.55	0.49	0.56	0.52	0.61	0.46	0.66	0.74	0.61	0.50	0.48	0.58	0.79	0.41	0.51	0.61	0.58	0.47	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.02	0.19	0.16	0.12
C2	0.03	0.00	0.16	0.23	0.01	0.11	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.26	0.03	0.38	0.01	0.56	0.57	0.45
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.03	0.08	0.07	0.13	0.19	0.14	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.07	0.25	0.23	0.15
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.13	0.00	0.12	0.03	0.17	0.10	0.22	0.26	0.19	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.14	0.17	0.27	0.26	0.16
C4	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.13	0.01	0.33	0.01	0.43	0.43	0.35
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.11	0.07	0.12	0.12	0.09	0.08	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.12	0.12	0.15	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.02	0.36	0.01	0.47	0.51	0.41
C5'	0.04	0.21	0.03	0.03	0.18	0.01	0.21	0.00	0.24	0.16	0.24	0.21	0.17	0.20	0.14	0.04	0.04	0.02	0.01	0.26	0.10	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.19	0.02	0.41	0.01	0.57	0.61	0.49
C8	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.11	0.03	0.25	0.02	0.25	0.27	0.23
N1	0.03	0.01	0.13	0.22	0.01	0.12	0.01	0.24	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.24	0.03	0.42	0.01	0.61	0.63	0.50
N2	0.04	0.01	0.19	0.26	0.01	0.12	0.01	0.21	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.31	0.04	0.39	0.02	0.60	0.59	0.47
N3	0.03	0.00	0.14	0.19	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.20	0.03	0.33	0.01	0.47	0.47	0.37
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03	0.32	0.02	0.38	0.43	0.35
N9	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.25	0.01	0.30	0.28	0.24
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.09	0.15	0.11	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.07	0.05	0.19	0.23	0.10
O3'	0.02	0.26	0.02	0.01	0.13	0.01	0.13	0.04	0.19	0.11	0.24	0.31	0.20	0.10	0.05	0.05	0.00	0.01	0.17	0.20	0.32	0.37	0.21
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.13	0.02	0.12	0.14	0.12
O5'	0.14	0.38	0.12	0.14	0.33	0.02	0.36	0.01	0.41	0.25	0.42	0.39	0.33	0.32	0.25	0.07	0.17	0.13	0.00	0.42	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.12	0.01	0.26	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.20	0.02	0.42	0.00	0.60	0.66	0.53
OP1	0.19	0.56	0.25	0.27	0.43	0.12	0.47	0.10	0.57	0.25	0.61	0.60	0.47	0.38	0.30	0.19	0.32	0.12	0.02	0.60	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.57	0.23	0.26	0.43	0.15	0.51	0.10	0.61	0.27	0.63	0.59	0.47	0.43	0.28	0.23	0.37	0.14	0.02	0.66	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.45	0.15	0.16	0.35	0.04	0.41	0.01	0.49	0.23	0.50	0.47	0.37	0.35	0.24	0.10	0.21	0.12	0.01	0.53	0.00	0.01	0.00