Doublet Group distance statistics: 50129

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.012, 0.030, 0.047, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.010, 0.030, 0.051, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.020, 0.041, 0.061, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.041 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.016, 0.037, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.017, 0.046, 0.075, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.046 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.032, 0.071, 0.110, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.071 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.025, 0.071, 0.117, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.071 std_dev=0.046
C8	A	0, 0.032, 0.084, 0.135, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.084 std_dev=0.052
N6	A	0, 0.053, 0.108, 0.162, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.108 std_dev=0.055
C2'	A	0, 0.059, 0.232, 0.405, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.232 std_dev=0.173
O4'	A	0, 0.125, 0.303, 0.481, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.303 std_dev=0.178
O3'	A	0, 0.152, 0.334, 0.515, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.334 std_dev=0.181
C3'	A	0, 0.091, 0.279, 0.468, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.279 std_dev=0.188
C4'	A	0, 0.082, 0.348, 0.614, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.348 std_dev=0.266
O2'	A	0, 0.069, 0.349, 0.629, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.349 std_dev=0.280
O2'	B	0, 0.162, 0.459, 0.756, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.459 std_dev=0.297
P	B	0, 0.250, 0.633, 1.016, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.633 std_dev=0.383
O5'	A	0, 0.084, 0.532, 0.980, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.532 std_dev=0.448
N2	B	0, 0.212, 0.664, 1.117, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.664 std_dev=0.453
C2'	B	0, 0.127, 0.686, 1.246, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.686 std_dev=0.560
P	A	0, 0.084, 0.659, 1.235, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.659 std_dev=0.575
C5'	A	0, 0.100, 0.705, 1.311, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.705 std_dev=0.605
C2	B	0, 0.182, 0.801, 1.420, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.801 std_dev=0.619
N3	B	0, 0.149, 0.776, 1.403, 1.573 max_d=1.573 avg_d=0.776 std_dev=0.627
OP2	B	0, 0.384, 1.026, 1.668, 2.166 max_d=2.166 avg_d=1.026 std_dev=0.642
O5'	B	0, 0.300, 0.971, 1.642, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.971 std_dev=0.671
C1'	B	0, 0.127, 0.873, 1.620, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.873 std_dev=0.746
OP1	A	0, 0.132, 0.879, 1.627, 1.886 max_d=1.886 avg_d=0.879 std_dev=0.748
OP2	A	0, 0.086, 0.849, 1.612, 1.761 max_d=1.761 avg_d=0.849 std_dev=0.763
N1	B	0, 0.187, 0.992, 1.798, 1.988 max_d=1.988 avg_d=0.992 std_dev=0.806
C4	B	0, 0.113, 0.973, 1.832, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.973 std_dev=0.860
C3'	B	0, 0.131, 1.010, 1.889, 2.093 max_d=2.093 avg_d=1.010 std_dev=0.879
N9	B	0, 0.107, 1.027, 1.947, 2.165 max_d=2.165 avg_d=1.027 std_dev=0.920
C4'	B	0, 0.165, 1.091, 2.018, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.091 std_dev=0.926
O4'	B	0, 0.144, 1.087, 2.029, 2.247 max_d=2.247 avg_d=1.087 std_dev=0.943
O3'	B	0, 0.122, 1.085, 2.049, 2.267 max_d=2.267 avg_d=1.085 std_dev=0.964
C6	B	0, 0.167, 1.208, 2.250, 2.473 max_d=2.473 avg_d=1.208 std_dev=1.042
C5	B	0, 0.133, 1.201, 2.268, 2.503 max_d=2.503 avg_d=1.201 std_dev=1.068
C8	B	0, 0.150, 1.309, 2.468, 2.724 max_d=2.724 avg_d=1.309 std_dev=1.159
OP1	B	0, 0.140, 1.313, 2.486, 2.681 max_d=2.681 avg_d=1.313 std_dev=1.173
O6	B	0, 0.203, 1.396, 2.588, 2.813 max_d=2.813 avg_d=1.396 std_dev=1.192
N7	B	0, 0.156, 1.422, 2.687, 2.952 max_d=2.952 avg_d=1.422 std_dev=1.266
C5'	B	0, 0.218, 1.494, 2.769, 3.074 max_d=3.074 avg_d=1.494 std_dev=1.276

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.06	0.57	0.22
C2	0.04	0.00	0.17	0.07	0.02	0.12	0.01	0.36	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.19	0.08	0.09	0.23	0.33	0.63	0.25
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.03	0.06	0.01	0.09	0.06	0.14	0.17	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.31	0.31	0.22	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.05	0.06	0.03	0.06	0.03	0.02	0.01	0.04	0.45	0.49	0.07	0.28
C4	0.03	0.02	0.09	0.02	0.00	0.07	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.12	0.03	0.05	0.16	0.23	0.69	0.29
C4'	0.04	0.12	0.03	0.01	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.11	0.11	0.06	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.16	0.46	0.11
C5	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.05	0.00	0.20	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.11	0.03	0.03	0.14	0.29	0.73	0.33
C5'	0.02	0.36	0.01	0.01	0.22	0.01	0.20	0.00	0.26	0.06	0.33	0.32	0.25	0.13	0.10	0.05	0.04	0.01	0.01	0.26	0.47	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.03	0.01	0.07	0.01	0.26	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.14	0.04	0.05	0.16	0.36	0.72	0.33
C8	0.02	0.04	0.06	0.06	0.01	0.03	0.04	0.06	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.06	0.04	0.08	0.17	0.71	0.32
N1	0.04	0.01	0.14	0.05	0.01	0.11	0.02	0.33	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.18	0.07	0.07	0.20	0.38	0.66	0.29
N3	0.04	0.01	0.17	0.06	0.01	0.11	0.02	0.32	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.17	0.08	0.09	0.22	0.25	0.65	0.25
N6	0.04	0.02	0.09	0.03	0.02	0.06	0.04	0.25	0.01	0.09	0.02	0.02	0.00	0.09	0.05	0.14	0.04	0.03	0.16	0.39	0.73	0.35
N7	0.03	0.01	0.05	0.06	0.03	0.04	0.00	0.13	0.04	0.00	0.03	0.03	0.09	0.00	0.04	0.07	0.06	0.05	0.10	0.26	0.75	0.35
N9	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.04	0.00	0.05	0.02	0.01	0.11	0.14	0.67	0.28
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.12	0.05	0.11	0.05	0.14	0.05	0.18	0.17	0.14	0.07	0.05	0.00	0.03	0.03	0.16	0.26	0.28	0.08
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.07	0.08	0.04	0.06	0.02	0.03	0.00	0.02	0.40	0.65	0.12	0.37
O4'	0.00	0.09	0.02	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.09	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.10	0.66	0.29
O5'	0.08	0.23	0.31	0.45	0.16	0.02	0.14	0.01	0.16	0.08	0.20	0.22	0.16	0.10	0.11	0.16	0.40	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.33	0.31	0.49	0.23	0.16	0.29	0.26	0.36	0.17	0.38	0.25	0.39	0.26	0.14	0.26	0.65	0.10	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.57	0.63	0.22	0.07	0.69	0.46	0.73	0.47	0.72	0.71	0.66	0.65	0.73	0.75	0.67	0.28	0.12	0.66	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.22	0.25	0.11	0.28	0.29	0.11	0.33	0.02	0.33	0.32	0.29	0.25	0.35	0.35	0.28	0.08	0.37	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.40	0.34	0.23	0.15	0.35	0.30	0.35	0.24	0.35	0.38	0.35	0.35	0.34	0.37	0.37	0.23	0.05	0.41	0.45	0.34	0.79	0.18	0.33
C2	0.13	0.18	0.13	0.27	0.11	0.10	0.13	0.15	0.17	0.09	0.20	0.22	0.13	0.10	0.09	0.15	0.42	0.15	0.25	0.19	0.87	0.15	0.37
C2'	0.28	0.21	0.17	0.09	0.20	0.20	0.20	0.11	0.23	0.21	0.24	0.22	0.20	0.20	0.22	0.22	0.05	0.28	0.43	0.25	0.68	0.25	0.28
C3'	0.25	0.22	0.08	0.06	0.20	0.12	0.21	0.04	0.24	0.20	0.26	0.24	0.20	0.20	0.20	0.14	0.15	0.24	0.34	0.27	0.64	0.27	0.23
C4	0.25	0.18	0.09	0.06	0.15	0.16	0.15	0.11	0.16	0.18	0.19	0.22	0.16	0.15	0.19	0.16	0.15	0.27	0.34	0.17	0.84	0.09	0.34
C4'	0.41	0.40	0.17	0.06	0.40	0.24	0.43	0.18	0.44	0.43	0.43	0.40	0.39	0.44	0.41	0.17	0.12	0.42	0.40	0.45	0.77	0.19	0.32
C5	0.22	0.19	0.08	0.06	0.12	0.16	0.12	0.11	0.15	0.14	0.19	0.24	0.13	0.11	0.14	0.16	0.12	0.24	0.34	0.16	0.85	0.08	0.35
C5'	0.31	0.37	0.09	0.18	0.35	0.12	0.39	0.09	0.42	0.36	0.41	0.37	0.33	0.39	0.33	0.13	0.39	0.32	0.25	0.44	0.67	0.28	0.22
C6	0.12	0.24	0.13	0.22	0.16	0.09	0.17	0.10	0.21	0.11	0.25	0.27	0.19	0.13	0.11	0.14	0.31	0.14	0.26	0.22	0.89	0.12	0.37
C8	0.41	0.24	0.28	0.23	0.30	0.35	0.27	0.30	0.23	0.34	0.22	0.25	0.29	0.30	0.35	0.25	0.16	0.42	0.46	0.22	0.80	0.21	0.34
N1	0.11	0.22	0.19	0.32	0.16	0.13	0.18	0.18	0.21	0.12	0.24	0.24	0.18	0.15	0.12	0.16	0.46	0.12	0.23	0.23	0.89	0.19	0.39
N3	0.20	0.17	0.08	0.17	0.13	0.10	0.13	0.09	0.16	0.13	0.18	0.21	0.14	0.12	0.14	0.15	0.29	0.22	0.30	0.17	0.84	0.10	0.35
N6	0.11	0.30	0.20	0.26	0.23	0.10	0.24	0.11	0.27	0.16	0.31	0.32	0.27	0.19	0.17	0.15	0.33	0.11	0.24	0.28	0.92	0.16	0.39
N7	0.33	0.18	0.22	0.18	0.18	0.30	0.16	0.26	0.15	0.24	0.18	0.25	0.17	0.19	0.25	0.24	0.12	0.35	0.43	0.15	0.84	0.16	0.36
N9	0.35	0.24	0.19	0.11	0.27	0.26	0.25	0.21	0.23	0.30	0.24	0.26	0.26	0.27	0.30	0.21	0.02	0.37	0.42	0.23	0.81	0.16	0.33
O2'	0.40	0.30	0.34	0.30	0.32	0.36	0.30	0.28	0.29	0.33	0.30	0.29	0.33	0.31	0.34	0.34	0.28	0.39	0.58	0.29	0.73	0.22	0.36
O3'	0.26	0.21	0.12	0.05	0.20	0.14	0.21	0.05	0.23	0.20	0.24	0.22	0.21	0.20	0.21	0.17	0.09	0.25	0.38	0.26	0.61	0.29	0.25
O4'	0.42	0.40	0.19	0.09	0.40	0.28	0.42	0.24	0.42	0.43	0.42	0.39	0.38	0.44	0.41	0.19	0.08	0.44	0.41	0.43	0.84	0.15	0.34
O5'	0.43	0.38	0.24	0.14	0.39	0.31	0.40	0.26	0.40	0.42	0.40	0.38	0.38	0.41	0.40	0.26	0.07	0.44	0.48	0.41	1.00	0.16	0.48
OP1	0.15	0.31	0.24	0.36	0.23	0.21	0.29	0.23	0.35	0.22	0.37	0.34	0.23	0.27	0.20	0.32	0.57	0.15	0.13	0.40	0.57	0.32	0.15
OP2	0.53	0.53	0.72	0.85	0.54	0.66	0.52	0.71	0.51	0.53	0.52	0.54	0.55	0.52	0.54	0.72	1.01	0.51	0.47	0.50	0.22	0.63	0.37
P	0.13	0.22	0.28	0.39	0.17	0.22	0.18	0.25	0.21	0.16	0.24	0.26	0.19	0.17	0.16	0.32	0.56	0.13	0.11	0.23	0.57	0.34	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.01	0.16	0.83	0.32
C2	0.03	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.03	0.02	0.14	0.01	0.08	0.94	0.34
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.03	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.22	0.05	0.50	0.26	0.15
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.03	0.08	0.09	0.05	0.03	0.03	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.46	0.10	0.56	0.11	0.37
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.05	0.02	0.13	0.01	0.13	1.12	0.46
C4'	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.06	0.03	0.11	0.02	0.00	0.02	0.06	0.40	0.31	0.06
C5	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.10	0.03	0.18	0.01	0.35	1.37	0.63
C5'	0.01	0.06	0.01	0.03	0.06	0.01	0.09	0.00	0.10	0.08	0.09	0.06	0.05	0.10	0.05	0.10	0.03	0.01	0.01	0.11	0.16	0.39	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.18	0.00	0.37	1.35	0.61
C8	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.10	0.05	0.29	0.02	0.43	1.52	0.76
N1	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.07	0.02	0.16	0.01	0.21	1.14	0.47
N2	0.05	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.03	0.04	0.17	0.02	0.17	0.78	0.23
N3	0.03	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.03	0.03	0.12	0.02	0.11	0.89	0.30
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.12	0.05	0.25	0.02	0.55	1.62	0.80
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.17	0.01	0.13	1.15	0.50
O2'	0.01	0.13	0.00	0.03	0.07	0.11	0.06	0.10	0.08	0.02	0.12	0.15	0.12	0.02	0.03	0.00	0.07	0.07	0.24	0.08	0.80	0.11	0.33
O3'	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.10	0.03	0.11	0.10	0.07	0.03	0.03	0.12	0.05	0.07	0.00	0.02	0.74	0.14	0.93	0.74	0.82
O4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.37	0.04	0.08	0.93	0.44
O5'	0.16	0.14	0.22	0.46	0.13	0.02	0.18	0.01	0.18	0.29	0.16	0.17	0.12	0.25	0.17	0.24	0.74	0.37	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.14	0.04	0.20	0.00	0.52	1.47	0.70
OP1	0.16	0.08	0.50	0.56	0.13	0.40	0.35	0.16	0.37	0.43	0.21	0.17	0.11	0.55	0.13	0.80	0.93	0.08	0.02	0.52	0.00	0.01	0.00
OP2	0.83	0.94	0.26	0.11	1.12	0.31	1.37	0.39	1.35	1.52	1.14	0.78	0.89	1.62	1.15	0.11	0.74	0.93	0.02	1.47	0.01	0.00	0.01
P	0.32	0.34	0.15	0.37	0.46	0.06	0.63	0.01	0.61	0.76	0.47	0.23	0.30	0.80	0.50	0.33	0.82	0.44	0.01	0.70	0.00	0.01	0.00