Doublet Group distance statistics: 50131

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.005, 0.026, 0.048, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.010, 0.039, 0.069, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.039 std_dev=0.030
N1	A	0, 0.007, 0.042, 0.076, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.034
C4	A	0, 0.008, 0.045, 0.081, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.011, 0.052, 0.094, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.052 std_dev=0.041
C2	A	0, 0.015, 0.057, 0.100, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.057 std_dev=0.042
N9	A	0, 0.016, 0.061, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.061 std_dev=0.044
N3	A	0, 0.015, 0.061, 0.107, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.061 std_dev=0.046
C1'	A	0, 0.015, 0.065, 0.115, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.065 std_dev=0.050
N6	A	0, 0.022, 0.101, 0.180, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.101 std_dev=0.079
C2'	B	0, 0.092, 0.316, 0.540, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.316 std_dev=0.224
O2'	B	0, 0.133, 0.470, 0.808, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.470 std_dev=0.337
O4'	A	0, 0.223, 0.778, 1.332, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.778 std_dev=0.554
O3'	A	0, 0.251, 0.912, 1.574, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.912 std_dev=0.662
C4'	A	0, 0.262, 0.943, 1.624, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.943 std_dev=0.681
C3'	A	0, 0.272, 0.991, 1.710, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.991 std_dev=0.719
C2'	A	0, 0.300, 1.058, 1.817, 1.741 max_d=1.741 avg_d=1.058 std_dev=0.759
C3'	B	0, 0.343, 1.171, 1.999, 1.764 max_d=1.764 avg_d=1.171 std_dev=0.828
C5'	A	0, 0.428, 1.545, 2.663, 2.604 max_d=2.604 avg_d=1.545 std_dev=1.117
O2'	A	0, 0.501, 1.741, 2.981, 2.795 max_d=2.795 avg_d=1.741 std_dev=1.240
O5'	A	0, 0.561, 1.923, 3.286, 2.990 max_d=2.990 avg_d=1.923 std_dev=1.363
C1'	B	0, 0.574, 1.962, 3.350, 3.000 max_d=3.000 avg_d=1.962 std_dev=1.388
OP2	B	0, 0.593, 2.025, 3.457, 3.060 max_d=3.060 avg_d=2.025 std_dev=1.432
O5'	B	0, 0.674, 2.301, 3.928, 3.488 max_d=3.488 avg_d=2.301 std_dev=1.627
C4'	B	0, 0.688, 2.350, 4.012, 3.580 max_d=3.580 avg_d=2.350 std_dev=1.662
C8	B	0, 0.753, 2.574, 4.394, 3.901 max_d=3.901 avg_d=2.574 std_dev=1.820
O4'	B	0, 0.761, 2.602, 4.444, 3.989 max_d=3.989 avg_d=2.602 std_dev=1.841
OP1	A	0, 0.762, 2.630, 4.498, 4.159 max_d=4.159 avg_d=2.630 std_dev=1.868
O3'	B	0, 0.802, 2.740, 4.678, 4.146 max_d=4.146 avg_d=2.740 std_dev=1.938
N9	B	0, 0.812, 2.773, 4.733, 4.192 max_d=4.192 avg_d=2.773 std_dev=1.961
P	A	0, 0.941, 3.219, 5.497, 4.931 max_d=4.931 avg_d=3.219 std_dev=2.278
P	B	0, 0.964, 3.291, 5.618, 4.956 max_d=4.956 avg_d=3.291 std_dev=2.327
C5'	B	0, 0.976, 3.333, 5.691, 5.053 max_d=5.053 avg_d=3.333 std_dev=2.358
N7	B	0, 1.108, 3.782, 6.457, 5.696 max_d=5.696 avg_d=3.782 std_dev=2.675
C4	B	0, 1.264, 4.315, 7.366, 6.487 max_d=6.487 avg_d=4.315 std_dev=3.051
OP2	A	0, 1.264, 4.316, 7.367, 6.521 max_d=6.521 avg_d=4.316 std_dev=3.052
OP1	B	0, 1.440, 4.917, 8.393, 7.384 max_d=7.384 avg_d=4.917 std_dev=3.477
C5	B	0, 1.460, 4.984, 8.508, 7.480 max_d=7.480 avg_d=4.984 std_dev=3.524
N3	B	0, 1.486, 5.074, 8.661, 7.615 max_d=7.615 avg_d=5.074 std_dev=3.588
C2	B	0, 1.969, 6.721, 11.474, 10.090 max_d=10.090 avg_d=6.721 std_dev=4.753
C6	B	0, 1.979, 6.758, 11.537, 10.150 max_d=10.150 avg_d=6.758 std_dev=4.779
N1	B	0, 2.210, 7.546, 12.881, 11.344 max_d=11.344 avg_d=7.546 std_dev=5.336
O6	B	0, 2.236, 7.634, 13.031, 11.465 max_d=11.465 avg_d=7.634 std_dev=5.398
N2	B	0, 2.255, 7.698, 13.141, 11.563 max_d=11.563 avg_d=7.698 std_dev=5.443

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.03	0.05	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.15	0.01	0.30	0.20	0.46	0.36
C2	0.06	0.00	0.32	0.22	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.33	0.14	0.08	0.37	0.34	0.73	0.57
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.14	0.02	0.06	0.16	0.13	0.16	0.25	0.31	0.08	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.53	0.37	0.74	0.54
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.06	0.19	0.20	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.24	0.09	0.32	0.17
C4	0.02	0.01	0.14	0.11	0.00	0.02	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.05	0.46	0.38	0.82	0.65
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.07	0.05	0.07	0.06	0.07	0.02	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.08	0.05	0.59	0.52	1.08	0.86
C5'	0.08	0.11	0.16	0.00	0.15	0.00	0.21	0.00	0.20	0.24	0.15	0.09	0.26	0.26	0.15	0.04	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.13	0.12	0.01	0.03	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.08	0.06	0.58	0.54	1.10	0.87
C8	0.03	0.02	0.16	0.06	0.00	0.07	0.01	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.24	0.13	0.06	0.65	0.51	1.09	0.88
N1	0.05	0.01	0.25	0.19	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.22	0.12	0.07	0.48	0.45	0.93	0.73
N3	0.06	0.00	0.31	0.20	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.11	0.08	0.33	0.28	0.63	0.49
N6	0.00	0.01	0.08	0.08	0.01	0.06	0.02	0.26	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.06	0.07	0.08	0.66	0.65	1.27	1.01
N7	0.01	0.02	0.09	0.02	0.01	0.07	0.00	0.26	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.20	0.10	0.04	0.68	0.60	1.24	0.99
N9	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.11	0.01	0.48	0.36	0.79	0.63
O2'	0.02	0.33	0.00	0.01	0.09	0.12	0.06	0.04	0.08	0.24	0.22	0.32	0.06	0.20	0.08	0.00	0.05	0.07	0.37	0.28	0.64	0.40
O3'	0.15	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.08	0.15	0.08	0.13	0.12	0.11	0.07	0.10	0.11	0.05	0.00	0.11	0.04	0.17	0.09	0.18
O4'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.07	0.08	0.08	0.04	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.06	0.13	0.13
O5'	0.30	0.37	0.53	0.24	0.46	0.01	0.59	0.00	0.58	0.65	0.48	0.33	0.66	0.68	0.48	0.37	0.04	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.20	0.34	0.37	0.09	0.38	0.01	0.52	0.01	0.54	0.51	0.45	0.28	0.65	0.60	0.36	0.28	0.17	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.46	0.73	0.74	0.32	0.82	0.02	1.08	0.01	1.10	1.09	0.93	0.63	1.27	1.24	0.79	0.64	0.09	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.36	0.57	0.54	0.17	0.65	0.02	0.86	0.01	0.87	0.88	0.73	0.49	1.01	0.99	0.63	0.40	0.18	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.56	0.09	0.19	0.36	0.27	0.38	0.36	0.49	0.19	0.57	0.67	0.45	0.28	0.22	0.13	0.30	0.13	0.24	0.51	0.33	0.18	0.29
C2	0.31	1.60	0.08	0.33	1.01	0.50	1.04	0.69	1.34	0.50	1.58	1.92	1.29	0.75	0.61	0.16	0.66	0.10	0.44	1.37	0.81	0.33	0.56
C2'	0.11	0.48	0.10	0.14	0.29	0.30	0.31	0.41	0.41	0.14	0.49	0.57	0.37	0.22	0.16	0.10	0.16	0.22	0.26	0.44	0.33	0.20	0.32
C3'	0.19	0.20	0.14	0.21	0.11	0.36	0.12	0.44	0.17	0.13	0.21	0.27	0.14	0.10	0.12	0.18	0.20	0.31	0.32	0.19	0.34	0.27	0.37
C4	0.20	0.93	0.09	0.27	0.60	0.36	0.62	0.48	0.78	0.31	0.91	1.11	0.77	0.45	0.37	0.16	0.48	0.11	0.31	0.80	0.49	0.23	0.38
C4'	0.09	0.21	0.07	0.11	0.15	0.16	0.16	0.22	0.19	0.10	0.21	0.24	0.18	0.13	0.11	0.08	0.14	0.12	0.14	0.20	0.15	0.12	0.17
C5	0.23	0.85	0.08	0.26	0.57	0.31	0.57	0.42	0.70	0.31	0.81	0.98	0.73	0.42	0.38	0.14	0.49	0.09	0.27	0.70	0.42	0.20	0.32
C5'	0.18	0.06	0.16	0.16	0.13	0.17	0.13	0.15	0.09	0.18	0.05	0.01	0.10	0.15	0.17	0.17	0.19	0.21	0.18	0.09	0.27	0.19	0.18
C6	0.34	1.27	0.07	0.32	0.86	0.41	0.85	0.55	1.03	0.45	1.21	1.45	1.11	0.62	0.56	0.14	0.65	0.08	0.35	1.03	0.61	0.26	0.43
C8	0.11	0.24	0.09	0.16	0.19	0.16	0.20	0.21	0.22	0.13	0.24	0.27	0.22	0.16	0.15	0.11	0.23	0.09	0.14	0.23	0.14	0.12	0.16
N1	0.37	1.68	0.09	0.35	1.08	0.50	1.10	0.69	1.37	0.55	1.62	1.97	1.39	0.79	0.67	0.15	0.72	0.07	0.44	1.39	0.81	0.32	0.55
N3	0.25	1.28	0.09	0.30	0.80	0.44	0.84	0.60	1.07	0.40	1.27	1.53	1.03	0.60	0.48	0.16	0.56	0.13	0.38	1.11	0.66	0.29	0.48
N6	0.44	1.26	0.09	0.34	0.93	0.38	0.88	0.53	1.03	0.50	1.18	1.38	1.16	0.66	0.64	0.10	0.73	0.13	0.34	1.00	0.60	0.25	0.41
N7	0.15	0.34	0.09	0.18	0.26	0.17	0.26	0.22	0.30	0.17	0.33	0.38	0.31	0.21	0.20	0.11	0.31	0.09	0.15	0.30	0.18	0.12	0.17
N9	0.14	0.57	0.09	0.21	0.37	0.27	0.39	0.35	0.48	0.20	0.56	0.67	0.47	0.28	0.23	0.14	0.34	0.11	0.23	0.50	0.32	0.18	0.27
O2'	0.24	0.87	0.28	0.13	0.60	0.20	0.65	0.34	0.80	0.37	0.90	1.00	0.71	0.51	0.41	0.19	0.12	0.12	0.16	0.84	0.28	0.11	0.22
O3'	0.15	0.45	0.11	0.17	0.25	0.35	0.28	0.45	0.39	0.14	0.46	0.55	0.33	0.19	0.15	0.13	0.18	0.28	0.31	0.42	0.38	0.25	0.37
O4'	0.10	0.31	0.10	0.18	0.21	0.19	0.22	0.25	0.28	0.12	0.32	0.37	0.26	0.17	0.14	0.13	0.28	0.10	0.17	0.29	0.21	0.14	0.20
O5'	0.70	0.45	0.69	0.71	0.60	0.72	0.60	0.70	0.52	0.70	0.45	0.36	0.53	0.66	0.67	0.72	0.74	0.74	0.73	0.52	0.85	0.76	0.75
OP1	0.61	0.16	0.64	0.79	0.31	0.86	0.28	0.92	0.16	0.55	0.17	0.29	0.19	0.43	0.49	0.72	0.92	0.77	0.87	0.15	1.14	0.86	0.93
OP2	1.51	0.90	1.56	1.66	1.24	1.69	1.24	1.71	1.08	1.50	0.91	0.69	1.08	1.40	1.43	1.61	1.75	1.62	1.72	1.06	1.94	1.75	1.77
P	1.09	0.56	1.11	1.20	0.85	1.25	0.84	1.27	0.69	1.06	0.56	0.39	0.72	0.96	1.01	1.16	1.28	1.20	1.26	0.68	1.45	1.27	1.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.04	0.04
C2	0.02	0.00	0.15	0.15	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.03	0.04	0.00	0.05	0.05	0.04
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.00	0.07	0.05	0.12	0.18	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.15	0.06	0.05
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.06	0.12	0.18	0.13	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.18	0.08	0.08
C4	0.00	0.01	0.07	0.07	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.10	0.02	0.05	0.00	0.07	0.05	0.05
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.01
C5	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.08	0.06	0.05
C5'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.06	0.01	0.04	0.02	0.07	0.03	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.00	0.00
C6	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.06	0.00	0.08	0.06	0.05
C8	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.09	0.01	0.09	0.06	0.05
N1	0.02	0.00	0.12	0.12	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.18	0.02	0.04	0.00	0.06	0.05	0.04
N2	0.02	0.00	0.18	0.18	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.25	0.03	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06
N3	0.02	0.01	0.14	0.13	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.03	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05
N7	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.07	0.07
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.04	0.04
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.10	0.16	0.11	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.11	0.03	0.01
O3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.10	0.02	0.07	0.01	0.12	0.05	0.18	0.25	0.18	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.10	0.25	0.10	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.06	0.09	0.10
O5'	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.09	0.04	0.05	0.04	0.09	0.05	0.01	0.05	0.06	0.00	0.08	0.02	0.00	0.00
O6	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.02	0.08	0.00	0.10	0.08	0.07
OP1	0.06	0.05	0.15	0.18	0.07	0.06	0.08	0.02	0.08	0.09	0.06	0.05	0.05	0.10	0.07	0.11	0.25	0.06	0.02	0.10	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.05	0.06	0.08	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.03	0.10	0.09	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.04	0.05	0.08	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.05	0.04	0.06	0.05	0.07	0.04	0.01	0.12	0.10	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00