Doublet Group distance statistics: 50141

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 6, 5, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.031 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.027 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.016, 0.041, 0.066, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.041 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.016, 0.044, 0.072, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.044 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.020, 0.053, 0.085, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.053 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.050, 0.106, 0.162, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.106 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.044, 0.101, 0.158, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.101 std_dev=0.057
C3'	A	0, 0.048, 0.120, 0.193, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.120 std_dev=0.073
O2	B	0, 0.090, 0.176, 0.261, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.176 std_dev=0.085
N3	B	0, 0.137, 0.225, 0.314, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.225 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.055, 0.145, 0.234, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.145 std_dev=0.090
C2	B	0, 0.116, 0.209, 0.302, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.209 std_dev=0.093
C4	B	0, 0.184, 0.286, 0.388, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.286 std_dev=0.102
O3'	A	0, 0.115, 0.225, 0.336, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.225 std_dev=0.111
O4	B	0, 0.211, 0.322, 0.434, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.322 std_dev=0.112
C2'	B	0, 0.174, 0.286, 0.399, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.286 std_dev=0.112
O2'	A	0, 0.102, 0.214, 0.327, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.214 std_dev=0.113
N1	B	0, 0.148, 0.269, 0.390, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.269 std_dev=0.121
C5	B	0, 0.209, 0.334, 0.458, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.334 std_dev=0.125
C3'	B	0, 0.178, 0.305, 0.432, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.305 std_dev=0.127
C6	B	0, 0.184, 0.314, 0.445, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.314 std_dev=0.130
C1'	B	0, 0.155, 0.290, 0.425, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.290 std_dev=0.135
O3'	B	0, 0.123, 0.262, 0.402, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.262 std_dev=0.140
O4'	B	0, 0.172, 0.322, 0.472, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.322 std_dev=0.150
C4'	B	0, 0.194, 0.347, 0.500, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.347 std_dev=0.153
O2'	B	0, 0.141, 0.296, 0.450, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.296 std_dev=0.154
O5'	A	0, 0.124, 0.300, 0.476, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.300 std_dev=0.176
P	A	0, 0.199, 0.380, 0.561, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.380 std_dev=0.181
O5'	B	0, 0.279, 0.467, 0.656, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.467 std_dev=0.188
C5'	B	0, 0.262, 0.453, 0.645, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.453 std_dev=0.191
C5'	A	0, 0.076, 0.298, 0.520, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.298 std_dev=0.222
P	B	0, 0.357, 0.586, 0.815, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.586 std_dev=0.229
OP2	B	0, 0.390, 0.619, 0.849, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.619 std_dev=0.230
OP1	B	0, 0.445, 0.730, 1.016, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.730 std_dev=0.285
OP1	A	0, 0.372, 0.843, 1.313, 1.892 max_d=1.892 avg_d=0.843 std_dev=0.471
OP2	A	0, 0.239, 0.824, 1.408, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.824 std_dev=0.585

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.13	0.15	0.58	0.19
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.22	0.26	0.86	0.25
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.24	0.44	0.16
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.33	0.27	0.14
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02	0.20	0.20	0.83	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.05	0.04	0.07	0.09	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.14	0.16	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.07	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.02	0.21	0.24	0.88	0.27
C5'	0.07	0.16	0.05	0.04	0.18	0.01	0.23	0.00	0.22	0.26	0.19	0.14	0.24	0.27	0.18	0.05	0.07	0.02	0.01	0.29	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.07	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.03	0.22	0.24	0.92	0.27
C8	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.09	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.03	0.18	0.33	0.74	0.26
N1	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.03	0.22	0.25	0.91	0.26
N3	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.21	0.22	0.81	0.24
N6	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.07	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.05	0.03	0.23	0.26	0.92	0.29
N7	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.09	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.05	0.03	0.20	0.33	0.83	0.28
N9	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.17	0.21	0.73	0.23
O2'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.06	0.04	0.00	0.05	0.06	0.05	0.13	0.34	0.10
O3'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.07	0.04	0.04	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.05	0.00	0.03	0.09	0.31	0.16	0.09
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.13	0.12	0.48	0.17
O5'	0.13	0.22	0.07	0.04	0.20	0.01	0.21	0.01	0.22	0.18	0.22	0.21	0.23	0.20	0.17	0.05	0.09	0.13	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.15	0.26	0.24	0.33	0.20	0.14	0.24	0.29	0.24	0.33	0.25	0.22	0.26	0.33	0.21	0.13	0.31	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.58	0.86	0.44	0.27	0.83	0.16	0.88	0.15	0.92	0.74	0.91	0.81	0.92	0.83	0.73	0.34	0.16	0.48	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.19	0.25	0.16	0.14	0.25	0.05	0.27	0.02	0.27	0.26	0.26	0.24	0.29	0.28	0.23	0.10	0.09	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.06	0.09	0.09	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.07	0.05	0.08	0.10	0.08	0.09	0.08	0.09	0.14	0.13	0.11
C2	0.10	0.07	0.12	0.10	0.08	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.08	0.08	0.13	0.09	0.11	0.11	0.09	0.13	0.11	0.10
C2'	0.11	0.09	0.09	0.09	0.08	0.09	0.09	0.11	0.10	0.10	0.07	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10	0.11	0.16	0.14	0.13
C3'	0.08	0.08	0.08	0.08	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.07	0.10	0.08	0.07	0.08	0.07	0.09	0.15	0.14	0.12
C4	0.08	0.06	0.10	0.09	0.07	0.08	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.11	0.08	0.10	0.09	0.08	0.12	0.11	0.10
C4'	0.09	0.11	0.12	0.13	0.11	0.11	0.11	0.11	0.11	0.10	0.11	0.12	0.10	0.09	0.11	0.10	0.13	0.19	0.19	0.17
C5	0.08	0.06	0.11	0.09	0.08	0.08	0.07	0.08	0.07	0.07	0.07	0.07	0.11	0.08	0.11	0.09	0.08	0.12	0.11	0.09
C5'	0.24	0.28	0.28	0.29	0.28	0.29	0.28	0.28	0.28	0.27	0.29	0.29	0.24	0.25	0.26	0.28	0.29	0.31	0.32	0.31
C6	0.10	0.08	0.12	0.10	0.08	0.10	0.08	0.09	0.09	0.09	0.08	0.08	0.14	0.08	0.11	0.11	0.09	0.12	0.11	0.10
C8	0.09	0.06	0.09	0.09	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.05	0.08	0.10	0.09	0.10	0.08	0.08	0.13	0.12	0.10
N1	0.10	0.08	0.13	0.10	0.08	0.10	0.08	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09	0.14	0.09	0.11	0.12	0.09	0.13	0.11	0.10
N3	0.08	0.06	0.11	0.09	0.07	0.09	0.07	0.08	0.07	0.07	0.07	0.07	0.12	0.08	0.10	0.09	0.08	0.12	0.11	0.10
N6	0.11	0.09	0.13	0.10	0.09	0.10	0.09	0.10	0.10	0.10	0.09	0.09	0.16	0.08	0.11	0.12	0.10	0.13	0.11	0.10
N7	0.09	0.05	0.10	0.08	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.06	0.07	0.10	0.08	0.11	0.08	0.08	0.12	0.11	0.10
N9	0.08	0.05	0.10	0.09	0.07	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.05	0.07	0.10	0.08	0.10	0.08	0.08	0.13	0.12	0.10
O2'	0.13	0.12	0.10	0.10	0.11	0.11	0.11	0.13	0.12	0.12	0.11	0.13	0.10	0.10	0.11	0.13	0.12	0.17	0.15	0.14
O3'	0.09	0.07	0.07	0.08	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.08	0.07	0.07	0.07	0.09	0.15	0.14	0.12
O4'	0.11	0.07	0.10	0.10	0.08	0.09	0.09	0.10	0.09	0.08	0.06	0.08	0.10	0.10	0.10	0.09	0.11	0.16	0.14	0.13
O5'	0.22	0.20	0.20	0.20	0.14	0.21	0.17	0.20	0.19	0.21	0.16	0.21	0.19	0.20	0.12	0.21	0.20	0.24	0.23	0.22
OP1	0.50	0.47	0.46	0.43	0.57	0.48	0.62	0.51	0.60	0.53	0.49	0.39	0.43	0.38	0.60	0.51	0.57	0.60	0.66	0.63
OP2	0.74	0.72	0.68	0.64	0.51	0.62	0.48	0.52	0.57	0.69	0.64	0.78	0.81	0.73	0.46	0.66	0.47	0.38	0.35	0.40
P	0.32	0.29	0.28	0.27	0.26	0.29	0.28	0.27	0.31	0.31	0.27	0.29	0.31	0.28	0.25	0.31	0.28	0.29	0.29	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.01	0.07	0.08	0.10	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02	0.05	0.07	0.09	0.11	0.09
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.07	0.02	0.07	0.07	0.06	0.04	0.07	0.07	0.01	0.02	0.08	0.03	0.11	0.14	0.12	0.12
C3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.05	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.06	0.02	0.05	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.07	0.01	0.05	0.06	0.09	0.11	0.09
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.06	0.02	0.04	0.05	0.01	0.02	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.02	0.07	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.07	0.01	0.08	0.07	0.09	0.11	0.09
C5'	0.05	0.09	0.07	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.08	0.08	0.09	0.10	0.06	0.06	0.09	0.02	0.01	0.06	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.02	0.09	0.07	0.09	0.11	0.08
N1	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.03	0.07	0.09	0.11	0.09
N3	0.02	0.01	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.06	0.02	0.04	0.07	0.09	0.11	0.08
O2	0.04	0.01	0.07	0.04	0.03	0.06	0.03	0.10	0.02	0.02	0.02	0.00	0.11	0.05	0.03	0.10	0.09	0.10	0.11	0.09
O2'	0.03	0.08	0.01	0.02	0.10	0.02	0.08	0.06	0.07	0.04	0.10	0.11	0.00	0.03	0.11	0.03	0.12	0.16	0.14	0.14
O3'	0.05	0.05	0.02	0.01	0.07	0.04	0.07	0.06	0.07	0.05	0.06	0.05	0.03	0.00	0.07	0.05	0.04	0.08	0.07	0.04
O4	0.02	0.02	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.02	0.02	0.03	0.11	0.07	0.00	0.05	0.07	0.09	0.11	0.09
O4'	0.01	0.05	0.03	0.02	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.04	0.10	0.03	0.05	0.05	0.00	0.09	0.09	0.11	0.10
O5'	0.07	0.07	0.11	0.05	0.06	0.02	0.07	0.01	0.07	0.07	0.07	0.09	0.12	0.04	0.07	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.08	0.09	0.14	0.07	0.09	0.05	0.09	0.06	0.09	0.09	0.09	0.10	0.16	0.08	0.09	0.09	0.02	0.00	0.04	0.02
OP2	0.10	0.11	0.12	0.06	0.11	0.04	0.11	0.03	0.11	0.11	0.11	0.11	0.14	0.07	0.11	0.11	0.03	0.04	0.00	0.02
P	0.08	0.09	0.12	0.04	0.09	0.02	0.09	0.02	0.08	0.09	0.08	0.09	0.14	0.04	0.09	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00