Doublet Group distance statistics: 50149

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.019 std_dev=0.018
N1	A	0, -0.001, 0.020, 0.041, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.020 std_dev=0.021
C5	A	0, -0.005, 0.022, 0.050, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.022 std_dev=0.027
C4	A	0, -0.002, 0.029, 0.060, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.029 std_dev=0.031
N9	A	0, -0.002, 0.034, 0.069, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.034 std_dev=0.036
N6	A	0, -0.006, 0.046, 0.097, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.046 std_dev=0.052
N7	A	0, -0.014, 0.048, 0.109, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.048 std_dev=0.061
C8	A	0, -0.012, 0.059, 0.130, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.059 std_dev=0.071
O2'	A	0, 0.003, 0.149, 0.296, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.149 std_dev=0.147
C2'	A	0, -0.014, 0.133, 0.280, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.133 std_dev=0.147
O4'	A	0, 0.004, 0.161, 0.317, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.161 std_dev=0.156
O5'	A	0, 0.105, 0.329, 0.554, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.329 std_dev=0.225
C4'	A	0, 0.026, 0.267, 0.507, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.267 std_dev=0.240
C3'	A	0, 0.007, 0.249, 0.491, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.249 std_dev=0.242
OP1	A	0, 0.040, 0.294, 0.547, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.294 std_dev=0.254
C5'	A	0, 0.071, 0.388, 0.705, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.388 std_dev=0.317
C3'	B	0, -0.031, 0.323, 0.678, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.323 std_dev=0.354
O2'	B	0, 0.077, 0.447, 0.818, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.447 std_dev=0.370
O3'	A	0, -0.029, 0.363, 0.754, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.363 std_dev=0.392
P	A	0, 0.029, 0.431, 0.834, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.431 std_dev=0.403
C2'	B	0, -0.025, 0.469, 0.963, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.469 std_dev=0.494
OP1	B	0, -0.057, 0.492, 1.041, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.492 std_dev=0.549
C4'	B	0, -0.112, 0.521, 1.154, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.521 std_dev=0.633
P	B	0, -0.172, 0.476, 1.124, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.476 std_dev=0.648
C5'	B	0, -0.251, 0.658, 1.567, 2.225 max_d=2.225 avg_d=0.658 std_dev=0.909
O4'	B	0, -0.209, 0.733, 1.675, 2.350 max_d=2.350 avg_d=0.733 std_dev=0.942
O5'	B	0, -0.302, 0.650, 1.602, 2.295 max_d=2.295 avg_d=0.650 std_dev=0.952
OP2	B	0, -0.155, 0.826, 1.808, 2.502 max_d=2.502 avg_d=0.826 std_dev=0.981
O3'	B	0, -0.302, 0.709, 1.720, 2.455 max_d=2.455 avg_d=0.709 std_dev=1.011
C1'	B	0, -0.220, 0.797, 1.815, 2.543 max_d=2.543 avg_d=0.797 std_dev=1.017
OP2	A	0, -0.083, 1.025, 2.134, 2.894 max_d=2.894 avg_d=1.025 std_dev=1.109
C6	B	0, -0.390, 0.965, 2.319, 3.298 max_d=3.298 avg_d=0.965 std_dev=1.354
N1	B	0, -0.426, 1.059, 2.545, 3.622 max_d=3.622 avg_d=1.059 std_dev=1.486
C5	B	0, -0.603, 1.277, 3.156, 4.523 max_d=4.523 avg_d=1.277 std_dev=1.879
C2	B	0, -0.679, 1.480, 3.639, 5.210 max_d=5.210 avg_d=1.480 std_dev=2.159
O2	B	0, -0.695, 1.595, 3.884, 5.549 max_d=5.549 avg_d=1.595 std_dev=2.289
C4	B	0, -0.902, 1.727, 4.357, 6.275 max_d=6.275 avg_d=1.727 std_dev=2.629
N3	B	0, -0.907, 1.796, 4.499, 6.470 max_d=6.470 avg_d=1.796 std_dev=2.703
O4	B	0, -1.126, 2.059, 5.244, 7.570 max_d=7.570 avg_d=2.059 std_dev=3.185

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.16	0.12
C2	0.01	0.00	0.14	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.19	0.06	0.02	0.09	0.37	0.16
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.02	0.09	0.05	0.12	0.13	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.23	0.37	0.17
C3'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.03	0.11	0.05	0.14	0.13	0.10	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.31	0.54	0.28
C4	0.00	0.00	0.08	0.09	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.04	0.03	0.09	0.38	0.17
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.15	0.17	0.03
C5	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.04	0.04	0.14	0.54	0.19
C5'	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.04	0.02	0.07	0.08	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.12	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.05	0.03	0.16	0.57	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.07	0.12	0.51	0.19
N1	0.01	0.00	0.12	0.14	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.06	0.02	0.13	0.48	0.18
N3	0.01	0.00	0.13	0.13	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.15	0.05	0.02	0.06	0.30	0.15
N6	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.06	0.04	0.20	0.67	0.21
N7	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.06	0.17	0.64	0.21
N9	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.33	0.16
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.01	0.06	0.04	0.09	0.10	0.06	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.23	0.39	0.14
O3'	0.02	0.19	0.01	0.01	0.10	0.02	0.09	0.02	0.14	0.06	0.18	0.15	0.13	0.04	0.03	0.03	0.00	0.02	0.10	0.46	0.82	0.42
O4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.05	0.28	0.24
O5'	0.04	0.02	0.08	0.09	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.07	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04	0.06	0.10	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.04	0.09	0.23	0.31	0.09	0.15	0.14	0.13	0.16	0.12	0.13	0.06	0.20	0.17	0.06	0.23	0.46	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.37	0.37	0.54	0.38	0.17	0.54	0.12	0.57	0.51	0.48	0.30	0.67	0.64	0.33	0.39	0.82	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.16	0.17	0.28	0.17	0.03	0.19	0.01	0.20	0.19	0.18	0.15	0.21	0.21	0.16	0.14	0.42	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.20	0.23	0.21	0.19	0.29	0.22	0.29	0.24	0.24	0.18	0.20	0.27	0.12	0.18	0.30	0.36	0.07	0.68	0.39
C2	0.49	0.27	0.16	0.04	0.17	0.43	0.23	0.39	0.32	0.35	0.18	0.28	0.31	0.31	0.12	0.63	0.63	0.11	0.68	0.54
C2'	0.37	0.38	0.28	0.22	0.37	0.29	0.35	0.27	0.35	0.37	0.38	0.40	0.30	0.06	0.37	0.36	0.43	0.09	0.77	0.47
C3'	0.31	0.42	0.28	0.21	0.43	0.21	0.38	0.18	0.35	0.36	0.45	0.44	0.26	0.09	0.46	0.26	0.32	0.07	0.76	0.41
C4	0.42	0.32	0.24	0.15	0.27	0.34	0.29	0.31	0.33	0.35	0.28	0.33	0.33	0.08	0.24	0.46	0.46	0.08	0.72	0.46
C4'	0.12	0.15	0.16	0.17	0.17	0.14	0.16	0.15	0.15	0.14	0.16	0.14	0.15	0.13	0.18	0.11	0.17	0.10	0.60	0.27
C5	0.46	0.42	0.27	0.14	0.37	0.31	0.37	0.26	0.39	0.42	0.39	0.44	0.34	0.13	0.36	0.47	0.43	0.07	0.75	0.45
C5'	0.03	0.10	0.09	0.11	0.16	0.05	0.11	0.05	0.07	0.05	0.15	0.10	0.04	0.11	0.20	0.09	0.04	0.19	0.51	0.13
C6	0.54	0.42	0.21	0.04	0.35	0.35	0.36	0.28	0.41	0.45	0.37	0.44	0.32	0.37	0.32	0.60	0.52	0.08	0.74	0.50
C8	0.33	0.41	0.32	0.25	0.42	0.22	0.38	0.21	0.36	0.37	0.43	0.43	0.29	0.13	0.44	0.26	0.28	0.06	0.74	0.36
N1	0.54	0.33	0.15	0.04	0.24	0.41	0.28	0.35	0.36	0.40	0.26	0.35	0.30	0.44	0.19	0.67	0.63	0.10	0.70	0.54
N3	0.44	0.25	0.19	0.10	0.18	0.40	0.23	0.37	0.30	0.32	0.19	0.26	0.32	0.16	0.14	0.54	0.55	0.10	0.69	0.50
N6	0.61	0.51	0.20	0.06	0.43	0.30	0.43	0.21	0.46	0.52	0.47	0.54	0.27	0.56	0.41	0.64	0.49	0.08	0.76	0.48
N7	0.40	0.51	0.34	0.22	0.49	0.22	0.44	0.18	0.42	0.45	0.51	0.53	0.32	0.04	0.50	0.32	0.30	0.06	0.76	0.38
N9	0.34	0.31	0.26	0.21	0.29	0.29	0.29	0.27	0.31	0.32	0.29	0.31	0.30	0.07	0.28	0.34	0.37	0.07	0.71	0.41
O2'	0.36	0.29	0.26	0.22	0.26	0.34	0.28	0.33	0.31	0.32	0.26	0.29	0.31	0.09	0.24	0.39	0.47	0.10	0.75	0.48
O3'	0.33	0.46	0.29	0.21	0.48	0.21	0.41	0.18	0.37	0.39	0.50	0.49	0.26	0.08	0.51	0.27	0.35	0.08	0.80	0.44
O4'	0.12	0.07	0.15	0.19	0.08	0.19	0.10	0.21	0.11	0.10	0.07	0.07	0.17	0.17	0.08	0.14	0.20	0.08	0.57	0.27
O5'	0.11	0.35	0.21	0.17	0.43	0.02	0.32	0.02	0.23	0.24	0.44	0.37	0.10	0.13	0.50	0.06	0.03	0.15	0.62	0.18
OP1	0.34	0.76	0.58	0.58	0.93	0.25	0.76	0.26	0.60	0.58	0.93	0.76	0.37	0.58	1.05	0.15	0.23	0.19	0.97	0.45
OP2	1.20	1.75	1.40	1.30	1.86	0.92	1.66	0.89	1.48	1.49	1.91	1.80	1.13	1.19	1.98	0.90	0.95	0.80	1.74	1.15
P	0.40	0.80	0.63	0.61	0.93	0.28	0.77	0.28	0.63	0.62	0.94	0.81	0.43	0.61	1.03	0.19	0.28	0.19	0.99	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.13	0.02	0.59	0.17
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.01	0.38	0.07	0.42	0.04
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.07	0.00	0.04	0.03	0.00	0.23	0.22	0.39	0.01
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.06	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.31	0.34	0.26	0.14
C4	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.01	0.56	0.07	0.20	0.13
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.12	0.48	0.10
C5	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.56	0.04	0.24	0.12
C5'	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.05	0.04	0.00	0.01	0.15	0.39	0.02
C6	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.47	0.02	0.43	0.02
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.00	0.34	0.03	0.49	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.01	0.48	0.08	0.30	0.06
O2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.01	0.01	0.30	0.08	0.44	0.07
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.06	0.02	0.02	0.06	0.19	0.45	0.08
O3'	0.03	0.08	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.08	0.11	0.06	0.00	0.06	0.02	0.24	0.45	0.16	0.20
O4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.59	0.09	0.11	0.18
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.10	0.70	0.30
O5'	0.13	0.38	0.23	0.31	0.56	0.01	0.56	0.01	0.47	0.34	0.48	0.30	0.06	0.24	0.59	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.07	0.22	0.34	0.07	0.12	0.04	0.15	0.02	0.03	0.08	0.08	0.19	0.45	0.09	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.59	0.42	0.39	0.26	0.20	0.48	0.24	0.39	0.43	0.49	0.30	0.44	0.45	0.16	0.11	0.70	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.17	0.04	0.01	0.14	0.13	0.10	0.12	0.02	0.02	0.06	0.06	0.07	0.08	0.20	0.18	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00