Doublet Group distance statistics: 50160

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 7, 8, 7, 5, 4, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.037, 0.050, 0.063, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.050 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.020, 0.033, 0.046, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.033 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.038, 0.053, 0.067, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.053 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.033 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.014, 0.034, 0.053, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.034 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.050, 0.071, 0.092, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.071 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.063, 0.085, 0.106, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.085 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.020, 0.044, 0.068, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.044 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.039, 0.064, 0.089, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.064 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.026, 0.058, 0.091, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.058 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.074, 0.169, 0.263, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.169 std_dev=0.095
C2'	A	0, 0.117, 0.233, 0.349, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.233 std_dev=0.116
C4'	A	0, 0.119, 0.250, 0.382, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.250 std_dev=0.132
C3'	A	0, 0.111, 0.268, 0.425, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.268 std_dev=0.157
C2'	B	0, 0.217, 0.386, 0.555, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.386 std_dev=0.169
C1'	B	0, 0.352, 0.570, 0.787, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.570 std_dev=0.218
O2'	B	0, 0.218, 0.459, 0.699, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.459 std_dev=0.240
C3'	B	0, 0.267, 0.510, 0.753, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.510 std_dev=0.243
C5'	A	0, 0.215, 0.470, 0.725, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.470 std_dev=0.255
N9	B	0, 0.373, 0.635, 0.898, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.635 std_dev=0.263
C4'	B	0, 0.316, 0.585, 0.853, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.585 std_dev=0.268
O4'	B	0, 0.388, 0.687, 0.987, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.687 std_dev=0.300
O2'	A	0, 0.206, 0.506, 0.806, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.506 std_dev=0.300
O3'	A	0, 0.112, 0.412, 0.713, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.412 std_dev=0.301
N3	B	0, 0.299, 0.603, 0.907, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.603 std_dev=0.304
C4	B	0, 0.264, 0.588, 0.912, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.588 std_dev=0.324
O3'	B	0, 0.236, 0.602, 0.968, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.602 std_dev=0.366
C8	B	0, 0.471, 0.837, 1.204, 1.969 max_d=1.969 avg_d=0.837 std_dev=0.366
C5	B	0, 0.342, 0.744, 1.145, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.744 std_dev=0.402
O5'	A	0, 0.171, 0.582, 0.993, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.582 std_dev=0.411
C2	B	0, 0.267, 0.679, 1.091, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.679 std_dev=0.412
C5'	B	0, 0.384, 0.822, 1.260, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.822 std_dev=0.438
N7	B	0, 0.480, 0.919, 1.358, 2.277 max_d=2.277 avg_d=0.919 std_dev=0.439
N2	B	0, 0.368, 0.856, 1.343, 2.253 max_d=2.253 avg_d=0.856 std_dev=0.487
C6	B	0, 0.284, 0.774, 1.264, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.774 std_dev=0.490
N1	B	0, 0.202, 0.694, 1.187, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.694 std_dev=0.492
O5'	B	0, 0.496, 1.027, 1.558, 2.771 max_d=2.771 avg_d=1.027 std_dev=0.531
P	A	0, 0.215, 0.772, 1.329, 2.491 max_d=2.491 avg_d=0.772 std_dev=0.557
O6	B	0, 0.376, 0.948, 1.520, 2.235 max_d=2.235 avg_d=0.948 std_dev=0.572
OP2	A	0, 0.180, 0.943, 1.707, 3.704 max_d=3.704 avg_d=0.943 std_dev=0.763
P	B	0, 0.630, 1.408, 2.186, 3.708 max_d=3.708 avg_d=1.408 std_dev=0.778
OP1	A	0, 0.189, 1.062, 1.934, 4.269 max_d=4.269 avg_d=1.062 std_dev=0.872
OP2	B	0, 0.662, 1.610, 2.558, 4.643 max_d=4.643 avg_d=1.610 std_dev=0.948
OP1	B	0, 0.482, 1.675, 2.867, 5.561 max_d=5.561 avg_d=1.675 std_dev=1.192

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.11	0.03	0.16	0.19	0.09
C2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.16	0.03	0.24	0.02	0.22	0.48	0.26
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.02	0.07	0.08	0.09	0.06	0.10	0.12	0.10	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.14	0.09	0.17	0.17	0.11
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.13	0.14	0.13	0.14	0.11	0.14	0.08	0.02	0.01	0.01	0.23	0.14	0.24	0.18	0.17
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.09	0.02	0.24	0.02	0.20	0.44	0.24
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.06	0.06	0.04	0.08	0.04	0.12	0.03	0.00	0.02	0.08	0.19	0.09	0.07
C5	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.13	0.03	0.29	0.01	0.28	0.56	0.32
C5'	0.05	0.15	0.08	0.02	0.14	0.01	0.17	0.00	0.18	0.16	0.17	0.14	0.12	0.18	0.12	0.06	0.08	0.02	0.01	0.19	0.14	0.17	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.22	0.15	0.03	0.30	0.01	0.31	0.62	0.35
C8	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.13	0.04	0.27	0.02	0.23	0.45	0.27
N1	0.03	0.01	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.15	0.03	0.28	0.01	0.27	0.57	0.32
N2	0.03	0.01	0.12	0.14	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.20	0.03	0.23	0.02	0.21	0.46	0.24
N3	0.03	0.00	0.10	0.11	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.14	0.03	0.21	0.02	0.19	0.41	0.21
N7	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.15	0.04	0.30	0.01	0.31	0.58	0.34
N9	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.02	0.20	0.02	0.17	0.35	0.19
O2'	0.02	0.27	0.01	0.02	0.18	0.12	0.18	0.06	0.22	0.07	0.25	0.28	0.24	0.12	0.09	0.00	0.06	0.08	0.14	0.22	0.15	0.13	0.11
O3'	0.06	0.16	0.03	0.01	0.09	0.03	0.13	0.08	0.15	0.13	0.15	0.20	0.14	0.15	0.06	0.06	0.00	0.05	0.26	0.17	0.33	0.21	0.22
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.08	0.05	0.00	0.10	0.04	0.22	0.12	0.12
O5'	0.11	0.24	0.14	0.23	0.24	0.02	0.29	0.01	0.30	0.27	0.28	0.23	0.21	0.30	0.20	0.14	0.26	0.10	0.00	0.32	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.09	0.14	0.02	0.08	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.22	0.17	0.04	0.32	0.00	0.36	0.68	0.40
OP1	0.16	0.22	0.17	0.24	0.20	0.19	0.28	0.14	0.31	0.23	0.27	0.21	0.19	0.31	0.17	0.15	0.33	0.22	0.02	0.36	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.48	0.17	0.18	0.44	0.09	0.56	0.17	0.62	0.45	0.57	0.46	0.41	0.58	0.35	0.13	0.21	0.12	0.02	0.68	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.26	0.11	0.17	0.24	0.07	0.32	0.01	0.35	0.27	0.32	0.24	0.21	0.34	0.19	0.11	0.22	0.12	0.01	0.40	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.47	0.19	0.21	0.29	0.19	0.30	0.21	0.36	0.23	0.44	0.57	0.39	0.26	0.22	0.26	0.19	0.20	0.37	0.36	0.44	0.60	0.41
C2	0.20	0.32	0.18	0.28	0.28	0.24	0.39	0.33	0.46	0.35	0.41	0.38	0.25	0.41	0.27	0.23	0.26	0.24	0.51	0.54	0.68	0.81	0.59
C2'	0.18	0.47	0.16	0.18	0.27	0.16	0.28	0.19	0.36	0.23	0.44	0.61	0.37	0.26	0.20	0.26	0.18	0.17	0.40	0.37	0.49	0.68	0.48
C3'	0.17	0.40	0.17	0.20	0.21	0.20	0.21	0.19	0.26	0.23	0.35	0.54	0.32	0.23	0.17	0.26	0.22	0.17	0.39	0.27	0.51	0.63	0.46
C4	0.20	0.33	0.18	0.27	0.27	0.24	0.34	0.32	0.38	0.31	0.37	0.39	0.26	0.35	0.25	0.24	0.26	0.23	0.48	0.41	0.61	0.74	0.54
C4'	0.15	0.40	0.13	0.14	0.21	0.14	0.19	0.12	0.25	0.15	0.34	0.52	0.34	0.15	0.14	0.23	0.14	0.14	0.31	0.24	0.41	0.58	0.38
C5	0.21	0.20	0.18	0.31	0.22	0.28	0.31	0.37	0.29	0.34	0.22	0.30	0.16	0.37	0.26	0.22	0.31	0.26	0.54	0.33	0.70	0.82	0.61
C5'	0.17	0.35	0.16	0.14	0.18	0.19	0.17	0.14	0.22	0.18	0.29	0.45	0.30	0.18	0.14	0.25	0.20	0.17	0.31	0.23	0.44	0.59	0.39
C6	0.22	0.21	0.18	0.33	0.23	0.30	0.33	0.41	0.31	0.37	0.21	0.34	0.17	0.42	0.27	0.21	0.33	0.28	0.58	0.39	0.79	0.90	0.67
C8	0.20	0.24	0.18	0.29	0.20	0.25	0.22	0.32	0.22	0.27	0.23	0.29	0.20	0.26	0.22	0.23	0.28	0.23	0.48	0.23	0.56	0.68	0.52
N1	0.21	0.23	0.18	0.31	0.25	0.28	0.36	0.38	0.40	0.37	0.29	0.33	0.19	0.43	0.27	0.22	0.30	0.26	0.56	0.49	0.76	0.88	0.65
N2	0.20	0.34	0.18	0.27	0.30	0.23	0.41	0.32	0.49	0.35	0.45	0.40	0.26	0.43	0.27	0.24	0.25	0.23	0.50	0.59	0.68	0.82	0.58
N3	0.20	0.39	0.18	0.26	0.30	0.22	0.38	0.30	0.45	0.32	0.46	0.46	0.29	0.38	0.26	0.24	0.24	0.22	0.47	0.50	0.60	0.75	0.53
N7	0.21	0.18	0.18	0.33	0.18	0.29	0.24	0.39	0.20	0.32	0.19	0.27	0.13	0.32	0.25	0.20	0.33	0.28	0.55	0.23	0.68	0.79	0.61
N9	0.19	0.37	0.18	0.25	0.26	0.22	0.29	0.28	0.32	0.26	0.36	0.43	0.30	0.29	0.23	0.25	0.24	0.21	0.44	0.33	0.53	0.67	0.48
O2'	0.21	0.55	0.19	0.20	0.32	0.19	0.33	0.16	0.43	0.22	0.53	0.71	0.43	0.27	0.23	0.24	0.21	0.20	0.35	0.45	0.43	0.62	0.41
O3'	0.16	0.43	0.16	0.21	0.21	0.21	0.21	0.21	0.27	0.22	0.37	0.60	0.34	0.23	0.16	0.26	0.23	0.17	0.40	0.29	0.56	0.63	0.48
O4'	0.18	0.42	0.17	0.19	0.25	0.17	0.23	0.18	0.28	0.17	0.36	0.51	0.36	0.18	0.18	0.25	0.19	0.18	0.32	0.27	0.39	0.54	0.36
O5'	0.19	0.35	0.20	0.11	0.22	0.12	0.24	0.13	0.28	0.24	0.32	0.43	0.31	0.27	0.18	0.36	0.04	0.16	0.37	0.31	0.51	0.62	0.46
O6	0.23	0.28	0.18	0.35	0.23	0.33	0.31	0.45	0.28	0.39	0.28	0.40	0.21	0.43	0.28	0.20	0.36	0.32	0.63	0.35	0.88	0.97	0.74
OP1	0.38	0.34	0.27	0.16	0.28	0.36	0.28	0.33	0.28	0.36	0.29	0.43	0.34	0.35	0.30	0.42	0.02	0.43	0.37	0.31	0.56	0.44	0.41
OP2	0.17	0.42	0.18	0.16	0.40	0.12	0.53	0.25	0.57	0.52	0.50	0.41	0.35	0.60	0.36	0.22	0.03	0.12	0.49	0.64	0.75	0.70	0.61
P	0.12	0.25	0.12	0.04	0.16	0.15	0.23	0.17	0.26	0.27	0.25	0.32	0.21	0.31	0.14	0.27	0.03	0.14	0.32	0.31	0.54	0.49	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.14	0.01	0.25	0.20	0.12
C2	0.02	0.00	0.15	0.14	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.18	0.04	0.26	0.01	0.41	0.51	0.28
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.02	0.06	0.08	0.08	0.09	0.11	0.18	0.15	0.08	0.03	0.00	0.04	0.01	0.21	0.07	0.24	0.33	0.20
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.10	0.01	0.12	0.04	0.12	0.18	0.13	0.18	0.13	0.17	0.09	0.02	0.01	0.02	0.24	0.14	0.29	0.31	0.22
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.09	0.03	0.26	0.01	0.41	0.47	0.27
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.11	0.05	0.07	0.05	0.11	0.05	0.15	0.04	0.00	0.02	0.08	0.21	0.14	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.12	0.03	0.31	0.01	0.52	0.60	0.35
C5'	0.07	0.16	0.08	0.04	0.18	0.01	0.24	0.00	0.24	0.26	0.20	0.14	0.13	0.28	0.17	0.09	0.10	0.02	0.01	0.27	0.23	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.14	0.03	0.33	0.00	0.55	0.66	0.38
C8	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.11	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.19	0.05	0.31	0.01	0.49	0.52	0.32
N1	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.15	0.03	0.30	0.01	0.49	0.60	0.34
N2	0.03	0.00	0.18	0.18	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.24	0.05	0.25	0.01	0.39	0.49	0.26
N3	0.02	0.00	0.15	0.13	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.17	0.03	0.24	0.01	0.36	0.43	0.24
N7	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.11	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.19	0.05	0.34	0.01	0.59	0.65	0.39
N9	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.07	0.02	0.24	0.01	0.37	0.38	0.23
O2'	0.02	0.25	0.00	0.02	0.16	0.15	0.16	0.09	0.19	0.09	0.23	0.28	0.23	0.12	0.08	0.00	0.07	0.08	0.18	0.19	0.26	0.29	0.17
O3'	0.05	0.18	0.04	0.01	0.09	0.04	0.12	0.10	0.14	0.19	0.15	0.24	0.17	0.19	0.07	0.07	0.00	0.04	0.23	0.16	0.39	0.33	0.25
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.08	0.04	0.00	0.15	0.04	0.24	0.16	0.15
O5'	0.14	0.26	0.21	0.24	0.26	0.02	0.31	0.01	0.33	0.31	0.30	0.25	0.24	0.34	0.24	0.18	0.23	0.15	0.00	0.35	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.08	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.16	0.04	0.35	0.00	0.62	0.73	0.42
OP1	0.25	0.41	0.24	0.29	0.41	0.21	0.52	0.23	0.55	0.49	0.49	0.39	0.36	0.59	0.37	0.26	0.39	0.24	0.02	0.62	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.51	0.33	0.31	0.47	0.14	0.60	0.23	0.66	0.52	0.60	0.49	0.43	0.65	0.38	0.29	0.33	0.16	0.02	0.73	0.02	0.00	0.00
P	0.12	0.28	0.20	0.22	0.27	0.06	0.35	0.01	0.38	0.32	0.34	0.26	0.24	0.39	0.23	0.17	0.25	0.15	0.01	0.42	0.01	0.00	0.00