Doublet Group distance statistics: 50166

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 4, 5, 2, 2, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.021, 0.029, 0.038, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.029 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.028, 0.040, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.040 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.015, 0.028, 0.040, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.023, 0.039, 0.056, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.039 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.030, 0.047, 0.065, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.047 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.030, 0.049, 0.069, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.049 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.034, 0.054, 0.075, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.054 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.037, 0.058, 0.079, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.058 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.029, 0.051, 0.072, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.051 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.035, 0.061, 0.087, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.061 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.054, 0.081, 0.109, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.081 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.055, 0.100, 0.145, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.100 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.095, 0.261, 0.428, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.261 std_dev=0.166
O2'	A	0, 0.136, 0.323, 0.510, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.323 std_dev=0.187
N9	B	0, 0.427, 0.624, 0.820, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.624 std_dev=0.196
C2'	A	0, 0.086, 0.294, 0.502, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.294 std_dev=0.208
C1'	B	0, 0.353, 0.570, 0.787, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.570 std_dev=0.217
C3'	B	0, 0.318, 0.572, 0.826, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.572 std_dev=0.254
C2'	B	0, 0.229, 0.501, 0.774, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.501 std_dev=0.272
P	A	0, 0.290, 0.575, 0.860, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.575 std_dev=0.285
O5'	A	0, 0.237, 0.528, 0.820, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.528 std_dev=0.291
C4'	A	0, 0.118, 0.436, 0.754, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.436 std_dev=0.318
O3'	B	0, 0.287, 0.608, 0.929, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.608 std_dev=0.321
C8	B	0, 0.508, 0.835, 1.162, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.835 std_dev=0.327
OP2	A	0, 0.437, 0.768, 1.100, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.768 std_dev=0.331
O2'	B	0, 0.284, 0.627, 0.969, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.627 std_dev=0.343
O4'	B	0, 0.456, 0.800, 1.144, 1.711 max_d=1.711 avg_d=0.800 std_dev=0.344
C4'	B	0, 0.404, 0.749, 1.094, 1.912 max_d=1.912 avg_d=0.749 std_dev=0.345
C3'	A	0, 0.129, 0.476, 0.823, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.476 std_dev=0.347
C4	B	0, 0.393, 0.749, 1.105, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.749 std_dev=0.356
OP1	A	0, 0.473, 0.890, 1.308, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.890 std_dev=0.417
N7	B	0, 0.576, 1.034, 1.492, 1.736 max_d=1.736 avg_d=1.034 std_dev=0.458
C5	B	0, 0.486, 0.971, 1.456, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.971 std_dev=0.485
O3'	A	0, 0.247, 0.739, 1.231, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.739 std_dev=0.492
C5'	B	0, 0.472, 0.968, 1.465, 2.441 max_d=2.441 avg_d=0.968 std_dev=0.496
N3	B	0, 0.343, 0.842, 1.342, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.842 std_dev=0.500
C5'	A	0, 0.148, 0.651, 1.153, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.651 std_dev=0.502
O5'	B	0, 0.430, 1.111, 1.792, 3.235 max_d=3.235 avg_d=1.111 std_dev=0.681
C2	B	0, 0.414, 1.106, 1.798, 2.182 max_d=2.182 avg_d=1.106 std_dev=0.692
C6	B	0, 0.497, 1.214, 1.930, 2.376 max_d=2.376 avg_d=1.214 std_dev=0.716
P	B	0, 0.785, 1.545, 2.306, 3.479 max_d=3.479 avg_d=1.545 std_dev=0.760
N1	B	0, 0.459, 1.245, 2.031, 2.485 max_d=2.485 avg_d=1.245 std_dev=0.786
OP1	B	0, 1.206, 2.015, 2.824, 3.821 max_d=3.821 avg_d=2.015 std_dev=0.809
N2	B	0, 0.504, 1.355, 2.205, 2.591 max_d=2.591 avg_d=1.355 std_dev=0.851
O6	B	0, 0.589, 1.460, 2.330, 2.821 max_d=2.821 avg_d=1.460 std_dev=0.871
OP2	B	0, 0.970, 1.856, 2.742, 3.517 max_d=3.517 avg_d=1.856 std_dev=0.886

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.15	0.03	0.22	0.38	0.18
C2	0.04	0.00	0.18	0.22	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.17	0.29	0.05	0.23	0.01	0.24	0.54	0.25
C2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.09	0.02	0.06	0.02	0.09	0.08	0.15	0.22	0.18	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.08	0.10	0.50	0.21
C3'	0.02	0.22	0.01	0.00	0.14	0.00	0.13	0.01	0.16	0.11	0.21	0.26	0.20	0.11	0.08	0.02	0.01	0.02	0.17	0.15	0.08	0.46	0.25
C4	0.02	0.01	0.09	0.14	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.03	0.24	0.01	0.23	0.52	0.24
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.08	0.11	0.08	0.09	0.05	0.07	0.02	0.00	0.01	0.08	0.22	0.23	0.09
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.03	0.27	0.01	0.32	0.56	0.29
C5'	0.05	0.14	0.02	0.01	0.14	0.01	0.17	0.00	0.18	0.16	0.17	0.14	0.12	0.19	0.12	0.06	0.05	0.02	0.01	0.20	0.21	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.21	0.04	0.28	0.01	0.35	0.57	0.31
C8	0.02	0.02	0.08	0.11	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.04	0.27	0.03	0.27	0.50	0.27
N1	0.03	0.01	0.15	0.21	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.27	0.04	0.26	0.01	0.30	0.57	0.28
N2	0.06	0.00	0.22	0.26	0.02	0.11	0.01	0.14	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.21	0.34	0.06	0.22	0.02	0.23	0.54	0.24
N3	0.04	0.00	0.18	0.20	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.25	0.05	0.22	0.01	0.22	0.51	0.23
N7	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.19	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.04	0.28	0.03	0.36	0.56	0.32
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.23	0.02	0.21	0.47	0.22
O2'	0.01	0.17	0.01	0.02	0.08	0.07	0.06	0.06	0.09	0.06	0.14	0.21	0.15	0.05	0.03	0.00	0.05	0.06	0.05	0.08	0.22	0.41	0.15
O3'	0.02	0.29	0.03	0.01	0.17	0.02	0.16	0.05	0.21	0.13	0.27	0.34	0.25	0.14	0.08	0.05	0.00	0.02	0.27	0.21	0.13	0.46	0.27
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.20	0.04	0.33	0.25	0.20
O5'	0.15	0.23	0.08	0.17	0.24	0.01	0.27	0.01	0.28	0.27	0.26	0.22	0.22	0.28	0.23	0.05	0.27	0.20	0.00	0.29	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.08	0.15	0.01	0.08	0.01	0.20	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.21	0.04	0.29	0.00	0.42	0.57	0.33
OP1	0.22	0.24	0.10	0.08	0.23	0.22	0.32	0.21	0.35	0.27	0.30	0.23	0.22	0.36	0.21	0.22	0.13	0.33	0.02	0.42	0.00	0.01	0.01
OP2	0.38	0.54	0.50	0.46	0.52	0.23	0.56	0.06	0.57	0.50	0.57	0.54	0.51	0.56	0.47	0.41	0.46	0.25	0.01	0.57	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.25	0.21	0.25	0.24	0.09	0.29	0.01	0.31	0.27	0.28	0.24	0.23	0.32	0.22	0.15	0.27	0.20	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.57	0.13	0.26	0.44	0.23	0.53	0.32	0.61	0.40	0.63	0.61	0.46	0.50	0.33	0.22	0.33	0.18	0.48	0.65	0.59	0.69	0.56
C2	0.20	0.16	0.25	0.30	0.28	0.30	0.57	0.47	0.68	0.51	0.39	0.42	0.16	0.68	0.30	0.36	0.34	0.26	0.78	0.89	0.91	1.03	0.91
C2'	0.15	0.61	0.10	0.20	0.44	0.18	0.54	0.28	0.65	0.38	0.68	0.66	0.47	0.50	0.31	0.22	0.29	0.15	0.47	0.71	0.63	0.73	0.59
C3'	0.15	0.52	0.18	0.16	0.33	0.17	0.40	0.22	0.50	0.28	0.55	0.62	0.41	0.37	0.22	0.35	0.30	0.13	0.39	0.55	0.60	0.68	0.53
C4	0.14	0.23	0.19	0.29	0.26	0.29	0.48	0.45	0.51	0.45	0.36	0.32	0.13	0.56	0.27	0.31	0.34	0.23	0.71	0.61	0.83	0.92	0.82
C4'	0.24	0.58	0.25	0.14	0.39	0.17	0.40	0.18	0.49	0.26	0.56	0.69	0.50	0.33	0.27	0.42	0.23	0.19	0.28	0.50	0.47	0.55	0.39
C5	0.18	0.30	0.24	0.30	0.11	0.33	0.29	0.53	0.26	0.41	0.20	0.45	0.24	0.49	0.21	0.32	0.34	0.27	0.81	0.37	0.95	1.02	0.93
C5'	0.34	0.53	0.38	0.21	0.36	0.25	0.32	0.18	0.39	0.24	0.48	0.63	0.48	0.27	0.28	0.56	0.26	0.28	0.22	0.39	0.45	0.49	0.34
C6	0.24	0.50	0.28	0.31	0.20	0.36	0.25	0.57	0.19	0.42	0.35	0.68	0.40	0.51	0.24	0.35	0.34	0.31	0.88	0.34	1.05	1.12	1.03
C8	0.13	0.26	0.14	0.26	0.20	0.30	0.30	0.46	0.30	0.35	0.27	0.32	0.21	0.39	0.22	0.24	0.33	0.23	0.65	0.34	0.78	0.81	0.74
N1	0.24	0.40	0.28	0.31	0.20	0.34	0.41	0.53	0.40	0.48	0.17	0.68	0.33	0.61	0.27	0.37	0.34	0.30	0.85	0.65	1.01	1.11	1.00
N2	0.22	0.19	0.26	0.30	0.33	0.30	0.63	0.46	0.78	0.54	0.52	0.38	0.19	0.72	0.33	0.37	0.34	0.27	0.77	1.04	0.90	1.04	0.90
N3	0.16	0.30	0.21	0.29	0.35	0.27	0.61	0.43	0.72	0.49	0.56	0.32	0.17	0.65	0.31	0.33	0.34	0.23	0.70	0.85	0.81	0.94	0.81
N7	0.16	0.31	0.22	0.29	0.15	0.35	0.23	0.55	0.24	0.35	0.27	0.40	0.25	0.37	0.18	0.28	0.33	0.27	0.80	0.29	0.93	0.96	0.91
N9	0.12	0.35	0.11	0.27	0.31	0.26	0.44	0.40	0.48	0.40	0.42	0.38	0.26	0.48	0.27	0.25	0.33	0.20	0.61	0.53	0.72	0.80	0.70
O2'	0.22	0.77	0.18	0.24	0.54	0.21	0.64	0.28	0.78	0.43	0.84	0.86	0.59	0.56	0.39	0.20	0.29	0.20	0.42	0.84	0.56	0.69	0.53
O3'	0.18	0.59	0.20	0.16	0.36	0.19	0.42	0.21	0.54	0.27	0.61	0.72	0.46	0.36	0.23	0.39	0.30	0.15	0.35	0.59	0.60	0.67	0.51
O4'	0.19	0.59	0.16	0.20	0.41	0.17	0.43	0.24	0.51	0.30	0.58	0.66	0.50	0.37	0.28	0.30	0.31	0.14	0.33	0.52	0.47	0.53	0.41
O5'	0.23	0.47	0.25	0.18	0.35	0.13	0.35	0.22	0.39	0.31	0.44	0.54	0.42	0.34	0.29	0.27	0.02	0.17	0.35	0.39	0.57	0.57	0.47
O6	0.27	0.69	0.31	0.31	0.34	0.38	0.27	0.62	0.39	0.38	0.64	0.83	0.54	0.41	0.27	0.36	0.33	0.33	0.94	0.34	1.15	1.20	1.12
OP1	0.14	0.19	0.05	0.13	0.16	0.29	0.26	0.46	0.23	0.40	0.17	0.28	0.17	0.40	0.21	0.14	0.02	0.26	0.54	0.29	0.74	0.60	0.64
OP2	0.13	0.42	0.19	0.06	0.34	0.20	0.40	0.34	0.46	0.33	0.46	0.44	0.36	0.40	0.25	0.14	0.02	0.11	0.44	0.49	0.68	0.42	0.50
P	0.03	0.21	0.08	0.01	0.11	0.09	0.15	0.17	0.16	0.22	0.18	0.28	0.18	0.23	0.09	0.11	0.01	0.06	0.29	0.19	0.49	0.35	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.14	0.08
C2	0.03	0.00	0.14	0.12	0.01	0.04	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.18	0.04	0.33	0.02	0.32	0.35	0.31
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.01	0.06	0.08	0.11	0.17	0.14	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.06	0.20	0.12	0.12
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.09	0.16	0.10	0.17	0.12	0.15	0.06	0.02	0.01	0.02	0.20	0.10	0.26	0.13	0.17
C4	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.03	0.33	0.01	0.30	0.29	0.29
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.09	0.15	0.06	0.07	0.04	0.15	0.06	0.07	0.02	0.00	0.03	0.11	0.10	0.17	0.03
C5	0.01	0.02	0.04	0.09	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.42	0.01	0.40	0.40	0.40
C5'	0.03	0.11	0.01	0.02	0.15	0.01	0.23	0.00	0.23	0.26	0.17	0.08	0.09	0.29	0.14	0.07	0.07	0.01	0.01	0.26	0.13	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.04	0.44	0.00	0.44	0.47	0.45
C8	0.02	0.02	0.08	0.16	0.01	0.15	0.01	0.26	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.41	0.02	0.34	0.28	0.33
N1	0.03	0.01	0.11	0.10	0.02	0.06	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.16	0.13	0.04	0.39	0.01	0.39	0.43	0.39
N2	0.04	0.00	0.17	0.17	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.25	0.24	0.05	0.30	0.03	0.30	0.34	0.28
N3	0.03	0.01	0.14	0.12	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.18	0.16	0.04	0.28	0.01	0.26	0.28	0.24
N7	0.02	0.02	0.06	0.15	0.01	0.15	0.01	0.29	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.16	0.04	0.47	0.02	0.44	0.42	0.44
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.28	0.02	0.24	0.21	0.22
O2'	0.03	0.20	0.00	0.02	0.10	0.07	0.07	0.07	0.11	0.05	0.16	0.25	0.18	0.04	0.03	0.00	0.06	0.05	0.06	0.09	0.13	0.12	0.06
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.08	0.02	0.10	0.07	0.10	0.17	0.13	0.24	0.16	0.16	0.06	0.06	0.00	0.02	0.19	0.12	0.30	0.20	0.20
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.04	0.09	0.26	0.15
O5'	0.12	0.33	0.16	0.20	0.33	0.03	0.42	0.01	0.44	0.41	0.39	0.30	0.28	0.47	0.28	0.06	0.19	0.11	0.00	0.48	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.11	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.09	0.12	0.04	0.48	0.00	0.50	0.53	0.51
OP1	0.12	0.32	0.20	0.26	0.30	0.10	0.40	0.13	0.44	0.34	0.39	0.30	0.26	0.44	0.24	0.13	0.30	0.09	0.01	0.50	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.35	0.12	0.13	0.29	0.17	0.40	0.22	0.47	0.28	0.43	0.34	0.28	0.42	0.21	0.12	0.20	0.26	0.01	0.53	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.31	0.12	0.17	0.29	0.03	0.40	0.01	0.45	0.33	0.39	0.28	0.24	0.44	0.22	0.06	0.20	0.15	0.01	0.51	0.01	0.01	0.00