Doublet Group distance statistics: 50168

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 1, 2, 3, 2, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.026 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.007, 0.031, 0.054, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.031 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.005, 0.029, 0.053, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.029 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.003, 0.027, 0.051, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.027 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.013, 0.049, 0.084, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.049 std_dev=0.036
C2'	A	0, -0.012, 0.178, 0.368, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.178 std_dev=0.190
O2'	A	0, 0.014, 0.217, 0.420, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.217 std_dev=0.203
O4'	A	0, -0.036, 0.175, 0.386, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.175 std_dev=0.211
O2'	B	0, 0.196, 0.409, 0.623, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.409 std_dev=0.213
C1'	B	0, 0.157, 0.450, 0.743, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.450 std_dev=0.293
C2'	B	0, 0.150, 0.447, 0.745, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.447 std_dev=0.298
C3'	A	0, -0.010, 0.301, 0.612, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.301 std_dev=0.311
C4'	A	0, -0.037, 0.282, 0.600, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.282 std_dev=0.318
N9	B	0, 0.234, 0.600, 0.965, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.600 std_dev=0.366
O4'	B	0, 0.115, 0.487, 0.859, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.487 std_dev=0.372
O3'	B	0, 0.085, 0.473, 0.861, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.473 std_dev=0.388
C3'	B	0, 0.057, 0.449, 0.841, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.449 std_dev=0.392
P	A	0, 0.122, 0.521, 0.921, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.521 std_dev=0.399
O3'	A	0, 0.037, 0.444, 0.852, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.444 std_dev=0.408
C4	B	0, 0.288, 0.715, 1.143, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.715 std_dev=0.428
N3	B	0, 0.249, 0.704, 1.160, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.704 std_dev=0.455
O5'	A	0, 0.019, 0.483, 0.947, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.483 std_dev=0.464
C8	B	0, 0.288, 0.764, 1.240, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.764 std_dev=0.476
C4'	B	0, 0.032, 0.510, 0.988, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.510 std_dev=0.478
OP2	A	0, 0.133, 0.621, 1.108, 2.029 max_d=2.029 avg_d=0.621 std_dev=0.488
C5	B	0, 0.374, 0.915, 1.457, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.915 std_dev=0.541
N7	B	0, 0.380, 0.943, 1.505, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.943 std_dev=0.562
C2	B	0, 0.315, 0.905, 1.495, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.905 std_dev=0.590
C5'	A	0, -0.103, 0.503, 1.110, 2.273 max_d=2.273 avg_d=0.503 std_dev=0.606
C5'	B	0, 0.086, 0.729, 1.373, 2.459 max_d=2.459 avg_d=0.729 std_dev=0.644
OP1	A	0, 0.079, 0.723, 1.367, 2.506 max_d=2.506 avg_d=0.723 std_dev=0.644
C6	B	0, 0.443, 1.109, 1.774, 2.107 max_d=2.107 avg_d=1.109 std_dev=0.666
N1	B	0, 0.407, 1.081, 1.756, 2.119 max_d=2.119 avg_d=1.081 std_dev=0.674
N2	B	0, 0.312, 0.991, 1.669, 2.033 max_d=2.033 avg_d=0.991 std_dev=0.679
O6	B	0, 0.534, 1.324, 2.115, 2.457 max_d=2.457 avg_d=1.324 std_dev=0.791
O5'	B	0, 0.095, 1.334, 2.572, 4.980 max_d=4.980 avg_d=1.334 std_dev=1.238
P	B	0, -0.105, 1.628, 3.360, 6.844 max_d=6.844 avg_d=1.628 std_dev=1.733
OP1	B	0, -0.033, 1.762, 3.556, 7.431 max_d=7.431 avg_d=1.762 std_dev=1.795
OP2	B	0, -0.534, 1.883, 4.301, 8.576 max_d=8.576 avg_d=1.883 std_dev=2.418

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.01	0.19	0.12	0.10
C2	0.04	0.00	0.12	0.20	0.01	0.08	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.23	0.05	0.30	0.03	0.20	0.28	0.15
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.06	0.03	0.07	0.08	0.10	0.13	0.12	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.21	0.07	0.28	0.18	0.12
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.13	0.00	0.12	0.03	0.15	0.11	0.18	0.22	0.18	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.32	0.14	0.43	0.24	0.25
C4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.31	0.01	0.20	0.26	0.15
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.10	0.07	0.09	0.07	0.06	0.09	0.05	0.05	0.03	0.00	0.03	0.10	0.24	0.20	0.09
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.02	0.39	0.01	0.22	0.35	0.21
C5'	0.04	0.18	0.03	0.03	0.16	0.01	0.21	0.00	0.23	0.17	0.21	0.16	0.15	0.21	0.13	0.05	0.04	0.02	0.02	0.24	0.28	0.32	0.02
C6	0.01	0.02	0.07	0.15	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.18	0.02	0.40	0.00	0.23	0.39	0.23
C8	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.14	0.06	0.39	0.02	0.21	0.29	0.20
N1	0.03	0.01	0.10	0.18	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.22	0.03	0.36	0.02	0.22	0.35	0.20
N2	0.06	0.01	0.13	0.22	0.02	0.07	0.01	0.16	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.10	0.26	0.08	0.27	0.04	0.21	0.27	0.15
N3	0.04	0.00	0.12	0.18	0.01	0.06	0.01	0.15	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.20	0.06	0.26	0.02	0.19	0.24	0.13
N7	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.05	0.43	0.02	0.24	0.38	0.25
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.29	0.01	0.19	0.21	0.13
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.04	0.09	0.10	0.08	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.06	0.08	0.26	0.11	0.10
O3'	0.02	0.23	0.03	0.01	0.14	0.03	0.15	0.04	0.18	0.14	0.22	0.26	0.20	0.15	0.07	0.05	0.00	0.02	0.29	0.19	0.55	0.28	0.30
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.08	0.06	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.13	0.03	0.24	0.22	0.21
O5'	0.14	0.30	0.21	0.32	0.31	0.03	0.39	0.02	0.40	0.39	0.36	0.27	0.26	0.43	0.29	0.06	0.29	0.13	0.00	0.44	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.03	0.07	0.14	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.08	0.19	0.03	0.44	0.00	0.26	0.44	0.27
OP1	0.19	0.20	0.28	0.43	0.20	0.24	0.22	0.28	0.23	0.21	0.22	0.21	0.19	0.24	0.19	0.26	0.55	0.24	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.28	0.18	0.24	0.26	0.20	0.35	0.32	0.39	0.29	0.35	0.27	0.24	0.38	0.21	0.11	0.28	0.22	0.02	0.44	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.15	0.12	0.25	0.15	0.09	0.21	0.02	0.23	0.20	0.20	0.15	0.13	0.25	0.13	0.10	0.30	0.21	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.32	0.20	0.15	0.29	0.19	0.35	0.16	0.40	0.29	0.38	0.28	0.26	0.34	0.26	0.26	0.29	0.18	0.19	0.43	0.37	0.46	0.20
C2	0.19	0.26	0.20	0.13	0.26	0.17	0.33	0.23	0.36	0.34	0.26	0.40	0.26	0.39	0.26	0.19	0.26	0.21	0.57	0.45	0.52	1.11	0.67
C2'	0.21	0.28	0.25	0.07	0.28	0.11	0.33	0.11	0.37	0.30	0.34	0.25	0.25	0.34	0.28	0.35	0.15	0.17	0.21	0.41	0.43	0.56	0.28
C3'	0.29	0.29	0.32	0.17	0.30	0.15	0.31	0.18	0.32	0.31	0.31	0.28	0.30	0.31	0.31	0.40	0.12	0.24	0.32	0.34	0.50	0.68	0.38
C4	0.17	0.18	0.19	0.11	0.22	0.14	0.29	0.19	0.31	0.30	0.21	0.30	0.20	0.35	0.24	0.20	0.25	0.17	0.51	0.38	0.49	1.00	0.59
C4'	0.25	0.40	0.23	0.10	0.33	0.10	0.33	0.10	0.37	0.28	0.39	0.42	0.37	0.30	0.30	0.30	0.15	0.21	0.17	0.38	0.44	0.45	0.23
C5	0.20	0.29	0.21	0.16	0.20	0.17	0.22	0.26	0.18	0.30	0.17	0.43	0.28	0.31	0.23	0.18	0.25	0.20	0.68	0.27	0.67	1.27	0.81
C5'	0.32	0.36	0.23	0.16	0.31	0.24	0.27	0.21	0.29	0.24	0.32	0.41	0.38	0.24	0.30	0.26	0.17	0.35	0.33	0.29	0.45	0.60	0.33
C6	0.23	0.40	0.23	0.19	0.26	0.21	0.26	0.31	0.21	0.33	0.29	0.54	0.35	0.34	0.26	0.17	0.26	0.24	0.77	0.26	0.77	1.46	0.94
C8	0.14	0.16	0.19	0.11	0.13	0.11	0.21	0.16	0.23	0.24	0.19	0.23	0.15	0.26	0.18	0.20	0.24	0.13	0.52	0.29	0.54	0.99	0.60
N1	0.22	0.35	0.22	0.17	0.26	0.20	0.30	0.29	0.28	0.35	0.26	0.51	0.32	0.38	0.27	0.18	0.26	0.23	0.70	0.36	0.67	1.34	0.85
N2	0.20	0.27	0.21	0.13	0.28	0.17	0.36	0.23	0.40	0.35	0.31	0.37	0.26	0.41	0.27	0.20	0.25	0.21	0.55	0.50	0.48	1.07	0.64
N3	0.18	0.22	0.20	0.11	0.26	0.15	0.35	0.18	0.39	0.33	0.30	0.29	0.22	0.38	0.26	0.20	0.25	0.18	0.47	0.47	0.44	0.92	0.53
N7	0.18	0.28	0.21	0.17	0.15	0.17	0.13	0.26	0.15	0.24	0.20	0.37	0.27	0.23	0.18	0.17	0.25	0.18	0.71	0.23	0.73	1.30	0.84
N9	0.16	0.18	0.19	0.09	0.23	0.12	0.30	0.14	0.33	0.28	0.27	0.20	0.18	0.32	0.24	0.22	0.25	0.15	0.39	0.38	0.42	0.80	0.45
O2'	0.24	0.36	0.23	0.18	0.31	0.27	0.36	0.25	0.43	0.30	0.42	0.34	0.29	0.35	0.28	0.30	0.27	0.26	0.22	0.47	0.57	0.33	0.29
O3'	0.30	0.30	0.34	0.20	0.30	0.17	0.30	0.18	0.32	0.31	0.31	0.30	0.30	0.31	0.31	0.42	0.14	0.26	0.28	0.34	0.57	0.65	0.38
O4'	0.21	0.41	0.22	0.20	0.34	0.17	0.37	0.16	0.41	0.29	0.42	0.42	0.37	0.34	0.29	0.28	0.32	0.17	0.14	0.42	0.39	0.35	0.16
O5'	0.37	0.39	0.42	0.14	0.43	0.10	0.47	0.08	0.47	0.45	0.43	0.35	0.39	0.48	0.43	0.59	0.01	0.25	0.26	0.51	0.45	0.63	0.34
O6	0.26	0.49	0.25	0.22	0.32	0.25	0.29	0.38	0.29	0.35	0.43	0.60	0.42	0.34	0.29	0.19	0.26	0.27	0.89	0.27	0.93	1.68	1.11
OP1	0.09	0.15	0.06	0.16	0.09	0.33	0.09	0.42	0.12	0.08	0.14	0.19	0.14	0.08	0.07	0.25	0.01	0.23	0.64	0.15	0.57	0.93	0.66
OP2	0.20	0.27	0.28	0.08	0.28	0.05	0.33	0.07	0.34	0.33	0.31	0.25	0.24	0.36	0.27	0.38	0.02	0.12	0.38	0.38	0.61	0.78	0.46
P	0.12	0.15	0.19	0.02	0.15	0.09	0.18	0.12	0.19	0.19	0.17	0.15	0.13	0.20	0.15	0.32	0.01	0.07	0.34	0.22	0.44	0.65	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.39	0.02	0.32	0.61	0.37
C2	0.04	0.00	0.09	0.08	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.19	0.09	0.43	0.01	0.29	0.77	0.45
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.06	0.09	0.04	0.09	0.10	0.07	0.06	0.03	0.00	0.02	0.02	0.46	0.10	0.50	0.77	0.49
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.07	0.06	0.10	0.08	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.23	0.07	0.41	0.43	0.24
C4	0.02	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.05	0.55	0.01	0.40	0.93	0.58
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.11	0.05	0.13	0.09	0.10	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.07	0.25	0.19	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.04	0.72	0.02	0.57	1.22	0.80
C5'	0.04	0.06	0.06	0.02	0.09	0.01	0.17	0.00	0.16	0.23	0.10	0.08	0.05	0.25	0.11	0.05	0.02	0.01	0.02	0.22	0.25	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.05	0.01	0.04	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.13	0.05	0.70	0.01	0.55	1.23	0.79
C8	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.11	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.11	0.05	0.06	0.83	0.04	0.69	1.31	0.90
N1	0.03	0.01	0.09	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.17	0.07	0.57	0.01	0.40	1.01	0.62
N2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.13	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.11	0.34	0.02	0.27	0.62	0.33
N3	0.04	0.01	0.07	0.08	0.01	0.09	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.18	0.09	0.39	0.01	0.27	0.69	0.39
N7	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.10	0.01	0.25	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.06	0.06	0.86	0.03	0.74	1.44	0.98
N9	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.59	0.02	0.44	0.93	0.61
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.08	0.01	0.11	0.05	0.14	0.11	0.15	0.18	0.13	0.12	0.05	0.00	0.03	0.01	0.45	0.17	0.57	0.88	0.53
O3'	0.07	0.19	0.02	0.01	0.12	0.02	0.10	0.02	0.13	0.05	0.17	0.22	0.18	0.06	0.07	0.03	0.00	0.05	0.16	0.12	0.42	0.38	0.21
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.07	0.11	0.09	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.24	0.05	0.25	0.34	0.21
O5'	0.39	0.43	0.46	0.23	0.55	0.03	0.72	0.02	0.70	0.83	0.57	0.34	0.39	0.86	0.59	0.45	0.16	0.24	0.00	0.79	0.01	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.10	0.07	0.01	0.07	0.02	0.22	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.17	0.12	0.05	0.79	0.00	0.66	1.40	0.92
OP1	0.32	0.29	0.50	0.41	0.40	0.25	0.57	0.25	0.55	0.69	0.40	0.27	0.27	0.74	0.44	0.57	0.42	0.25	0.01	0.66	0.00	0.01	0.01
OP2	0.61	0.77	0.77	0.43	0.93	0.19	1.22	0.15	1.23	1.31	1.01	0.62	0.69	1.44	0.93	0.88	0.38	0.34	0.03	1.40	0.01	0.00	0.00
P	0.37	0.45	0.49	0.24	0.58	0.06	0.80	0.02	0.79	0.90	0.62	0.33	0.39	0.98	0.61	0.53	0.21	0.21	0.01	0.92	0.01	0.00	0.00