Doublet Group distance statistics: 50170

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 3, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.014, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.015, 0.024, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.024 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.015, 0.027, 0.038, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.018, 0.031, 0.044, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.024, 0.045, 0.066, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.025, 0.048, 0.072, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.048 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.016, 0.040, 0.063, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.021, 0.051, 0.081, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.051 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.035, 0.108, 0.182, 0.254 max_d=0.254 avg_d=0.108 std_dev=0.074
C2'	A	0, 0.054, 0.142, 0.229, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.142 std_dev=0.088
C4'	A	0, 0.123, 0.240, 0.357, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.240 std_dev=0.117
O2'	B	0, 0.281, 0.453, 0.624, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.453 std_dev=0.172
C3'	A	0, 0.058, 0.265, 0.472, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.265 std_dev=0.207
C2'	B	0, 0.439, 0.654, 0.868, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.654 std_dev=0.214
C5'	A	0, 0.215, 0.439, 0.663, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.439 std_dev=0.224
O2'	A	0, 0.012, 0.305, 0.598, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.305 std_dev=0.293
C1'	B	0, 0.528, 0.823, 1.118, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.823 std_dev=0.295
C3'	B	0, 0.597, 0.904, 1.212, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.904 std_dev=0.308
O4'	B	0, 0.598, 0.954, 1.310, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.954 std_dev=0.356
C4'	B	0, 0.637, 1.008, 1.380, 1.551 max_d=1.551 avg_d=1.008 std_dev=0.372
O3'	B	0, 0.541, 0.928, 1.314, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.928 std_dev=0.387
O3'	A	0, 0.065, 0.490, 0.915, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.490 std_dev=0.425
N9	B	0, 0.703, 1.129, 1.555, 1.844 max_d=1.844 avg_d=1.129 std_dev=0.426
O5'	A	0, 0.174, 0.641, 1.107, 1.991 max_d=1.991 avg_d=0.641 std_dev=0.466
P	A	0, 0.463, 0.944, 1.425, 2.114 max_d=2.114 avg_d=0.944 std_dev=0.481
C4	B	0, 0.730, 1.224, 1.718, 2.153 max_d=2.153 avg_d=1.224 std_dev=0.494
N3	B	0, 0.630, 1.127, 1.625, 2.158 max_d=2.158 avg_d=1.127 std_dev=0.498
OP2	A	0, 0.620, 1.122, 1.623, 2.076 max_d=2.076 avg_d=1.122 std_dev=0.502
C8	B	0, 0.923, 1.476, 2.029, 2.338 max_d=2.338 avg_d=1.476 std_dev=0.553
C5'	B	0, 0.916, 1.471, 2.025, 2.075 max_d=2.075 avg_d=1.471 std_dev=0.555
C5	B	0, 0.952, 1.571, 2.190, 2.650 max_d=2.650 avg_d=1.571 std_dev=0.619
C2	B	0, 0.793, 1.413, 2.034, 2.643 max_d=2.643 avg_d=1.413 std_dev=0.620
O5'	B	0, 1.037, 1.664, 2.291, 2.332 max_d=2.332 avg_d=1.664 std_dev=0.627
OP1	A	0, 0.580, 1.222, 1.864, 2.796 max_d=2.796 avg_d=1.222 std_dev=0.642
N7	B	0, 1.057, 1.714, 2.371, 2.786 max_d=2.786 avg_d=1.714 std_dev=0.657
N2	B	0, 0.828, 1.520, 2.213, 2.924 max_d=2.924 avg_d=1.520 std_dev=0.692
N1	B	0, 0.978, 1.693, 2.408, 3.004 max_d=3.004 avg_d=1.693 std_dev=0.715
C6	B	0, 1.067, 1.795, 2.522, 3.062 max_d=3.062 avg_d=1.795 std_dev=0.727
OP2	B	0, 1.214, 2.011, 2.808, 2.973 max_d=2.973 avg_d=2.011 std_dev=0.797
O6	B	0, 1.263, 2.112, 2.961, 3.528 max_d=3.528 avg_d=2.112 std_dev=0.849
P	B	0, 1.237, 2.113, 2.989, 3.353 max_d=3.353 avg_d=2.113 std_dev=0.876
OP1	B	0, 1.082, 2.650, 4.218, 5.684 max_d=5.684 avg_d=2.650 std_dev=1.568

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.19	0.11	0.14
C2	0.02	0.00	0.10	0.15	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.35	0.16	0.01	0.41	0.01	0.46	0.45	0.41
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.07	0.04	0.08	0.11	0.09	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.19	0.07	0.26	0.07	0.14
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.14	0.01	0.17	0.03	0.18	0.18	0.16	0.16	0.14	0.19	0.12	0.03	0.01	0.01	0.25	0.19	0.34	0.13	0.24
C4	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.09	0.01	0.40	0.01	0.42	0.40	0.38
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.05	0.17	0.02	0.00	0.01	0.08	0.13	0.14	0.02
C5	0.00	0.00	0.06	0.17	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.13	0.02	0.48	0.01	0.51	0.53	0.48
C5'	0.02	0.09	0.07	0.03	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.10	0.10	0.10	0.08	0.11	0.06	0.10	0.12	0.01	0.01	0.12	0.17	0.26	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.18	0.00	0.08	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.30	0.16	0.02	0.51	0.00	0.57	0.60	0.52
C8	0.01	0.00	0.04	0.18	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.13	0.03	0.43	0.02	0.41	0.39	0.39
N1	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.34	0.16	0.01	0.48	0.00	0.53	0.55	0.48
N2	0.03	0.00	0.11	0.16	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.36	0.21	0.02	0.39	0.01	0.44	0.42	0.39
N3	0.02	0.00	0.09	0.14	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.15	0.01	0.36	0.00	0.39	0.36	0.35
N7	0.01	0.00	0.05	0.19	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.16	0.03	0.50	0.02	0.51	0.55	0.49
N9	0.00	0.01	0.03	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.05	0.01	0.35	0.01	0.34	0.29	0.30
O2'	0.01	0.35	0.00	0.03	0.24	0.17	0.24	0.10	0.30	0.10	0.34	0.36	0.31	0.17	0.13	0.00	0.05	0.12	0.24	0.30	0.35	0.08	0.21
O3'	0.10	0.16	0.01	0.01	0.09	0.02	0.13	0.12	0.16	0.13	0.16	0.21	0.15	0.16	0.05	0.05	0.00	0.06	0.25	0.18	0.45	0.24	0.30
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.12	0.06	0.00	0.08	0.02	0.10	0.12	0.07
O5'	0.17	0.41	0.19	0.25	0.40	0.01	0.48	0.01	0.51	0.43	0.48	0.39	0.36	0.50	0.35	0.24	0.25	0.08	0.00	0.54	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.07	0.19	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.30	0.18	0.02	0.54	0.00	0.62	0.67	0.58
OP1	0.19	0.46	0.26	0.34	0.42	0.13	0.51	0.17	0.57	0.41	0.53	0.44	0.39	0.51	0.34	0.35	0.45	0.10	0.01	0.62	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.45	0.07	0.13	0.40	0.14	0.53	0.26	0.60	0.39	0.55	0.42	0.36	0.55	0.29	0.08	0.24	0.12	0.02	0.67	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.41	0.14	0.24	0.38	0.02	0.48	0.01	0.52	0.39	0.48	0.39	0.35	0.49	0.30	0.21	0.30	0.07	0.01	0.58	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.33	0.10	0.14	0.27	0.11	0.34	0.17	0.40	0.25	0.39	0.32	0.26	0.32	0.21	0.23	0.19	0.11	0.35	0.44	0.73	0.27	0.40
C2	0.10	0.17	0.09	0.23	0.17	0.14	0.32	0.24	0.39	0.28	0.29	0.26	0.13	0.37	0.17	0.17	0.31	0.11	0.45	0.51	1.14	0.39	0.55
C2'	0.14	0.32	0.09	0.10	0.25	0.08	0.33	0.16	0.39	0.25	0.38	0.33	0.25	0.32	0.20	0.26	0.17	0.10	0.39	0.44	0.81	0.33	0.47
C3'	0.15	0.27	0.15	0.17	0.20	0.19	0.25	0.15	0.30	0.22	0.30	0.33	0.21	0.26	0.17	0.24	0.25	0.13	0.53	0.33	0.85	0.46	0.61
C4	0.09	0.18	0.09	0.22	0.18	0.14	0.31	0.22	0.38	0.26	0.30	0.23	0.12	0.34	0.16	0.16	0.30	0.10	0.42	0.46	1.01	0.34	0.50
C4'	0.19	0.33	0.13	0.09	0.27	0.13	0.29	0.11	0.33	0.22	0.35	0.35	0.29	0.27	0.21	0.27	0.15	0.14	0.38	0.36	0.61	0.32	0.43
C5	0.13	0.18	0.11	0.27	0.14	0.18	0.27	0.26	0.29	0.27	0.19	0.30	0.15	0.34	0.17	0.12	0.35	0.14	0.46	0.39	1.10	0.38	0.54
C5'	0.19	0.25	0.17	0.11	0.22	0.18	0.24	0.14	0.27	0.21	0.27	0.26	0.23	0.24	0.20	0.26	0.20	0.17	0.43	0.29	0.57	0.35	0.47
C6	0.16	0.24	0.12	0.30	0.17	0.21	0.26	0.29	0.28	0.29	0.20	0.37	0.20	0.36	0.19	0.11	0.38	0.18	0.49	0.39	1.22	0.44	0.59
C8	0.08	0.13	0.09	0.23	0.14	0.14	0.25	0.22	0.28	0.23	0.20	0.16	0.09	0.29	0.14	0.13	0.31	0.09	0.40	0.32	0.86	0.30	0.45
N1	0.13	0.19	0.11	0.27	0.16	0.18	0.28	0.27	0.32	0.29	0.20	0.33	0.16	0.37	0.18	0.13	0.35	0.15	0.48	0.46	1.22	0.43	0.58
N2	0.10	0.18	0.09	0.22	0.19	0.14	0.33	0.24	0.40	0.28	0.31	0.25	0.13	0.38	0.17	0.18	0.30	0.11	0.45	0.54	1.16	0.40	0.55
N3	0.09	0.22	0.08	0.20	0.20	0.12	0.34	0.22	0.42	0.27	0.35	0.25	0.14	0.36	0.17	0.19	0.28	0.09	0.42	0.52	1.03	0.34	0.50
N7	0.14	0.19	0.12	0.29	0.13	0.19	0.22	0.26	0.22	0.25	0.16	0.28	0.18	0.30	0.16	0.09	0.37	0.16	0.46	0.28	1.02	0.35	0.51
N9	0.08	0.22	0.08	0.19	0.21	0.12	0.32	0.20	0.37	0.24	0.32	0.20	0.15	0.32	0.17	0.18	0.26	0.08	0.39	0.42	0.86	0.29	0.44
O2'	0.16	0.41	0.13	0.15	0.30	0.16	0.40	0.13	0.51	0.27	0.51	0.43	0.30	0.37	0.22	0.21	0.24	0.15	0.38	0.58	0.76	0.31	0.44
O3'	0.18	0.43	0.16	0.19	0.27	0.21	0.30	0.20	0.37	0.23	0.42	0.55	0.35	0.28	0.20	0.29	0.28	0.14	0.55	0.40	0.87	0.52	0.65
O4'	0.18	0.35	0.12	0.13	0.30	0.12	0.34	0.15	0.38	0.26	0.38	0.33	0.31	0.31	0.24	0.25	0.17	0.14	0.31	0.40	0.58	0.26	0.34
O5'	0.23	0.23	0.22	0.07	0.24	0.08	0.31	0.09	0.32	0.30	0.27	0.22	0.22	0.34	0.24	0.39	0.02	0.15	0.47	0.36	0.66	0.46	0.54
O6	0.20	0.33	0.15	0.33	0.21	0.25	0.26	0.32	0.25	0.32	0.28	0.44	0.27	0.36	0.23	0.09	0.42	0.23	0.52	0.33	1.30	0.49	0.63
OP1	0.10	0.14	0.10	0.03	0.13	0.11	0.24	0.27	0.27	0.23	0.21	0.17	0.12	0.30	0.10	0.20	0.02	0.08	0.59	0.34	0.64	0.61	0.71
OP2	0.07	0.29	0.10	0.05	0.30	0.12	0.43	0.25	0.46	0.40	0.39	0.26	0.23	0.49	0.26	0.26	0.01	0.08	0.73	0.53	0.93	0.67	0.83
P	0.09	0.15	0.11	0.01	0.17	0.06	0.27	0.19	0.29	0.26	0.23	0.15	0.12	0.33	0.15	0.24	0.01	0.03	0.57	0.35	0.65	0.54	0.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.08	0.01	0.13	0.15	0.14
C2	0.02	0.00	0.05	0.11	0.01	0.04	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.09	0.02	0.22	0.00	0.68	0.33	0.29
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.07	0.09	0.07	0.08	0.05	0.07	0.05	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.22	0.12	0.13
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.01	0.14	0.03	0.14	0.16	0.12	0.11	0.10	0.17	0.11	0.01	0.01	0.02	0.29	0.16	0.25	0.21	0.26
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.03	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.07	0.01	0.19	0.01	0.53	0.31	0.25
C4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.15	0.03	0.00	0.01	0.05	0.18	0.18	0.03
C5	0.01	0.00	0.07	0.14	0.00	0.04	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.13	0.01	0.21	0.01	0.65	0.39	0.30
C5'	0.06	0.14	0.09	0.03	0.14	0.00	0.17	0.00	0.18	0.15	0.17	0.13	0.12	0.17	0.12	0.07	0.13	0.01	0.01	0.20	0.31	0.35	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.14	0.01	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.14	0.01	0.23	0.00	0.77	0.42	0.33
C8	0.00	0.01	0.08	0.16	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.15	0.02	0.20	0.01	0.38	0.34	0.27
N1	0.02	0.00	0.05	0.12	0.01	0.04	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.10	0.02	0.23	0.00	0.77	0.39	0.32
N2	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.13	0.03	0.23	0.00	0.69	0.32	0.30
N3	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.09	0.02	0.19	0.00	0.55	0.28	0.25
N7	0.01	0.00	0.09	0.17	0.00	0.04	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.18	0.02	0.21	0.01	0.57	0.42	0.30
N9	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.05	0.01	0.15	0.01	0.35	0.25	0.21
O2'	0.02	0.24	0.01	0.01	0.18	0.15	0.19	0.07	0.23	0.10	0.24	0.24	0.21	0.15	0.10	0.00	0.04	0.09	0.20	0.23	0.21	0.12	0.18
O3'	0.09	0.09	0.01	0.01	0.07	0.03	0.13	0.13	0.14	0.15	0.10	0.13	0.09	0.18	0.05	0.04	0.00	0.07	0.36	0.17	0.35	0.34	0.37
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.09	0.07	0.00	0.15	0.02	0.16	0.20	0.20
O5'	0.08	0.22	0.14	0.29	0.19	0.01	0.21	0.01	0.23	0.20	0.23	0.23	0.19	0.21	0.15	0.20	0.36	0.15	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.08	0.16	0.01	0.05	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.17	0.02	0.24	0.00	0.84	0.46	0.35
OP1	0.13	0.68	0.22	0.25	0.53	0.18	0.65	0.31	0.77	0.38	0.77	0.69	0.55	0.57	0.35	0.21	0.35	0.16	0.01	0.84	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.33	0.12	0.21	0.31	0.18	0.39	0.35	0.42	0.34	0.39	0.32	0.28	0.42	0.25	0.12	0.34	0.20	0.01	0.46	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.29	0.13	0.26	0.25	0.03	0.30	0.01	0.33	0.27	0.32	0.30	0.25	0.30	0.21	0.18	0.37	0.20	0.00	0.35	0.01	0.00	0.00