Doublet Group distance statistics: 50172

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.029, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.010, 0.028, 0.046, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.028 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.012, 0.031, 0.051, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.031 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.014, 0.037, 0.061, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.037 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.021, 0.048, 0.076, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.048 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.022, 0.050, 0.079, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.050 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.024, 0.053, 0.083, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.053 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.019, 0.049, 0.079, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.049 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.018, 0.049, 0.080, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.049 std_dev=0.031
C4	A	0, 0.019, 0.052, 0.084, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.052 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.027, 0.074, 0.121, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.074 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.027, 0.118, 0.210, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.118 std_dev=0.092
C2'	A	0, 0.055, 0.181, 0.307, 0.462 max_d=0.462 avg_d=0.181 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.022, 0.186, 0.351, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.186 std_dev=0.164
O2'	B	0, 0.254, 0.453, 0.652, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.453 std_dev=0.199
C4'	A	0, 0.099, 0.348, 0.598, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.348 std_dev=0.250
N2	B	0, 0.243, 0.516, 0.789, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.516 std_dev=0.273
C2	B	0, 0.240, 0.521, 0.803, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.521 std_dev=0.281
O2'	A	0, 0.115, 0.409, 0.703, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.409 std_dev=0.294
N1	B	0, 0.270, 0.564, 0.859, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.564 std_dev=0.294
N3	B	0, 0.256, 0.555, 0.854, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.555 std_dev=0.299
O3'	A	0, -0.002, 0.308, 0.618, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.308 std_dev=0.310
C4	B	0, 0.342, 0.656, 0.970, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.656 std_dev=0.314
C6	B	0, 0.332, 0.661, 0.990, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.661 std_dev=0.329
C5	B	0, 0.387, 0.717, 1.046, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.717 std_dev=0.330
N9	B	0, 0.437, 0.771, 1.106, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.771 std_dev=0.335
O6	B	0, 0.391, 0.733, 1.076, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.733 std_dev=0.342
N7	B	0, 0.503, 0.860, 1.217, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.860 std_dev=0.357
C1'	B	0, 0.447, 0.813, 1.180, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.813 std_dev=0.366
C8	B	0, 0.516, 0.883, 1.251, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.883 std_dev=0.367
O4'	B	0, 0.532, 1.050, 1.568, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.050 std_dev=0.518
O5'	A	0, 0.269, 0.808, 1.346, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.808 std_dev=0.538
C5'	A	0, 0.246, 0.808, 1.370, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.808 std_dev=0.562
C2'	B	0, 0.475, 1.062, 1.650, 1.742 max_d=1.742 avg_d=1.062 std_dev=0.587
P	B	0, 0.850, 1.632, 2.414, 2.596 max_d=2.596 avg_d=1.632 std_dev=0.782
O5'	B	0, 0.781, 1.596, 2.411, 2.640 max_d=2.640 avg_d=1.596 std_dev=0.815
C5'	B	0, 0.853, 1.678, 2.503, 2.909 max_d=2.909 avg_d=1.678 std_dev=0.825
OP2	B	0, 0.880, 1.736, 2.592, 2.970 max_d=2.970 avg_d=1.736 std_dev=0.856
P	A	0, 0.233, 1.125, 2.016, 3.579 max_d=3.579 avg_d=1.125 std_dev=0.891
OP1	A	0, 0.382, 1.276, 2.169, 3.693 max_d=3.693 avg_d=1.276 std_dev=0.893
C4'	B	0, 0.725, 1.651, 2.576, 2.874 max_d=2.874 avg_d=1.651 std_dev=0.925
OP1	B	0, 1.038, 2.043, 3.048, 3.483 max_d=3.483 avg_d=2.043 std_dev=1.005
C3'	B	0, 0.748, 2.029, 3.310, 3.445 max_d=3.445 avg_d=2.029 std_dev=1.281
OP2	A	0, 0.681, 2.345, 4.009, 4.813 max_d=4.813 avg_d=2.345 std_dev=1.664
O3'	B	0, 0.920, 2.803, 4.687, 4.804 max_d=4.804 avg_d=2.803 std_dev=1.883

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.09	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.23	0.02	0.43	0.30	0.26
C2	0.04	0.00	0.12	0.07	0.01	0.04	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.11	0.02	0.25	0.01	0.27	0.30	0.24
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.09	0.05	0.11	0.14	0.12	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.09	0.49	0.28	0.20
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.04	0.08	0.16	0.06	0.09	0.07	0.14	0.09	0.01	0.01	0.02	0.24	0.09	0.35	0.43	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.07	0.00	0.08	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.04	0.02	0.27	0.01	0.19	0.29	0.23
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.12	0.21	0.07	0.06	0.04	0.21	0.10	0.04	0.02	0.01	0.03	0.15	0.41	0.35	0.21
C5	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.14	0.00	0.42	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.07	0.04	0.31	0.01	0.16	0.35	0.28
C5'	0.09	0.23	0.04	0.04	0.30	0.01	0.42	0.00	0.42	0.48	0.33	0.16	0.19	0.52	0.30	0.04	0.06	0.04	0.01	0.48	0.21	0.30	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.12	0.01	0.42	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.06	0.04	0.30	0.00	0.18	0.38	0.29
C8	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.21	0.00	0.48	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.16	0.05	0.33	0.01	0.19	0.32	0.28
N1	0.03	0.01	0.11	0.06	0.01	0.07	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.07	0.03	0.28	0.01	0.16	0.34	0.25
N2	0.04	0.01	0.14	0.09	0.01	0.06	0.02	0.16	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.33	0.16	0.03	0.24	0.02	0.36	0.29	0.25
N3	0.04	0.01	0.12	0.07	0.00	0.04	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.10	0.02	0.24	0.01	0.32	0.28	0.24
N7	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.21	0.00	0.52	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.15	0.05	0.33	0.01	0.28	0.37	0.34
N9	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.10	0.01	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.03	0.28	0.01	0.20	0.28	0.22
O2'	0.02	0.28	0.00	0.01	0.16	0.04	0.14	0.04	0.19	0.04	0.25	0.33	0.25	0.07	0.06	0.00	0.04	0.09	0.08	0.19	0.72	0.35	0.41
O3'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.04	0.02	0.07	0.06	0.06	0.16	0.07	0.16	0.10	0.15	0.07	0.04	0.00	0.02	0.36	0.08	0.46	0.47	0.14
O4'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.09	0.02	0.00	0.29	0.05	0.43	0.40	0.28
O5'	0.23	0.25	0.15	0.24	0.27	0.03	0.31	0.01	0.30	0.33	0.28	0.24	0.24	0.33	0.28	0.08	0.36	0.29	0.00	0.32	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.15	0.01	0.48	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.08	0.05	0.32	0.00	0.28	0.43	0.34
OP1	0.43	0.27	0.49	0.35	0.19	0.41	0.16	0.21	0.18	0.19	0.16	0.36	0.32	0.28	0.20	0.72	0.46	0.43	0.02	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.30	0.28	0.43	0.29	0.35	0.35	0.30	0.38	0.32	0.34	0.29	0.28	0.37	0.28	0.35	0.47	0.40	0.02	0.43	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.24	0.20	0.10	0.23	0.21	0.28	0.01	0.29	0.28	0.25	0.25	0.24	0.34	0.22	0.41	0.14	0.28	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.23	0.32	0.26	0.20	0.23	0.26	0.16	0.30	0.21	0.29	0.23	0.17	0.26	0.15	0.12	0.40	0.14	0.24	0.32	0.26	0.49	0.30
C2	0.23	0.15	0.49	0.64	0.14	0.40	0.17	0.35	0.19	0.18	0.15	0.24	0.16	0.19	0.17	0.05	0.77	0.20	0.15	0.25	0.18	0.29	0.14
C2'	0.11	0.20	0.32	0.29	0.16	0.27	0.22	0.17	0.26	0.18	0.25	0.21	0.14	0.23	0.12	0.10	0.42	0.14	0.18	0.29	0.22	0.47	0.25
C3'	0.09	0.28	0.18	0.18	0.27	0.22	0.33	0.10	0.36	0.28	0.34	0.27	0.24	0.33	0.21	0.16	0.34	0.10	0.28	0.39	0.28	0.64	0.38
C4	0.21	0.11	0.48	0.59	0.11	0.39	0.19	0.31	0.23	0.17	0.20	0.19	0.09	0.21	0.13	0.05	0.71	0.20	0.13	0.29	0.16	0.34	0.16
C4'	0.22	0.35	0.13	0.22	0.38	0.11	0.42	0.19	0.43	0.40	0.39	0.30	0.34	0.43	0.35	0.31	0.31	0.16	0.51	0.44	0.50	0.82	0.58
C5	0.24	0.13	0.52	0.74	0.10	0.48	0.18	0.38	0.23	0.17	0.19	0.22	0.10	0.21	0.15	0.06	0.90	0.23	0.14	0.31	0.18	0.31	0.13
C5'	0.52	0.60	0.48	0.56	0.69	0.33	0.75	0.47	0.74	0.75	0.66	0.49	0.61	0.79	0.68	0.57	0.55	0.39	0.83	0.76	0.80	1.19	0.91
C6	0.26	0.16	0.53	0.83	0.13	0.51	0.15	0.44	0.18	0.19	0.16	0.25	0.16	0.20	0.18	0.08	1.00	0.23	0.20	0.27	0.24	0.27	0.14
C8	0.19	0.19	0.47	0.57	0.16	0.42	0.26	0.29	0.30	0.20	0.27	0.20	0.10	0.26	0.13	0.05	0.71	0.22	0.15	0.34	0.20	0.43	0.21
N1	0.25	0.17	0.52	0.76	0.15	0.46	0.16	0.41	0.17	0.19	0.15	0.26	0.18	0.20	0.18	0.06	0.92	0.22	0.19	0.24	0.23	0.27	0.15
N2	0.23	0.17	0.48	0.62	0.16	0.38	0.17	0.35	0.18	0.18	0.16	0.24	0.17	0.20	0.18	0.05	0.75	0.20	0.15	0.24	0.18	0.29	0.14
N3	0.21	0.12	0.46	0.55	0.12	0.36	0.17	0.30	0.21	0.17	0.17	0.20	0.12	0.20	0.14	0.06	0.66	0.19	0.13	0.26	0.16	0.33	0.15
N7	0.24	0.17	0.53	0.77	0.11	0.51	0.23	0.38	0.29	0.19	0.25	0.21	0.09	0.25	0.13	0.07	0.94	0.25	0.13	0.34	0.18	0.35	0.14
N9	0.18	0.18	0.43	0.46	0.14	0.35	0.23	0.25	0.28	0.18	0.26	0.20	0.10	0.24	0.13	0.07	0.58	0.18	0.16	0.32	0.20	0.42	0.22
O2'	0.11	0.21	0.20	0.12	0.19	0.13	0.23	0.10	0.25	0.19	0.24	0.22	0.18	0.23	0.16	0.20	0.30	0.11	0.29	0.27	0.29	0.52	0.34
O3'	0.14	0.27	0.14	0.12	0.28	0.18	0.33	0.10	0.35	0.31	0.32	0.25	0.25	0.35	0.25	0.24	0.27	0.11	0.34	0.37	0.33	0.71	0.44
O4'	0.11	0.30	0.19	0.15	0.27	0.15	0.32	0.12	0.34	0.26	0.33	0.29	0.26	0.31	0.21	0.17	0.34	0.10	0.35	0.36	0.37	0.60	0.41
O5'	0.43	0.29	0.37	0.34	0.31	0.52	0.25	0.37	0.23	0.28	0.25	0.30	0.34	0.24	0.33	0.35	0.49	0.52	0.24	0.20	0.27	0.46	0.26
O6	0.27	0.19	0.54	0.93	0.15	0.57	0.15	0.50	0.17	0.21	0.18	0.26	0.18	0.21	0.20	0.10	1.14	0.25	0.26	0.27	0.31	0.26	0.19
OP1	0.57	0.22	0.78	0.90	0.41	0.74	0.47	0.85	0.39	0.66	0.28	0.24	0.25	0.61	0.55	0.67	0.94	0.65	1.03	0.42	1.11	1.25	1.09
OP2	0.55	0.66	0.43	0.54	0.58	0.33	0.48	0.34	0.48	0.45	0.57	0.74	0.68	0.42	0.53	0.48	0.54	0.43	0.45	0.42	0.25	0.53	0.39
P	0.25	0.25	0.36	0.26	0.15	0.44	0.13	0.38	0.15	0.20	0.21	0.34	0.20	0.16	0.18	0.39	0.27	0.38	0.30	0.13	0.33	0.41	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.24	0.00	0.34	0.02	0.32	0.38	0.33
C2	0.03	0.00	0.22	0.24	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.37	0.09	0.25	0.02	0.19	0.31	0.24
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.14	0.04	0.13	0.19	0.17	0.06	0.21	0.24	0.19	0.08	0.05	0.01	0.11	0.02	0.47	0.17	0.48	0.59	0.50
C3'	0.03	0.24	0.01	0.00	0.30	0.01	0.44	0.04	0.45	0.46	0.36	0.17	0.18	0.52	0.29	0.02	0.02	0.01	0.06	0.52	0.15	0.16	0.06
C4	0.02	0.00	0.14	0.30	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.35	0.06	0.24	0.01	0.20	0.31	0.25
C4'	0.01	0.06	0.04	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.15	0.24	0.10	0.06	0.05	0.24	0.12	0.28	0.05	0.01	0.02	0.18	0.14	0.14	0.02
C5	0.01	0.01	0.13	0.44	0.00	0.16	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.49	0.05	0.21	0.01	0.15	0.28	0.21
C5'	0.09	0.14	0.19	0.04	0.16	0.01	0.23	0.00	0.23	0.27	0.18	0.12	0.12	0.29	0.16	0.11	0.15	0.03	0.01	0.26	0.21	0.19	0.01
C6	0.02	0.01	0.17	0.45	0.00	0.15	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.26	0.52	0.07	0.21	0.00	0.14	0.26	0.20
C8	0.01	0.01	0.06	0.46	0.00	0.24	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.49	0.04	0.21	0.01	0.17	0.30	0.23
N1	0.03	0.01	0.21	0.36	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.43	0.08	0.22	0.01	0.15	0.28	0.21
N2	0.03	0.00	0.24	0.17	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.38	0.10	0.26	0.02	0.21	0.32	0.25
N3	0.03	0.00	0.19	0.18	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.34	0.08	0.27	0.01	0.23	0.33	0.26
N7	0.01	0.01	0.08	0.52	0.00	0.24	0.00	0.29	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.58	0.03	0.21	0.01	0.15	0.26	0.20
N9	0.00	0.01	0.05	0.29	0.00	0.12	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.31	0.02	0.26	0.01	0.23	0.34	0.27
O2'	0.03	0.25	0.01	0.02	0.23	0.28	0.25	0.11	0.26	0.22	0.25	0.25	0.24	0.25	0.18	0.00	0.13	0.20	0.30	0.27	0.34	0.60	0.38
O3'	0.24	0.37	0.11	0.02	0.35	0.05	0.49	0.15	0.52	0.49	0.43	0.38	0.34	0.58	0.31	0.13	0.00	0.17	0.33	0.61	0.40	0.44	0.37
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.07	0.04	0.08	0.10	0.08	0.03	0.02	0.20	0.17	0.00	0.23	0.07	0.24	0.22	0.21
O5'	0.34	0.25	0.47	0.06	0.24	0.02	0.21	0.01	0.21	0.21	0.22	0.26	0.27	0.21	0.26	0.30	0.33	0.23	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.17	0.52	0.01	0.18	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.27	0.61	0.07	0.20	0.00	0.15	0.25	0.19
OP1	0.32	0.19	0.48	0.15	0.20	0.14	0.15	0.21	0.14	0.17	0.15	0.21	0.23	0.15	0.23	0.34	0.40	0.24	0.02	0.15	0.00	0.01	0.01
OP2	0.38	0.31	0.59	0.16	0.31	0.14	0.28	0.19	0.26	0.30	0.28	0.32	0.33	0.26	0.34	0.60	0.44	0.22	0.02	0.25	0.01	0.00	0.00
P	0.33	0.24	0.50	0.06	0.25	0.02	0.21	0.01	0.20	0.23	0.21	0.25	0.26	0.20	0.27	0.38	0.37	0.21	0.01	0.19	0.01	0.00	0.00