Doublet Group distance statistics: 50173

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.010, 0.024, 0.037, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.002, 0.019, 0.036, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.011, 0.029, 0.046, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.004, 0.023, 0.041, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.018 std_dev=0.019
C2	A	0, -0.001, 0.019, 0.038, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.019 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.034 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.021, 0.054, 0.087, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.054 std_dev=0.033
N2	A	0, -0.003, 0.040, 0.084, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.040 std_dev=0.043
OP3	B	0, 0.000, 0.167, 0.333, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.167 std_dev=0.167
C2'	B	0, 0.203, 0.417, 0.632, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.417 std_dev=0.214
O4'	A	0, 0.144, 0.386, 0.629, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.386 std_dev=0.242
C2'	A	0, 0.155, 0.422, 0.688, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.422 std_dev=0.266
C4'	A	0, 0.210, 0.550, 0.889, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.550 std_dev=0.339
O2'	B	0, 0.214, 0.561, 0.909, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.561 std_dev=0.348
O2'	A	0, 0.190, 0.551, 0.913, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.551 std_dev=0.362
C3'	A	0, 0.224, 0.609, 0.994, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.609 std_dev=0.385
C3'	B	0, 0.298, 0.830, 1.362, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.830 std_dev=0.532
C1'	B	0, 0.282, 0.818, 1.354, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.818 std_dev=0.536
O3'	A	0, 0.265, 0.809, 1.354, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.809 std_dev=0.545
C5'	A	0, 0.349, 0.923, 1.496, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.923 std_dev=0.574
N9	B	0, 0.326, 0.946, 1.566, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.946 std_dev=0.620
N3	B	0, 0.295, 0.921, 1.547, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.921 std_dev=0.626
C4	B	0, 0.294, 0.945, 1.596, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.945 std_dev=0.651
C4'	B	0, 0.342, 1.070, 1.798, 2.052 max_d=2.052 avg_d=1.070 std_dev=0.728
O3'	B	0, 0.288, 1.038, 1.789, 2.399 max_d=2.399 avg_d=1.038 std_dev=0.750
C2	B	0, 0.303, 1.073, 1.844, 2.637 max_d=2.637 avg_d=1.073 std_dev=0.770
O4'	B	0, 0.365, 1.164, 1.963, 2.228 max_d=2.228 avg_d=1.164 std_dev=0.799
O5'	A	0, 0.264, 1.069, 1.873, 2.506 max_d=2.506 avg_d=1.069 std_dev=0.804
C8	B	0, 0.355, 1.180, 2.005, 2.082 max_d=2.082 avg_d=1.180 std_dev=0.825
C5	B	0, 0.307, 1.140, 1.973, 2.405 max_d=2.405 avg_d=1.140 std_dev=0.833
N2	B	0, 0.359, 1.233, 2.107, 3.074 max_d=3.074 avg_d=1.233 std_dev=0.874
N1	B	0, 0.295, 1.189, 2.083, 3.094 max_d=3.094 avg_d=1.189 std_dev=0.894
C6	B	0, 0.306, 1.250, 2.195, 3.064 max_d=3.064 avg_d=1.250 std_dev=0.944
N7	B	0, 0.353, 1.301, 2.250, 2.476 max_d=2.476 avg_d=1.301 std_dev=0.948
P	A	0, 0.120, 1.183, 2.247, 3.390 max_d=3.390 avg_d=1.183 std_dev=1.063
O5'	B	0, 0.679, 1.757, 2.835, 3.301 max_d=3.301 avg_d=1.757 std_dev=1.078
C5'	B	0, 0.532, 1.646, 2.760, 3.283 max_d=3.283 avg_d=1.646 std_dev=1.114
O6	B	0, 0.340, 1.465, 2.590, 3.697 max_d=3.697 avg_d=1.465 std_dev=1.125
OP1	A	0, 0.105, 1.290, 2.475, 3.768 max_d=3.768 avg_d=1.290 std_dev=1.185
OP2	B	0, 0.962, 2.351, 3.739, 4.523 max_d=4.523 avg_d=2.351 std_dev=1.389
P	B	0, 0.807, 2.232, 3.658, 4.726 max_d=4.726 avg_d=2.232 std_dev=1.425
OP2	A	0, 0.015, 1.488, 2.961, 4.354 max_d=4.354 avg_d=1.488 std_dev=1.473
OP1	B	0, 1.007, 2.565, 4.122, 4.389 max_d=4.389 avg_d=2.565 std_dev=1.557

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.23	0.02	0.23	0.36	0.29
C2	0.04	0.00	0.16	0.17	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.23	0.22	0.03	0.50	0.03	0.55	0.93	0.65
C2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.07	0.02	0.04	0.03	0.06	0.09	0.12	0.20	0.16	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.37	0.04	0.39	0.31	0.35
C3'	0.01	0.17	0.02	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.12	0.16	0.14	0.21	0.15	0.15	0.08	0.03	0.00	0.01	0.42	0.14	0.50	0.16	0.33
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.10	0.03	0.51	0.01	0.56	0.89	0.65
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.12	0.16	0.07	0.09	0.06	0.16	0.07	0.10	0.02	0.00	0.04	0.15	0.16	0.27	0.05
C5	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.12	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.06	0.62	0.01	0.75	1.14	0.82
C5'	0.02	0.10	0.03	0.02	0.12	0.01	0.20	0.00	0.22	0.23	0.15	0.08	0.07	0.26	0.11	0.09	0.04	0.04	0.01	0.27	0.29	0.43	0.03
C6	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.12	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.13	0.13	0.06	0.65	0.01	0.81	1.24	0.88
C8	0.02	0.02	0.09	0.16	0.01	0.16	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.16	0.09	0.61	0.03	0.68	0.95	0.74
N1	0.03	0.01	0.12	0.14	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.17	0.03	0.58	0.02	0.70	1.12	0.78
N2	0.06	0.01	0.20	0.21	0.01	0.09	0.02	0.08	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.28	0.29	0.05	0.46	0.04	0.49	0.86	0.60
N3	0.04	0.01	0.16	0.15	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.19	0.03	0.44	0.03	0.46	0.79	0.56
N7	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.16	0.00	0.26	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.08	0.68	0.03	0.83	1.21	0.90
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.04	0.45	0.02	0.48	0.72	0.55
O2'	0.02	0.23	0.01	0.03	0.12	0.10	0.09	0.09	0.13	0.06	0.19	0.28	0.21	0.06	0.04	0.00	0.07	0.07	0.19	0.12	0.24	0.13	0.16
O3'	0.02	0.22	0.03	0.00	0.10	0.02	0.11	0.04	0.13	0.16	0.17	0.29	0.19	0.15	0.06	0.07	0.00	0.03	0.32	0.14	0.53	0.28	0.28
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.04	0.06	0.09	0.03	0.05	0.03	0.08	0.04	0.07	0.03	0.00	0.12	0.08	0.14	0.27	0.20
O5'	0.23	0.50	0.37	0.42	0.51	0.04	0.62	0.01	0.65	0.61	0.58	0.46	0.44	0.68	0.45	0.19	0.32	0.12	0.00	0.70	0.01	0.02	0.02
O6	0.02	0.03	0.04	0.14	0.01	0.15	0.01	0.27	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.12	0.14	0.08	0.70	0.00	0.92	1.38	0.97
OP1	0.23	0.55	0.39	0.50	0.56	0.16	0.75	0.29	0.81	0.68	0.70	0.49	0.46	0.83	0.48	0.24	0.53	0.14	0.01	0.92	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.93	0.31	0.16	0.89	0.27	1.14	0.43	1.24	0.95	1.12	0.86	0.79	1.21	0.72	0.13	0.28	0.27	0.02	1.38	0.01	0.00	0.00
P	0.29	0.65	0.35	0.33	0.65	0.05	0.82	0.03	0.88	0.74	0.78	0.60	0.56	0.90	0.55	0.16	0.28	0.20	0.02	0.97	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	OP3	P
C1'	0.34	0.75	0.16	0.49	0.54	0.22	0.58	0.42	0.69	0.39	0.76	0.82	0.63	0.49	0.40	0.32	0.81	0.20	0.59	0.72	0.73	0.90	0.01	0.71
C2	0.29	0.46	0.13	0.35	0.41	0.21	0.57	0.41	0.66	0.51	0.54	0.58	0.39	0.64	0.38	0.25	0.53	0.23	0.65	0.83	0.87	1.11	0.04	0.87
C2'	0.26	0.70	0.25	0.63	0.45	0.38	0.49	0.66	0.62	0.31	0.70	0.84	0.57	0.41	0.30	0.40	0.95	0.10	0.84	0.66	1.04	1.18	0.02	1.01
C3'	0.31	0.65	0.39	0.76	0.43	0.55	0.45	0.84	0.55	0.33	0.63	0.78	0.55	0.40	0.32	0.52	1.06	0.26	0.99	0.57	1.16	1.24	0.02	1.13
C4	0.25	0.42	0.12	0.40	0.38	0.23	0.51	0.44	0.59	0.42	0.52	0.46	0.36	0.53	0.33	0.25	0.58	0.17	0.65	0.66	0.81	1.04	0.02	0.83
C4'	0.36	0.71	0.42	0.73	0.51	0.48	0.52	0.70	0.61	0.39	0.68	0.81	0.62	0.45	0.40	0.54	1.07	0.26	0.83	0.62	0.89	1.02	0.01	0.91
C5	0.18	0.23	0.16	0.37	0.20	0.28	0.35	0.49	0.35	0.38	0.23	0.36	0.19	0.45	0.24	0.22	0.45	0.19	0.70	0.44	0.83	1.09	0.03	0.88
C5'	0.48	0.63	0.59	0.92	0.53	0.73	0.55	0.94	0.58	0.51	0.61	0.69	0.59	0.54	0.49	0.64	1.23	0.49	1.03	0.60	1.02	1.14	0.02	1.07
C6	0.20	0.38	0.18	0.33	0.19	0.29	0.31	0.49	0.28	0.41	0.30	0.56	0.28	0.48	0.24	0.22	0.38	0.23	0.71	0.40	0.89	1.16	0.04	0.93
C8	0.13	0.26	0.13	0.47	0.24	0.31	0.33	0.51	0.36	0.27	0.32	0.25	0.20	0.34	0.19	0.23	0.59	0.12	0.69	0.40	0.73	0.96	0.01	0.80
N1	0.24	0.36	0.16	0.33	0.28	0.25	0.43	0.45	0.44	0.47	0.31	0.55	0.29	0.58	0.31	0.23	0.43	0.23	0.68	0.61	0.90	1.16	0.05	0.92
N2	0.32	0.52	0.13	0.35	0.46	0.19	0.63	0.40	0.74	0.55	0.63	0.65	0.44	0.69	0.42	0.25	0.54	0.27	0.64	0.93	0.89	1.13	0.05	0.87
N3	0.31	0.57	0.11	0.39	0.47	0.20	0.61	0.41	0.74	0.49	0.68	0.64	0.47	0.62	0.39	0.26	0.61	0.22	0.63	0.85	0.83	1.05	0.03	0.82
N7	0.14	0.26	0.17	0.39	0.17	0.33	0.27	0.54	0.29	0.30	0.26	0.32	0.20	0.34	0.18	0.22	0.42	0.22	0.74	0.33	0.79	1.05	0.02	0.87
N9	0.25	0.51	0.12	0.46	0.41	0.25	0.49	0.45	0.57	0.36	0.57	0.52	0.43	0.46	0.32	0.27	0.68	0.13	0.64	0.61	0.75	0.96	0.01	0.77
O2'	0.37	0.82	0.20	0.54	0.53	0.24	0.56	0.50	0.70	0.35	0.82	0.99	0.67	0.46	0.39	0.42	0.90	0.22	0.69	0.74	0.92	1.06	0.02	0.87
O3'	0.34	0.68	0.44	0.81	0.44	0.61	0.45	0.92	0.54	0.34	0.64	0.83	0.57	0.40	0.34	0.56	1.12	0.31	1.05	0.56	1.25	1.31	0.01	1.22
O4'	0.34	0.75	0.25	0.54	0.54	0.27	0.56	0.44	0.65	0.38	0.73	0.82	0.66	0.46	0.40	0.40	0.88	0.20	0.57	0.66	0.64	0.79	0.01	0.64
O5'	0.55	0.65	0.76	1.09	0.67	0.74	0.75	1.01	0.76	0.74	0.69	0.62	0.64	0.80	0.65	0.72	1.32	0.51	1.22	0.81	1.20	1.43	0.02	1.29
O6	0.20	0.62	0.21	0.32	0.26	0.33	0.28	0.53	0.42	0.39	0.63	0.76	0.43	0.42	0.23	0.21	0.36	0.29	0.74	0.44	0.93	1.20	0.05	0.98
OP1	0.60	0.54	0.77	1.41	0.73	1.18	0.92	1.56	0.88	1.04	0.69	0.43	0.53	1.10	0.81	0.30	1.72	0.81	1.68	0.99	1.73	1.83	0.01	1.75
OP2	1.07	1.09	1.03	1.63	1.36	1.46	1.60	1.93	1.58	1.68	1.33	0.85	1.07	1.78	1.40	0.36	1.46	1.28	2.22	1.70	2.12	2.45	0.01	2.31
P	0.75	0.73	0.87	1.47	0.92	1.19	1.08	1.52	1.06	1.16	0.88	0.57	0.71	1.22	0.96	0.37	1.66	0.90	1.70	1.15	1.59	1.83	0.01	1.73

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	OP3	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.17	0.03	0.10	0.28	0.00	0.20
C2	0.03	0.00	0.23	0.25	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.40	0.32	0.08	0.40	0.01	0.45	0.71	0.02	0.51
C2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.11	0.02	0.05	0.06	0.09	0.14	0.17	0.29	0.24	0.10	0.04	0.01	0.03	0.01	0.16	0.08	0.19	0.24	0.00	0.18
C3'	0.02	0.25	0.01	0.00	0.15	0.01	0.16	0.06	0.17	0.28	0.21	0.32	0.24	0.24	0.13	0.04	0.00	0.01	0.13	0.17	0.26	0.18	0.01	0.19
C4	0.01	0.01	0.11	0.15	0.00	0.09	0.00	0.21	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.23	0.14	0.05	0.38	0.02	0.40	0.61	0.00	0.46
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.18	0.11	0.12	0.09	0.17	0.09	0.15	0.02	0.00	0.03	0.15	0.09	0.05	0.01	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.13	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.15	0.04	0.44	0.02	0.53	0.72	0.02	0.56
C5'	0.05	0.21	0.06	0.06	0.21	0.01	0.28	0.00	0.30	0.29	0.26	0.20	0.18	0.33	0.19	0.12	0.04	0.02	0.00	0.34	0.06	0.02	0.02	0.02
C6	0.03	0.00	0.09	0.17	0.02	0.13	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.16	0.05	0.47	0.01	0.60	0.81	0.01	0.62
C8	0.01	0.01	0.14	0.28	0.01	0.18	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.09	0.31	0.05	0.41	0.02	0.45	0.52	0.05	0.46
N1	0.03	0.00	0.17	0.21	0.01	0.11	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.34	0.23	0.07	0.45	0.01	0.55	0.79	0.01	0.58
N2	0.03	0.01	0.29	0.32	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.46	0.43	0.09	0.40	0.01	0.45	0.72	0.04	0.50
N3	0.03	0.00	0.24	0.24	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.37	0.29	0.08	0.36	0.02	0.37	0.61	0.02	0.44
N7	0.01	0.01	0.10	0.24	0.00	0.17	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.28	0.04	0.47	0.02	0.58	0.72	0.05	0.58
N9	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01	0.09	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.11	0.03	0.31	0.02	0.30	0.45	0.02	0.36
O2'	0.03	0.40	0.01	0.04	0.23	0.15	0.19	0.12	0.26	0.09	0.34	0.46	0.37	0.10	0.08	0.00	0.08	0.14	0.06	0.24	0.26	0.16	0.01	0.11
O3'	0.02	0.32	0.03	0.00	0.14	0.02	0.15	0.04	0.16	0.31	0.23	0.43	0.29	0.28	0.11	0.08	0.00	0.03	0.22	0.18	0.52	0.38	0.01	0.37
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.07	0.09	0.08	0.04	0.03	0.14	0.03	0.00	0.14	0.05	0.11	0.25	0.01	0.21
O5'	0.17	0.40	0.16	0.13	0.38	0.03	0.44	0.00	0.47	0.41	0.45	0.40	0.36	0.47	0.31	0.06	0.22	0.14	0.00	0.50	0.02	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.08	0.17	0.02	0.15	0.02	0.34	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.24	0.18	0.05	0.50	0.00	0.69	0.88	0.03	0.68
OP1	0.10	0.45	0.19	0.26	0.40	0.09	0.53	0.06	0.60	0.45	0.55	0.45	0.37	0.58	0.30	0.26	0.52	0.11	0.02	0.69	0.00	0.01	0.00	0.00
OP2	0.28	0.71	0.24	0.18	0.61	0.05	0.72	0.02	0.81	0.52	0.79	0.72	0.61	0.72	0.45	0.16	0.38	0.25	0.02	0.88	0.01	0.00	0.01	0.00
OP3	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.51	0.18	0.19	0.46	0.04	0.56	0.02	0.62	0.46	0.58	0.50	0.44	0.58	0.36	0.11	0.37	0.21	0.01	0.68	0.00	0.00	0.01	0.00