Doublet Group distance statistics: 50180

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.004, 0.026, 0.049, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.026 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.011, 0.039, 0.066, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.039 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.007, 0.036, 0.065, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.036 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.005, 0.034, 0.064, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.034 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.007, 0.036, 0.066, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.036 std_dev=0.030
N3	A	0, 0.005, 0.035, 0.064, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.035 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.010, 0.041, 0.071, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.041 std_dev=0.031
O6	A	0, 0.012, 0.044, 0.075, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.044 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.008, 0.064, 0.121, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.064 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.082, 0.255, 0.427, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.255 std_dev=0.173
C2'	A	0, 0.095, 0.322, 0.550, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.322 std_dev=0.228
O2'	A	0, 0.023, 0.277, 0.531, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.277 std_dev=0.254
C2'	B	0, 0.138, 0.459, 0.781, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.459 std_dev=0.321
O5'	A	0, 0.099, 0.428, 0.756, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.428 std_dev=0.329
C4'	A	0, 0.145, 0.478, 0.812, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.478 std_dev=0.334
O2'	B	0, 0.146, 0.490, 0.835, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.490 std_dev=0.345
C3'	B	0, 0.123, 0.468, 0.814, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.468 std_dev=0.346
O3'	B	0, 0.145, 0.507, 0.869, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.507 std_dev=0.362
P	A	0, 0.078, 0.442, 0.805, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.442 std_dev=0.364
C3'	A	0, 0.165, 0.553, 0.941, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.553 std_dev=0.388
OP2	A	0, 0.033, 0.454, 0.876, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.454 std_dev=0.421
C5'	A	0, 0.171, 0.606, 1.042, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.606 std_dev=0.435
OP1	A	0, 0.107, 0.593, 1.078, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.593 std_dev=0.486
C1'	B	0, 0.187, 0.761, 1.334, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.761 std_dev=0.574
C4'	B	0, 0.166, 0.810, 1.455, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.810 std_dev=0.645
O3'	A	0, 0.297, 1.009, 1.720, 1.737 max_d=1.737 avg_d=1.009 std_dev=0.711
C5'	B	0, 0.176, 0.970, 1.764, 2.293 max_d=2.293 avg_d=0.970 std_dev=0.794
O4'	B	0, 0.166, 0.987, 1.809, 2.314 max_d=2.314 avg_d=0.987 std_dev=0.822
N9	B	0, 0.119, 1.136, 2.153, 2.791 max_d=2.791 avg_d=1.136 std_dev=1.017
C4	B	0, 0.047, 1.358, 2.669, 3.640 max_d=3.640 avg_d=1.358 std_dev=1.311
C8	B	0, 0.070, 1.424, 2.777, 3.702 max_d=3.702 avg_d=1.424 std_dev=1.354
N3	B	0, 0.010, 1.370, 2.730, 3.814 max_d=3.814 avg_d=1.370 std_dev=1.360
OP2	B	0, 0.049, 1.425, 2.801, 3.971 max_d=3.971 avg_d=1.425 std_dev=1.376
O5'	B	0, 0.545, 2.236, 3.928, 4.659 max_d=4.659 avg_d=2.236 std_dev=1.691
C5	B	0, -0.015, 1.695, 3.406, 4.730 max_d=4.730 avg_d=1.695 std_dev=1.710
N7	B	0, 0.005, 1.730, 3.454, 4.747 max_d=4.747 avg_d=1.730 std_dev=1.725
C2	B	0, -0.097, 1.723, 3.543, 5.090 max_d=5.090 avg_d=1.723 std_dev=1.820
N2	B	0, -0.182, 1.889, 3.959, 5.795 max_d=5.795 avg_d=1.889 std_dev=2.071
P	B	0, 0.479, 2.554, 4.630, 5.857 max_d=5.857 avg_d=2.554 std_dev=2.075
C6	B	0, -0.091, 2.025, 4.141, 5.881 max_d=5.881 avg_d=2.025 std_dev=2.116
N1	B	0, -0.130, 2.010, 4.151, 5.971 max_d=5.971 avg_d=2.010 std_dev=2.141
O6	B	0, -0.130, 2.364, 4.859, 6.946 max_d=6.946 avg_d=2.364 std_dev=2.494
OP1	B	0, 0.822, 3.662, 6.501, 7.608 max_d=7.608 avg_d=3.662 std_dev=2.840

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.12	0.02	0.08	0.25	0.11
C2	0.05	0.00	0.16	0.22	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.22	0.03	0.10	0.01	0.18	0.41	0.21
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.04	0.08	0.09	0.13	0.20	0.15	0.08	0.04	0.00	0.02	0.01	0.12	0.08	0.11	0.36	0.17
C3'	0.04	0.22	0.01	0.00	0.17	0.00	0.18	0.02	0.20	0.12	0.22	0.25	0.20	0.15	0.12	0.02	0.01	0.02	0.12	0.20	0.09	0.35	0.19
C4	0.02	0.01	0.08	0.17	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.16	0.02	0.11	0.02	0.17	0.38	0.20
C4'	0.00	0.08	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.06	0.11	0.07	0.06	0.03	0.14	0.05	0.00	0.01	0.06	0.10	0.17	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.21	0.03	0.11	0.02	0.26	0.42	0.25
C5'	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.02	0.07	0.04	0.08	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.03
C6	0.02	0.01	0.08	0.20	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.25	0.03	0.11	0.01	0.30	0.44	0.27
C8	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.07	0.15	0.04	0.13	0.03	0.20	0.34	0.21
N1	0.04	0.00	0.13	0.22	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.25	0.02	0.10	0.01	0.26	0.44	0.25
N2	0.08	0.00	0.20	0.25	0.01	0.11	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.09	0.24	0.05	0.11	0.02	0.16	0.41	0.20
N3	0.05	0.01	0.15	0.20	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.18	0.03	0.11	0.02	0.14	0.37	0.18
N7	0.02	0.02	0.08	0.15	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.08	0.20	0.04	0.12	0.04	0.30	0.41	0.27
N9	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.12	0.02	0.12	0.32	0.17
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.14	0.07	0.11	0.06	0.07	0.08	0.09	0.07	0.08	0.04	0.00	0.09	0.11	0.03	0.07	0.09	0.30	0.10
O3'	0.05	0.22	0.02	0.01	0.16	0.05	0.21	0.01	0.25	0.15	0.25	0.24	0.18	0.20	0.10	0.09	0.00	0.07	0.22	0.28	0.08	0.41	0.23
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.05	0.03	0.04	0.01	0.11	0.07	0.00	0.15	0.04	0.14	0.16	0.10
O5'	0.12	0.10	0.12	0.12	0.11	0.01	0.11	0.01	0.11	0.13	0.10	0.11	0.11	0.12	0.12	0.03	0.22	0.15	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.20	0.02	0.06	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.07	0.28	0.04	0.13	0.00	0.37	0.45	0.30
OP1	0.08	0.18	0.11	0.09	0.17	0.10	0.26	0.14	0.30	0.20	0.26	0.16	0.14	0.30	0.12	0.09	0.08	0.14	0.01	0.37	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.41	0.36	0.35	0.38	0.17	0.42	0.04	0.44	0.34	0.44	0.41	0.37	0.41	0.32	0.30	0.41	0.16	0.01	0.45	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.21	0.17	0.19	0.20	0.06	0.25	0.03	0.27	0.21	0.25	0.20	0.18	0.27	0.17	0.10	0.23	0.10	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.41	1.30	0.30	0.20	0.96	0.18	1.03	0.21	1.20	0.69	1.32	1.41	1.09	0.87	0.70	0.32	0.21	0.30	0.60	1.22	0.62	0.41	0.55
C2	0.48	1.22	0.26	0.27	1.07	0.36	1.43	0.43	1.70	1.11	1.58	1.19	0.92	1.42	0.88	0.42	0.27	0.54	1.04	1.92	1.38	0.87	1.15
C2'	0.42	1.30	0.33	0.27	0.94	0.23	1.02	0.30	1.21	0.67	1.35	1.44	1.08	0.85	0.69	0.29	0.21	0.32	0.67	1.25	0.57	0.41	0.61
C3'	0.39	1.14	0.35	0.28	0.79	0.25	0.79	0.32	0.95	0.46	1.12	1.30	0.98	0.59	0.56	0.28	0.24	0.29	0.51	0.94	0.31	0.24	0.40
C4	0.47	1.17	0.26	0.27	1.00	0.34	1.21	0.39	1.35	0.95	1.33	1.17	0.95	1.16	0.81	0.38	0.27	0.50	0.92	1.42	1.10	0.73	0.96
C4'	0.39	1.14	0.38	0.22	0.78	0.15	0.73	0.18	0.88	0.41	1.07	1.32	1.00	0.52	0.54	0.30	0.14	0.22	0.44	0.85	0.40	0.10	0.34
C5	0.45	0.94	0.25	0.32	0.85	0.42	1.08	0.49	1.15	0.96	1.08	0.95	0.76	1.13	0.76	0.37	0.30	0.58	1.08	1.22	1.30	0.86	1.15
C5'	0.36	0.92	0.40	0.24	0.60	0.18	0.49	0.21	0.61	0.23	0.81	1.10	0.83	0.29	0.40	0.36	0.13	0.21	0.42	0.54	0.47	0.12	0.35
C6	0.45	0.89	0.26	0.33	0.81	0.46	1.15	0.54	1.24	1.06	1.10	0.96	0.68	1.29	0.76	0.40	0.31	0.63	1.21	1.41	1.57	0.99	1.35
C8	0.41	0.87	0.25	0.30	0.74	0.35	0.78	0.40	0.83	0.64	0.87	0.89	0.77	0.72	0.62	0.29	0.29	0.46	0.82	0.82	0.82	0.59	0.79
N1	0.48	1.00	0.26	0.31	0.94	0.43	1.34	0.51	1.53	1.13	1.32	1.02	0.76	1.42	0.84	0.41	0.29	0.61	1.17	1.79	1.57	0.98	1.31
N2	0.48	1.29	0.25	0.26	1.11	0.35	1.51	0.41	1.84	1.15	1.73	1.25	0.96	1.49	0.90	0.43	0.26	0.53	1.02	2.13	1.42	0.88	1.16
N3	0.47	1.34	0.26	0.25	1.10	0.31	1.37	0.36	1.61	1.03	1.60	1.34	1.04	1.30	0.86	0.40	0.25	0.49	0.91	1.74	1.16	0.75	0.98
N7	0.42	0.78	0.23	0.34	0.69	0.44	0.79	0.51	0.82	0.76	0.82	0.80	0.67	0.83	0.63	0.31	0.31	0.58	1.06	0.82	1.15	0.79	1.07
N9	0.45	1.14	0.28	0.26	0.94	0.29	1.03	0.33	1.15	0.78	1.20	1.18	0.98	0.93	0.74	0.34	0.25	0.43	0.76	1.16	0.83	0.58	0.75
O2'	0.37	1.44	0.29	0.16	0.99	0.11	1.09	0.14	1.34	0.68	1.51	1.63	1.15	0.90	0.68	0.34	0.20	0.24	0.57	1.41	0.53	0.32	0.51
O3'	0.39	1.19	0.37	0.28	0.80	0.24	0.78	0.34	0.96	0.42	1.16	1.39	1.01	0.55	0.54	0.31	0.23	0.27	0.44	0.95	0.32	0.15	0.31
O4'	0.40	1.19	0.34	0.17	0.86	0.12	0.85	0.13	0.98	0.54	1.14	1.32	1.05	0.67	0.61	0.27	0.18	0.24	0.46	0.97	0.47	0.24	0.37
O5'	0.26	0.62	0.28	0.18	0.39	0.08	0.32	0.17	0.39	0.22	0.53	0.74	0.55	0.22	0.27	0.25	0.01	0.16	0.45	0.35	0.34	0.18	0.35
O6	0.43	0.84	0.27	0.34	0.66	0.50	0.96	0.59	1.04	1.01	0.98	0.96	0.61	1.20	0.67	0.40	0.32	0.67	1.32	1.23	1.76	1.09	1.50
OP1	0.15	0.42	0.06	0.13	0.32	0.29	0.43	0.44	0.46	0.50	0.42	0.52	0.36	0.55	0.30	0.12	0.01	0.26	0.60	0.53	0.93	0.63	0.70
OP2	0.05	0.56	0.11	0.04	0.38	0.15	0.48	0.29	0.58	0.35	0.61	0.62	0.45	0.45	0.23	0.13	0.02	0.14	0.63	0.64	0.41	0.41	0.54
P	0.02	0.43	0.06	0.02	0.25	0.08	0.29	0.18	0.35	0.27	0.40	0.53	0.37	0.31	0.13	0.10	0.01	0.05	0.39	0.39	0.37	0.26	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.20	0.03	0.69	0.48	0.22
C2	0.03	0.00	0.21	0.30	0.01	0.13	0.01	0.31	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.22	0.38	0.06	0.34	0.01	0.84	0.59	0.26
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.11	0.03	0.06	0.06	0.09	0.11	0.15	0.26	0.22	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.25	0.08	0.51	0.29	0.18
C3'	0.02	0.30	0.01	0.00	0.20	0.01	0.21	0.02	0.24	0.21	0.28	0.35	0.28	0.22	0.12	0.01	0.01	0.02	0.32	0.25	0.37	0.14	0.22
C4	0.01	0.01	0.11	0.20	0.00	0.12	0.00	0.33	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.12	0.21	0.03	0.34	0.02	0.85	0.60	0.26
C4'	0.01	0.13	0.03	0.01	0.12	0.00	0.17	0.02	0.18	0.21	0.16	0.15	0.11	0.21	0.12	0.07	0.02	0.00	0.02	0.22	0.29	0.23	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.21	0.00	0.17	0.00	0.45	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.22	0.02	0.41	0.02	0.94	0.67	0.33
C5'	0.12	0.31	0.06	0.02	0.33	0.02	0.45	0.00	0.46	0.48	0.40	0.27	0.25	0.51	0.33	0.04	0.08	0.04	0.02	0.52	0.19	0.10	0.04
C6	0.02	0.01	0.09	0.24	0.02	0.18	0.01	0.46	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.11	0.27	0.03	0.44	0.00	0.95	0.69	0.36
C8	0.01	0.02	0.11	0.21	0.01	0.21	0.02	0.48	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.21	0.06	0.38	0.05	0.94	0.65	0.28
N1	0.03	0.01	0.15	0.28	0.02	0.16	0.01	0.40	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.33	0.05	0.39	0.01	0.90	0.65	0.31
N2	0.03	0.01	0.26	0.35	0.02	0.15	0.01	0.27	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.28	0.46	0.07	0.32	0.02	0.80	0.57	0.25
N3	0.02	0.01	0.22	0.28	0.00	0.11	0.00	0.25	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.33	0.05	0.30	0.02	0.79	0.56	0.24
N7	0.01	0.01	0.08	0.22	0.00	0.21	0.01	0.51	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.23	0.04	0.45	0.05	0.99	0.71	0.36
N9	0.00	0.02	0.03	0.12	0.01	0.12	0.01	0.33	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.30	0.03	0.82	0.57	0.23
O2'	0.01	0.22	0.01	0.01	0.12	0.07	0.08	0.04	0.11	0.06	0.17	0.28	0.22	0.05	0.04	0.00	0.05	0.07	0.11	0.09	0.39	0.26	0.10
O3'	0.02	0.38	0.02	0.01	0.21	0.02	0.22	0.08	0.27	0.21	0.33	0.46	0.33	0.23	0.10	0.05	0.00	0.01	0.28	0.29	0.27	0.10	0.23
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.03	0.06	0.05	0.07	0.05	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.21	0.04	0.67	0.53	0.28
O5'	0.20	0.34	0.25	0.32	0.34	0.02	0.41	0.02	0.44	0.38	0.39	0.32	0.30	0.45	0.30	0.11	0.28	0.21	0.00	0.49	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.08	0.25	0.02	0.22	0.02	0.52	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.09	0.29	0.04	0.49	0.00	1.00	0.74	0.42
OP1	0.69	0.84	0.51	0.37	0.85	0.29	0.94	0.19	0.95	0.94	0.90	0.80	0.79	0.99	0.82	0.39	0.27	0.67	0.02	1.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.48	0.59	0.29	0.14	0.60	0.23	0.67	0.10	0.69	0.65	0.65	0.57	0.56	0.71	0.57	0.26	0.10	0.53	0.01	0.74	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.26	0.18	0.22	0.26	0.04	0.33	0.04	0.36	0.28	0.31	0.25	0.24	0.36	0.23	0.10	0.23	0.28	0.01	0.42	0.01	0.01	0.00