Doublet Group distance statistics: 50181

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.011
O6	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.006, 0.023, 0.039, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.016
O2'	A	0, 0.150, 0.387, 0.624, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.387 std_dev=0.237
C2'	A	0, 0.110, 0.362, 0.614, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.362 std_dev=0.252
O4'	A	0, 0.072, 0.348, 0.623, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.348 std_dev=0.276
O3'	B	0, 0.259, 0.698, 1.137, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.698 std_dev=0.439
C3'	A	0, 0.125, 0.564, 1.003, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.564 std_dev=0.439
C4'	A	0, 0.089, 0.529, 0.970, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.529 std_dev=0.440
C8	B	0, 0.384, 0.845, 1.306, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.845 std_dev=0.461
N7	B	0, 0.409, 0.878, 1.348, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.878 std_dev=0.470
N9	B	0, 0.356, 0.828, 1.300, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.828 std_dev=0.472
C2'	B	0, 0.224, 0.714, 1.205, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.714 std_dev=0.491
C1'	B	0, 0.327, 0.827, 1.327, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.827 std_dev=0.500
O2'	B	0, 0.205, 0.707, 1.209, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.707 std_dev=0.502
C3'	B	0, 0.301, 0.814, 1.327, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.814 std_dev=0.513
C5	B	0, 0.372, 0.896, 1.419, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.896 std_dev=0.523
C4	B	0, 0.348, 0.876, 1.404, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.876 std_dev=0.528
P	A	0, 0.244, 0.788, 1.333, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.788 std_dev=0.545
O5'	A	0, 0.183, 0.730, 1.276, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.730 std_dev=0.547
C4'	B	0, 0.389, 0.941, 1.492, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.941 std_dev=0.552
O4'	B	0, 0.359, 0.925, 1.491, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.925 std_dev=0.566
O3'	A	0, 0.208, 0.791, 1.373, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.791 std_dev=0.583
N3	B	0, 0.330, 0.950, 1.569, 1.761 max_d=1.761 avg_d=0.950 std_dev=0.620
C6	B	0, 0.348, 0.975, 1.602, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.975 std_dev=0.627
O6	B	0, 0.352, 1.018, 1.685, 1.848 max_d=1.848 avg_d=1.018 std_dev=0.666
OP1	A	0, 0.296, 0.981, 1.666, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.981 std_dev=0.685
C5'	B	0, 0.496, 1.191, 1.886, 1.983 max_d=1.983 avg_d=1.191 std_dev=0.695
C2	B	0, 0.348, 1.051, 1.754, 1.946 max_d=1.946 avg_d=1.051 std_dev=0.703
N1	B	0, 0.344, 1.055, 1.766, 1.874 max_d=1.874 avg_d=1.055 std_dev=0.711
O5'	B	0, 0.706, 1.462, 2.217, 2.083 max_d=2.083 avg_d=1.462 std_dev=0.755
C5'	A	0, 0.175, 0.937, 1.698, 1.958 max_d=1.958 avg_d=0.937 std_dev=0.761
N2	B	0, 0.395, 1.204, 2.012, 2.287 max_d=2.287 avg_d=1.204 std_dev=0.808
P	B	0, 0.800, 1.616, 2.431, 2.203 max_d=2.203 avg_d=1.616 std_dev=0.816
OP2	B	0, 0.739, 1.647, 2.556, 2.639 max_d=2.639 avg_d=1.647 std_dev=0.909
OP2	A	0, 0.231, 1.143, 2.054, 2.595 max_d=2.595 avg_d=1.143 std_dev=0.911
OP1	B	0, 1.040, 2.223, 3.405, 3.373 max_d=3.373 avg_d=2.223 std_dev=1.182

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.28	0.02	0.12	0.13	0.11
C2	0.03	0.00	0.17	0.26	0.01	0.17	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.29	0.04	0.44	0.01	0.30	0.38	0.26
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.02	0.09	0.04	0.13	0.19	0.16	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.30	0.07	0.23	0.14	0.13
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.14	0.00	0.10	0.03	0.15	0.07	0.22	0.31	0.24	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.31	0.13	0.34	0.21	0.16
C4	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.11	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.03	0.48	0.01	0.30	0.40	0.28
C4'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.14	0.07	0.16	0.19	0.15	0.08	0.06	0.04	0.03	0.00	0.01	0.13	0.13	0.25	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.11	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.57	0.01	0.40	0.56	0.38
C5'	0.03	0.28	0.02	0.03	0.21	0.01	0.23	0.00	0.27	0.16	0.29	0.30	0.24	0.20	0.13	0.04	0.06	0.01	0.00	0.28	0.30	0.42	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.15	0.01	0.14	0.01	0.27	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.16	0.04	0.58	0.00	0.43	0.59	0.40
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.59	0.02	0.35	0.53	0.37
N1	0.03	0.00	0.13	0.22	0.01	0.16	0.01	0.29	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.25	0.04	0.52	0.00	0.38	0.49	0.34
N2	0.03	0.00	0.19	0.31	0.01	0.19	0.01	0.30	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.36	0.05	0.39	0.01	0.27	0.34	0.23
N3	0.02	0.01	0.16	0.24	0.01	0.15	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.26	0.04	0.40	0.01	0.25	0.32	0.22
N7	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.08	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.63	0.02	0.44	0.67	0.45
N9	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.46	0.02	0.25	0.34	0.25
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.08	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.07	0.03	0.11	0.05	0.14	0.09	0.08
O3'	0.03	0.29	0.03	0.01	0.15	0.03	0.10	0.06	0.16	0.07	0.25	0.36	0.26	0.04	0.04	0.07	0.00	0.04	0.18	0.14	0.31	0.32	0.09
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.00	0.14	0.04	0.11	0.07	0.10
O5'	0.28	0.44	0.30	0.31	0.48	0.01	0.57	0.00	0.58	0.59	0.52	0.39	0.40	0.63	0.46	0.11	0.18	0.14	0.00	0.62	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.13	0.01	0.28	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.14	0.04	0.62	0.00	0.50	0.67	0.45
OP1	0.12	0.30	0.23	0.34	0.30	0.13	0.40	0.30	0.43	0.35	0.38	0.27	0.25	0.44	0.25	0.14	0.31	0.11	0.02	0.50	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.38	0.14	0.21	0.40	0.25	0.56	0.42	0.59	0.53	0.49	0.34	0.32	0.67	0.34	0.09	0.32	0.07	0.01	0.67	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.26	0.13	0.16	0.28	0.08	0.38	0.01	0.40	0.37	0.34	0.23	0.22	0.45	0.25	0.08	0.09	0.10	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.29	0.22	0.26	0.26	0.24	0.33	0.23	0.39	0.24	0.37	0.24	0.23	0.31	0.20	0.28	0.22	0.19	0.47	0.43	0.43	0.39	0.38
C2	0.30	0.37	0.34	0.33	0.28	0.28	0.25	0.22	0.26	0.23	0.26	0.48	0.37	0.25	0.26	0.36	0.11	0.26	0.65	0.33	0.56	0.45	0.50
C2'	0.19	0.32	0.21	0.22	0.25	0.21	0.33	0.20	0.40	0.22	0.40	0.31	0.25	0.30	0.19	0.28	0.19	0.18	0.46	0.46	0.42	0.35	0.35
C3'	0.18	0.26	0.21	0.16	0.19	0.18	0.25	0.18	0.33	0.16	0.33	0.27	0.20	0.23	0.15	0.35	0.13	0.14	0.42	0.39	0.40	0.31	0.30
C4	0.24	0.18	0.31	0.32	0.17	0.26	0.21	0.22	0.25	0.18	0.15	0.25	0.24	0.24	0.18	0.34	0.10	0.22	0.60	0.35	0.53	0.43	0.47
C4'	0.17	0.26	0.19	0.14	0.18	0.17	0.22	0.21	0.29	0.14	0.30	0.27	0.21	0.19	0.13	0.38	0.22	0.13	0.34	0.33	0.34	0.35	0.27
C5	0.24	0.29	0.33	0.34	0.18	0.27	0.12	0.23	0.15	0.13	0.17	0.36	0.31	0.17	0.17	0.35	0.12	0.22	0.64	0.27	0.57	0.45	0.50
C5'	0.19	0.13	0.26	0.11	0.06	0.19	0.12	0.22	0.19	0.07	0.19	0.15	0.08	0.12	0.07	0.49	0.19	0.16	0.32	0.25	0.32	0.36	0.23
C6	0.28	0.42	0.35	0.36	0.27	0.28	0.15	0.23	0.14	0.15	0.31	0.50	0.40	0.14	0.23	0.37	0.15	0.25	0.68	0.14	0.60	0.48	0.53
C8	0.17	0.21	0.26	0.32	0.19	0.26	0.28	0.26	0.32	0.19	0.27	0.21	0.20	0.28	0.15	0.29	0.09	0.21	0.56	0.37	0.51	0.43	0.44
N1	0.30	0.43	0.35	0.35	0.29	0.29	0.21	0.22	0.18	0.20	0.29	0.54	0.41	0.20	0.26	0.37	0.12	0.26	0.68	0.21	0.59	0.48	0.53
N2	0.33	0.42	0.34	0.33	0.32	0.28	0.29	0.21	0.32	0.26	0.34	0.54	0.40	0.28	0.29	0.37	0.13	0.28	0.65	0.37	0.55	0.45	0.50
N3	0.28	0.28	0.31	0.31	0.24	0.27	0.26	0.22	0.30	0.22	0.25	0.35	0.31	0.27	0.23	0.35	0.13	0.24	0.61	0.39	0.52	0.43	0.47
N7	0.21	0.28	0.30	0.34	0.21	0.26	0.22	0.26	0.28	0.14	0.26	0.30	0.29	0.22	0.16	0.31	0.16	0.22	0.62	0.33	0.56	0.45	0.48
N9	0.18	0.15	0.26	0.29	0.17	0.25	0.27	0.23	0.33	0.20	0.26	0.13	0.15	0.27	0.15	0.31	0.11	0.19	0.54	0.39	0.49	0.41	0.42
O2'	0.22	0.41	0.21	0.24	0.31	0.24	0.38	0.23	0.46	0.26	0.48	0.43	0.33	0.34	0.24	0.26	0.31	0.21	0.43	0.51	0.41	0.38	0.35
O3'	0.15	0.29	0.17	0.14	0.20	0.17	0.26	0.19	0.35	0.16	0.36	0.32	0.22	0.23	0.14	0.32	0.17	0.13	0.37	0.41	0.36	0.31	0.27
O4'	0.18	0.26	0.19	0.21	0.23	0.20	0.29	0.21	0.34	0.21	0.32	0.24	0.22	0.27	0.18	0.32	0.27	0.15	0.40	0.37	0.38	0.36	0.32
O5'	0.29	0.39	0.34	0.18	0.38	0.11	0.40	0.20	0.42	0.36	0.41	0.37	0.37	0.39	0.35	0.33	0.01	0.16	0.30	0.43	0.37	0.15	0.27
O6	0.29	0.49	0.36	0.38	0.33	0.28	0.23	0.23	0.29	0.16	0.44	0.54	0.44	0.12	0.26	0.37	0.19	0.25	0.71	0.21	0.64	0.51	0.56
OP1	0.30	0.17	0.27	0.30	0.20	0.41	0.21	0.39	0.21	0.24	0.18	0.17	0.19	0.24	0.24	0.25	0.01	0.37	0.20	0.24	0.22	0.30	0.13
OP2	0.41	0.39	0.35	0.39	0.46	0.47	0.50	0.55	0.48	0.52	0.43	0.34	0.40	0.53	0.47	0.30	0.02	0.46	0.80	0.49	0.76	0.48	0.69
P	0.04	0.12	0.09	0.01	0.14	0.18	0.20	0.25	0.20	0.19	0.17	0.11	0.10	0.22	0.13	0.05	0.01	0.09	0.29	0.23	0.37	0.12	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.16	0.01	0.15	0.44	0.19
C2	0.04	0.00	0.11	0.11	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.20	0.03	0.34	0.01	0.29	0.48	0.29
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.03	0.04	0.02	0.05	0.04	0.09	0.13	0.10	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.22	0.04	0.22	0.33	0.15
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.07	0.11	0.09	0.14	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.29	0.07	0.30	0.21	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.22	0.02	0.35	0.00	0.29	0.48	0.29
C4'	0.01	0.08	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.07	0.09	0.07	0.05	0.02	0.10	0.05	0.00	0.02	0.05	0.11	0.37	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.32	0.02	0.42	0.01	0.36	0.50	0.35
C5'	0.04	0.15	0.02	0.03	0.13	0.01	0.16	0.00	0.18	0.14	0.17	0.15	0.13	0.16	0.10	0.09	0.15	0.02	0.00	0.19	0.17	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.33	0.01	0.43	0.00	0.38	0.50	0.36
C8	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.35	0.02	0.40	0.01	0.33	0.49	0.33
N1	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.27	0.02	0.39	0.01	0.34	0.49	0.33
N2	0.05	0.00	0.13	0.14	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.20	0.04	0.31	0.02	0.27	0.47	0.27
N3	0.04	0.00	0.10	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.17	0.03	0.30	0.00	0.25	0.47	0.26
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.39	0.02	0.45	0.02	0.39	0.51	0.37
N9	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.22	0.01	0.31	0.01	0.25	0.47	0.27
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.10	0.05	0.09	0.07	0.02	0.10	0.14	0.11	0.02	0.02	0.00	0.33	0.05	0.13	0.06	0.21	0.34	0.14
O3'	0.06	0.20	0.06	0.00	0.22	0.05	0.32	0.15	0.33	0.35	0.27	0.20	0.17	0.39	0.22	0.33	0.00	0.05	0.20	0.38	0.37	0.37	0.19
O4'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.06	0.01	0.11	0.46	0.20
O5'	0.16	0.34	0.22	0.29	0.35	0.02	0.42	0.00	0.43	0.40	0.39	0.31	0.30	0.45	0.31	0.13	0.20	0.06	0.00	0.47	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.38	0.01	0.47	0.00	0.42	0.51	0.39
OP1	0.15	0.29	0.22	0.30	0.29	0.11	0.36	0.17	0.38	0.33	0.34	0.27	0.25	0.39	0.25	0.21	0.37	0.11	0.01	0.42	0.00	0.01	0.00
OP2	0.44	0.48	0.33	0.21	0.48	0.37	0.50	0.40	0.50	0.49	0.49	0.47	0.47	0.51	0.47	0.34	0.37	0.46	0.00	0.51	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.29	0.15	0.18	0.29	0.06	0.35	0.01	0.36	0.33	0.33	0.27	0.26	0.37	0.27	0.14	0.19	0.20	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00