Doublet Group distance statistics: 50184

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.002, 0.012, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.011, 0.030, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.030 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.009, 0.028, 0.048, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, -0.002, 0.022, 0.045, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.022 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.014, 0.040, 0.066, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.040 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.019, 0.053, 0.087, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.053 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.060, 0.200, 0.340, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.200 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.067, 0.239, 0.411, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.239 std_dev=0.172
O4'	A	0, 0.025, 0.227, 0.429, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.227 std_dev=0.202
C3'	A	0, 0.156, 0.406, 0.656, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.406 std_dev=0.250
C4'	A	0, 0.132, 0.409, 0.687, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.409 std_dev=0.277
O3'	A	0, 0.228, 0.559, 0.891, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.559 std_dev=0.331
O2'	B	0, 0.040, 0.386, 0.732, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.386 std_dev=0.346
C2'	B	0, 0.129, 0.645, 1.161, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.645 std_dev=0.516
C5'	A	0, 0.150, 0.681, 1.212, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.681 std_dev=0.531
O5'	A	0, 0.145, 0.724, 1.303, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.724 std_dev=0.579
P	A	0, 0.219, 0.819, 1.419, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.819 std_dev=0.600
OP2	A	0, 0.233, 0.840, 1.447, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.840 std_dev=0.607
C1'	B	0, 0.166, 0.783, 1.401, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.783 std_dev=0.617
O3'	B	0, 0.246, 0.917, 1.588, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.917 std_dev=0.671
C3'	B	0, 0.221, 0.923, 1.625, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.923 std_dev=0.702
O4'	B	0, 0.288, 1.185, 2.082, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.185 std_dev=0.897
OP1	A	0, 0.113, 1.145, 2.177, 2.731 max_d=2.731 avg_d=1.145 std_dev=1.032
C4'	B	0, 0.351, 1.419, 2.487, 2.495 max_d=2.495 avg_d=1.419 std_dev=1.068
N9	B	0, -0.078, 1.128, 2.335, 3.057 max_d=3.057 avg_d=1.128 std_dev=1.207
O5'	B	0, 0.317, 1.826, 3.336, 4.135 max_d=4.135 avg_d=1.826 std_dev=1.510
C4	B	0, -0.256, 1.344, 2.945, 4.019 max_d=4.019 avg_d=1.344 std_dev=1.601
N3	B	0, -0.194, 1.416, 3.026, 4.117 max_d=4.117 avg_d=1.416 std_dev=1.610
C8	B	0, -0.276, 1.441, 3.158, 4.311 max_d=4.311 avg_d=1.441 std_dev=1.717
C5'	B	0, 0.371, 2.110, 3.850, 4.456 max_d=4.456 avg_d=2.110 std_dev=1.740
OP2	B	0, 0.771, 2.647, 4.522, 5.285 max_d=5.285 avg_d=2.647 std_dev=1.875
P	B	0, 0.472, 2.354, 4.235, 5.262 max_d=5.262 avg_d=2.354 std_dev=1.881
OP1	B	0, 0.591, 2.592, 4.592, 5.562 max_d=5.562 avg_d=2.592 std_dev=2.001
C5	B	0, -0.547, 1.655, 3.857, 5.407 max_d=5.407 avg_d=1.655 std_dev=2.202
C2	B	0, -0.418, 1.801, 4.021, 5.595 max_d=5.595 avg_d=1.801 std_dev=2.220
N7	B	0, -0.589, 1.688, 3.965, 5.560 max_d=5.560 avg_d=1.688 std_dev=2.277
N2	B	0, -0.467, 2.045, 4.557, 6.346 max_d=6.346 avg_d=2.045 std_dev=2.512
N1	B	0, -0.652, 2.051, 4.753, 6.698 max_d=6.698 avg_d=2.051 std_dev=2.703
C6	B	0, -0.733, 2.016, 4.766, 6.744 max_d=6.744 avg_d=2.016 std_dev=2.749
O6	B	0, -0.976, 2.340, 5.657, 8.062 max_d=8.062 avg_d=2.340 std_dev=3.317

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.03	0.27	0.17	0.10
C2	0.04	0.00	0.05	0.09	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.52	0.00	0.64	0.38	0.40
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.07	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.28	0.05	0.45	0.07	0.19
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.07	0.12	0.09	0.09	0.04	0.02	0.01	0.00	0.33	0.07	0.57	0.15	0.29
C4	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.55	0.01	0.58	0.36	0.38
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.20	0.28	0.06
C5	0.02	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.67	0.01	0.69	0.49	0.50
C5'	0.03	0.10	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.10	0.06	0.11	0.10	0.08	0.08	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.11	0.30	0.40	0.01
C6	0.03	0.00	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.69	0.00	0.76	0.56	0.55
C8	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.65	0.00	0.56	0.40	0.42
N1	0.04	0.00	0.03	0.07	0.01	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.62	0.00	0.73	0.49	0.49
N2	0.04	0.00	0.07	0.12	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.47	0.00	0.62	0.35	0.37
N3	0.04	0.00	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.47	0.01	0.56	0.31	0.33
N7	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.72	0.00	0.68	0.54	0.53
N9	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.51	0.01	0.48	0.28	0.31
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.03	0.04	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.06	0.23	0.09	0.02
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.07	0.11	0.06	0.13	0.08	0.12	0.04	0.04	0.00	0.01	0.19	0.10	0.58	0.29	0.27
O4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.14	0.02	0.10	0.33	0.13
O5'	0.26	0.52	0.28	0.33	0.55	0.01	0.67	0.01	0.69	0.65	0.62	0.47	0.47	0.72	0.51	0.05	0.19	0.14	0.00	0.75	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.75	0.00	0.83	0.64	0.62
OP1	0.27	0.64	0.45	0.57	0.58	0.20	0.69	0.30	0.76	0.56	0.73	0.62	0.56	0.68	0.48	0.23	0.58	0.10	0.01	0.83	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.38	0.07	0.15	0.36	0.28	0.49	0.40	0.56	0.40	0.49	0.35	0.31	0.54	0.28	0.09	0.29	0.33	0.01	0.64	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.40	0.19	0.29	0.38	0.06	0.50	0.01	0.55	0.42	0.49	0.37	0.33	0.53	0.31	0.02	0.27	0.13	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.62	1.85	0.25	0.16	1.41	0.35	1.54	0.28	1.79	1.05	1.93	1.95	1.57	1.32	1.03	0.16	0.21	0.47	0.61	1.85	0.84	1.06	0.76
C2	0.58	2.07	0.35	0.24	1.62	0.05	2.07	0.27	2.53	1.45	2.55	2.05	1.54	1.91	1.20	0.29	0.06	0.42	0.66	2.83	0.73	1.45	0.91
C2'	0.54	1.85	0.22	0.06	1.33	0.32	1.46	0.31	1.76	0.91	1.93	2.03	1.53	1.20	0.93	0.26	0.05	0.35	0.47	1.84	0.76	0.86	0.60
C3'	0.36	1.50	0.19	0.17	1.04	0.39	1.10	0.47	1.36	0.61	1.53	1.67	1.24	0.85	0.67	0.28	0.14	0.13	0.39	1.40	0.75	0.64	0.51
C4	0.56	1.92	0.33	0.23	1.54	0.03	1.89	0.24	2.25	1.34	2.26	1.84	1.49	1.73	1.15	0.29	0.08	0.37	0.62	2.42	0.74	1.37	0.88
C4'	0.38	1.32	0.12	0.13	0.91	0.51	0.93	0.59	1.13	0.53	1.30	1.50	1.13	0.70	0.60	0.09	0.15	0.30	0.58	1.14	0.96	0.78	0.72
C5	0.52	1.59	0.40	0.35	1.44	0.19	1.89	0.50	2.21	1.42	2.07	1.31	1.21	1.83	1.12	0.32	0.19	0.39	0.72	2.44	0.85	1.57	1.04
C5'	0.11	0.88	0.07	0.23	0.52	0.62	0.49	0.73	0.65	0.21	0.82	1.05	0.75	0.31	0.26	0.06	0.20	0.28	0.61	0.64	0.96	0.70	0.71
C6	0.52	1.53	0.43	0.39	1.42	0.26	1.97	0.62	2.35	1.50	2.14	1.21	1.12	1.96	1.13	0.33	0.21	0.43	0.79	2.70	0.93	1.71	1.16
C8	0.49	1.33	0.35	0.29	1.29	0.11	1.55	0.34	1.70	1.20	1.59	1.10	1.12	1.48	1.02	0.31	0.18	0.30	0.61	1.80	0.80	1.37	0.91
N1	0.55	1.81	0.40	0.33	1.54	0.15	2.06	0.48	2.51	1.51	2.40	1.63	1.33	1.99	1.18	0.32	0.14	0.42	0.74	2.87	0.84	1.62	1.06
N2	0.60	2.17	0.34	0.21	1.66	0.09	2.11	0.21	2.62	1.46	2.66	2.21	1.61	1.94	1.22	0.29	0.05	0.44	0.65	2.94	0.70	1.41	0.88
N3	0.59	2.13	0.31	0.18	1.62	0.11	1.97	0.14	2.40	1.35	2.48	2.19	1.62	1.78	1.18	0.27	0.06	0.41	0.61	2.61	0.71	1.31	0.82
N7	0.48	1.19	0.43	0.41	1.26	0.29	1.69	0.60	1.86	1.35	1.62	0.83	0.94	1.69	1.04	0.33	0.26	0.39	0.73	2.04	0.91	1.59	1.08
N9	0.55	1.78	0.29	0.18	1.45	0.09	1.68	0.12	1.94	1.20	1.98	1.72	1.46	1.51	1.08	0.27	0.08	0.34	0.57	2.04	0.74	1.24	0.80
O2'	0.64	2.01	0.22	0.19	1.40	0.54	1.50	0.55	1.84	0.93	2.06	2.28	1.65	1.21	0.98	0.15	0.27	0.58	0.67	1.91	0.98	0.88	0.77
O3'	0.32	1.50	0.16	0.19	0.97	0.50	1.00	0.67	1.28	0.47	1.50	1.75	1.23	0.71	0.58	0.25	0.18	0.20	0.55	1.31	0.95	0.54	0.64
O4'	0.55	1.47	0.25	0.22	1.14	0.43	1.19	0.41	1.37	0.82	1.49	1.57	1.29	1.00	0.84	0.07	0.27	0.40	0.60	1.39	0.91	0.98	0.76
O5'	0.09	0.56	0.25	0.13	0.32	0.27	0.29	0.31	0.40	0.07	0.52	0.66	0.47	0.14	0.15	0.33	0.01	0.09	0.36	0.39	0.67	0.40	0.43
O6	0.49	1.19	0.47	0.47	1.28	0.40	1.89	0.81	2.23	1.53	1.87	0.78	0.87	1.98	1.08	0.33	0.29	0.48	0.90	2.66	1.08	1.88	1.31
OP1	0.15	0.31	0.10	0.11	0.08	0.11	0.12	0.16	0.13	0.27	0.21	0.46	0.29	0.28	0.04	0.04	0.01	0.16	0.38	0.18	0.84	0.57	0.59
OP2	0.28	0.39	0.32	0.05	0.41	0.04	0.47	0.20	0.47	0.48	0.44	0.37	0.36	0.50	0.40	0.36	0.02	0.12	0.34	0.49	0.87	0.71	0.65
P	0.09	0.19	0.14	0.01	0.04	0.04	0.11	0.09	0.11	0.25	0.14	0.29	0.16	0.23	0.09	0.07	0.00	0.06	0.34	0.14	0.72	0.49	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.25	0.00	0.25	0.00	0.42	0.45	0.33
C2	0.03	0.00	0.25	0.15	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.44	0.33	0.12	0.32	0.00	0.39	0.48	0.36
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.14	0.00	0.10	0.19	0.15	0.12	0.21	0.29	0.24	0.08	0.04	0.00	0.04	0.01	0.47	0.13	0.82	0.81	0.70
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.13	0.00	0.19	0.01	0.18	0.26	0.16	0.16	0.13	0.25	0.15	0.01	0.00	0.02	0.34	0.20	0.64	0.36	0.45
C4	0.01	0.01	0.14	0.13	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.29	0.17	0.06	0.33	0.00	0.40	0.48	0.36
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.10	0.02	0.04	0.02	0.09	0.04	0.22	0.02	0.00	0.01	0.04	0.22	0.16	0.07
C5	0.01	0.00	0.10	0.19	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.04	0.03	0.37	0.01	0.41	0.51	0.40
C5'	0.07	0.07	0.19	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.08	0.09	0.08	0.08	0.07	0.09	0.07	0.03	0.21	0.01	0.00	0.08	0.18	0.34	0.00
C6	0.01	0.00	0.15	0.18	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.09	0.06	0.38	0.00	0.41	0.52	0.40
C8	0.01	0.01	0.12	0.26	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.29	0.15	0.09	0.35	0.01	0.41	0.49	0.39
N1	0.03	0.00	0.21	0.16	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.42	0.22	0.10	0.36	0.00	0.40	0.50	0.38
N2	0.04	0.00	0.29	0.16	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.50	0.43	0.14	0.31	0.00	0.38	0.47	0.34
N3	0.03	0.00	0.24	0.13	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.40	0.34	0.11	0.30	0.00	0.39	0.46	0.34
N7	0.00	0.01	0.08	0.25	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.32	0.13	0.05	0.37	0.01	0.41	0.52	0.41
N9	0.00	0.01	0.04	0.15	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.08	0.00	0.32	0.01	0.40	0.46	0.36
O2'	0.02	0.44	0.00	0.01	0.29	0.22	0.32	0.03	0.38	0.29	0.42	0.50	0.40	0.32	0.17	0.00	0.07	0.16	0.47	0.40	0.91	1.00	0.77
O3'	0.25	0.33	0.04	0.00	0.17	0.02	0.04	0.21	0.09	0.15	0.22	0.43	0.34	0.13	0.08	0.07	0.00	0.17	0.37	0.03	0.63	0.37	0.45
O4'	0.00	0.12	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.09	0.10	0.14	0.11	0.05	0.00	0.16	0.17	0.00	0.05	0.05	0.12	0.17	0.06
O5'	0.25	0.32	0.47	0.34	0.33	0.01	0.37	0.00	0.38	0.35	0.36	0.31	0.30	0.37	0.32	0.47	0.37	0.05	0.00	0.39	0.01	0.01	0.00
O6	0.00	0.00	0.13	0.20	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.40	0.03	0.05	0.39	0.00	0.42	0.54	0.42
OP1	0.42	0.39	0.82	0.64	0.40	0.22	0.41	0.18	0.41	0.41	0.40	0.38	0.39	0.41	0.40	0.91	0.63	0.12	0.01	0.42	0.00	0.00	0.00
OP2	0.45	0.48	0.81	0.36	0.48	0.16	0.51	0.34	0.52	0.49	0.50	0.47	0.46	0.52	0.46	1.00	0.37	0.17	0.01	0.54	0.00	0.00	0.00
P	0.33	0.36	0.70	0.45	0.36	0.07	0.40	0.00	0.40	0.39	0.38	0.34	0.34	0.41	0.36	0.77	0.45	0.06	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00