Doublet Group distance statistics: 50185

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.001, 0.013, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N3	A	0, -0.001, 0.017, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.017 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.002, 0.020, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.003, 0.024, 0.044, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.020
C4	A	0, -0.001, 0.019, 0.040, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.001, 0.025, 0.049, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.025 std_dev=0.024
N7	A	0, -0.002, 0.036, 0.073, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.036 std_dev=0.038
C8	A	0, -0.006, 0.039, 0.084, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.039 std_dev=0.045
C2'	A	0, 0.017, 0.071, 0.124, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.071 std_dev=0.053
C3'	A	0, 0.009, 0.098, 0.186, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.098 std_dev=0.089
O4'	A	0, 0.000, 0.092, 0.183, 0.242 max_d=0.242 avg_d=0.092 std_dev=0.092
O2'	A	0, 0.005, 0.105, 0.205, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.105 std_dev=0.100
O3'	A	0, 0.004, 0.121, 0.239, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.121 std_dev=0.118
C4'	A	0, -0.015, 0.138, 0.291, 0.385 max_d=0.385 avg_d=0.138 std_dev=0.153
C5'	A	0, -0.024, 0.275, 0.574, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.275 std_dev=0.299
O5'	A	0, -0.027, 0.331, 0.688, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.331 std_dev=0.357
O3'	B	0, -0.133, 0.347, 0.827, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.347 std_dev=0.480
O2'	B	0, -0.047, 0.438, 0.922, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.438 std_dev=0.485
P	A	0, -0.030, 0.493, 1.016, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.493 std_dev=0.523
C2'	B	0, 0.006, 0.537, 1.069, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.537 std_dev=0.532
OP2	A	0, 0.001, 0.616, 1.230, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.616 std_dev=0.614
C3'	B	0, -0.126, 0.525, 1.175, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.525 std_dev=0.650
C4'	B	0, -0.146, 0.594, 1.334, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.594 std_dev=0.740
OP1	A	0, -0.046, 0.731, 1.508, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.731 std_dev=0.777
C1'	B	0, 0.027, 0.848, 1.668, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.848 std_dev=0.820
O4'	B	0, -0.106, 0.781, 1.667, 2.205 max_d=2.205 avg_d=0.781 std_dev=0.886
C5'	B	0, -0.182, 0.794, 1.770, 2.423 max_d=2.423 avg_d=0.794 std_dev=0.976
N9	B	0, -0.016, 1.392, 2.799, 3.283 max_d=3.283 avg_d=1.392 std_dev=1.407
C8	B	0, -0.061, 1.600, 3.262, 3.971 max_d=3.971 avg_d=1.600 std_dev=1.661
O5'	B	0, -0.135, 1.660, 3.454, 4.383 max_d=4.383 avg_d=1.660 std_dev=1.794
C4	B	0, -0.095, 1.974, 4.043, 4.942 max_d=4.942 avg_d=1.974 std_dev=2.069
N7	B	0, -0.135, 2.174, 4.484, 5.574 max_d=5.574 avg_d=2.174 std_dev=2.309
N3	B	0, -0.171, 2.227, 4.624, 5.799 max_d=5.799 avg_d=2.227 std_dev=2.397
C5	B	0, -0.138, 2.381, 4.901, 6.046 max_d=6.046 avg_d=2.381 std_dev=2.520
P	B	0, -0.616, 2.016, 4.647, 6.446 max_d=6.446 avg_d=2.016 std_dev=2.632
OP1	B	0, -0.175, 2.547, 5.269, 6.546 max_d=6.546 avg_d=2.547 std_dev=2.722
C2	B	0, -0.257, 2.843, 5.943, 7.516 max_d=7.516 avg_d=2.843 std_dev=3.100
C6	B	0, -0.220, 3.030, 6.280, 7.826 max_d=7.826 avg_d=3.030 std_dev=3.250
OP2	B	0, -1.075, 2.349, 5.772, 8.228 max_d=8.228 avg_d=2.349 std_dev=3.423
N1	B	0, -0.261, 3.197, 6.655, 8.354 max_d=8.354 avg_d=3.197 std_dev=3.458
N2	B	0, -0.381, 3.226, 6.834, 8.805 max_d=8.805 avg_d=3.226 std_dev=3.608
O6	B	0, -0.282, 3.492, 7.267, 9.100 max_d=9.100 avg_d=3.492 std_dev=3.774

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.12	0.01	0.02	0.20	0.07
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.34	0.02	0.35	0.59	0.36
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.03	0.10	0.18	0.09
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.06	0.03	0.13	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.29	0.01	0.24	0.48	0.28
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.09	0.07	0.08	0.04	0.03	0.09	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.11	0.04	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.04	0.35	0.00	0.33	0.59	0.36
C5'	0.04	0.17	0.03	0.03	0.15	0.00	0.22	0.00	0.24	0.17	0.22	0.15	0.12	0.23	0.12	0.05	0.02	0.01	0.01	0.27	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.09	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.39	0.00	0.43	0.69	0.44
C8	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.05	0.23	0.01	0.14	0.35	0.20
N1	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.08	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.39	0.01	0.43	0.68	0.43
N2	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.15	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.08	0.01	0.33	0.03	0.36	0.60	0.36
N3	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.28	0.01	0.25	0.49	0.28
N7	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.31	0.01	0.28	0.52	0.33
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.22	0.01	0.12	0.34	0.18
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.05	0.04	0.02	0.06	0.10	0.07	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.03	0.13	0.06
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.05	0.03	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.08	0.06	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.17	0.06	0.04
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.05	0.03	0.00	0.02	0.05	0.12	0.08	0.06
O5'	0.12	0.34	0.11	0.06	0.29	0.02	0.35	0.01	0.39	0.23	0.39	0.33	0.28	0.31	0.22	0.06	0.03	0.02	0.00	0.41	0.03	0.02	0.01
O6	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.11	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.05	0.41	0.00	0.49	0.75	0.49
OP1	0.02	0.35	0.10	0.13	0.24	0.04	0.33	0.04	0.43	0.14	0.43	0.36	0.25	0.28	0.12	0.03	0.17	0.12	0.03	0.49	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.59	0.18	0.09	0.48	0.05	0.59	0.02	0.69	0.35	0.68	0.60	0.49	0.52	0.34	0.13	0.06	0.08	0.02	0.75	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.36	0.09	0.06	0.28	0.02	0.36	0.01	0.44	0.20	0.43	0.36	0.28	0.33	0.18	0.06	0.04	0.06	0.01	0.49	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.62	1.44	0.31	0.21	0.89	0.27	0.71	0.03	0.90	0.37	1.23	1.78	1.30	0.42	0.59	0.31	0.15	0.44	0.54	0.80	0.97	0.81	0.82
C2	0.80	2.35	0.30	0.12	1.53	0.31	1.46	0.14	1.82	0.76	2.23	2.83	2.00	1.01	1.02	0.23	0.07	0.61	0.49	1.80	0.94	1.07	0.95
C2'	0.59	1.49	0.29	0.14	0.87	0.20	0.65	0.09	0.86	0.30	1.25	1.89	1.33	0.32	0.54	0.40	0.11	0.38	0.48	0.74	0.96	0.50	0.63
C3'	0.47	1.21	0.25	0.09	0.65	0.10	0.40	0.21	0.57	0.27	0.95	1.59	1.10	0.23	0.36	0.45	0.10	0.25	0.50	0.43	0.91	0.21	0.44
C4	0.78	2.00	0.32	0.16	1.33	0.31	1.21	0.12	1.48	0.64	1.84	2.38	1.77	0.82	0.91	0.27	0.04	0.58	0.45	1.42	0.84	0.93	0.86
C4'	0.30	0.85	0.14	0.08	0.37	0.04	0.17	0.29	0.26	0.41	0.59	1.18	0.78	0.39	0.17	0.27	0.09	0.11	0.59	0.19	0.91	0.26	0.47
C5	0.81	2.15	0.31	0.13	1.48	0.29	1.39	0.14	1.68	0.78	2.01	2.50	1.91	1.00	1.02	0.21	0.10	0.59	0.38	1.63	0.68	0.87	0.77
C5'	0.06	0.42	0.05	0.14	0.01	0.16	0.29	0.41	0.19	0.63	0.15	0.71	0.40	0.65	0.18	0.14	0.08	0.09	0.72	0.36	0.89	0.49	0.51
C6	0.82	2.46	0.29	0.11	1.66	0.28	1.64	0.17	2.00	0.93	2.37	2.89	2.11	1.22	1.14	0.16	0.15	0.61	0.39	1.99	0.68	0.92	0.79
C8	0.73	1.54	0.34	0.19	1.08	0.28	0.94	0.10	1.12	0.53	1.38	1.79	1.44	0.64	0.77	0.27	0.06	0.51	0.33	1.04	0.60	0.70	0.66
N1	0.82	2.51	0.29	0.11	1.65	0.30	1.63	0.16	2.02	0.89	2.42	2.98	2.11	1.19	1.11	0.19	0.13	0.62	0.44	2.02	0.82	1.02	0.89
N2	0.80	2.42	0.29	0.12	1.55	0.32	1.50	0.15	1.89	0.77	2.32	2.93	2.03	1.03	1.03	0.24	0.06	0.61	0.52	1.88	1.02	1.13	1.01
N3	0.78	2.12	0.31	0.15	1.37	0.32	1.26	0.12	1.57	0.64	1.96	2.56	1.84	0.83	0.92	0.27	0.04	0.58	0.51	1.51	0.97	1.03	0.94
N7	0.80	1.87	0.32	0.14	1.35	0.27	1.25	0.14	1.46	0.73	1.73	2.11	1.72	0.91	0.97	0.19	0.10	0.56	0.30	1.40	0.52	0.72	0.64
N9	0.72	1.66	0.33	0.19	1.10	0.30	0.95	0.08	1.16	0.49	1.48	1.99	1.51	0.60	0.76	0.29	0.08	0.52	0.45	1.07	0.82	0.84	0.80
O2'	0.54	1.42	0.27	0.17	0.79	0.21	0.57	0.14	0.77	0.33	1.17	1.84	1.26	0.33	0.48	0.36	0.16	0.35	0.62	0.65	1.15	0.63	0.76
O3'	0.39	1.15	0.22	0.03	0.54	0.01	0.26	0.34	0.43	0.32	0.86	1.56	1.03	0.28	0.25	0.48	0.07	0.15	0.66	0.27	1.12	0.43	0.56
O4'	0.48	1.06	0.26	0.20	0.62	0.20	0.44	0.08	0.56	0.34	0.84	1.35	0.98	0.34	0.40	0.27	0.18	0.32	0.56	0.47	0.90	0.62	0.69
O5'	0.18	0.54	0.08	0.03	0.17	0.08	0.09	0.27	0.03	0.43	0.31	0.79	0.51	0.43	0.06	0.25	0.01	0.05	0.54	0.13	0.67	0.44	0.37
O6	0.80	2.64	0.28	0.12	1.78	0.26	1.83	0.18	2.22	1.07	2.58	3.08	2.21	1.41	1.22	0.11	0.20	0.60	0.38	2.24	0.57	0.86	0.73
OP1	0.24	0.40	0.26	0.12	0.57	0.05	0.86	0.18	0.85	0.99	0.63	0.26	0.33	1.10	0.60	0.12	0.02	0.12	0.68	1.01	0.80	0.92	0.65
OP2	0.05	0.32	0.04	0.09	0.09	0.06	0.11	0.17	0.11	0.32	0.22	0.46	0.29	0.29	0.08	0.12	0.04	0.04	0.43	0.13	0.42	0.52	0.30
P	0.04	0.19	0.09	0.02	0.14	0.05	0.34	0.18	0.29	0.57	0.14	0.35	0.18	0.58	0.24	0.09	0.01	0.01	0.51	0.41	0.53	0.56	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.28	0.01	0.21	0.22	0.13
C2	0.04	0.00	0.19	0.08	0.01	0.10	0.01	0.48	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.45	0.22	0.14	0.12	0.01	0.08	0.43	0.21
C2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.07	0.03	0.03	0.01	0.04	0.19	0.13	0.26	0.19	0.14	0.04	0.00	0.02	0.01	0.30	0.03	0.24	0.36	0.21
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.16	0.01	0.29	0.03	0.26	0.42	0.16	0.11	0.07	0.42	0.22	0.04	0.01	0.02	0.37	0.32	0.28	0.40	0.25
C4	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.13	0.00	0.44	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.27	0.03	0.06	0.27	0.00	0.26	0.56	0.36
C4'	0.02	0.10	0.03	0.01	0.13	0.00	0.21	0.01	0.21	0.24	0.15	0.09	0.09	0.26	0.13	0.16	0.05	0.00	0.03	0.24	0.07	0.27	0.14
C5	0.01	0.01	0.03	0.29	0.00	0.21	0.00	0.54	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.24	0.19	0.01	0.42	0.00	0.46	0.90	0.63
C5'	0.09	0.48	0.01	0.03	0.44	0.01	0.54	0.00	0.59	0.43	0.56	0.45	0.40	0.53	0.34	0.15	0.14	0.02	0.00	0.64	0.31	0.33	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.26	0.00	0.21	0.00	0.59	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.30	0.13	0.04	0.37	0.00	0.43	0.88	0.60
C8	0.01	0.02	0.19	0.42	0.00	0.24	0.00	0.43	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.17	0.41	0.15	0.64	0.01	0.65	1.14	0.85
N1	0.03	0.01	0.13	0.16	0.01	0.15	0.01	0.56	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.39	0.07	0.10	0.22	0.01	0.25	0.62	0.39
N2	0.05	0.01	0.26	0.11	0.03	0.09	0.02	0.45	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.53	0.37	0.17	0.11	0.03	0.08	0.41	0.19
N3	0.03	0.01	0.19	0.07	0.01	0.09	0.00	0.40	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.41	0.23	0.15	0.13	0.01	0.05	0.36	0.15
N7	0.01	0.01	0.14	0.42	0.00	0.26	0.00	0.53	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.18	0.40	0.10	0.63	0.01	0.69	1.28	0.92
N9	0.00	0.02	0.04	0.22	0.01	0.13	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.14	0.12	0.03	0.37	0.01	0.34	0.61	0.43
O2'	0.02	0.45	0.00	0.04	0.27	0.16	0.24	0.15	0.30	0.17	0.39	0.53	0.41	0.18	0.14	0.00	0.05	0.15	0.29	0.29	0.23	0.33	0.24
O3'	0.07	0.22	0.02	0.01	0.03	0.05	0.19	0.14	0.13	0.41	0.07	0.37	0.23	0.40	0.12	0.05	0.00	0.02	0.35	0.22	0.28	0.26	0.18
O4'	0.01	0.14	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.02	0.04	0.15	0.10	0.17	0.15	0.10	0.03	0.15	0.02	0.00	0.29	0.01	0.19	0.19	0.01
O5'	0.28	0.12	0.30	0.37	0.27	0.03	0.42	0.00	0.37	0.64	0.22	0.11	0.13	0.63	0.37	0.29	0.35	0.29	0.00	0.45	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.32	0.00	0.24	0.00	0.64	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.29	0.22	0.01	0.45	0.00	0.54	1.07	0.74
OP1	0.21	0.08	0.24	0.28	0.26	0.07	0.46	0.31	0.43	0.65	0.25	0.08	0.05	0.69	0.34	0.23	0.28	0.19	0.01	0.54	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.43	0.36	0.40	0.56	0.27	0.90	0.33	0.88	1.14	0.62	0.41	0.36	1.28	0.61	0.33	0.26	0.19	0.01	1.07	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.21	0.21	0.25	0.36	0.14	0.63	0.02	0.60	0.85	0.39	0.19	0.15	0.92	0.43	0.24	0.18	0.01	0.01	0.74	0.00	0.00	0.00