Doublet Group distance statistics: 50190

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.000, 0.028, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N3	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N2	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
C4	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
N7	A	0, 0.000, 0.045, 0.090, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.045
O6	A	0, 0.000, 0.045, 0.090, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.045
N9	A	0, 0.000, 0.045, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.045
C8	A	0, 0.000, 0.068, 0.135, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.068 std_dev=0.068
O4'	A	0, 0.000, 0.215, 0.429, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.215 std_dev=0.215
C5'	A	0, 0.000, 0.232, 0.464, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.232 std_dev=0.232
C4'	A	0, 0.000, 0.264, 0.528, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.264 std_dev=0.264
C2'	B	0, 0.000, 0.295, 0.590, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.295 std_dev=0.295
C2'	A	0, 0.000, 0.329, 0.659, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.329 std_dev=0.329
C3'	A	0, 0.000, 0.390, 0.781, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.390 std_dev=0.390
O2'	B	0, 0.000, 0.635, 1.270, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.635 std_dev=0.635
C3'	B	0, 0.000, 0.917, 1.834, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.917 std_dev=0.917
O2'	A	0, 0.000, 0.942, 1.884, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.942 std_dev=0.942
O3'	A	0, 0.000, 0.963, 1.926, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.963 std_dev=0.963
O5'	A	0, 0.000, 1.174, 2.347, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.174 std_dev=1.174
C1'	B	0, 0.000, 1.283, 2.565, 2.565 max_d=2.565 avg_d=1.283 std_dev=1.283
C4'	B	0, 0.000, 1.326, 2.652, 2.652 max_d=2.652 avg_d=1.326 std_dev=1.326
C5'	B	0, 0.000, 1.397, 2.795, 2.795 max_d=2.795 avg_d=1.397 std_dev=1.397
O3'	B	0, 0.000, 1.576, 3.151, 3.151 max_d=3.151 avg_d=1.576 std_dev=1.576
O4'	B	0, 0.000, 1.577, 3.155, 3.155 max_d=3.155 avg_d=1.577 std_dev=1.577
O5'	B	0, 0.000, 1.656, 3.311, 3.311 max_d=3.311 avg_d=1.656 std_dev=1.656
P	A	0, 0.000, 1.749, 3.499, 3.499 max_d=3.499 avg_d=1.749 std_dev=1.749
OP2	B	0, 0.000, 1.770, 3.539, 3.539 max_d=3.539 avg_d=1.770 std_dev=1.770
C8	B	0, 0.000, 1.982, 3.964, 3.964 max_d=3.964 avg_d=1.982 std_dev=1.982
N9	B	0, 0.000, 2.066, 4.132, 4.132 max_d=4.132 avg_d=2.066 std_dev=2.066
P	B	0, 0.000, 2.084, 4.167, 4.167 max_d=4.167 avg_d=2.084 std_dev=2.084
OP2	A	0, 0.000, 2.370, 4.740, 4.740 max_d=4.740 avg_d=2.370 std_dev=2.370
OP1	A	0, 0.000, 2.393, 4.786, 4.786 max_d=4.786 avg_d=2.393 std_dev=2.393
N7	B	0, 0.000, 3.034, 6.068, 6.068 max_d=6.068 avg_d=3.034 std_dev=3.034
OP1	B	0, 0.000, 3.063, 6.127, 6.127 max_d=6.127 avg_d=3.063 std_dev=3.063
C4	B	0, 0.000, 3.309, 6.618, 6.618 max_d=6.618 avg_d=3.309 std_dev=3.309
C5	B	0, 0.000, 3.853, 7.707, 7.707 max_d=7.707 avg_d=3.853 std_dev=3.853
N3	B	0, 0.000, 3.937, 7.874, 7.874 max_d=7.874 avg_d=3.937 std_dev=3.937
C2	B	0, 0.000, 5.162, 10.323, 10.323 max_d=10.323 avg_d=5.162 std_dev=5.162
C6	B	0, 0.000, 5.172, 10.345, 10.345 max_d=10.345 avg_d=5.172 std_dev=5.172
N1	B	0, 0.000, 5.744, 11.488, 11.488 max_d=11.488 avg_d=5.744 std_dev=5.744
O6	B	0, 0.000, 5.855, 11.710, 11.710 max_d=11.710 avg_d=5.855 std_dev=5.855
N2	B	0, 0.000, 5.967, 11.935, 11.935 max_d=11.935 avg_d=5.967 std_dev=5.967

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.26	0.00	0.29	0.01	0.55	0.24	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.03	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.43	0.07	0.41	0.01	0.92	0.08	0.33
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.17	0.01	0.11	0.03	0.11	0.09	0.10	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.06	0.74	0.42
C3'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.03	0.07	0.13	0.01	0.07	0.03	0.13	0.06	0.01	0.00	0.00	0.08	0.09	0.03	0.63	0.34
C4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.28	0.03	0.48	0.01	0.93	0.04	0.39
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.06	0.02	0.07	0.05	0.05	0.02	0.16	0.00	0.00	0.02	0.04	0.24	0.24	0.11
C5	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.20	0.01	0.60	0.01	1.12	0.29	0.60
C5'	0.05	0.07	0.17	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.08	0.00	0.04	0.03	0.18	0.01	0.00	0.00	0.19	0.16	0.01
C6	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.25	0.00	0.61	0.00	1.18	0.31	0.63
C8	0.01	0.00	0.11	0.13	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.04	0.06	0.65	0.02	1.03	0.37	0.61
N1	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.35	0.04	0.52	0.00	1.08	0.12	0.49
N2	0.02	0.00	0.11	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.50	0.09	0.34	0.01	0.85	0.21	0.23
N3	0.02	0.00	0.09	0.03	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.42	0.08	0.37	0.01	0.81	0.15	0.24
N7	0.00	0.01	0.10	0.13	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.07	0.05	0.69	0.02	1.18	0.49	0.73
N9	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.18	0.01	0.49	0.01	0.83	0.05	0.35
O2'	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.22	0.03	0.20	0.27	0.11	0.08	0.03	0.30	0.14	0.00	0.00	0.12	0.02	0.24	0.17	0.96	0.56
O3'	0.26	0.43	0.02	0.00	0.28	0.00	0.20	0.18	0.25	0.04	0.35	0.50	0.42	0.07	0.18	0.00	0.00	0.19	0.11	0.20	0.02	0.58	0.27
O4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.04	0.09	0.08	0.05	0.01	0.12	0.19	0.00	0.29	0.03	0.72	0.03	0.23
O5'	0.29	0.41	0.04	0.08	0.48	0.02	0.60	0.00	0.61	0.65	0.52	0.34	0.37	0.69	0.49	0.02	0.11	0.29	0.00	0.68	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.24	0.20	0.03	0.68	0.00	1.29	0.47	0.75
OP1	0.55	0.92	0.06	0.03	0.93	0.24	1.12	0.19	1.18	1.03	1.08	0.85	0.81	1.18	0.83	0.17	0.02	0.72	0.02	1.29	0.00	0.01	0.00
OP2	0.24	0.08	0.74	0.63	0.04	0.24	0.29	0.16	0.31	0.37	0.12	0.21	0.15	0.49	0.05	0.96	0.58	0.03	0.02	0.47	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.33	0.42	0.34	0.39	0.11	0.60	0.01	0.63	0.61	0.49	0.23	0.24	0.73	0.35	0.56	0.27	0.23	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.66	0.69	0.08	0.29	0.63	0.55	0.57	0.48	0.58	0.51	0.63	0.72	0.70	0.51	0.60	0.15	0.36	0.81	0.51	0.55	0.54	0.81	0.60
C2	0.78	1.92	0.14	0.10	1.40	0.24	1.43	0.17	1.70	0.94	1.92	2.19	1.65	1.16	1.05	0.15	0.02	0.72	0.23	1.73	0.06	0.62	0.26
C2'	0.71	0.25	0.31	0.63	0.45	0.76	0.43	0.73	0.34	0.59	0.26	0.14	0.36	0.51	0.58	0.15	0.84	0.86	0.74	0.34	0.93	1.14	0.92
C3'	0.11	0.58	0.22	0.25	0.34	0.43	0.39	0.40	0.52	0.12	0.60	0.66	0.44	0.26	0.13	0.28	0.60	0.39	0.45	0.54	0.78	0.77	0.65
C4	0.80	1.71	0.10	0.09	1.29	0.30	1.26	0.23	1.45	0.85	1.65	1.90	1.54	1.02	0.99	0.22	0.01	0.79	0.27	1.45	0.10	0.62	0.30
C4'	0.31	0.23	0.17	0.25	0.11	0.61	0.22	0.55	0.32	0.04	0.32	0.24	0.10	0.18	0.04	0.30	0.47	0.66	0.62	0.38	0.79	0.74	0.72
C5	0.86	2.24	0.10	0.04	1.61	0.17	1.60	0.09	1.88	1.00	2.16	2.54	1.97	1.25	1.17	0.28	0.25	0.78	0.13	1.88	0.17	0.49	0.12
C5'	0.31	0.29	0.19	0.23	0.18	0.73	0.32	0.66	0.43	0.14	0.41	0.27	0.15	0.30	0.02	0.31	0.40	0.73	0.71	0.51	0.82	0.71	0.76
C6	0.85	2.60	0.11	0.08	1.79	0.08	1.83	0.00	2.22	1.10	2.56	3.01	2.19	1.43	1.26	0.26	0.31	0.72	0.04	2.25	0.32	0.42	0.01
C8	0.84	1.59	0.05	0.00	1.25	0.32	1.17	0.24	1.32	0.79	1.50	1.72	1.51	0.92	0.98	0.36	0.23	0.88	0.25	1.28	0.01	0.56	0.25
N1	0.82	2.37	0.13	0.00	1.66	0.14	1.72	0.06	2.07	1.06	2.37	2.74	2.00	1.36	1.19	0.20	0.16	0.71	0.12	2.12	0.17	0.51	0.11
N2	0.76	1.82	0.15	0.15	1.33	0.26	1.39	0.19	1.64	0.93	1.84	2.06	1.55	1.14	1.01	0.10	0.11	0.70	0.26	1.69	0.13	0.67	0.31
N3	0.75	1.56	0.12	0.16	1.19	0.33	1.19	0.26	1.37	0.83	1.53	1.75	1.39	0.98	0.93	0.15	0.12	0.75	0.32	1.38	0.21	0.69	0.37
N7	0.88	2.22	0.07	0.11	1.64	0.15	1.58	0.08	1.84	0.98	2.11	2.46	2.01	1.22	1.18	0.36	0.41	0.83	0.10	1.81	0.26	0.43	0.07
N9	0.77	1.30	0.08	0.14	1.05	0.40	0.99	0.33	1.10	0.72	1.23	1.42	1.23	0.81	0.85	0.25	0.06	0.84	0.36	1.07	0.23	0.68	0.40
O2'	0.99	0.47	0.66	0.87	0.75	0.93	0.76	0.92	0.65	0.95	0.52	0.29	0.60	0.87	0.90	0.64	1.04	1.05	0.88	0.65	1.11	1.38	1.11
O3'	0.17	1.11	0.43	0.06	0.78	0.23	0.85	0.20	1.04	0.47	1.15	1.22	0.91	0.68	0.49	0.35	0.50	0.13	0.20	1.08	0.63	0.48	0.42
O4'	0.51	0.42	0.11	0.15	0.36	0.54	0.26	0.45	0.25	0.23	0.32	0.49	0.47	0.18	0.36	0.33	0.21	0.78	0.51	0.19	0.50	0.65	0.55
O5'	0.28	0.79	0.65	0.18	0.70	0.20	0.79	0.22	0.88	0.60	0.87	0.78	0.70	0.73	0.56	0.75	0.00	0.09	0.43	0.92	0.77	0.60	0.61
O6	0.85	2.98	0.10	0.17	1.99	0.03	2.07	0.13	2.55	1.18	2.96	3.50	2.44	1.59	1.34	0.29	0.46	0.67	0.08	2.61	0.54	0.30	0.15
OP1	0.31	0.11	0.13	0.37	0.01	0.58	0.04	0.64	0.12	0.12	0.14	0.14	0.03	0.02	0.13	0.07	0.01	0.51	1.02	0.15	1.27	1.39	1.28
OP2	0.25	0.84	0.29	0.22	0.80	0.13	0.99	0.30	1.09	0.81	1.01	0.78	0.71	1.00	0.65	0.05	0.01	0.17	0.29	1.18	0.09	0.09	0.03
P	0.02	0.46	0.21	0.01	0.40	0.18	0.51	0.11	0.58	0.37	0.55	0.43	0.37	0.49	0.29	0.19	0.00	0.14	0.29	0.63	0.57	0.66	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.29	0.01	0.13	0.17	0.11
C2	0.00	0.00	0.26	0.21	0.00	0.11	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.01	0.25	0.43	0.00	0.41	0.41	0.42
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.13	0.01	0.04	0.14	0.09	0.16	0.19	0.31	0.26	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.06	0.16	0.62	0.23
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.22	0.00	0.25	0.02	0.27	0.21	0.25	0.19	0.19	0.25	0.18	0.00	0.00	0.01	0.06	0.29	0.13	0.54	0.21
C4	0.00	0.00	0.13	0.22	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.13	0.55	0.00	0.48	0.37	0.47
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.02	0.19	0.05	0.16	0.10	0.15	0.06	0.19	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.39	0.10
C5	0.00	0.00	0.04	0.25	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.14	0.04	0.74	0.01	0.71	0.66	0.70
C5'	0.07	0.20	0.14	0.02	0.10	0.01	0.02	0.00	0.06	0.14	0.14	0.26	0.19	0.11	0.02	0.04	0.13	0.02	0.00	0.01	0.24	0.34	0.01
C6	0.00	0.00	0.09	0.27	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.15	0.09	0.73	0.00	0.76	0.78	0.75
C8	0.00	0.00	0.16	0.21	0.00	0.19	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.15	0.16	0.87	0.01	0.72	0.50	0.71
N1	0.00	0.00	0.19	0.25	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.18	0.58	0.00	0.60	0.63	0.60
N2	0.01	0.00	0.31	0.19	0.00	0.16	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.03	0.30	0.32	0.00	0.31	0.34	0.33
N3	0.00	0.00	0.26	0.19	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.02	0.24	0.38	0.00	0.32	0.26	0.33
N7	0.00	0.01	0.10	0.25	0.00	0.15	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.20	0.09	0.92	0.01	0.87	0.79	0.86
N9	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.04	0.00	0.58	0.00	0.44	0.21	0.42
O2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.03	0.19	0.16	0.04	0.11	0.32	0.02	0.24	0.16	0.30	0.13	0.00	0.02	0.14	0.11	0.17	0.19	0.71	0.24
O3'	0.15	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.14	0.13	0.15	0.15	0.09	0.03	0.02	0.20	0.04	0.02	0.00	0.13	0.03	0.20	0.08	0.47	0.16
O4'	0.00	0.25	0.00	0.01	0.13	0.00	0.04	0.02	0.09	0.16	0.18	0.30	0.24	0.09	0.00	0.14	0.13	0.00	0.24	0.05	0.20	0.10	0.17
O5'	0.29	0.43	0.09	0.06	0.55	0.01	0.74	0.00	0.73	0.87	0.58	0.32	0.38	0.92	0.58	0.11	0.03	0.24	0.00	0.82	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.06	0.29	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.20	0.05	0.82	0.00	0.90	0.96	0.88
OP1	0.13	0.41	0.16	0.13	0.48	0.01	0.71	0.24	0.76	0.72	0.60	0.31	0.32	0.87	0.44	0.19	0.08	0.20	0.01	0.90	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.41	0.62	0.54	0.37	0.39	0.66	0.34	0.78	0.50	0.63	0.34	0.26	0.79	0.21	0.71	0.47	0.10	0.01	0.96	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.42	0.23	0.21	0.47	0.10	0.70	0.01	0.75	0.71	0.60	0.33	0.33	0.86	0.42	0.24	0.16	0.17	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00