Doublet Group distance statistics: 50208

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 4, 2, 3, 5, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N9	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.014 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.011, 0.028, 0.045, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.010, 0.037, 0.063, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.037 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.018, 0.101, 0.184, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.101 std_dev=0.083
O2'	A	0, 0.032, 0.117, 0.203, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.117 std_dev=0.085
O4'	A	0, 0.004, 0.098, 0.192, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.098 std_dev=0.094
C4'	A	0, 0.038, 0.173, 0.307, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.173 std_dev=0.135
C3'	A	0, 0.035, 0.173, 0.310, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.173 std_dev=0.138
O5'	A	0, 0.095, 0.284, 0.473, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.284 std_dev=0.189
O2'	B	0, 0.120, 0.328, 0.537, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.328 std_dev=0.208
O3'	A	0, 0.053, 0.261, 0.469, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.261 std_dev=0.208
C5'	A	0, 0.058, 0.270, 0.481, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.270 std_dev=0.211
O3'	B	0, 0.159, 0.379, 0.599, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.379 std_dev=0.220
P	A	0, 0.147, 0.375, 0.603, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.375 std_dev=0.228
C3'	B	0, 0.145, 0.383, 0.621, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.383 std_dev=0.238
C2'	B	0, 0.124, 0.365, 0.606, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.365 std_dev=0.241
OP2	A	0, 0.175, 0.432, 0.689, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.432 std_dev=0.257
OP1	A	0, 0.152, 0.425, 0.698, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.425 std_dev=0.273
C4'	B	0, 0.215, 0.521, 0.827, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.521 std_dev=0.306
C1'	B	0, 0.201, 0.536, 0.871, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.536 std_dev=0.335
O4'	B	0, 0.235, 0.600, 0.966, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.600 std_dev=0.365
C5'	B	0, 0.251, 0.626, 1.000, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.626 std_dev=0.374
O5'	B	0, 0.255, 0.691, 1.126, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.691 std_dev=0.435
N9	B	0, 0.233, 0.697, 1.161, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.697 std_dev=0.464
OP1	B	0, 0.213, 0.703, 1.194, 2.209 max_d=2.209 avg_d=0.703 std_dev=0.491
C8	B	0, 0.290, 0.807, 1.323, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.807 std_dev=0.517
C4	B	0, 0.265, 0.873, 1.482, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.873 std_dev=0.609
N3	B	0, 0.310, 0.973, 1.635, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.973 std_dev=0.662
N7	B	0, 0.314, 0.983, 1.652, 1.723 max_d=1.723 avg_d=0.983 std_dev=0.669
C5	B	0, 0.291, 1.019, 1.746, 1.850 max_d=1.850 avg_d=1.019 std_dev=0.728
P	B	0, 0.275, 1.108, 1.942, 2.247 max_d=2.247 avg_d=1.108 std_dev=0.834
C2	B	0, 0.373, 1.209, 2.045, 2.172 max_d=2.172 avg_d=1.209 std_dev=0.836
C6	B	0, 0.340, 1.238, 2.137, 2.313 max_d=2.313 avg_d=1.238 std_dev=0.899
N1	B	0, 0.383, 1.329, 2.276, 2.468 max_d=2.468 avg_d=1.329 std_dev=0.947
N6	B	0, 0.379, 1.407, 2.434, 2.649 max_d=2.649 avg_d=1.407 std_dev=1.028
OP2	B	0, 0.337, 2.239, 4.140, 4.475 max_d=4.475 avg_d=2.239 std_dev=1.901

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.07	0.04
C2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.03	0.06	0.01	0.08	0.11	0.08
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.10	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.07	0.08	0.06
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.09	0.07	0.11	0.15	0.11	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.09	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.07	0.01	0.08	0.11	0.08
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.07	0.10	0.07	0.07	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.04	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.02	0.11	0.01	0.12	0.16	0.12
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.13	0.07	0.08	0.05	0.13	0.06	0.05	0.03	0.02	0.00	0.09	0.05	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.10	0.00	0.13	0.17	0.12
C8	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.16	0.01	0.13	0.16	0.13
N1	0.02	0.00	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.03	0.08	0.01	0.11	0.14	0.10
N2	0.03	0.01	0.10	0.15	0.01	0.10	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.19	0.04	0.07	0.01	0.08	0.10	0.07
N3	0.02	0.00	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.05	0.01	0.07	0.09	0.06
N7	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.02	0.16	0.01	0.15	0.19	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.07	0.10	0.07
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.05	0.04	0.02	0.05	0.07	0.06	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.04	0.06	0.06	0.03
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.10	0.07	0.13	0.19	0.12	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.08	0.11	0.10	0.08	0.06
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.03	0.08	0.09	0.08
O5'	0.04	0.06	0.06	0.07	0.07	0.01	0.11	0.00	0.10	0.16	0.08	0.07	0.05	0.16	0.08	0.03	0.08	0.07	0.00	0.12	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.12	0.00	0.16	0.19	0.15
OP1	0.04	0.08	0.07	0.09	0.08	0.04	0.12	0.05	0.13	0.13	0.11	0.08	0.07	0.15	0.07	0.06	0.10	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.11	0.08	0.07	0.11	0.04	0.16	0.04	0.17	0.16	0.14	0.10	0.09	0.19	0.10	0.06	0.08	0.09	0.02	0.19	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.08	0.06	0.06	0.08	0.01	0.12	0.01	0.12	0.13	0.10	0.07	0.06	0.15	0.07	0.03	0.06	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.48	0.09	0.09	0.27	0.10	0.22	0.12	0.32	0.08	0.44	0.41	0.30	0.10	0.14	0.15	0.12	0.10	0.21	0.28	0.57	0.37
C2	0.08	0.26	0.08	0.10	0.11	0.14	0.10	0.22	0.10	0.23	0.20	0.22	0.09	0.21	0.10	0.13	0.11	0.11	0.38	0.29	1.12	0.66
C2'	0.10	0.48	0.07	0.09	0.25	0.10	0.21	0.15	0.32	0.07	0.44	0.40	0.29	0.08	0.12	0.13	0.10	0.07	0.24	0.29	0.75	0.41
C3'	0.07	0.42	0.05	0.08	0.22	0.09	0.18	0.13	0.27	0.06	0.38	0.35	0.25	0.06	0.09	0.10	0.09	0.05	0.22	0.29	0.78	0.36
C4	0.08	0.29	0.08	0.09	0.13	0.12	0.09	0.18	0.14	0.18	0.24	0.25	0.11	0.15	0.09	0.13	0.10	0.09	0.32	0.29	0.91	0.55
C4'	0.09	0.45	0.04	0.06	0.25	0.07	0.21	0.09	0.31	0.04	0.42	0.38	0.29	0.09	0.11	0.09	0.09	0.06	0.16	0.24	0.54	0.28
C5	0.09	0.18	0.09	0.10	0.11	0.13	0.13	0.20	0.11	0.24	0.14	0.16	0.12	0.23	0.13	0.12	0.10	0.11	0.37	0.29	1.01	0.61
C5'	0.06	0.37	0.07	0.07	0.20	0.07	0.17	0.09	0.24	0.07	0.34	0.32	0.23	0.08	0.09	0.12	0.08	0.03	0.17	0.20	0.56	0.26
C6	0.12	0.14	0.10	0.11	0.13	0.16	0.19	0.24	0.15	0.30	0.12	0.13	0.19	0.31	0.17	0.11	0.11	0.14	0.42	0.29	1.20	0.71
C8	0.08	0.27	0.07	0.08	0.14	0.09	0.11	0.13	0.15	0.14	0.23	0.24	0.13	0.12	0.09	0.13	0.10	0.07	0.25	0.27	0.63	0.41
N1	0.10	0.17	0.10	0.11	0.11	0.16	0.16	0.24	0.12	0.29	0.13	0.15	0.15	0.28	0.15	0.12	0.11	0.13	0.42	0.29	1.22	0.71
N2	0.08	0.28	0.08	0.10	0.11	0.14	0.09	0.22	0.11	0.23	0.22	0.24	0.09	0.21	0.10	0.13	0.11	0.11	0.39	0.29	1.17	0.68
N3	0.08	0.33	0.08	0.10	0.14	0.12	0.10	0.19	0.16	0.17	0.27	0.28	0.12	0.14	0.08	0.13	0.11	0.09	0.33	0.29	0.98	0.58
N7	0.09	0.17	0.09	0.10	0.11	0.12	0.13	0.17	0.12	0.23	0.14	0.15	0.13	0.21	0.13	0.11	0.11	0.11	0.33	0.28	0.84	0.53
N9	0.09	0.35	0.07	0.08	0.18	0.09	0.13	0.14	0.21	0.12	0.31	0.30	0.18	0.09	0.09	0.14	0.10	0.07	0.26	0.28	0.70	0.44
O2'	0.16	0.62	0.10	0.08	0.35	0.08	0.31	0.11	0.44	0.09	0.58	0.52	0.42	0.15	0.19	0.17	0.10	0.11	0.19	0.29	0.62	0.36
O3'	0.07	0.45	0.05	0.07	0.23	0.09	0.19	0.13	0.29	0.05	0.41	0.37	0.27	0.07	0.10	0.10	0.08	0.05	0.20	0.30	0.81	0.35
O4'	0.14	0.49	0.09	0.11	0.29	0.12	0.25	0.12	0.34	0.07	0.45	0.42	0.32	0.12	0.16	0.13	0.14	0.12	0.15	0.27	0.40	0.27
O5'	0.14	0.39	0.12	0.04	0.24	0.02	0.21	0.06	0.27	0.09	0.35	0.35	0.25	0.12	0.15	0.21	0.01	0.06	0.14	0.29	0.65	0.24
O6	0.15	0.13	0.12	0.12	0.19	0.18	0.27	0.26	0.24	0.36	0.17	0.13	0.30	0.38	0.23	0.10	0.12	0.18	0.45	0.28	1.32	0.77
OP1	0.11	0.33	0.05	0.03	0.20	0.09	0.17	0.12	0.22	0.07	0.29	0.30	0.20	0.09	0.12	0.12	0.02	0.09	0.12	0.23	0.66	0.18
OP2	0.05	0.15	0.04	0.04	0.07	0.11	0.06	0.16	0.06	0.12	0.10	0.14	0.06	0.11	0.05	0.10	0.02	0.08	0.24	0.32	1.03	0.35
P	0.09	0.26	0.05	0.01	0.15	0.05	0.11	0.09	0.16	0.03	0.22	0.24	0.13	0.04	0.08	0.12	0.01	0.05	0.14	0.25	0.70	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.06	0.21	0.34	0.07
C2	0.03	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.21	0.07	0.07	0.67	0.83	0.09
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.10	0.07
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.05	0.07	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.18	0.33	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.14	0.04	0.07	0.58	0.79	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.24	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.03	0.07	0.73	0.99	0.10
C5'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.11	0.07	0.11	0.07	0.12	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.15	0.40	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.07	0.81	1.05	0.10
C8	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.04	0.07	0.52	0.89	0.11
N1	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.18	0.06	0.07	0.78	0.97	0.09
N3	0.03	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.20	0.06	0.07	0.55	0.71	0.09
N6	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.12	0.04	0.08	0.89	1.16	0.10
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.07	0.72	1.08	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.07	0.43	0.67	0.10
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.09	0.01	0.07	0.04	0.11	0.06	0.14	0.14	0.10	0.05	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.11	0.12	0.10
O3'	0.09	0.21	0.03	0.01	0.14	0.02	0.11	0.02	0.14	0.04	0.18	0.20	0.12	0.05	0.08	0.05	0.00	0.05	0.05	0.18	0.36	0.09
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.18	0.22	0.13
O5'	0.06	0.07	0.05	0.08	0.07	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.06	0.05	0.09	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.21	0.67	0.08	0.18	0.58	0.09	0.73	0.15	0.81	0.52	0.78	0.55	0.89	0.72	0.43	0.11	0.18	0.18	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.83	0.10	0.33	0.79	0.24	0.99	0.40	1.05	0.89	0.97	0.71	1.16	1.08	0.67	0.12	0.36	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.09	0.07	0.11	0.09	0.02	0.10	0.01	0.10	0.11	0.09	0.09	0.10	0.11	0.10	0.10	0.09	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00