Doublet Group distance statistics: 50209

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 4, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.027 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.020, 0.040, 0.059, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.009, 0.030, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.013, 0.034, 0.055, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.005, 0.037, 0.069, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.037 std_dev=0.032
N2	A	0, 0.014, 0.050, 0.085, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.050 std_dev=0.036
C8	A	0, 0.010, 0.047, 0.084, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.047 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.027, 0.123, 0.219, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.123 std_dev=0.096
C2'	A	0, 0.023, 0.170, 0.316, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.170 std_dev=0.146
C4'	A	0, 0.083, 0.232, 0.381, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.232 std_dev=0.149
C3'	A	0, 0.106, 0.297, 0.489, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.297 std_dev=0.191
O5'	A	0, 0.141, 0.355, 0.570, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.355 std_dev=0.215
C5'	A	0, 0.112, 0.345, 0.579, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.345 std_dev=0.234
O2'	A	0, -0.009, 0.243, 0.494, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.243 std_dev=0.251
P	A	0, 0.180, 0.465, 0.751, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.465 std_dev=0.286
O3'	B	0, 0.175, 0.466, 0.756, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.466 std_dev=0.291
O3'	A	0, 0.129, 0.447, 0.765, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.447 std_dev=0.318
OP2	A	0, 0.238, 0.578, 0.919, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.578 std_dev=0.340
O2'	B	0, 0.094, 0.441, 0.787, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.441 std_dev=0.347
C3'	B	0, 0.141, 0.505, 0.868, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.505 std_dev=0.363
C2'	B	0, 0.078, 0.458, 0.837, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.458 std_dev=0.379
OP1	A	0, 0.164, 0.584, 1.004, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.584 std_dev=0.420
C4'	B	0, 0.128, 0.583, 1.038, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.583 std_dev=0.455
N3	B	0, 0.218, 0.696, 1.173, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.696 std_dev=0.477
C2	B	0, 0.306, 0.795, 1.284, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.795 std_dev=0.489
C4	B	0, 0.160, 0.652, 1.145, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.652 std_dev=0.492
N1	B	0, 0.327, 0.825, 1.323, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.825 std_dev=0.498
C6	B	0, 0.306, 0.806, 1.306, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.806 std_dev=0.500
C5	B	0, 0.252, 0.753, 1.253, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.753 std_dev=0.500
N9	B	0, 0.127, 0.652, 1.177, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.652 std_dev=0.525
C1'	B	0, 0.067, 0.601, 1.135, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.601 std_dev=0.534
N6	B	0, 0.372, 0.914, 1.456, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.914 std_dev=0.542
N7	B	0, 0.327, 0.870, 1.412, 2.011 max_d=2.011 avg_d=0.870 std_dev=0.542
C8	B	0, 0.257, 0.814, 1.371, 2.079 max_d=2.079 avg_d=0.814 std_dev=0.557
O4'	B	0, 0.095, 0.701, 1.306, 2.004 max_d=2.004 avg_d=0.701 std_dev=0.606
O5'	B	0, 0.270, 0.876, 1.482, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.876 std_dev=0.606
C5'	B	0, 0.144, 0.807, 1.471, 2.708 max_d=2.708 avg_d=0.807 std_dev=0.663
P	B	0, 0.417, 1.166, 1.914, 2.450 max_d=2.450 avg_d=1.166 std_dev=0.749
OP1	B	0, 0.574, 1.369, 2.165, 2.582 max_d=2.582 avg_d=1.369 std_dev=0.796
OP2	B	0, 0.493, 1.370, 2.247, 2.777 max_d=2.777 avg_d=1.370 std_dev=0.877

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.13	0.02	0.14	0.25	0.17
C2	0.04	0.00	0.16	0.16	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.21	0.03	0.24	0.01	0.29	0.46	0.31
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.11	0.02	0.09	0.02	0.12	0.05	0.14	0.18	0.15	0.07	0.05	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.10	0.20	0.11
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.11	0.00	0.12	0.03	0.13	0.12	0.15	0.19	0.15	0.12	0.08	0.03	0.01	0.01	0.11	0.13	0.13	0.18	0.12
C4	0.02	0.01	0.11	0.11	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.13	0.03	0.24	0.01	0.28	0.43	0.30
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.07	0.09	0.07	0.09	0.05	0.08	0.03	0.00	0.03	0.08	0.10	0.10	0.04
C5	0.01	0.00	0.09	0.12	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.14	0.05	0.27	0.01	0.36	0.50	0.36
C5'	0.03	0.12	0.02	0.03	0.12	0.01	0.16	0.00	0.16	0.17	0.14	0.12	0.10	0.19	0.11	0.08	0.05	0.02	0.01	0.18	0.12	0.06	0.03
C6	0.02	0.01	0.12	0.13	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.05	0.28	0.00	0.39	0.53	0.38
C8	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.07	0.26	0.02	0.31	0.42	0.33
N1	0.03	0.00	0.14	0.15	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.19	0.04	0.26	0.01	0.35	0.50	0.35
N2	0.05	0.00	0.18	0.19	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.25	0.03	0.24	0.02	0.28	0.45	0.31
N3	0.03	0.01	0.15	0.15	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.18	0.02	0.22	0.01	0.25	0.41	0.28
N7	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.15	0.07	0.29	0.02	0.39	0.52	0.38
N9	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.03	0.21	0.02	0.24	0.36	0.26
O2'	0.02	0.23	0.01	0.03	0.14	0.08	0.12	0.08	0.16	0.04	0.20	0.26	0.21	0.06	0.06	0.00	0.04	0.06	0.09	0.15	0.12	0.19	0.11
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.13	0.03	0.14	0.05	0.17	0.13	0.19	0.25	0.18	0.15	0.08	0.04	0.00	0.02	0.20	0.18	0.25	0.25	0.20
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.07	0.03	0.06	0.02	0.00	0.12	0.06	0.15	0.19	0.15
O5'	0.13	0.24	0.08	0.11	0.24	0.03	0.27	0.01	0.28	0.26	0.26	0.24	0.22	0.29	0.21	0.09	0.20	0.12	0.00	0.29	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.11	0.13	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.15	0.18	0.06	0.29	0.00	0.44	0.56	0.40
OP1	0.14	0.29	0.10	0.13	0.28	0.10	0.36	0.12	0.39	0.31	0.35	0.28	0.25	0.39	0.24	0.12	0.25	0.15	0.02	0.44	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.46	0.20	0.18	0.43	0.10	0.50	0.06	0.53	0.42	0.50	0.45	0.41	0.52	0.36	0.19	0.25	0.19	0.02	0.56	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.31	0.11	0.12	0.30	0.04	0.36	0.03	0.38	0.33	0.35	0.31	0.28	0.38	0.26	0.11	0.20	0.15	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.39	0.29	0.32	0.38	0.29	0.41	0.35	0.40	0.40	0.39	0.37	0.41	0.42	0.38	0.26	0.28	0.31	0.41	0.42	0.56	0.45
C2	0.29	0.34	0.24	0.35	0.36	0.34	0.47	0.49	0.50	0.45	0.42	0.30	0.58	0.52	0.36	0.19	0.33	0.31	0.44	0.54	0.78	0.55
C2'	0.31	0.41	0.26	0.25	0.35	0.24	0.37	0.27	0.39	0.37	0.40	0.37	0.40	0.39	0.34	0.30	0.22	0.28	0.36	0.40	0.51	0.39
C3'	0.30	0.34	0.27	0.20	0.28	0.21	0.30	0.21	0.30	0.33	0.32	0.31	0.31	0.33	0.30	0.37	0.19	0.25	0.30	0.37	0.40	0.31
C4	0.25	0.24	0.21	0.33	0.28	0.30	0.38	0.44	0.36	0.40	0.27	0.21	0.40	0.44	0.31	0.19	0.32	0.26	0.43	0.51	0.72	0.53
C4'	0.33	0.32	0.29	0.22	0.30	0.23	0.30	0.22	0.29	0.33	0.30	0.31	0.29	0.32	0.32	0.39	0.20	0.28	0.30	0.32	0.36	0.30
C5	0.20	0.28	0.17	0.32	0.18	0.30	0.27	0.46	0.22	0.36	0.20	0.21	0.28	0.39	0.24	0.20	0.33	0.22	0.42	0.55	0.76	0.54
C5'	0.31	0.25	0.30	0.20	0.24	0.22	0.23	0.20	0.21	0.29	0.23	0.26	0.20	0.26	0.27	0.42	0.18	0.26	0.25	0.30	0.31	0.24
C6	0.22	0.34	0.19	0.33	0.22	0.32	0.30	0.51	0.25	0.38	0.27	0.26	0.33	0.42	0.26	0.20	0.34	0.24	0.42	0.58	0.81	0.57
C8	0.17	0.24	0.13	0.28	0.17	0.24	0.23	0.37	0.20	0.32	0.21	0.20	0.23	0.32	0.22	0.21	0.31	0.17	0.42	0.49	0.64	0.49
N1	0.25	0.27	0.21	0.34	0.27	0.34	0.39	0.52	0.38	0.42	0.27	0.23	0.49	0.48	0.31	0.19	0.33	0.28	0.43	0.57	0.81	0.57
N2	0.32	0.41	0.26	0.36	0.41	0.35	0.52	0.50	0.57	0.48	0.52	0.36	0.66	0.55	0.40	0.21	0.33	0.34	0.44	0.54	0.79	0.56
N3	0.31	0.39	0.26	0.35	0.39	0.33	0.48	0.46	0.50	0.45	0.45	0.34	0.54	0.51	0.38	0.21	0.32	0.32	0.44	0.51	0.73	0.53
N7	0.20	0.37	0.17	0.29	0.23	0.26	0.25	0.42	0.24	0.33	0.31	0.32	0.24	0.34	0.23	0.23	0.33	0.18	0.42	0.54	0.72	0.53
N9	0.24	0.24	0.21	0.32	0.27	0.28	0.34	0.39	0.31	0.37	0.26	0.22	0.34	0.39	0.30	0.20	0.31	0.25	0.43	0.47	0.64	0.49
O2'	0.35	0.51	0.29	0.27	0.42	0.26	0.44	0.28	0.47	0.40	0.50	0.46	0.48	0.42	0.39	0.31	0.24	0.32	0.34	0.35	0.47	0.36
O3'	0.31	0.36	0.29	0.21	0.29	0.23	0.30	0.20	0.32	0.34	0.35	0.33	0.33	0.33	0.30	0.39	0.21	0.26	0.27	0.35	0.36	0.27
O4'	0.35	0.33	0.31	0.30	0.35	0.27	0.36	0.30	0.34	0.38	0.32	0.34	0.34	0.38	0.37	0.31	0.27	0.32	0.37	0.37	0.46	0.39
O5'	0.22	0.34	0.24	0.11	0.24	0.09	0.24	0.14	0.27	0.24	0.32	0.31	0.26	0.23	0.22	0.31	0.06	0.14	0.32	0.47	0.37	0.34
O6	0.24	0.46	0.20	0.32	0.28	0.33	0.31	0.53	0.33	0.37	0.45	0.36	0.35	0.41	0.27	0.22	0.34	0.25	0.41	0.61	0.84	0.58
OP1	0.05	0.27	0.10	0.04	0.17	0.13	0.22	0.26	0.26	0.22	0.28	0.22	0.29	0.25	0.13	0.17	0.03	0.08	0.44	0.59	0.46	0.44
OP2	0.17	0.42	0.18	0.06	0.32	0.13	0.36	0.29	0.41	0.30	0.44	0.35	0.42	0.34	0.25	0.18	0.02	0.11	0.46	0.72	0.50	0.53
P	0.08	0.28	0.13	0.01	0.19	0.08	0.21	0.20	0.25	0.20	0.29	0.23	0.27	0.22	0.13	0.17	0.01	0.03	0.36	0.51	0.34	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.23	0.22	0.25	0.17
C2	0.02	0.00	0.14	0.19	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.20	0.04	0.36	0.39	0.70	0.44
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.03	0.07	0.07	0.12	0.14	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.14	0.13	0.22	0.12
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.13	0.00	0.14	0.02	0.16	0.11	0.19	0.17	0.16	0.12	0.08	0.02	0.01	0.02	0.13	0.17	0.17	0.12
C4	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.12	0.03	0.38	0.39	0.64	0.43
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.15	0.11	0.06	0.15	0.16	0.09	0.07	0.04	0.00	0.02	0.12	0.12	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.13	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.05	0.45	0.51	0.81	0.56
C5'	0.05	0.20	0.03	0.02	0.21	0.01	0.30	0.00	0.31	0.30	0.26	0.16	0.35	0.35	0.20	0.07	0.06	0.02	0.01	0.23	0.21	0.02
C6	0.01	0.00	0.07	0.16	0.01	0.13	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.16	0.05	0.45	0.54	0.88	0.59
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.15	0.01	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.12	0.09	0.46	0.48	0.64	0.51
N1	0.02	0.00	0.12	0.19	0.01	0.11	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.20	0.04	0.41	0.48	0.83	0.54
N3	0.02	0.00	0.14	0.17	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.18	0.04	0.33	0.33	0.59	0.37
N6	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.15	0.01	0.35	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.17	0.06	0.47	0.62	0.98	0.66
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.16	0.00	0.35	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.13	0.08	0.49	0.58	0.84	0.62
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.04	0.36	0.34	0.51	0.36
O2'	0.03	0.16	0.00	0.02	0.09	0.07	0.08	0.07	0.11	0.06	0.15	0.15	0.10	0.06	0.05	0.00	0.03	0.07	0.07	0.17	0.13	0.09
O3'	0.01	0.20	0.02	0.01	0.12	0.04	0.13	0.06	0.16	0.12	0.20	0.18	0.17	0.13	0.07	0.03	0.00	0.03	0.22	0.28	0.21	0.21
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.09	0.04	0.04	0.06	0.08	0.04	0.07	0.03	0.00	0.22	0.26	0.12	0.13
O5'	0.23	0.36	0.14	0.13	0.38	0.02	0.45	0.01	0.45	0.46	0.41	0.33	0.47	0.49	0.36	0.07	0.22	0.22	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.22	0.39	0.13	0.17	0.39	0.12	0.51	0.23	0.54	0.48	0.48	0.33	0.62	0.58	0.34	0.17	0.28	0.26	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.70	0.22	0.17	0.64	0.12	0.81	0.21	0.88	0.64	0.83	0.59	0.98	0.84	0.51	0.13	0.21	0.12	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.17	0.44	0.12	0.12	0.43	0.08	0.56	0.02	0.59	0.51	0.54	0.37	0.66	0.62	0.36	0.09	0.21	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00