Doublet Group distance statistics: 50211

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 7, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.013, 0.020, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.019, 0.029, 0.040, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.024, 0.036, 0.048, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.036 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.013, 0.026, 0.038, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.033, 0.048, 0.064, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.048 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.023, 0.041, 0.059, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.041 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.029, 0.047, 0.065, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.047 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.015, 0.038, 0.060, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.038 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.033, 0.057, 0.082, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.057 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.060, 0.087, 0.115, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.087 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.016, 0.046, 0.075, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.046 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.088, 0.143, 0.197, 0.214 max_d=0.214 avg_d=0.143 std_dev=0.055
C2'	A	0, 0.128, 0.196, 0.264, 0.300 max_d=0.300 avg_d=0.196 std_dev=0.068
O5'	A	0, 0.128, 0.217, 0.306, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.217 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.135, 0.247, 0.359, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.247 std_dev=0.112
O2'	A	0, 0.181, 0.299, 0.417, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.299 std_dev=0.118
C5'	A	0, 0.148, 0.268, 0.389, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.268 std_dev=0.121
P	A	0, 0.077, 0.198, 0.320, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.198 std_dev=0.122
C3'	A	0, 0.211, 0.350, 0.490, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.350 std_dev=0.139
OP2	A	0, 0.373, 0.546, 0.718, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.546 std_dev=0.172
O2'	B	0, 0.449, 0.644, 0.838, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.644 std_dev=0.194
O3'	B	0, 0.386, 0.599, 0.812, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.599 std_dev=0.213
C2'	B	0, 0.507, 0.721, 0.935, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.721 std_dev=0.214
N3	B	0, 0.489, 0.706, 0.922, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.706 std_dev=0.216
C1'	B	0, 0.557, 0.802, 1.047, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.802 std_dev=0.245
OP1	A	0, 0.182, 0.433, 0.685, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.433 std_dev=0.252
C3'	B	0, 0.533, 0.788, 1.043, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.788 std_dev=0.255
O3'	A	0, 0.443, 0.702, 0.961, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.702 std_dev=0.259
C4	B	0, 0.604, 0.869, 1.135, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.869 std_dev=0.266
C2	B	0, 0.550, 0.822, 1.095, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.822 std_dev=0.273
N9	B	0, 0.636, 0.917, 1.199, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.917 std_dev=0.282
O4'	B	0, 0.671, 0.970, 1.269, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.970 std_dev=0.299
C4'	B	0, 0.633, 0.950, 1.267, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.950 std_dev=0.317
N1	B	0, 0.694, 1.038, 1.382, 1.725 max_d=1.725 avg_d=1.038 std_dev=0.344
C5	B	0, 0.744, 1.092, 1.439, 1.736 max_d=1.736 avg_d=1.092 std_dev=0.347
C8	B	0, 0.787, 1.155, 1.523, 1.764 max_d=1.764 avg_d=1.155 std_dev=0.368
C6	B	0, 0.788, 1.168, 1.547, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.168 std_dev=0.379
N7	B	0, 0.848, 1.251, 1.654, 1.971 max_d=1.971 avg_d=1.251 std_dev=0.403
N6	B	0, 0.944, 1.407, 1.870, 2.322 max_d=2.322 avg_d=1.407 std_dev=0.463
P	B	0, 0.516, 0.994, 1.473, 2.308 max_d=2.308 avg_d=0.994 std_dev=0.478
O5'	B	0, 0.075, 0.589, 1.102, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.589 std_dev=0.513
C5'	B	0, 0.716, 1.245, 1.774, 1.736 max_d=1.736 avg_d=1.245 std_dev=0.529
OP2	B	0, 1.602, 2.461, 3.320, 3.365 max_d=3.365 avg_d=2.461 std_dev=0.859
OP1	B	0, 1.654, 2.620, 3.586, 3.395 max_d=3.395 avg_d=2.620 std_dev=0.966

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.05	0.04
C2	0.02	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.08	0.01	0.08	0.14	0.08
C2'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.04	0.07	0.11	0.07
C3'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.06	0.01	0.08	0.04	0.08	0.07	0.08	0.07	0.05	0.08	0.05	0.03	0.00	0.01	0.06	0.09	0.07	0.07	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.02	0.08	0.01	0.07	0.12	0.07
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.03
C5	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.04	0.09	0.01	0.09	0.15	0.10
C5'	0.02	0.05	0.04	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.08	0.06	0.05	0.05	0.09	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.03	0.10	0.01	0.11	0.17	0.11
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.05	0.09	0.02	0.07	0.11	0.08
N1	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.09	0.01	0.10	0.16	0.10
N2	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02	0.08	0.02	0.08	0.14	0.08
N3	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.12	0.07
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.05	0.10	0.02	0.10	0.15	0.10
N9	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.03	0.07	0.01	0.06	0.09	0.06
O2'	0.01	0.08	0.01	0.03	0.06	0.06	0.05	0.05	0.06	0.03	0.08	0.09	0.08	0.04	0.03	0.00	0.06	0.04	0.05	0.07	0.07	0.07	0.04
O3'	0.02	0.07	0.02	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.10	0.08	0.09	0.07	0.05	0.10	0.05	0.06	0.00	0.02	0.06	0.12	0.10	0.08	0.07
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.11	0.08	0.09
O5'	0.04	0.08	0.08	0.06	0.08	0.01	0.09	0.01	0.10	0.09	0.09	0.08	0.07	0.10	0.07	0.05	0.06	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.12	0.04	0.11	0.00	0.13	0.18	0.13
OP1	0.06	0.08	0.07	0.07	0.07	0.05	0.09	0.04	0.11	0.07	0.10	0.08	0.07	0.10	0.06	0.07	0.10	0.11	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.14	0.11	0.07	0.12	0.02	0.15	0.01	0.17	0.11	0.16	0.14	0.12	0.15	0.09	0.07	0.08	0.08	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.08	0.07	0.05	0.07	0.03	0.10	0.01	0.11	0.08	0.10	0.08	0.07	0.10	0.06	0.04	0.07	0.09	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.12	0.12	0.11	0.10	0.15	0.09	0.20	0.08	0.12	0.10	0.12	0.08	0.11	0.11	0.11	0.12	0.10	0.25	0.42	0.39	0.16
C2	0.11	0.17	0.11	0.11	0.14	0.14	0.15	0.13	0.17	0.15	0.18	0.15	0.17	0.16	0.13	0.07	0.14	0.10	0.21	0.29	0.43	0.20
C2'	0.09	0.15	0.09	0.07	0.10	0.09	0.09	0.13	0.10	0.10	0.13	0.13	0.10	0.09	0.09	0.11	0.09	0.07	0.23	0.49	0.39	0.15
C3'	0.07	0.13	0.08	0.05	0.08	0.06	0.10	0.09	0.12	0.11	0.13	0.11	0.13	0.12	0.08	0.12	0.06	0.06	0.25	0.58	0.37	0.17
C4	0.11	0.15	0.11	0.11	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.14	0.14	0.14	0.13	0.14	0.12	0.08	0.14	0.09	0.22	0.31	0.42	0.20
C4'	0.07	0.10	0.08	0.05	0.06	0.07	0.07	0.15	0.08	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09	0.07	0.12	0.05	0.05	0.26	0.57	0.37	0.16
C5	0.11	0.16	0.10	0.11	0.13	0.11	0.14	0.11	0.14	0.15	0.15	0.14	0.14	0.15	0.13	0.06	0.15	0.09	0.24	0.33	0.45	0.26
C5'	0.09	0.16	0.10	0.05	0.10	0.05	0.12	0.09	0.14	0.11	0.16	0.14	0.15	0.12	0.09	0.16	0.05	0.08	0.25	0.63	0.36	0.16
C6	0.11	0.17	0.09	0.11	0.15	0.11	0.16	0.10	0.17	0.16	0.18	0.15	0.18	0.17	0.14	0.05	0.14	0.09	0.24	0.34	0.48	0.29
C8	0.11	0.13	0.11	0.11	0.11	0.12	0.10	0.12	0.09	0.13	0.11	0.13	0.09	0.12	0.11	0.10	0.14	0.09	0.25	0.36	0.42	0.23
N1	0.11	0.18	0.10	0.11	0.15	0.12	0.17	0.10	0.18	0.16	0.19	0.15	0.19	0.17	0.14	0.06	0.14	0.10	0.22	0.31	0.45	0.25
N2	0.12	0.18	0.12	0.11	0.15	0.15	0.16	0.15	0.18	0.15	0.19	0.16	0.19	0.16	0.14	0.08	0.14	0.11	0.20	0.28	0.42	0.19
N3	0.11	0.16	0.11	0.11	0.13	0.15	0.14	0.15	0.14	0.14	0.15	0.14	0.15	0.14	0.13	0.08	0.13	0.10	0.21	0.30	0.41	0.18
N7	0.11	0.15	0.10	0.12	0.12	0.11	0.12	0.12	0.12	0.14	0.13	0.15	0.12	0.14	0.13	0.08	0.15	0.09	0.27	0.35	0.46	0.28
N9	0.11	0.13	0.11	0.11	0.11	0.13	0.10	0.15	0.10	0.13	0.12	0.13	0.10	0.12	0.11	0.09	0.13	0.09	0.23	0.35	0.40	0.18
O2'	0.09	0.14	0.10	0.08	0.09	0.16	0.08	0.23	0.09	0.10	0.12	0.12	0.09	0.09	0.09	0.10	0.10	0.09	0.27	0.51	0.40	0.17
O3'	0.08	0.15	0.08	0.05	0.10	0.06	0.13	0.08	0.15	0.13	0.16	0.12	0.18	0.15	0.09	0.12	0.05	0.06	0.26	0.66	0.36	0.18
O4'	0.11	0.09	0.13	0.12	0.09	0.16	0.09	0.23	0.08	0.13	0.07	0.10	0.08	0.12	0.11	0.12	0.13	0.09	0.29	0.47	0.38	0.17
O5'	0.07	0.17	0.10	0.03	0.10	0.03	0.12	0.08	0.15	0.11	0.17	0.14	0.16	0.12	0.08	0.15	0.02	0.04	0.30	0.66	0.32	0.24
O6	0.10	0.18	0.08	0.11	0.15	0.09	0.18	0.12	0.19	0.17	0.19	0.15	0.20	0.19	0.14	0.06	0.14	0.09	0.27	0.38	0.52	0.34
OP1	0.05	0.20	0.03	0.04	0.13	0.15	0.17	0.22	0.21	0.12	0.22	0.16	0.23	0.16	0.08	0.05	0.01	0.11	0.34	0.82	0.25	0.31
OP2	0.10	0.24	0.14	0.05	0.16	0.09	0.17	0.22	0.22	0.16	0.25	0.20	0.23	0.17	0.12	0.17	0.02	0.05	0.41	0.72	0.42	0.41
P	0.04	0.19	0.07	0.02	0.12	0.07	0.14	0.14	0.18	0.12	0.20	0.15	0.19	0.14	0.08	0.10	0.01	0.03	0.34	0.67	0.31	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.37	0.38	0.23
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.00	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.03	0.28	0.57	0.52	0.36
C2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.02	0.06	0.04	0.07	0.04	0.09	0.10	0.07	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.17	0.20	0.40	0.21
C3'	0.01	0.12	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.09	0.07	0.11	0.11	0.09	0.07	0.04	0.01	0.01	0.02	0.26	0.27	0.38	0.22
C4	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.05	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.09	0.03	0.28	0.56	0.51	0.36
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.05	0.09	0.09	0.04	0.10	0.01	0.00	0.02	0.13	0.35	0.07
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.07	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.35	0.65	0.61	0.43
C5'	0.04	0.18	0.04	0.04	0.18	0.01	0.24	0.00	0.26	0.23	0.23	0.15	0.29	0.27	0.16	0.10	0.03	0.02	0.01	0.33	0.30	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.09	0.01	0.08	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.36	0.67	0.63	0.44
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.08	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.35	0.60	0.58	0.41
N1	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.07	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.03	0.33	0.63	0.59	0.41
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.14	0.03	0.24	0.52	0.48	0.33
N6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.09	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.04	0.39	0.71	0.69	0.47
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.09	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.39	0.68	0.66	0.46
N9	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.26	0.51	0.47	0.34
O2'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.10	0.04	0.10	0.05	0.03	0.08	0.08	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.11	0.17	0.40	0.14
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.09	0.01	0.09	0.03	0.11	0.08	0.15	0.14	0.12	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.27	0.42	0.35	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.13	0.36	0.35	0.21
O5'	0.13	0.28	0.17	0.26	0.28	0.02	0.35	0.01	0.36	0.35	0.33	0.24	0.39	0.39	0.26	0.11	0.27	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.37	0.57	0.20	0.27	0.56	0.13	0.65	0.33	0.67	0.60	0.63	0.52	0.71	0.68	0.51	0.17	0.42	0.36	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.38	0.52	0.40	0.38	0.51	0.35	0.61	0.30	0.63	0.58	0.59	0.48	0.69	0.66	0.47	0.40	0.35	0.35	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.36	0.21	0.22	0.36	0.07	0.43	0.01	0.44	0.41	0.41	0.33	0.47	0.46	0.34	0.14	0.19	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00