Doublet Group distance statistics: 50218

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.017, 0.028, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.028 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.015, 0.028, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.010, 0.024, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.024, 0.038, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.038 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.019, 0.039, 0.058, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.039 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.014, 0.034, 0.054, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.034 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.018, 0.038, 0.059, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.038 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.039, 0.080, 0.121, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.080 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.013, 0.074, 0.136, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.074 std_dev=0.062
C3'	A	0, 0.036, 0.119, 0.202, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.119 std_dev=0.083
C4'	A	0, 0.049, 0.143, 0.237, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.143 std_dev=0.094
C3'	B	0, 0.153, 0.263, 0.374, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.263 std_dev=0.111
O2'	A	0, 0.076, 0.192, 0.308, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.192 std_dev=0.116
C4'	B	0, 0.156, 0.273, 0.390, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.273 std_dev=0.117
O3'	A	0, 0.070, 0.200, 0.331, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.200 std_dev=0.131
O3'	B	0, 0.105, 0.238, 0.371, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.238 std_dev=0.133
O5'	A	0, 0.069, 0.213, 0.358, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.213 std_dev=0.145
P	A	0, 0.082, 0.229, 0.376, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.229 std_dev=0.147
OP1	A	0, 0.068, 0.240, 0.413, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.240 std_dev=0.173
C2'	B	0, 0.124, 0.336, 0.548, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.336 std_dev=0.212
C5'	A	0, 0.028, 0.241, 0.455, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.241 std_dev=0.214
C5'	B	0, 0.193, 0.410, 0.627, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.410 std_dev=0.217
OP2	A	0, 0.105, 0.322, 0.540, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.322 std_dev=0.218
O4'	B	0, 0.166, 0.398, 0.630, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.398 std_dev=0.232
C1'	B	0, 0.168, 0.422, 0.676, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.422 std_dev=0.254
O5'	B	0, 0.102, 0.381, 0.661, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.381 std_dev=0.280
O2'	B	0, 0.162, 0.514, 0.866, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.514 std_dev=0.352
P	B	0, 0.124, 0.484, 0.844, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.484 std_dev=0.360
OP1	B	0, 0.142, 0.504, 0.866, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.504 std_dev=0.362
OP2	B	0, 0.203, 0.637, 1.070, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.637 std_dev=0.433
N9	B	0, 0.135, 0.668, 1.201, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.668 std_dev=0.533
C4	B	0, -0.050, 0.904, 1.858, 2.779 max_d=2.779 avg_d=0.904 std_dev=0.954
C8	B	0, -0.129, 1.231, 2.590, 3.686 max_d=3.686 avg_d=1.231 std_dev=1.360
N3	B	0, -0.048, 1.332, 2.712, 3.508 max_d=3.508 avg_d=1.332 std_dev=1.380
C5	B	0, -0.268, 1.236, 2.741, 4.208 max_d=4.208 avg_d=1.236 std_dev=1.505
N7	B	0, -0.200, 1.508, 3.216, 4.371 max_d=4.371 avg_d=1.508 std_dev=1.708
C2	B	0, -0.172, 1.864, 3.900, 5.164 max_d=5.164 avg_d=1.864 std_dev=2.036
C6	B	0, -0.442, 1.641, 3.725, 5.771 max_d=5.771 avg_d=1.641 std_dev=2.084
N1	B	0, -0.245, 2.006, 4.257, 6.135 max_d=6.135 avg_d=2.006 std_dev=2.251
N6	B	0, -0.729, 1.947, 4.623, 7.254 max_d=7.254 avg_d=1.947 std_dev=2.676

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.20	0.11
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.08	0.03	0.08	0.02	0.09	0.17	0.09
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.06	0.19	0.09
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.18	0.07
C4	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.14	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.08	0.02	0.08	0.17	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.04	0.05	0.03	0.10	0.06	0.05	0.03	0.01	0.02	0.08	0.04	0.12	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.03	0.10	0.02	0.08	0.14	0.08
C5'	0.05	0.12	0.02	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.18	0.22	0.15	0.11	0.10	0.23	0.14	0.05	0.05	0.01	0.01	0.21	0.02	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.02	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.07	0.03	0.10	0.01	0.09	0.14	0.08
C8	0.03	0.02	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.06	0.11	0.02	0.08	0.16	0.09
N1	0.03	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.07	0.02	0.09	0.02	0.09	0.16	0.09
N2	0.05	0.01	0.07	0.08	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.13	0.10	0.04	0.09	0.02	0.10	0.18	0.10
N3	0.03	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.07	0.02	0.08	0.02	0.08	0.18	0.10
N7	0.02	0.01	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.06	0.12	0.02	0.09	0.13	0.08
N9	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.09	0.02	0.08	0.19	0.10
O2'	0.03	0.11	0.01	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.03	0.10	0.13	0.10	0.02	0.03	0.00	0.04	0.06	0.07	0.08	0.13	0.17	0.11
O3'	0.03	0.08	0.02	0.01	0.05	0.03	0.07	0.05	0.07	0.09	0.07	0.10	0.07	0.09	0.05	0.04	0.00	0.03	0.07	0.08	0.07	0.14	0.06
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.06	0.03	0.00	0.07	0.04	0.07	0.21	0.12
O5'	0.05	0.08	0.03	0.03	0.08	0.02	0.10	0.01	0.10	0.11	0.09	0.09	0.08	0.12	0.09	0.07	0.07	0.07	0.00	0.11	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.03	0.06	0.02	0.08	0.02	0.21	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.08	0.04	0.11	0.00	0.09	0.11	0.08
OP1	0.07	0.09	0.06	0.03	0.08	0.04	0.08	0.02	0.09	0.08	0.09	0.10	0.08	0.09	0.08	0.13	0.07	0.07	0.02	0.09	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.17	0.19	0.18	0.17	0.12	0.14	0.08	0.14	0.16	0.16	0.18	0.18	0.13	0.19	0.17	0.14	0.21	0.02	0.11	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.09	0.09	0.07	0.09	0.05	0.08	0.02	0.08	0.09	0.09	0.10	0.10	0.08	0.10	0.11	0.06	0.12	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.32	0.16	0.16	0.22	0.17	0.50	0.29	0.42	0.83	0.22	0.31	0.60	0.87	0.37	0.18	0.15	0.17	0.22	0.13	0.26	0.08
C2	0.15	0.26	0.15	0.15	0.37	0.18	0.65	0.31	0.67	0.70	0.47	0.19	0.87	0.85	0.39	0.25	0.11	0.19	0.26	0.32	0.31	0.26
C2'	0.12	0.36	0.14	0.14	0.22	0.16	0.54	0.30	0.45	0.89	0.24	0.35	0.67	0.94	0.38	0.14	0.13	0.16	0.25	0.21	0.30	0.14
C3'	0.09	0.31	0.09	0.11	0.26	0.13	0.64	0.28	0.55	0.98	0.25	0.31	0.80	1.07	0.42	0.10	0.10	0.12	0.24	0.18	0.30	0.15
C4	0.14	0.23	0.14	0.15	0.41	0.19	0.74	0.30	0.74	0.86	0.48	0.16	0.95	1.01	0.46	0.24	0.10	0.20	0.23	0.22	0.26	0.17
C4'	0.08	0.42	0.08	0.09	0.20	0.12	0.52	0.26	0.41	0.92	0.24	0.41	0.63	0.95	0.37	0.05	0.11	0.10	0.26	0.17	0.29	0.18
C5	0.16	0.48	0.12	0.14	0.55	0.18	0.93	0.27	0.98	0.95	0.75	0.33	1.23	1.18	0.52	0.28	0.10	0.22	0.23	0.28	0.26	0.22
C5'	0.16	0.30	0.06	0.09	0.30	0.14	0.66	0.24	0.57	1.01	0.27	0.32	0.81	1.09	0.44	0.07	0.10	0.13	0.25	0.16	0.29	0.19
C6	0.15	0.62	0.12	0.14	0.58	0.18	0.94	0.28	1.05	0.88	0.87	0.44	1.31	1.13	0.49	0.31	0.10	0.20	0.27	0.36	0.30	0.29
C8	0.17	0.32	0.11	0.14	0.52	0.18	0.93	0.23	0.91	1.09	0.62	0.20	1.16	1.26	0.56	0.25	0.10	0.22	0.15	0.14	0.22	0.09
N1	0.14	0.47	0.13	0.15	0.48	0.18	0.79	0.30	0.87	0.76	0.69	0.33	1.10	0.96	0.43	0.29	0.10	0.19	0.27	0.37	0.32	0.31
N2	0.17	0.24	0.17	0.16	0.32	0.18	0.55	0.31	0.57	0.62	0.39	0.19	0.75	0.74	0.35	0.24	0.12	0.19	0.26	0.33	0.32	0.27
N3	0.15	0.19	0.16	0.16	0.33	0.19	0.61	0.32	0.59	0.74	0.36	0.16	0.78	0.85	0.39	0.22	0.11	0.19	0.25	0.25	0.28	0.20
N7	0.18	0.57	0.11	0.14	0.63	0.18	1.07	0.23	1.12	1.11	0.86	0.39	1.39	1.36	0.60	0.30	0.10	0.24	0.19	0.23	0.23	0.18
N9	0.14	0.14	0.14	0.16	0.38	0.19	0.72	0.29	0.68	0.92	0.39	0.11	0.89	1.04	0.47	0.22	0.11	0.19	0.19	0.12	0.23	0.07
O2'	0.14	0.61	0.15	0.13	0.15	0.17	0.34	0.31	0.24	0.79	0.36	0.54	0.40	0.78	0.30	0.14	0.18	0.20	0.32	0.32	0.34	0.25
O3'	0.08	0.41	0.09	0.10	0.22	0.13	0.58	0.31	0.48	0.97	0.24	0.39	0.74	1.04	0.39	0.06	0.11	0.12	0.28	0.22	0.32	0.19
O4'	0.11	0.37	0.13	0.14	0.20	0.14	0.48	0.26	0.38	0.86	0.22	0.36	0.56	0.87	0.37	0.15	0.16	0.13	0.24	0.14	0.29	0.16
O5'	0.13	0.39	0.10	0.12	0.24	0.12	0.54	0.19	0.44	0.94	0.25	0.38	0.63	0.96	0.41	0.10	0.02	0.10	0.16	0.11	0.25	0.14
O6	0.17	0.84	0.13	0.14	0.67	0.18	1.06	0.26	1.23	0.92	1.09	0.60	1.52	1.22	0.52	0.35	0.10	0.22	0.27	0.39	0.31	0.32
OP1	0.09	0.40	0.09	0.09	0.14	0.09	0.35	0.18	0.25	0.71	0.21	0.40	0.40	0.70	0.26	0.17	0.02	0.06	0.19	0.17	0.29	0.22
OP2	0.16	0.17	0.16	0.04	0.43	0.05	0.88	0.15	0.84	1.12	0.49	0.09	1.11	1.29	0.51	0.27	0.02	0.08	0.14	0.12	0.19	0.12
P	0.11	0.18	0.06	0.02	0.28	0.04	0.61	0.13	0.52	0.95	0.23	0.22	0.72	1.00	0.42	0.08	0.01	0.05	0.14	0.10	0.22	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.06	0.02	0.02	0.01	0.03	0.13	0.00	0.15	0.15	0.33	0.24
C2	0.06	0.00	0.48	0.52	0.01	0.49	0.01	1.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.23	0.15	0.27	0.74	0.68	0.92	0.80
C2'	0.01	0.48	0.00	0.00	0.28	0.01	0.18	0.10	0.27	0.14	0.40	0.47	0.22	0.04	0.06	0.01	0.02	0.03	0.11	0.10	0.21	0.12
C3'	0.02	0.52	0.00	0.00	0.17	0.01	0.11	0.03	0.12	0.52	0.34	0.52	0.11	0.41	0.15	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.14	0.06
C4	0.02	0.01	0.28	0.17	0.00	0.18	0.00	0.48	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.33	0.15	0.32	0.23	0.34	0.26
C4'	0.02	0.49	0.01	0.01	0.18	0.00	0.11	0.01	0.15	0.43	0.33	0.49	0.13	0.34	0.11	0.09	0.03	0.01	0.02	0.05	0.14	0.07
C5	0.01	0.01	0.18	0.11	0.00	0.11	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.63	0.07	0.22	0.13	0.40	0.23
C5'	0.05	1.00	0.10	0.03	0.48	0.01	0.31	0.00	0.52	0.34	0.82	0.91	0.42	0.21	0.11	0.04	0.13	0.04	0.01	0.03	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.27	0.12	0.01	0.15	0.01	0.52	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.54	0.12	0.36	0.31	0.49	0.38
C8	0.03	0.02	0.14	0.52	0.01	0.43	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.29	0.97	0.15	0.38	0.34	0.81	0.53
N1	0.04	0.01	0.40	0.34	0.01	0.33	0.01	0.82	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.28	0.21	0.60	0.57	0.76	0.66
N3	0.06	0.00	0.47	0.52	0.01	0.49	0.01	0.91	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.16	0.28	0.65	0.55	0.72	0.63
N6	0.02	0.02	0.22	0.11	0.01	0.13	0.01	0.42	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.69	0.09	0.30	0.25	0.50	0.34
N7	0.02	0.02	0.04	0.41	0.01	0.34	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.26	0.96	0.09	0.28	0.23	0.71	0.41
N9	0.01	0.02	0.06	0.15	0.01	0.11	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.48	0.01	0.16	0.10	0.40	0.22
O2'	0.03	0.23	0.01	0.01	0.08	0.09	0.13	0.04	0.12	0.29	0.15	0.22	0.14	0.26	0.12	0.00	0.05	0.05	0.09	0.12	0.20	0.14
O3'	0.13	0.15	0.02	0.01	0.33	0.03	0.63	0.13	0.54	0.97	0.28	0.16	0.69	0.96	0.48	0.05	0.00	0.07	0.13	0.11	0.18	0.13
O4'	0.00	0.27	0.03	0.02	0.15	0.01	0.07	0.04	0.12	0.15	0.21	0.28	0.09	0.09	0.01	0.05	0.07	0.00	0.17	0.14	0.34	0.25
O5'	0.15	0.74	0.11	0.04	0.32	0.02	0.22	0.01	0.36	0.38	0.60	0.65	0.30	0.28	0.16	0.09	0.13	0.17	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.15	0.68	0.10	0.04	0.23	0.05	0.13	0.03	0.31	0.34	0.57	0.55	0.25	0.23	0.10	0.12	0.11	0.14	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.33	0.92	0.21	0.14	0.34	0.14	0.40	0.15	0.49	0.81	0.76	0.72	0.50	0.71	0.40	0.20	0.18	0.34	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.24	0.80	0.12	0.06	0.26	0.07	0.23	0.02	0.38	0.53	0.66	0.63	0.34	0.41	0.22	0.14	0.13	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00