Doublet Group distance statistics: 50220

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 1, 2, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.008, 0.015, 0.023, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.030 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.018, 0.034, 0.049, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.034 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.012, 0.028, 0.045, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C2'	A	0, -0.073, 0.151, 0.375, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.151 std_dev=0.224
O4'	A	0, -0.084, 0.156, 0.396, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.156 std_dev=0.240
C2'	B	0, 0.167, 0.454, 0.741, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.454 std_dev=0.287
O2'	B	0, 0.180, 0.468, 0.757, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.468 std_dev=0.289
C1'	B	0, 0.176, 0.537, 0.899, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.537 std_dev=0.361
O5'	A	0, 0.040, 0.420, 0.800, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.420 std_dev=0.380
C3'	B	0, 0.208, 0.636, 1.063, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.636 std_dev=0.428
P	A	0, -0.020, 0.414, 0.848, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.414 std_dev=0.434
O2'	A	0, -0.186, 0.249, 0.684, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.249 std_dev=0.435
C4'	A	0, -0.169, 0.289, 0.746, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.289 std_dev=0.457
O3'	B	0, 0.068, 0.531, 0.993, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.531 std_dev=0.462
N9	B	0, 0.191, 0.670, 1.150, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.670 std_dev=0.480
C5'	A	0, -0.125, 0.368, 0.861, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.368 std_dev=0.493
O4'	B	0, 0.157, 0.678, 1.199, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.678 std_dev=0.521
OP2	A	0, 0.008, 0.533, 1.059, 1.629 max_d=1.629 avg_d=0.533 std_dev=0.525
N3	B	0, 0.259, 0.787, 1.314, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.787 std_dev=0.527
C3'	A	0, -0.229, 0.303, 0.834, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.303 std_dev=0.531
OP1	A	0, -0.006, 0.526, 1.058, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.526 std_dev=0.532
C4	B	0, 0.214, 0.748, 1.282, 1.826 max_d=1.826 avg_d=0.748 std_dev=0.534
C4'	B	0, 0.265, 0.841, 1.416, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.841 std_dev=0.575
C2	B	0, 0.271, 0.881, 1.490, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.881 std_dev=0.609
C8	B	0, 0.117, 0.728, 1.338, 2.171 max_d=2.171 avg_d=0.728 std_dev=0.610
C5	B	0, 0.155, 0.833, 1.510, 2.366 max_d=2.366 avg_d=0.833 std_dev=0.677
N1	B	0, 0.238, 0.946, 1.655, 2.286 max_d=2.286 avg_d=0.946 std_dev=0.709
N7	B	0, 0.077, 0.827, 1.576, 2.649 max_d=2.649 avg_d=0.827 std_dev=0.749
C6	B	0, 0.169, 0.929, 1.689, 2.595 max_d=2.595 avg_d=0.929 std_dev=0.760
O5'	B	0, 0.019, 0.791, 1.563, 2.291 max_d=2.291 avg_d=0.791 std_dev=0.772
O3'	A	0, -0.428, 0.481, 1.390, 3.012 max_d=3.012 avg_d=0.481 std_dev=0.909
OP1	B	0, 0.179, 1.103, 2.026, 2.959 max_d=2.959 avg_d=1.103 std_dev=0.923
N6	B	0, 0.115, 1.042, 1.969, 3.198 max_d=3.198 avg_d=1.042 std_dev=0.927
C5'	B	0, 0.418, 1.417, 2.417, 3.349 max_d=3.349 avg_d=1.417 std_dev=1.000
P	B	0, -0.208, 0.963, 2.133, 3.568 max_d=3.568 avg_d=0.963 std_dev=1.171
OP2	B	0, -0.137, 1.706, 3.550, 6.284 max_d=6.284 avg_d=1.706 std_dev=1.843

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.18	0.01	0.12	0.03	0.11	0.17	0.14
C2	0.02	0.00	0.17	0.29	0.01	0.11	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.14	0.06	0.16	0.02	0.13	0.18	0.12
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.09	0.01	0.04	0.13	0.07	0.08	0.13	0.21	0.18	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.05	0.27	0.36	0.31
C3'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.26	0.00	0.30	0.02	0.33	0.20	0.33	0.29	0.25	0.27	0.19	0.02	0.01	0.02	0.06	0.35	0.12	0.13	0.07
C4	0.01	0.01	0.09	0.26	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.10	0.03	0.14	0.02	0.09	0.13	0.08
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.13	0.10	0.12	0.11	0.09	0.12	0.08	0.22	0.01	0.00	0.05	0.15	0.10	0.07	0.05
C5	0.02	0.01	0.04	0.30	0.01	0.12	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.17	0.03	0.22	0.01	0.15	0.23	0.16
C5'	0.05	0.10	0.13	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.15	0.10	0.13	0.10	0.08	0.14	0.05	0.08	0.14	0.03	0.01	0.18	0.09	0.04	0.02
C6	0.03	0.02	0.07	0.33	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.28	0.21	0.04	0.25	0.00	0.21	0.30	0.21
C8	0.02	0.01	0.08	0.20	0.01	0.10	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.12	0.04	0.18	0.03	0.06	0.18	0.08
N1	0.03	0.01	0.13	0.33	0.01	0.12	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.27	0.19	0.05	0.22	0.02	0.19	0.26	0.18
N2	0.03	0.01	0.21	0.29	0.01	0.11	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.15	0.06	0.14	0.03	0.13	0.17	0.11
N3	0.02	0.00	0.18	0.25	0.01	0.09	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.10	0.05	0.11	0.02	0.08	0.11	0.07
N7	0.02	0.01	0.05	0.27	0.01	0.12	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.19	0.03	0.24	0.03	0.14	0.25	0.16
N9	0.01	0.01	0.01	0.19	0.01	0.08	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.03	0.01	0.10	0.02	0.04	0.12	0.07
O2'	0.01	0.24	0.00	0.02	0.20	0.22	0.24	0.08	0.28	0.16	0.27	0.23	0.20	0.22	0.14	0.00	0.03	0.18	0.20	0.29	0.18	0.40	0.24
O3'	0.18	0.14	0.01	0.01	0.10	0.01	0.17	0.14	0.21	0.12	0.19	0.15	0.10	0.19	0.03	0.03	0.00	0.13	0.16	0.25	0.30	0.30	0.21
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.03	0.01	0.18	0.13	0.00	0.16	0.04	0.14	0.20	0.17
O5'	0.12	0.16	0.28	0.06	0.14	0.05	0.22	0.01	0.25	0.18	0.22	0.14	0.11	0.24	0.10	0.20	0.16	0.16	0.00	0.29	0.01	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.35	0.02	0.15	0.01	0.18	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.29	0.25	0.04	0.29	0.00	0.26	0.38	0.27
OP1	0.11	0.13	0.27	0.12	0.09	0.10	0.15	0.09	0.21	0.06	0.19	0.13	0.08	0.14	0.04	0.18	0.30	0.14	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.18	0.36	0.13	0.13	0.07	0.23	0.04	0.30	0.18	0.26	0.17	0.11	0.25	0.12	0.40	0.30	0.20	0.02	0.38	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.12	0.31	0.07	0.08	0.05	0.16	0.02	0.21	0.08	0.18	0.11	0.07	0.16	0.07	0.24	0.21	0.17	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.18	0.21	0.19	0.22	0.24	0.26	0.32	0.25	0.29	0.21	0.19	0.30	0.30	0.24	0.24	0.26	0.30	0.29	0.51	0.69	0.20
C2	0.22	0.19	0.19	0.16	0.19	0.23	0.18	0.38	0.17	0.22	0.16	0.21	0.21	0.21	0.20	0.25	0.15	0.27	0.26	0.41	0.64	0.19
C2'	0.24	0.23	0.29	0.25	0.22	0.27	0.21	0.32	0.20	0.24	0.20	0.24	0.23	0.23	0.22	0.34	0.34	0.30	0.39	0.67	0.83	0.32
C3'	0.20	0.14	0.15	0.16	0.19	0.32	0.22	0.39	0.20	0.25	0.16	0.16	0.25	0.25	0.21	0.20	0.14	0.31	0.52	0.87	1.04	0.55
C4	0.21	0.17	0.19	0.16	0.18	0.22	0.19	0.37	0.18	0.22	0.16	0.19	0.21	0.22	0.19	0.25	0.16	0.26	0.27	0.45	0.63	0.19
C4'	0.24	0.20	0.18	0.18	0.24	0.35	0.27	0.40	0.26	0.29	0.23	0.21	0.31	0.30	0.25	0.21	0.20	0.34	0.54	0.88	1.06	0.59
C5	0.23	0.20	0.18	0.16	0.19	0.25	0.17	0.40	0.16	0.20	0.17	0.22	0.18	0.18	0.19	0.25	0.14	0.27	0.29	0.45	0.60	0.23
C5'	0.24	0.19	0.18	0.21	0.22	0.40	0.23	0.48	0.22	0.25	0.20	0.21	0.26	0.25	0.24	0.20	0.15	0.35	0.69	0.95	1.19	0.76
C6	0.25	0.24	0.19	0.17	0.21	0.27	0.18	0.42	0.17	0.20	0.19	0.25	0.18	0.18	0.21	0.26	0.16	0.29	0.30	0.44	0.61	0.25
C8	0.21	0.17	0.19	0.16	0.18	0.22	0.18	0.37	0.17	0.21	0.16	0.18	0.20	0.20	0.19	0.26	0.16	0.25	0.31	0.49	0.59	0.23
N1	0.24	0.23	0.19	0.16	0.20	0.25	0.17	0.41	0.16	0.20	0.18	0.24	0.18	0.19	0.20	0.25	0.14	0.28	0.28	0.42	0.64	0.23
N2	0.23	0.20	0.20	0.17	0.19	0.23	0.19	0.38	0.18	0.23	0.17	0.21	0.22	0.23	0.20	0.25	0.15	0.27	0.26	0.39	0.65	0.18
N3	0.21	0.17	0.19	0.16	0.18	0.21	0.19	0.36	0.18	0.23	0.16	0.19	0.23	0.23	0.20	0.25	0.17	0.26	0.26	0.42	0.65	0.17
N7	0.23	0.20	0.18	0.17	0.19	0.26	0.17	0.41	0.16	0.19	0.17	0.21	0.17	0.18	0.19	0.25	0.15	0.27	0.32	0.48	0.56	0.25
N9	0.21	0.17	0.20	0.17	0.19	0.22	0.21	0.35	0.20	0.24	0.17	0.18	0.24	0.24	0.20	0.25	0.20	0.27	0.28	0.48	0.63	0.19
O2'	0.24	0.20	0.21	0.17	0.26	0.34	0.33	0.45	0.31	0.40	0.23	0.21	0.39	0.43	0.29	0.28	0.27	0.39	0.46	0.80	0.94	0.54
O3'	0.25	0.28	0.18	0.20	0.31	0.38	0.36	0.45	0.37	0.37	0.33	0.27	0.43	0.40	0.31	0.20	0.12	0.36	0.59	1.00	1.21	0.68
O4'	0.24	0.22	0.21	0.20	0.26	0.28	0.30	0.34	0.30	0.33	0.25	0.21	0.35	0.34	0.27	0.23	0.29	0.33	0.36	0.62	0.76	0.31
O5'	0.09	0.05	0.06	0.10	0.08	0.28	0.12	0.39	0.14	0.13	0.09	0.07	0.20	0.15	0.10	0.12	0.02	0.23	0.57	0.81	0.95	0.60
O6	0.28	0.28	0.20	0.19	0.24	0.30	0.20	0.44	0.19	0.21	0.23	0.29	0.19	0.19	0.24	0.27	0.20	0.32	0.31	0.44	0.60	0.28
OP1	0.09	0.13	0.20	0.06	0.13	0.18	0.19	0.35	0.22	0.17	0.18	0.11	0.28	0.21	0.12	0.27	0.02	0.08	0.67	0.77	1.04	0.73
OP2	0.27	0.25	0.31	0.10	0.24	0.09	0.27	0.10	0.29	0.24	0.28	0.23	0.33	0.26	0.24	0.47	0.02	0.17	0.42	0.52	0.62	0.41
P	0.09	0.08	0.17	0.03	0.10	0.10	0.15	0.20	0.17	0.14	0.13	0.06	0.23	0.18	0.09	0.26	0.01	0.03	0.51	0.61	0.76	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.10	0.13	0.22	0.10
C2	0.04	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.02	0.24	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.12	0.08	0.05	0.15	0.20	0.53	0.26
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04	0.06	0.09	0.04	0.09	0.09	0.09	0.02	0.01	0.04	0.01	0.22	0.17	0.18	0.17
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.12	0.07	0.07	0.13	0.13	0.05	0.01	0.01	0.02	0.35	0.23	0.31	0.27
C4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.08	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.03	0.18	0.21	0.55	0.29
C4'	0.01	0.03	0.03	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.13	0.19	0.08	0.02	0.18	0.20	0.10	0.10	0.03	0.00	0.02	0.12	0.14	0.09
C5	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.14	0.00	0.40	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.26	0.30	0.80	0.45
C5'	0.08	0.24	0.04	0.01	0.28	0.01	0.40	0.00	0.41	0.43	0.33	0.19	0.47	0.48	0.27	0.10	0.09	0.02	0.01	0.13	0.28	0.02
C6	0.03	0.02	0.06	0.09	0.01	0.13	0.01	0.41	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.26	0.31	0.84	0.47
C8	0.02	0.03	0.09	0.12	0.01	0.19	0.01	0.43	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.08	0.12	0.06	0.30	0.29	0.77	0.45
N1	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.33	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.11	0.06	0.03	0.20	0.26	0.69	0.37
N3	0.04	0.00	0.09	0.07	0.01	0.02	0.02	0.19	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.12	0.09	0.06	0.13	0.17	0.44	0.20
N6	0.03	0.03	0.09	0.13	0.01	0.18	0.01	0.47	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.03	0.02	0.12	0.13	0.04	0.32	0.38	1.01	0.58
N7	0.02	0.03	0.09	0.13	0.01	0.20	0.01	0.48	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.09	0.13	0.05	0.34	0.35	0.97	0.55
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.04	0.02	0.19	0.20	0.48	0.26
O2'	0.04	0.12	0.01	0.01	0.07	0.10	0.08	0.10	0.10	0.08	0.11	0.12	0.12	0.09	0.05	0.00	0.10	0.05	0.15	0.18	0.14	0.17
O3'	0.04	0.08	0.04	0.01	0.05	0.03	0.08	0.09	0.08	0.12	0.06	0.09	0.13	0.13	0.04	0.10	0.00	0.05	0.36	0.30	0.43	0.33
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02	0.05	0.05	0.00	0.13	0.15	0.24	0.10
O5'	0.10	0.15	0.22	0.35	0.18	0.02	0.26	0.01	0.26	0.30	0.20	0.13	0.32	0.34	0.19	0.15	0.36	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.20	0.17	0.23	0.21	0.12	0.30	0.13	0.31	0.29	0.26	0.17	0.38	0.35	0.20	0.18	0.30	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.53	0.18	0.31	0.55	0.14	0.80	0.28	0.84	0.77	0.69	0.44	1.01	0.97	0.48	0.14	0.43	0.24	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.26	0.17	0.27	0.29	0.09	0.45	0.02	0.47	0.45	0.37	0.20	0.58	0.55	0.26	0.17	0.33	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00