Doublet Group distance statistics: 50223

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 1, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.007 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.012
O6	A	0, 0.004, 0.016, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.009, 0.026, 0.044, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.021, 0.047, 0.074, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.047 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.051, 0.161, 0.270, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.161 std_dev=0.109
C2'	A	0, 0.074, 0.193, 0.311, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.193 std_dev=0.118
C4'	A	0, 0.131, 0.313, 0.496, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.313 std_dev=0.183
C3'	A	0, 0.150, 0.367, 0.585, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.367 std_dev=0.217
O2'	A	0, 0.060, 0.292, 0.523, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.292 std_dev=0.231
C5'	A	0, 0.160, 0.464, 0.767, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.464 std_dev=0.304
P	A	0, 0.204, 0.513, 0.821, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.513 std_dev=0.308
O3'	A	0, 0.243, 0.556, 0.868, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.556 std_dev=0.312
C2'	B	0, 0.122, 0.435, 0.748, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.435 std_dev=0.313
O5'	A	0, 0.176, 0.496, 0.816, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.496 std_dev=0.320
O2'	B	0, 0.074, 0.431, 0.787, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.431 std_dev=0.357
OP1	A	0, 0.259, 0.620, 0.982, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.620 std_dev=0.361
OP2	A	0, 0.210, 0.576, 0.941, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.576 std_dev=0.365
C1'	B	0, 0.182, 0.560, 0.937, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.560 std_dev=0.378
O3'	B	0, 0.222, 0.661, 1.099, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.661 std_dev=0.439
C3'	B	0, 0.186, 0.631, 1.076, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.631 std_dev=0.445
O4'	B	0, 0.230, 0.794, 1.358, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.794 std_dev=0.564
N9	B	0, 0.162, 0.780, 1.399, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.780 std_dev=0.619
C4'	B	0, 0.253, 0.892, 1.530, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.892 std_dev=0.638
N3	B	0, 0.103, 0.753, 1.403, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.753 std_dev=0.650
C4	B	0, 0.087, 0.796, 1.506, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.796 std_dev=0.710
C2	B	0, 0.151, 1.058, 1.964, 2.519 max_d=2.519 avg_d=1.058 std_dev=0.906
C8	B	0, 0.266, 1.179, 2.093, 2.624 max_d=2.624 avg_d=1.179 std_dev=0.914
O5'	B	0, 0.284, 1.240, 2.196, 2.459 max_d=2.459 avg_d=1.240 std_dev=0.956
C5	B	0, 0.162, 1.148, 2.135, 2.634 max_d=2.634 avg_d=1.148 std_dev=0.986
C5'	B	0, 0.313, 1.345, 2.376, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.345 std_dev=1.031
N7	B	0, 0.270, 1.367, 2.463, 3.086 max_d=3.086 avg_d=1.367 std_dev=1.096
N1	B	0, 0.176, 1.297, 2.418, 3.082 max_d=3.082 avg_d=1.297 std_dev=1.121
C6	B	0, 0.183, 1.345, 2.506, 3.137 max_d=3.137 avg_d=1.345 std_dev=1.161
P	B	0, 0.414, 1.813, 3.212, 3.840 max_d=3.840 avg_d=1.813 std_dev=1.399
N6	B	0, 0.289, 1.714, 3.139, 3.954 max_d=3.954 avg_d=1.714 std_dev=1.425
OP2	B	0, 0.545, 2.119, 3.693, 4.136 max_d=4.136 avg_d=2.119 std_dev=1.574
OP1	B	0, 0.572, 2.302, 4.033, 5.076 max_d=5.076 avg_d=2.302 std_dev=1.731

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.02	0.07	0.23	0.18
C2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.23	0.13	0.03	0.09	0.01	0.14	0.29	0.21
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.03	0.07	0.02	0.08	0.09	0.10	0.13	0.10	0.08	0.05	0.00	0.03	0.02	0.04	0.08	0.16	0.21	0.11
C3'	0.03	0.11	0.00	0.00	0.11	0.01	0.16	0.02	0.15	0.20	0.13	0.13	0.10	0.20	0.12	0.04	0.01	0.01	0.06	0.18	0.24	0.21	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.12	0.02	0.10	0.01	0.14	0.27	0.20
C4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.13	0.07	0.08	0.06	0.13	0.07	0.13	0.04	0.00	0.01	0.11	0.13	0.10	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.18	0.03	0.17	0.01	0.19	0.29	0.22
C5'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.09	0.01	0.15	0.00	0.15	0.19	0.10	0.06	0.05	0.21	0.10	0.12	0.06	0.02	0.01	0.19	0.12	0.04	0.03
C6	0.02	0.00	0.08	0.15	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.18	0.03	0.18	0.00	0.22	0.31	0.24
C8	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.13	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.22	0.05	0.21	0.02	0.15	0.23	0.19
N1	0.03	0.00	0.10	0.13	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.14	0.03	0.13	0.01	0.19	0.30	0.23
N2	0.04	0.01	0.13	0.13	0.01	0.08	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.17	0.04	0.07	0.01	0.13	0.29	0.21
N3	0.03	0.01	0.10	0.10	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.12	0.03	0.06	0.01	0.12	0.27	0.20
N7	0.01	0.01	0.08	0.20	0.00	0.13	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.24	0.05	0.24	0.02	0.21	0.28	0.22
N9	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.12	0.02	0.10	0.01	0.11	0.24	0.19
O2'	0.03	0.23	0.00	0.04	0.14	0.13	0.12	0.12	0.15	0.07	0.20	0.27	0.21	0.08	0.06	0.00	0.11	0.11	0.07	0.14	0.23	0.16	0.06
O3'	0.03	0.13	0.03	0.01	0.12	0.04	0.18	0.06	0.18	0.22	0.14	0.17	0.12	0.24	0.12	0.11	0.00	0.04	0.12	0.22	0.41	0.37	0.23
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.11	0.04	0.00	0.07	0.04	0.09	0.24	0.22
O5'	0.04	0.09	0.04	0.06	0.10	0.01	0.17	0.01	0.18	0.21	0.13	0.07	0.06	0.24	0.10	0.07	0.12	0.07	0.00	0.21	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.11	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.22	0.04	0.21	0.00	0.26	0.33	0.26
OP1	0.07	0.14	0.16	0.24	0.14	0.13	0.19	0.12	0.22	0.15	0.19	0.13	0.12	0.21	0.11	0.23	0.41	0.09	0.02	0.26	0.00	0.05	0.01
OP2	0.23	0.29	0.21	0.21	0.27	0.10	0.29	0.04	0.31	0.23	0.30	0.29	0.27	0.28	0.24	0.16	0.37	0.24	0.02	0.33	0.05	0.00	0.01
P	0.18	0.21	0.11	0.10	0.20	0.05	0.22	0.03	0.24	0.19	0.23	0.21	0.20	0.22	0.19	0.06	0.23	0.22	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.51	0.14	0.34	0.36	0.26	0.41	0.48	0.48	0.35	0.53	0.41	0.50	0.40	0.31	0.29	0.43	0.19	0.32	0.93	0.90	0.61
C2	0.32	0.30	0.17	0.40	0.40	0.43	0.56	0.75	0.57	0.58	0.40	0.29	0.72	0.67	0.43	0.24	0.40	0.39	0.74	1.42	1.68	1.18
C2'	0.28	0.50	0.22	0.23	0.33	0.20	0.37	0.45	0.44	0.33	0.51	0.39	0.47	0.36	0.30	0.39	0.31	0.18	0.28	0.91	0.80	0.54
C3'	0.37	0.43	0.36	0.14	0.32	0.12	0.34	0.32	0.35	0.41	0.40	0.37	0.37	0.39	0.35	0.51	0.16	0.21	0.30	0.78	0.58	0.39
C4	0.29	0.33	0.17	0.39	0.34	0.39	0.44	0.68	0.44	0.47	0.37	0.29	0.49	0.51	0.37	0.26	0.41	0.33	0.60	1.22	1.39	0.96
C4'	0.30	0.46	0.27	0.16	0.31	0.07	0.32	0.28	0.37	0.33	0.44	0.39	0.38	0.33	0.29	0.45	0.25	0.14	0.21	0.80	0.44	0.40
C5	0.27	0.33	0.17	0.41	0.21	0.45	0.29	0.77	0.19	0.45	0.24	0.25	0.26	0.46	0.32	0.24	0.38	0.37	0.72	1.36	1.56	1.12
C5'	0.38	0.40	0.40	0.14	0.31	0.07	0.32	0.18	0.32	0.40	0.36	0.37	0.33	0.37	0.35	0.58	0.13	0.21	0.23	0.78	0.21	0.38
C6	0.28	0.38	0.17	0.41	0.20	0.50	0.29	0.85	0.11	0.51	0.29	0.25	0.23	0.53	0.33	0.21	0.38	0.42	0.85	1.57	1.84	1.34
C8	0.22	0.30	0.16	0.38	0.15	0.36	0.17	0.62	0.19	0.28	0.26	0.24	0.22	0.26	0.21	0.28	0.40	0.25	0.46	1.01	1.05	0.73
N1	0.31	0.27	0.17	0.41	0.30	0.48	0.45	0.82	0.37	0.57	0.19	0.23	0.53	0.63	0.39	0.22	0.39	0.42	0.83	1.55	1.84	1.32
N2	0.33	0.33	0.17	0.41	0.43	0.42	0.61	0.76	0.65	0.61	0.48	0.31	0.84	0.71	0.45	0.23	0.41	0.40	0.75	1.45	1.73	1.21
N3	0.31	0.39	0.17	0.39	0.42	0.38	0.56	0.68	0.60	0.53	0.52	0.34	0.70	0.61	0.42	0.26	0.41	0.34	0.62	1.26	1.46	1.00
N7	0.23	0.40	0.17	0.40	0.10	0.45	0.10	0.75	0.19	0.33	0.35	0.29	0.21	0.27	0.21	0.24	0.37	0.33	0.66	1.24	1.37	0.99
N9	0.26	0.38	0.16	0.37	0.31	0.33	0.36	0.59	0.38	0.37	0.39	0.32	0.41	0.40	0.31	0.29	0.42	0.25	0.45	1.04	1.10	0.75
O2'	0.29	0.60	0.22	0.24	0.39	0.16	0.43	0.38	0.54	0.36	0.63	0.45	0.58	0.40	0.33	0.38	0.29	0.19	0.30	0.88	0.79	0.52
O3'	0.39	0.45	0.40	0.16	0.32	0.11	0.34	0.25	0.36	0.43	0.42	0.37	0.38	0.41	0.37	0.54	0.09	0.23	0.33	0.73	0.51	0.33
O4'	0.22	0.49	0.14	0.32	0.32	0.20	0.34	0.40	0.41	0.28	0.47	0.41	0.41	0.32	0.26	0.32	0.46	0.12	0.20	0.86	0.67	0.52
O5'	0.44	0.37	0.53	0.18	0.33	0.09	0.32	0.25	0.30	0.43	0.32	0.37	0.32	0.40	0.38	0.66	0.02	0.24	0.23	0.70	0.27	0.28
O6	0.26	0.52	0.16	0.40	0.13	0.54	0.12	0.91	0.22	0.47	0.55	0.31	0.23	0.45	0.27	0.18	0.36	0.44	0.96	1.73	2.02	1.51
OP1	0.12	0.31	0.15	0.09	0.17	0.36	0.25	0.54	0.28	0.31	0.29	0.26	0.34	0.35	0.16	0.25	0.03	0.28	0.50	1.18	0.61	0.84
OP2	0.12	0.42	0.21	0.12	0.31	0.38	0.41	0.67	0.45	0.41	0.45	0.36	0.52	0.48	0.24	0.25	0.06	0.25	0.38	0.86	0.30	0.45
P	0.11	0.33	0.23	0.01	0.15	0.21	0.23	0.39	0.27	0.29	0.30	0.27	0.33	0.32	0.12	0.31	0.01	0.10	0.22	0.74	0.10	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.31	0.62	0.26
C2	0.03	0.00	0.23	0.39	0.00	0.21	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.45	0.03	0.27	0.66	1.10	0.52
C2'	0.00	0.23	0.00	0.01	0.14	0.02	0.12	0.02	0.15	0.13	0.19	0.24	0.14	0.13	0.07	0.01	0.03	0.01	0.23	0.32	0.44	0.17
C3'	0.02	0.39	0.01	0.00	0.25	0.00	0.25	0.01	0.29	0.25	0.36	0.36	0.29	0.25	0.14	0.05	0.00	0.02	0.31	0.22	0.36	0.05
C4	0.02	0.00	0.14	0.25	0.00	0.15	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.25	0.03	0.31	0.53	1.08	0.49
C4'	0.01	0.21	0.02	0.00	0.15	0.00	0.17	0.01	0.19	0.20	0.20	0.18	0.20	0.20	0.11	0.10	0.01	0.01	0.03	0.36	0.32	0.29
C5	0.02	0.00	0.12	0.25	0.00	0.17	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.25	0.05	0.42	0.65	1.33	0.66
C5'	0.03	0.34	0.02	0.01	0.26	0.01	0.32	0.00	0.36	0.30	0.36	0.28	0.39	0.34	0.19	0.11	0.04	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01
C6	0.02	0.00	0.15	0.29	0.01	0.19	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.32	0.04	0.42	0.74	1.39	0.71
C8	0.01	0.00	0.13	0.25	0.00	0.20	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.25	0.06	0.49	0.52	1.19	0.61
N1	0.02	0.00	0.19	0.36	0.01	0.20	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.40	0.04	0.35	0.72	1.28	0.62
N3	0.03	0.00	0.24	0.36	0.00	0.18	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.39	0.03	0.22	0.57	0.98	0.44
N6	0.02	0.01	0.14	0.29	0.01	0.20	0.01	0.39	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.33	0.05	0.48	0.83	1.54	0.82
N7	0.01	0.01	0.13	0.25	0.00	0.20	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.26	0.06	0.52	0.69	1.43	0.77
N9	0.01	0.00	0.07	0.14	0.00	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.13	0.04	0.31	0.38	0.95	0.40
O2'	0.02	0.16	0.01	0.05	0.09	0.10	0.09	0.11	0.11	0.08	0.14	0.15	0.11	0.08	0.04	0.00	0.08	0.05	0.12	0.56	0.40	0.42
O3'	0.02	0.45	0.03	0.00	0.25	0.01	0.25	0.04	0.32	0.25	0.40	0.39	0.33	0.26	0.13	0.08	0.00	0.01	0.26	0.44	0.26	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.05	0.01	0.00	0.11	0.33	0.57	0.32
O5'	0.14	0.27	0.23	0.31	0.31	0.03	0.42	0.01	0.42	0.49	0.35	0.22	0.48	0.52	0.31	0.12	0.26	0.11	0.00	0.02	0.05	0.01
OP1	0.31	0.66	0.32	0.22	0.53	0.36	0.65	0.09	0.74	0.52	0.72	0.57	0.83	0.69	0.38	0.56	0.44	0.33	0.02	0.00	0.05	0.01
OP2	0.62	1.10	0.44	0.36	1.08	0.32	1.33	0.19	1.39	1.19	1.28	0.98	1.54	1.43	0.95	0.40	0.26	0.57	0.05	0.05	0.00	0.01
P	0.26	0.52	0.17	0.05	0.49	0.29	0.66	0.01	0.71	0.61	0.62	0.44	0.82	0.77	0.40	0.42	0.22	0.32	0.01	0.01	0.01	0.00