Doublet Group distance statistics: 50224

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.011, 0.031, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.031 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.013, 0.035, 0.057, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.035 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.002, 0.028, 0.054, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.028 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.008, 0.035, 0.062, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.013, 0.043, 0.073, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.043 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.016, 0.047, 0.078, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.047 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.156, 0.426, 0.696, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.426 std_dev=0.270
C2'	A	0, 0.173, 0.470, 0.766, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.470 std_dev=0.297
C4'	B	0, 0.052, 0.392, 0.732, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.392 std_dev=0.340
C3'	B	0, 0.105, 0.464, 0.823, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.464 std_dev=0.359
C1'	B	0, 0.218, 0.578, 0.938, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.578 std_dev=0.360
O3'	B	0, 0.175, 0.546, 0.916, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.546 std_dev=0.370
O2'	A	0, 0.222, 0.599, 0.975, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.599 std_dev=0.377
C2'	B	0, 0.214, 0.612, 1.011, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.612 std_dev=0.398
O4'	B	0, 0.199, 0.606, 1.012, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.606 std_dev=0.407
N9	B	0, 0.222, 0.634, 1.047, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.634 std_dev=0.412
OP2	A	0, 0.159, 0.571, 0.984, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.571 std_dev=0.413
P	A	0, 0.197, 0.630, 1.064, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.630 std_dev=0.433
C4'	A	0, 0.250, 0.693, 1.136, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.693 std_dev=0.443
C3'	A	0, 0.252, 0.696, 1.139, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.696 std_dev=0.444
C5'	B	0, -0.151, 0.346, 0.843, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.346 std_dev=0.497
O2'	B	0, 0.288, 0.796, 1.304, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.796 std_dev=0.508
C5	B	0, 0.314, 0.897, 1.480, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.897 std_dev=0.583
O3'	A	0, 0.383, 1.055, 1.727, 1.611 max_d=1.611 avg_d=1.055 std_dev=0.672
O5'	A	0, 0.379, 1.096, 1.813, 1.825 max_d=1.825 avg_d=1.096 std_dev=0.717
C5'	A	0, 0.486, 1.343, 2.201, 2.099 max_d=2.099 avg_d=1.343 std_dev=0.857
N6	B	0, 0.400, 1.300, 2.199, 2.255 max_d=2.255 avg_d=1.300 std_dev=0.900
OP1	A	0, 0.514, 1.450, 2.387, 2.360 max_d=2.360 avg_d=1.450 std_dev=0.937
C4	B	0, 0.466, 1.427, 2.389, 2.251 max_d=2.251 avg_d=1.427 std_dev=0.962
O5'	B	0, 0.314, 1.328, 2.343, 2.577 max_d=2.577 avg_d=1.328 std_dev=1.015
N7	B	0, 0.491, 1.561, 2.632, 3.172 max_d=3.172 avg_d=1.561 std_dev=1.071
C8	B	0, 0.603, 1.751, 2.899, 3.196 max_d=3.196 avg_d=1.751 std_dev=1.148
C6	B	0, 0.504, 1.706, 2.909, 2.810 max_d=2.810 avg_d=1.706 std_dev=1.202
P	B	0, 0.486, 1.744, 3.001, 3.014 max_d=3.014 avg_d=1.744 std_dev=1.258
OP1	B	0, 0.587, 1.883, 3.179, 3.101 max_d=3.101 avg_d=1.883 std_dev=1.296
OP2	B	0, 0.650, 2.085, 3.520, 3.386 max_d=3.386 avg_d=2.085 std_dev=1.435
N3	B	0, 1.110, 3.090, 5.070, 4.623 max_d=4.623 avg_d=3.090 std_dev=1.980
N1	B	0, 1.174, 3.378, 5.583, 5.106 max_d=5.106 avg_d=3.378 std_dev=2.204
C2	B	0, 1.429, 3.976, 6.522, 5.884 max_d=5.884 avg_d=3.976 std_dev=2.547

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.02	0.17	0.12	0.13
C2	0.03	0.00	0.10	0.12	0.01	0.03	0.02	0.17	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.10	0.19	0.06	0.19	0.02	0.08	0.18	0.07
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.04	0.04	0.03	0.01	0.02	0.10	0.07	0.14	0.11	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.20	0.10
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.00	0.05	0.17	0.08	0.16	0.11	0.14	0.06	0.01	0.01	0.02	0.08	0.05	0.04	0.23	0.15
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.04	0.15	0.01	0.08	0.15	0.06
C4'	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.17	0.04	0.06	0.03	0.15	0.08	0.10	0.03	0.00	0.01	0.09	0.13	0.09	0.02
C5	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.09	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.13	0.01	0.18	0.15	0.04
C5'	0.07	0.17	0.01	0.00	0.22	0.00	0.31	0.00	0.30	0.38	0.23	0.13	0.15	0.39	0.23	0.11	0.09	0.03	0.01	0.33	0.10	0.01	0.02
C6	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.08	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.15	0.00	0.21	0.18	0.05
C8	0.02	0.02	0.10	0.17	0.02	0.17	0.01	0.38	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.18	0.04	0.07	0.03	0.15	0.10	0.01
N1	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.05	0.18	0.01	0.15	0.19	0.06
N2	0.04	0.01	0.14	0.16	0.02	0.06	0.03	0.13	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.13	0.26	0.08	0.21	0.03	0.07	0.19	0.09
N3	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.02	0.15	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.10	0.17	0.07	0.18	0.02	0.06	0.16	0.07
N7	0.02	0.03	0.08	0.14	0.02	0.15	0.01	0.39	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.06	0.15	0.04	0.09	0.02	0.25	0.12	0.05
N9	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01	0.08	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.12	0.02	0.05	0.12	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.11	0.04	0.06	0.07	0.13	0.10	0.06	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.19	0.20	0.06
O3'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.08	0.03	0.07	0.09	0.08	0.18	0.14	0.26	0.17	0.15	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.07	0.07	0.40	0.26
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.08	0.07	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.17	0.03	0.31	0.20	0.25
O5'	0.14	0.19	0.09	0.08	0.15	0.01	0.13	0.01	0.15	0.07	0.18	0.21	0.18	0.09	0.12	0.06	0.11	0.17	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.33	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.07	0.03	0.14	0.00	0.28	0.19	0.07
OP1	0.17	0.08	0.08	0.04	0.08	0.13	0.18	0.10	0.21	0.15	0.15	0.07	0.06	0.25	0.05	0.19	0.07	0.31	0.01	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.18	0.20	0.23	0.15	0.09	0.15	0.01	0.18	0.10	0.19	0.19	0.16	0.12	0.12	0.20	0.40	0.20	0.01	0.19	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.07	0.10	0.15	0.06	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.06	0.09	0.07	0.05	0.06	0.06	0.26	0.25	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.73	0.23	0.11	0.41	0.17	0.29	0.15	0.41	0.19	0.60	0.67	0.33	0.20	0.22	0.29	0.13	0.29	0.39	0.36	0.27	0.27
C2	0.15	1.38	0.22	0.09	0.58	0.12	0.34	0.17	0.61	0.51	1.10	1.19	0.46	0.41	0.18	0.31	0.11	0.27	0.40	0.38	0.34	0.33
C2'	0.09	0.70	0.18	0.16	0.32	0.09	0.21	0.17	0.33	0.33	0.56	0.62	0.26	0.28	0.12	0.18	0.22	0.12	0.36	0.44	0.30	0.33
C3'	0.06	0.49	0.11	0.21	0.24	0.20	0.16	0.31	0.25	0.20	0.40	0.44	0.21	0.18	0.08	0.12	0.32	0.09	0.38	0.51	0.34	0.39
C4	0.16	1.05	0.19	0.06	0.50	0.14	0.29	0.17	0.49	0.32	0.83	0.95	0.37	0.24	0.16	0.30	0.10	0.28	0.40	0.36	0.32	0.30
C4'	0.11	0.31	0.14	0.07	0.19	0.17	0.15	0.30	0.19	0.13	0.26	0.28	0.17	0.14	0.11	0.25	0.11	0.12	0.48	0.57	0.42	0.47
C5	0.13	1.05	0.17	0.06	0.49	0.13	0.27	0.16	0.48	0.34	0.83	0.97	0.34	0.22	0.13	0.32	0.11	0.28	0.36	0.33	0.30	0.27
C5'	0.14	0.30	0.08	0.19	0.17	0.39	0.12	0.56	0.16	0.11	0.25	0.29	0.13	0.11	0.11	0.22	0.17	0.29	0.65	0.75	0.62	0.67
C6	0.12	1.30	0.20	0.09	0.54	0.11	0.28	0.15	0.55	0.48	1.01	1.15	0.39	0.34	0.13	0.35	0.12	0.25	0.33	0.31	0.30	0.26
C8	0.18	0.62	0.12	0.04	0.37	0.17	0.25	0.17	0.35	0.08	0.51	0.59	0.27	0.08	0.17	0.23	0.07	0.30	0.37	0.32	0.27	0.24
N1	0.14	1.43	0.22	0.10	0.58	0.11	0.32	0.16	0.62	0.55	1.13	1.23	0.45	0.42	0.16	0.34	0.13	0.25	0.36	0.34	0.32	0.29
N2	0.16	1.49	0.23	0.10	0.61	0.12	0.37	0.17	0.67	0.56	1.20	1.26	0.51	0.47	0.20	0.30	0.11	0.26	0.41	0.39	0.34	0.34
N3	0.16	1.20	0.21	0.07	0.54	0.13	0.32	0.17	0.55	0.41	0.96	1.06	0.42	0.33	0.17	0.29	0.10	0.27	0.42	0.39	0.34	0.34
N7	0.12	0.75	0.10	0.03	0.40	0.14	0.23	0.17	0.37	0.16	0.60	0.72	0.28	0.07	0.12	0.28	0.09	0.30	0.34	0.30	0.28	0.24
N9	0.19	0.80	0.19	0.06	0.43	0.16	0.28	0.17	0.42	0.19	0.65	0.74	0.32	0.16	0.18	0.28	0.09	0.29	0.40	0.36	0.29	0.29
O2'	0.10	0.71	0.16	0.11	0.32	0.08	0.21	0.15	0.33	0.33	0.56	0.62	0.27	0.30	0.13	0.16	0.16	0.15	0.38	0.42	0.30	0.32
O3'	0.06	0.46	0.12	0.33	0.19	0.30	0.10	0.42	0.21	0.22	0.37	0.40	0.16	0.17	0.01	0.07	0.45	0.14	0.39	0.55	0.36	0.42
O4'	0.32	0.54	0.36	0.25	0.41	0.23	0.35	0.17	0.40	0.26	0.48	0.51	0.37	0.29	0.32	0.43	0.28	0.33	0.39	0.36	0.25	0.27
O5'	0.32	0.21	0.40	0.09	0.28	0.12	0.35	0.32	0.30	0.49	0.23	0.20	0.34	0.47	0.36	0.61	0.01	0.15	0.32	0.44	0.30	0.31
O6	0.12	1.35	0.21	0.11	0.53	0.09	0.26	0.15	0.55	0.52	1.05	1.17	0.37	0.37	0.13	0.36	0.13	0.23	0.28	0.27	0.28	0.23
OP1	0.22	0.99	0.05	0.21	0.50	0.46	0.33	0.72	0.51	0.19	0.82	0.89	0.40	0.12	0.20	0.18	0.01	0.42	0.56	0.68	0.67	0.63
OP2	0.36	0.20	0.43	0.19	0.20	0.08	0.37	0.12	0.22	0.74	0.05	0.14	0.33	0.68	0.43	0.50	0.02	0.19	0.36	0.16	0.38	0.27
P	0.12	0.41	0.22	0.02	0.06	0.13	0.10	0.31	0.06	0.42	0.28	0.35	0.07	0.36	0.16	0.37	0.01	0.04	0.16	0.22	0.22	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.16	0.16	0.26	0.14
C2	0.05	0.00	0.17	0.48	0.04	0.54	0.02	0.87	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.22	0.35	0.43	0.89	1.07	1.13	0.98
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.07	0.09	0.14	0.16	0.05	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.30	0.26	0.38	0.27
C3'	0.01	0.48	0.01	0.00	0.18	0.01	0.05	0.02	0.15	0.33	0.35	0.46	0.07	0.24	0.05	0.02	0.01	0.02	0.30	0.24	0.32	0.26
C4	0.01	0.04	0.07	0.18	0.00	0.20	0.01	0.27	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.18	0.22	0.16	0.31	0.10
C4'	0.02	0.54	0.01	0.01	0.20	0.00	0.03	0.01	0.15	0.34	0.39	0.53	0.06	0.26	0.05	0.03	0.05	0.01	0.01	0.17	0.16	0.08
C5	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.32	0.30	0.57	0.35
C5'	0.01	0.87	0.03	0.02	0.27	0.01	0.06	0.00	0.22	0.58	0.60	0.81	0.08	0.47	0.11	0.03	0.04	0.02	0.00	0.13	0.17	0.03
C6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.15	0.01	0.22	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.11	0.14	0.19	0.10	0.38	0.09
C8	0.03	0.04	0.09	0.33	0.01	0.34	0.02	0.58	0.03	0.00	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.20	0.23	0.24	0.98	1.05	1.27	1.08
N1	0.04	0.00	0.14	0.35	0.04	0.39	0.04	0.60	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.15	0.26	0.31	0.55	0.66	0.71	0.57
N3	0.04	0.01	0.16	0.46	0.01	0.53	0.02	0.81	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.22	0.31	0.44	0.82	0.92	0.95	0.85
N6	0.00	0.02	0.05	0.07	0.00	0.06	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.06	0.07	0.30	0.31	0.59	0.35
N7	0.03	0.03	0.06	0.24	0.01	0.26	0.01	0.47	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.14	0.18	0.17	0.87	0.99	1.27	1.03
N9	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.11	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.03	0.37	0.33	0.53	0.38
O2'	0.01	0.22	0.01	0.02	0.08	0.03	0.02	0.03	0.06	0.20	0.15	0.22	0.03	0.14	0.04	0.00	0.04	0.03	0.17	0.24	0.25	0.19
O3'	0.03	0.35	0.03	0.01	0.11	0.05	0.04	0.04	0.11	0.23	0.26	0.31	0.06	0.18	0.05	0.04	0.00	0.05	0.21	0.20	0.20	0.17
O4'	0.00	0.43	0.01	0.02	0.18	0.01	0.04	0.02	0.14	0.24	0.31	0.44	0.07	0.17	0.03	0.03	0.05	0.00	0.13	0.16	0.18	0.09
O5'	0.16	0.89	0.30	0.30	0.22	0.01	0.32	0.00	0.19	0.98	0.55	0.82	0.30	0.87	0.37	0.17	0.21	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.16	1.07	0.26	0.24	0.16	0.17	0.30	0.13	0.10	1.05	0.66	0.92	0.31	0.99	0.33	0.24	0.20	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	1.13	0.38	0.32	0.31	0.16	0.57	0.17	0.38	1.27	0.71	0.95	0.59	1.27	0.53	0.25	0.20	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.98	0.27	0.26	0.10	0.08	0.35	0.03	0.09	1.08	0.57	0.85	0.35	1.03	0.38	0.19	0.17	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00