Doublet Group distance statistics: 50225

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.005, 0.027, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.027 std_dev=0.022
C5	A	0, -0.004, 0.021, 0.045, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.021 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.001, 0.027, 0.053, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.027 std_dev=0.026
N1	A	0, -0.002, 0.025, 0.051, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.025 std_dev=0.027
N3	A	0, 0.002, 0.029, 0.056, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.029 std_dev=0.027
C4	A	0, -0.002, 0.028, 0.058, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.028 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.011, 0.044, 0.077, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.044 std_dev=0.033
N7	A	0, -0.009, 0.034, 0.076, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.034 std_dev=0.043
N2	A	0, -0.002, 0.043, 0.087, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.043 std_dev=0.045
C8	A	0, -0.009, 0.040, 0.089, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.040 std_dev=0.049
O2'	A	0, 0.047, 0.148, 0.250, 0.299 max_d=0.299 avg_d=0.148 std_dev=0.102
C2'	A	0, 0.029, 0.145, 0.261, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.145 std_dev=0.116
O4'	A	0, 0.002, 0.172, 0.342, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.172 std_dev=0.170
C3'	A	0, 0.002, 0.247, 0.492, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.247 std_dev=0.245
C4'	A	0, 0.012, 0.258, 0.504, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.258 std_dev=0.246
O5'	A	0, 0.024, 0.317, 0.611, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.317 std_dev=0.293
OP1	A	0, 0.085, 0.444, 0.803, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.444 std_dev=0.359
P	A	0, 0.033, 0.396, 0.759, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.396 std_dev=0.363
C5'	A	0, 0.018, 0.389, 0.759, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.389 std_dev=0.370
C2'	B	0, 0.077, 0.459, 0.842, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.459 std_dev=0.382
O3'	B	0, 0.016, 0.410, 0.805, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.410 std_dev=0.394
C3'	B	0, 0.051, 0.448, 0.844, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.448 std_dev=0.397
O3'	A	0, 0.009, 0.406, 0.804, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.406 std_dev=0.398
O2'	B	0, 0.144, 0.541, 0.939, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.541 std_dev=0.398
OP2	A	0, 0.041, 0.450, 0.858, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.450 std_dev=0.408
C1'	B	0, -0.017, 0.469, 0.956, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.469 std_dev=0.487
N3	B	0, 0.004, 0.519, 1.034, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.519 std_dev=0.515
C4	B	0, -0.069, 0.544, 1.157, 1.874 max_d=1.874 avg_d=0.544 std_dev=0.613
C2	B	0, -0.088, 0.640, 1.367, 2.286 max_d=2.286 avg_d=0.640 std_dev=0.727
C4'	B	0, -0.111, 0.627, 1.366, 2.274 max_d=2.274 avg_d=0.627 std_dev=0.738
N9	B	0, -0.167, 0.614, 1.395, 2.395 max_d=2.395 avg_d=0.614 std_dev=0.781
O4'	B	0, -0.132, 0.652, 1.437, 2.439 max_d=2.439 avg_d=0.652 std_dev=0.785
O5'	B	0, -0.014, 0.806, 1.625, 2.603 max_d=2.603 avg_d=0.806 std_dev=0.819
N1	B	0, -0.152, 0.707, 1.567, 2.683 max_d=2.683 avg_d=0.707 std_dev=0.859
C5'	B	0, -0.115, 0.785, 1.685, 2.808 max_d=2.808 avg_d=0.785 std_dev=0.900
OP2	B	0, 0.024, 1.019, 2.013, 3.171 max_d=3.171 avg_d=1.019 std_dev=0.995
P	B	0, -0.065, 0.997, 2.058, 3.364 max_d=3.364 avg_d=0.997 std_dev=1.061
C5	B	0, -0.312, 0.781, 1.875, 3.336 max_d=3.336 avg_d=0.781 std_dev=1.094
C6	B	0, -0.302, 0.811, 1.924, 3.421 max_d=3.421 avg_d=0.811 std_dev=1.113
OP1	B	0, -0.116, 1.018, 2.152, 3.583 max_d=3.583 avg_d=1.018 std_dev=1.134
C8	B	0, -0.469, 0.942, 2.353, 4.294 max_d=4.294 avg_d=0.942 std_dev=1.411
N6	B	0, -0.521, 1.054, 2.629, 4.799 max_d=4.799 avg_d=1.054 std_dev=1.575
N7	B	0, -0.569, 1.030, 2.629, 4.842 max_d=4.842 avg_d=1.030 std_dev=1.599

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.10	0.14	0.06
C2	0.04	0.00	0.14	0.16	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.21	0.04	0.07	0.01	0.07	0.17	0.06
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.09	0.03	0.13	0.19	0.13	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.05	0.16	0.08
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.12	0.09	0.15	0.20	0.14	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.11	0.06
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.05	0.02	0.05	0.20	0.07
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.11	0.07	0.03	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.02	0.06	0.24	0.09
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.06	0.04	0.10	0.05	0.06	0.02	0.05	0.04	0.01	0.01	0.05	0.06	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.12	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.01	0.07	0.00	0.07	0.23	0.09
C8	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.02	0.09	0.03	0.05	0.26	0.11
N1	0.03	0.01	0.13	0.15	0.01	0.06	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.20	0.02	0.06	0.01	0.06	0.20	0.08
N2	0.06	0.01	0.19	0.20	0.02	0.11	0.02	0.10	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.19	0.27	0.06	0.09	0.03	0.10	0.14	0.06
N3	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.17	0.04	0.06	0.01	0.08	0.17	0.06
N7	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.08	0.03	0.08	0.28	0.12
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.20	0.08
O2'	0.01	0.13	0.01	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.01	0.12	0.19	0.11	0.02	0.02	0.00	0.05	0.03	0.03	0.08	0.09	0.11	0.04
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.11	0.02	0.12	0.04	0.16	0.11	0.20	0.27	0.17	0.10	0.06	0.05	0.00	0.02	0.06	0.17	0.07	0.08	0.06
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.02	0.14	0.06	0.06
O5'	0.03	0.07	0.04	0.05	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.09	0.06	0.09	0.06	0.08	0.05	0.03	0.06	0.07	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.02	0.05	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.08	0.17	0.02	0.08	0.00	0.09	0.23	0.10
OP1	0.10	0.07	0.05	0.02	0.05	0.08	0.06	0.06	0.07	0.05	0.06	0.10	0.08	0.08	0.06	0.09	0.07	0.14	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.17	0.16	0.11	0.20	0.03	0.24	0.04	0.23	0.26	0.20	0.14	0.17	0.28	0.20	0.11	0.08	0.06	0.02	0.23	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.06	0.08	0.06	0.07	0.02	0.09	0.02	0.09	0.11	0.08	0.06	0.06	0.12	0.08	0.04	0.06	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.38	0.17	0.23	0.20	0.50	0.29	0.57	0.21	0.55	0.28	0.26	0.26	0.48	0.38	0.15	0.12	0.67	0.50	0.61	0.46	0.55
C2	0.12	0.63	0.14	0.14	0.19	0.22	0.20	0.29	0.38	0.17	0.59	0.42	0.37	0.13	0.08	0.34	0.15	0.34	0.26	0.35	0.20	0.26
C2'	0.29	0.37	0.10	0.20	0.18	0.49	0.24	0.55	0.21	0.45	0.31	0.25	0.24	0.39	0.31	0.21	0.13	0.63	0.44	0.61	0.38	0.51
C3'	0.22	0.36	0.03	0.15	0.18	0.45	0.20	0.49	0.23	0.32	0.32	0.27	0.23	0.27	0.22	0.25	0.09	0.55	0.33	0.57	0.27	0.43
C4	0.18	0.48	0.12	0.15	0.14	0.28	0.16	0.34	0.26	0.26	0.42	0.32	0.26	0.20	0.16	0.29	0.16	0.43	0.29	0.40	0.25	0.31
C4'	0.28	0.29	0.12	0.21	0.16	0.51	0.23	0.56	0.16	0.46	0.21	0.22	0.20	0.40	0.30	0.13	0.07	0.60	0.43	0.64	0.40	0.53
C5	0.08	0.48	0.16	0.15	0.20	0.16	0.24	0.19	0.36	0.10	0.47	0.32	0.37	0.16	0.06	0.35	0.17	0.27	0.16	0.29	0.13	0.17
C5'	0.20	0.23	0.06	0.16	0.11	0.44	0.15	0.47	0.11	0.31	0.17	0.18	0.13	0.26	0.20	0.15	0.07	0.47	0.32	0.60	0.30	0.45
C6	0.07	0.60	0.21	0.15	0.31	0.08	0.39	0.10	0.54	0.17	0.64	0.41	0.57	0.29	0.14	0.40	0.16	0.14	0.08	0.21	0.09	0.08
C8	0.23	0.28	0.11	0.17	0.17	0.31	0.19	0.33	0.21	0.26	0.26	0.20	0.22	0.23	0.22	0.24	0.17	0.47	0.28	0.41	0.24	0.31
N1	0.06	0.67	0.19	0.14	0.29	0.12	0.33	0.16	0.51	0.08	0.68	0.45	0.53	0.20	0.08	0.38	0.16	0.20	0.14	0.24	0.10	0.13
N2	0.14	0.67	0.14	0.15	0.19	0.25	0.18	0.33	0.39	0.21	0.63	0.44	0.37	0.13	0.09	0.33	0.15	0.36	0.30	0.39	0.24	0.30
N3	0.20	0.55	0.12	0.16	0.13	0.31	0.15	0.38	0.27	0.31	0.47	0.36	0.25	0.24	0.18	0.29	0.15	0.45	0.34	0.44	0.29	0.36
N7	0.08	0.31	0.16	0.16	0.17	0.16	0.22	0.18	0.30	0.12	0.34	0.21	0.31	0.18	0.09	0.34	0.18	0.27	0.14	0.29	0.13	0.16
N9	0.26	0.38	0.12	0.18	0.16	0.37	0.20	0.42	0.21	0.38	0.31	0.26	0.22	0.31	0.26	0.23	0.15	0.54	0.36	0.48	0.32	0.39
O2'	0.35	0.38	0.15	0.22	0.21	0.54	0.31	0.65	0.23	0.61	0.28	0.26	0.29	0.54	0.39	0.16	0.09	0.70	0.55	0.69	0.50	0.62
O3'	0.19	0.37	0.06	0.11	0.18	0.43	0.19	0.47	0.23	0.28	0.33	0.28	0.23	0.24	0.20	0.31	0.06	0.52	0.29	0.57	0.22	0.41
O4'	0.36	0.31	0.21	0.26	0.21	0.54	0.30	0.60	0.20	0.59	0.21	0.23	0.26	0.51	0.39	0.08	0.09	0.68	0.52	0.64	0.49	0.58
O5'	0.18	0.27	0.10	0.11	0.20	0.33	0.21	0.31	0.23	0.19	0.26	0.24	0.23	0.19	0.18	0.25	0.02	0.37	0.15	0.47	0.14	0.28
O6	0.14	0.62	0.26	0.17	0.42	0.07	0.56	0.05	0.70	0.37	0.74	0.41	0.77	0.51	0.29	0.42	0.16	0.05	0.08	0.13	0.15	0.10
OP1	0.13	0.09	0.05	0.14	0.11	0.31	0.11	0.30	0.10	0.13	0.09	0.10	0.11	0.12	0.12	0.12	0.03	0.28	0.16	0.54	0.17	0.32
OP2	0.30	0.23	0.39	0.14	0.34	0.02	0.44	0.06	0.42	0.53	0.32	0.21	0.48	0.54	0.40	0.54	0.01	0.12	0.24	0.25	0.22	0.06
P	0.09	0.13	0.14	0.02	0.12	0.16	0.14	0.13	0.15	0.14	0.14	0.12	0.16	0.15	0.12	0.25	0.01	0.15	0.06	0.37	0.03	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.16	0.10	0.08
C2	0.05	0.00	0.21	0.07	0.01	0.20	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.41	0.09	0.25	0.14	0.18	0.35	0.15
C2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.12	0.02	0.06	0.07	0.10	0.12	0.17	0.22	0.08	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.28	0.17	0.17
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.07	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.23	0.08	0.09
C4	0.03	0.01	0.12	0.04	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.19	0.08	0.14	0.18	0.20	0.26	0.15
C4'	0.01	0.20	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.05	0.17	0.13	0.20	0.03	0.12	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.14	0.03	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.05	0.28	0.25	0.31	0.23
C5'	0.04	0.11	0.07	0.02	0.04	0.01	0.15	0.00	0.10	0.32	0.03	0.12	0.18	0.29	0.13	0.07	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02
C6	0.03	0.01	0.10	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.10	0.27	0.26	0.38	0.24
C8	0.01	0.01	0.12	0.04	0.01	0.17	0.01	0.32	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.26	0.07	0.15	0.33	0.27	0.17	0.23
N1	0.04	0.01	0.17	0.06	0.01	0.13	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.29	0.09	0.19	0.21	0.22	0.39	0.20
N3	0.05	0.01	0.22	0.07	0.00	0.20	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.42	0.09	0.26	0.10	0.16	0.29	0.11
N6	0.03	0.02	0.08	0.06	0.02	0.03	0.02	0.18	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.09	0.06	0.33	0.30	0.41	0.29
N7	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.12	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.19	0.08	0.08	0.35	0.29	0.26	0.27
N9	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.19	0.20	0.16	0.14
O2'	0.02	0.41	0.01	0.03	0.19	0.03	0.05	0.07	0.13	0.26	0.29	0.42	0.07	0.19	0.04	0.00	0.05	0.02	0.08	0.35	0.25	0.22
O3'	0.07	0.09	0.03	0.01	0.08	0.01	0.08	0.05	0.08	0.07	0.09	0.09	0.09	0.08	0.07	0.05	0.00	0.07	0.07	0.22	0.08	0.07
O4'	0.00	0.25	0.01	0.01	0.14	0.01	0.05	0.01	0.10	0.15	0.19	0.26	0.06	0.08	0.01	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.07	0.06
O5'	0.07	0.14	0.07	0.06	0.18	0.01	0.28	0.01	0.27	0.33	0.21	0.10	0.33	0.35	0.19	0.08	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.16	0.18	0.28	0.23	0.20	0.14	0.25	0.04	0.26	0.27	0.22	0.16	0.30	0.29	0.20	0.35	0.22	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.35	0.17	0.08	0.26	0.03	0.31	0.01	0.38	0.17	0.39	0.29	0.41	0.26	0.16	0.25	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.15	0.17	0.09	0.15	0.04	0.23	0.02	0.24	0.23	0.20	0.11	0.29	0.27	0.14	0.22	0.07	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00