Doublet Group distance statistics: 50234

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.015, 0.037, 0.059, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.037 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.014, 0.037, 0.060, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.037 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.001, 0.024, 0.048, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.024 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.005, 0.029, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.012, 0.037, 0.061, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.037 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.007, 0.032, 0.058, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.032 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.013, 0.045, 0.076, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.045 std_dev=0.032
N2	A	0, 0.027, 0.066, 0.105, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.066 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.064, 0.211, 0.357, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.211 std_dev=0.146
C5'	A	0, 0.121, 0.286, 0.452, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.286 std_dev=0.165
C2'	A	0, 0.098, 0.282, 0.466, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.282 std_dev=0.184
C4'	A	0, 0.096, 0.286, 0.477, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.286 std_dev=0.191
C3'	A	0, 0.120, 0.517, 0.914, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.517 std_dev=0.397
O2'	B	0, 0.176, 0.588, 1.001, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.588 std_dev=0.412
O3'	B	0, 0.301, 0.758, 1.215, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.758 std_dev=0.457
P	A	0, 0.293, 0.767, 1.241, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.767 std_dev=0.474
C2'	B	0, 0.301, 0.813, 1.324, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.813 std_dev=0.512
OP2	A	0, 0.319, 0.834, 1.349, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.834 std_dev=0.515
C3'	B	0, 0.358, 0.923, 1.488, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.923 std_dev=0.565
C1'	B	0, 0.399, 1.004, 1.609, 1.493 max_d=1.493 avg_d=1.004 std_dev=0.605
O2'	A	0, 0.192, 0.811, 1.429, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.811 std_dev=0.619
C4'	B	0, 0.449, 1.146, 1.843, 1.723 max_d=1.723 avg_d=1.146 std_dev=0.697
OP1	A	0, 0.366, 1.088, 1.810, 1.746 max_d=1.746 avg_d=1.088 std_dev=0.722
O4'	B	0, 0.481, 1.217, 1.954, 1.825 max_d=1.825 avg_d=1.217 std_dev=0.737
O5'	A	0, 0.214, 0.986, 1.758, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.986 std_dev=0.772
O3'	A	0, 0.256, 1.237, 2.217, 2.223 max_d=2.223 avg_d=1.237 std_dev=0.980
C5'	B	0, 0.606, 1.596, 2.586, 2.447 max_d=2.447 avg_d=1.596 std_dev=0.990
N9	B	0, 0.577, 1.577, 2.577, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.577 std_dev=1.000
O5'	B	0, 0.688, 1.825, 2.962, 2.806 max_d=2.806 avg_d=1.825 std_dev=1.137
C4	B	0, 0.647, 1.918, 3.189, 3.073 max_d=3.073 avg_d=1.918 std_dev=1.271
N3	B	0, 0.599, 1.914, 3.229, 3.139 max_d=3.139 avg_d=1.914 std_dev=1.315
C8	B	0, 0.747, 2.090, 3.432, 3.283 max_d=3.283 avg_d=2.090 std_dev=1.342
P	B	0, 0.868, 2.340, 3.811, 3.606 max_d=3.606 avg_d=2.340 std_dev=1.471
OP1	B	0, 0.911, 2.487, 4.063, 3.847 max_d=3.847 avg_d=2.487 std_dev=1.576
OP2	B	0, 0.931, 2.550, 4.168, 3.964 max_d=3.964 avg_d=2.550 std_dev=1.619
C5	B	0, 0.827, 2.503, 4.180, 4.042 max_d=4.042 avg_d=2.503 std_dev=1.677
N7	B	0, 0.885, 2.601, 4.316, 4.164 max_d=4.164 avg_d=2.601 std_dev=1.716
C2	B	0, 0.751, 2.499, 4.246, 4.141 max_d=4.141 avg_d=2.499 std_dev=1.747
C6	B	0, 0.945, 3.003, 5.062, 4.918 max_d=4.918 avg_d=3.003 std_dev=2.059
N1	B	0, 0.908, 2.983, 5.059, 4.925 max_d=4.925 avg_d=2.983 std_dev=2.075
N6	B	0, 1.113, 3.590, 6.067, 5.894 max_d=5.894 avg_d=3.590 std_dev=2.477

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.09	0.03	0.01	0.05	0.07	0.05	0.00	0.00	0.02	0.16	0.00	0.14	0.03	0.70	0.11	0.27
C2	0.06	0.00	0.04	0.12	0.02	0.04	0.00	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.32	0.10	0.11	0.17	0.00	0.66	0.18	0.31
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.14	0.04	0.08	0.04	0.05	0.04	0.06	0.03	0.00	0.05	0.02	0.21	0.04	0.58	0.05	0.19
C3'	0.03	0.12	0.01	0.00	0.17	0.00	0.24	0.01	0.24	0.23	0.19	0.08	0.10	0.27	0.16	0.02	0.01	0.04	0.39	0.26	0.62	0.09	0.34
C4	0.03	0.02	0.02	0.17	0.00	0.02	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.26	0.08	0.06	0.21	0.01	0.71	0.21	0.34
C4'	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.30	0.04	0.00	0.01	0.03	0.41	0.06	0.08
C5	0.02	0.00	0.04	0.24	0.00	0.02	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.27	0.18	0.04	0.25	0.01	0.69	0.27	0.38
C5'	0.09	0.17	0.14	0.01	0.17	0.00	0.19	0.00	0.20	0.19	0.19	0.17	0.16	0.19	0.16	0.16	0.16	0.02	0.01	0.20	0.30	0.07	0.01
C6	0.03	0.00	0.04	0.24	0.01	0.02	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.31	0.18	0.06	0.25	0.01	0.65	0.28	0.37
C8	0.01	0.02	0.08	0.23	0.01	0.01	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.16	0.18	0.04	0.28	0.02	0.76	0.26	0.40
N1	0.05	0.00	0.04	0.19	0.01	0.03	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.33	0.12	0.09	0.21	0.01	0.65	0.24	0.34
N2	0.07	0.01	0.05	0.08	0.03	0.05	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.31	0.14	0.14	0.14	0.01	0.63	0.15	0.28
N3	0.05	0.01	0.04	0.10	0.01	0.03	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.28	0.11	0.10	0.16	0.01	0.68	0.16	0.30
N7	0.00	0.01	0.06	0.27	0.00	0.01	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.22	0.24	0.01	0.29	0.02	0.71	0.32	0.41
N9	0.00	0.03	0.03	0.16	0.01	0.01	0.01	0.16	0.02	0.00	0.03	0.04	0.02	0.00	0.00	0.16	0.07	0.01	0.22	0.02	0.74	0.19	0.34
O2'	0.02	0.32	0.00	0.02	0.26	0.30	0.27	0.16	0.31	0.16	0.33	0.31	0.28	0.22	0.16	0.00	0.06	0.17	0.35	0.32	0.75	0.15	0.33
O3'	0.16	0.10	0.05	0.01	0.08	0.04	0.18	0.16	0.18	0.18	0.12	0.14	0.11	0.24	0.07	0.06	0.00	0.16	0.38	0.23	0.49	0.15	0.33
O4'	0.00	0.11	0.02	0.04	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.04	0.09	0.14	0.10	0.01	0.01	0.17	0.16	0.00	0.04	0.06	0.65	0.14	0.24
O5'	0.14	0.17	0.21	0.39	0.21	0.01	0.25	0.01	0.25	0.28	0.21	0.14	0.16	0.29	0.22	0.35	0.38	0.04	0.00	0.26	0.02	0.04	0.01
O6	0.03	0.00	0.04	0.26	0.01	0.03	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.32	0.23	0.06	0.26	0.00	0.61	0.32	0.38
OP1	0.70	0.66	0.58	0.62	0.71	0.41	0.69	0.30	0.65	0.76	0.65	0.63	0.68	0.71	0.74	0.75	0.49	0.65	0.02	0.61	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.18	0.05	0.09	0.21	0.06	0.27	0.07	0.28	0.26	0.24	0.15	0.16	0.32	0.19	0.15	0.15	0.14	0.04	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.27	0.31	0.19	0.34	0.34	0.08	0.38	0.01	0.37	0.40	0.34	0.28	0.30	0.41	0.34	0.33	0.33	0.24	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.96	0.36	0.17	0.66	0.06	0.64	0.04	0.79	0.32	0.93	0.84	0.78	0.44	0.44	0.35	0.03	0.15	0.04	0.20	0.06	0.09
C2	0.19	0.99	0.21	0.05	0.58	0.21	0.55	0.33	0.75	0.16	0.95	0.82	0.74	0.31	0.31	0.28	0.17	0.12	0.30	0.52	0.31	0.38
C2'	0.50	1.19	0.49	0.31	0.89	0.20	0.91	0.16	1.07	0.59	1.19	1.04	1.09	0.73	0.66	0.39	0.09	0.30	0.19	0.04	0.20	0.15
C3'	0.10	0.68	0.09	0.04	0.43	0.15	0.50	0.13	0.66	0.24	0.73	0.52	0.71	0.38	0.25	0.17	0.17	0.12	0.08	0.12	0.05	0.08
C4	0.24	0.93	0.26	0.05	0.57	0.15	0.52	0.25	0.69	0.18	0.87	0.80	0.67	0.30	0.33	0.34	0.16	0.05	0.24	0.45	0.27	0.32
C4'	0.32	0.67	0.33	0.29	0.51	0.21	0.52	0.22	0.61	0.33	0.67	0.59	0.63	0.41	0.39	0.19	0.18	0.24	0.19	0.14	0.17	0.17
C5	0.18	0.79	0.18	0.11	0.46	0.24	0.39	0.36	0.54	0.06	0.72	0.69	0.50	0.16	0.23	0.31	0.24	0.13	0.35	0.56	0.39	0.43
C5'	0.51	0.62	0.51	0.50	0.56	0.47	0.52	0.45	0.56	0.42	0.60	0.61	0.55	0.44	0.50	0.38	0.39	0.50	0.37	0.30	0.27	0.32
C6	0.10	0.76	0.12	0.16	0.40	0.32	0.33	0.46	0.49	0.02	0.69	0.64	0.46	0.10	0.16	0.26	0.27	0.23	0.44	0.67	0.47	0.53
C8	0.30	0.77	0.29	0.07	0.50	0.09	0.43	0.18	0.54	0.15	0.69	0.71	0.50	0.23	0.32	0.43	0.17	0.10	0.21	0.39	0.26	0.28
N1	0.12	0.88	0.15	0.12	0.48	0.29	0.43	0.42	0.62	0.06	0.82	0.72	0.59	0.19	0.21	0.26	0.23	0.20	0.40	0.63	0.42	0.49
N2	0.19	1.05	0.22	0.04	0.62	0.20	0.61	0.32	0.82	0.20	1.03	0.85	0.83	0.36	0.33	0.27	0.15	0.12	0.28	0.51	0.28	0.36
N3	0.25	1.03	0.27	0.05	0.63	0.14	0.61	0.24	0.80	0.23	0.99	0.86	0.79	0.38	0.37	0.31	0.13	0.04	0.22	0.43	0.23	0.29
N7	0.20	0.69	0.19	0.13	0.40	0.22	0.31	0.34	0.44	0.06	0.60	0.62	0.38	0.11	0.21	0.35	0.27	0.11	0.36	0.55	0.40	0.43
N9	0.31	0.91	0.31	0.09	0.59	0.06	0.54	0.14	0.69	0.22	0.85	0.80	0.67	0.33	0.37	0.38	0.11	0.08	0.15	0.34	0.19	0.22
O2'	0.56	1.37	0.48	0.27	0.98	0.21	1.00	0.15	1.20	0.63	1.36	1.18	1.22	0.79	0.72	0.41	0.04	0.36	0.16	0.06	0.14	0.10
O3'	0.36	0.15	0.30	0.22	0.11	0.34	0.13	0.27	0.22	0.20	0.24	0.08	0.31	0.13	0.22	0.52	0.25	0.39	0.24	0.17	0.15	0.20
O4'	0.26	0.69	0.28	0.15	0.46	0.08	0.42	0.05	0.54	0.18	0.66	0.61	0.53	0.26	0.30	0.25	0.05	0.13	0.05	0.16	0.09	0.10
O5'	0.30	0.23	0.31	0.11	0.28	0.12	0.26	0.02	0.23	0.31	0.22	0.25	0.20	0.28	0.30	0.47	0.03	0.21	0.05	0.14	0.04	0.05
O6	0.04	0.65	0.06	0.23	0.29	0.40	0.21	0.56	0.36	0.13	0.56	0.54	0.31	0.03	0.07	0.22	0.31	0.31	0.54	0.77	0.58	0.63
OP1	0.06	0.08	0.13	0.00	0.10	0.07	0.12	0.23	0.11	0.15	0.10	0.08	0.12	0.15	0.11	0.26	0.04	0.04	0.16	0.33	0.18	0.24
OP2	0.03	0.12	0.08	0.04	0.11	0.10	0.13	0.18	0.13	0.14	0.13	0.10	0.14	0.15	0.09	0.17	0.02	0.11	0.11	0.17	0.08	0.12
P	0.09	0.10	0.14	0.01	0.12	0.04	0.15	0.15	0.13	0.19	0.11	0.09	0.13	0.18	0.14	0.25	0.01	0.01	0.07	0.18	0.07	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03
C2	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.01	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.07	0.03	0.15	0.15	0.25	0.20
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.08	0.07	0.09	0.03	0.05	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.05	0.10	0.07
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.06	0.17	0.05	0.05	0.07	0.14	0.08	0.02	0.01	0.01	0.09	0.05	0.10	0.08
C4	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.04	0.01	0.16	0.17	0.23	0.20
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.05	0.11	0.03	0.01	0.07	0.11	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.01	0.22	0.26	0.32	0.29
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.12	0.01	0.18	0.00	0.17	0.22	0.14	0.07	0.20	0.23	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.06	0.01	0.22	0.27	0.35	0.30
C8	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.18	0.04	0.24	0.26	0.26	0.26
N1	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.05	0.02	0.19	0.22	0.32	0.26
N3	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.05	0.03	0.12	0.12	0.20	0.16
N6	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.07	0.01	0.25	0.32	0.40	0.35
N7	0.01	0.00	0.05	0.14	0.01	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.16	0.03	0.27	0.32	0.36	0.33
N9	0.00	0.00	0.03	0.08	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.15	0.15	0.17	0.16
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.10	0.01	0.07	0.01	0.11	0.03	0.15	0.17	0.10	0.01	0.03	0.00	0.07	0.03	0.06	0.04	0.09	0.06
O3'	0.03	0.07	0.04	0.01	0.04	0.02	0.09	0.02	0.06	0.18	0.05	0.05	0.07	0.16	0.09	0.07	0.00	0.03	0.08	0.06	0.11	0.08
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.09	0.07	0.11	0.09
O5'	0.03	0.15	0.07	0.09	0.16	0.01	0.22	0.01	0.22	0.24	0.19	0.12	0.25	0.27	0.15	0.06	0.08	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.02	0.15	0.05	0.05	0.17	0.02	0.26	0.03	0.27	0.26	0.22	0.12	0.32	0.32	0.15	0.04	0.06	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.25	0.10	0.10	0.23	0.01	0.32	0.01	0.35	0.26	0.32	0.20	0.40	0.36	0.17	0.09	0.11	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.20	0.07	0.08	0.20	0.02	0.29	0.02	0.30	0.26	0.26	0.16	0.35	0.33	0.16	0.06	0.08	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00