Doublet Group distance statistics: 50238

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.001, 0.018, 0.037, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.002, 0.027, 0.052, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.001, 0.028, 0.055, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.028 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.003, 0.035, 0.067, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.035 std_dev=0.032
C4	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.033 std_dev=0.033
N9	A	0, 0.002, 0.038, 0.073, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.038 std_dev=0.036
O6	A	0, -0.003, 0.035, 0.073, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.035 std_dev=0.038
N7	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.043 std_dev=0.043
C8	A	0, 0.006, 0.058, 0.111, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.058 std_dev=0.052
O4'	A	0, 0.042, 0.179, 0.316, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.179 std_dev=0.137
C2'	B	0, 0.044, 0.218, 0.392, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.218 std_dev=0.174
C2'	A	0, 0.015, 0.232, 0.449, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.232 std_dev=0.217
C4'	A	0, 0.079, 0.306, 0.533, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.306 std_dev=0.227
C3'	B	0, 0.060, 0.349, 0.637, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.349 std_dev=0.288
C3'	A	0, 0.072, 0.371, 0.670, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.371 std_dev=0.299
O2'	A	0, -0.067, 0.253, 0.572, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.253 std_dev=0.319
O3'	A	0, 0.110, 0.546, 0.982, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.546 std_dev=0.436
OP2	A	0, 0.092, 0.534, 0.975, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.534 std_dev=0.442
C5'	A	0, 0.097, 0.553, 1.008, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.553 std_dev=0.456
O5'	A	0, 0.072, 0.530, 0.987, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.530 std_dev=0.457
P	A	0, 0.086, 0.556, 1.026, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.556 std_dev=0.470
C4'	B	0, 0.042, 0.515, 0.988, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.515 std_dev=0.473
OP1	A	0, 0.124, 0.599, 1.075, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.599 std_dev=0.475
O3'	B	0, 0.033, 0.596, 1.160, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.596 std_dev=0.563
O4'	B	0, -0.008, 0.592, 1.192, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.592 std_dev=0.600
O2'	B	0, -0.106, 0.540, 1.187, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.540 std_dev=0.647
C1'	B	0, -0.123, 0.714, 1.552, 1.890 max_d=1.890 avg_d=0.714 std_dev=0.838
C5'	B	0, -0.135, 1.127, 2.390, 2.890 max_d=2.890 avg_d=1.127 std_dev=1.263
O5'	B	0, -0.215, 1.318, 2.851, 3.468 max_d=3.468 avg_d=1.318 std_dev=1.533
N9	B	0, -0.346, 1.305, 2.956, 3.634 max_d=3.634 avg_d=1.305 std_dev=1.651
P	B	0, -0.346, 1.741, 3.828, 4.675 max_d=4.675 avg_d=1.741 std_dev=2.087
C8	B	0, -0.471, 1.650, 3.771, 4.645 max_d=4.645 avg_d=1.650 std_dev=2.121
OP1	B	0, -0.338, 1.885, 4.107, 5.005 max_d=5.005 avg_d=1.885 std_dev=2.222
C4	B	0, -0.560, 1.840, 4.241, 5.231 max_d=5.231 avg_d=1.840 std_dev=2.400
OP2	B	0, -0.484, 1.962, 4.409, 5.412 max_d=5.412 avg_d=1.962 std_dev=2.447
N3	B	0, -0.657, 2.053, 4.763, 5.882 max_d=5.882 avg_d=2.053 std_dev=2.710
N7	B	0, -0.688, 2.225, 5.139, 6.341 max_d=6.341 avg_d=2.225 std_dev=2.914
C5	B	0, -0.728, 2.308, 5.345, 6.598 max_d=6.598 avg_d=2.308 std_dev=3.037
C2	B	0, -0.886, 2.653, 6.193, 7.656 max_d=7.656 avg_d=2.653 std_dev=3.539
C6	B	0, -0.957, 2.906, 6.769, 8.366 max_d=8.366 avg_d=2.906 std_dev=3.863
N1	B	0, -1.018, 3.034, 7.087, 8.762 max_d=8.762 avg_d=3.034 std_dev=4.052
N6	B	0, -1.146, 3.432, 8.011, 9.904 max_d=9.904 avg_d=3.432 std_dev=4.579

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.15	0.02	0.19	0.19	0.25
C2	0.02	0.00	0.21	0.22	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.29	0.03	0.29	0.02	0.31	0.37	0.37
C2'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.04	0.11	0.05	0.16	0.25	0.22	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.07	0.09	0.04	0.04	0.12
C3'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.14	0.01	0.10	0.06	0.13	0.06	0.18	0.26	0.22	0.05	0.06	0.00	0.00	0.02	0.02	0.12	0.04	0.08	0.02
C4	0.00	0.00	0.13	0.14	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.16	0.03	0.27	0.02	0.31	0.35	0.36
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.10	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.07
C5	0.00	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.03	0.28	0.02	0.34	0.39	0.38
C5'	0.04	0.13	0.04	0.06	0.11	0.01	0.11	0.00	0.12	0.08	0.13	0.14	0.13	0.10	0.09	0.01	0.05	0.02	0.00	0.13	0.03	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.13	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.03	0.29	0.01	0.36	0.41	0.39
C8	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.23	0.02	0.32	0.34	0.37
N1	0.01	0.00	0.16	0.18	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.24	0.04	0.30	0.01	0.34	0.40	0.38
N2	0.03	0.00	0.25	0.26	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.34	0.03	0.29	0.02	0.30	0.37	0.36
N3	0.02	0.00	0.22	0.22	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.27	0.03	0.28	0.02	0.29	0.34	0.35
N7	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.03	0.25	0.01	0.36	0.40	0.39
N9	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.23	0.02	0.28	0.30	0.34
O2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.04	0.13	0.23	0.18	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.01	0.08
O3'	0.02	0.29	0.00	0.00	0.16	0.01	0.12	0.05	0.17	0.06	0.24	0.34	0.27	0.05	0.06	0.00	0.00	0.02	0.07	0.16	0.18	0.19	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.02	0.21	0.16	0.23
O5'	0.15	0.29	0.07	0.02	0.27	0.01	0.28	0.00	0.29	0.23	0.30	0.29	0.28	0.25	0.23	0.03	0.07	0.12	0.00	0.30	0.02	0.03	0.00
O6	0.02	0.02	0.09	0.12	0.02	0.05	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.16	0.02	0.30	0.00	0.38	0.44	0.40
OP1	0.19	0.31	0.04	0.04	0.31	0.04	0.34	0.03	0.36	0.32	0.34	0.30	0.29	0.36	0.28	0.01	0.18	0.21	0.02	0.38	0.00	0.04	0.00
OP2	0.19	0.37	0.04	0.08	0.35	0.01	0.39	0.01	0.41	0.34	0.40	0.37	0.34	0.40	0.30	0.01	0.19	0.16	0.03	0.44	0.04	0.00	0.01
P	0.25	0.37	0.12	0.02	0.36	0.07	0.38	0.02	0.39	0.37	0.38	0.36	0.35	0.39	0.34	0.08	0.10	0.23	0.00	0.40	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.60	1.85	0.10	0.19	1.54	0.21	1.92	0.17	2.26	1.32	2.21	1.44	2.45	1.75	1.13	0.18	0.49	0.29	0.27	0.38	0.83	0.43
C2	0.38	1.13	0.02	0.19	1.29	0.05	2.17	0.26	2.59	1.71	2.03	0.69	3.32	2.35	1.08	0.03	0.51	0.35	0.77	0.99	1.57	1.08
C2'	0.64	1.74	0.21	0.08	1.43	0.13	1.79	0.15	2.13	1.24	2.10	1.35	2.36	1.64	1.07	0.42	0.36	0.33	0.26	0.42	0.86	0.45
C3'	0.73	1.59	0.36	0.05	1.29	0.05	1.51	0.16	1.78	1.04	1.80	1.31	1.91	1.34	0.99	0.68	0.21	0.40	0.16	0.33	0.69	0.34
C4	0.39	1.06	0.01	0.21	1.22	0.10	1.94	0.16	2.21	1.54	1.76	0.70	2.65	2.06	1.02	0.06	0.53	0.30	0.64	0.86	1.35	0.91
C4'	0.82	1.87	0.36	0.02	1.45	0.10	1.56	0.30	1.85	1.00	1.97	1.60	1.91	1.30	1.07	0.57	0.24	0.42	0.01	0.07	0.43	0.11
C5	0.20	0.24	0.07	0.21	0.73	0.06	1.49	0.29	1.57	1.41	0.93	0.06	2.07	1.87	0.75	0.06	0.52	0.23	0.77	1.08	1.55	1.11
C5'	0.85	1.57	0.45	0.13	1.19	0.05	1.17	0.32	1.38	0.70	1.54	1.41	1.35	0.89	0.89	0.71	0.05	0.47	0.14	0.10	0.15	0.08
C6	0.13	0.11	0.09	0.20	0.56	0.02	1.41	0.41	1.48	1.44	0.69	0.24	2.14	1.93	0.67	0.03	0.50	0.23	0.90	1.26	1.77	1.29
C8	0.27	0.47	0.03	0.24	0.73	0.15	1.20	0.09	1.25	1.10	0.89	0.28	1.50	1.39	0.69	0.24	0.55	0.16	0.51	0.79	1.14	0.77
N1	0.24	0.43	0.06	0.19	0.90	0.02	1.81	0.37	2.05	1.61	1.31	0.16	2.83	2.20	0.87	0.03	0.50	0.30	0.89	1.18	1.74	1.24
N2	0.42	1.36	0.02	0.19	1.41	0.05	2.31	0.26	2.82	1.78	2.32	0.86	3.64	2.46	1.16	0.05	0.50	0.39	0.78	0.97	1.58	1.08
N3	0.46	1.50	0.01	0.20	1.47	0.09	2.25	0.15	2.70	1.68	2.31	1.00	3.25	2.29	1.16	0.01	0.51	0.36	0.64	0.82	1.37	0.90
N7	0.10	0.18	0.09	0.23	0.37	0.08	0.98	0.26	0.94	1.11	0.38	0.29	1.30	1.40	0.50	0.15	0.52	0.14	0.71	1.07	1.45	1.05
N9	0.45	1.21	0.03	0.22	1.25	0.15	1.77	0.02	1.99	1.36	1.71	0.89	2.26	1.79	1.01	0.16	0.53	0.26	0.47	0.66	1.10	0.69
O2'	0.67	2.15	0.19	0.10	1.62	0.18	1.99	0.25	2.45	1.29	2.51	1.64	2.70	1.76	1.16	0.30	0.34	0.33	0.18	0.27	0.76	0.33
O3'	0.76	1.67	0.40	0.11	1.29	0.04	1.48	0.21	1.78	0.98	1.86	1.37	1.91	1.27	0.97	0.72	0.11	0.42	0.09	0.23	0.59	0.26
O4'	0.76	1.93	0.22	0.14	1.59	0.19	1.77	0.25	2.04	1.18	2.10	1.65	2.11	1.52	1.17	0.29	0.44	0.37	0.13	0.18	0.58	0.23
O5'	0.58	0.82	0.36	0.10	0.64	0.01	0.63	0.23	0.74	0.38	0.82	0.74	0.73	0.48	0.50	0.77	0.06	0.30	0.11	0.14	0.21	0.06
O6	0.03	0.76	0.14	0.21	0.14	0.02	0.94	0.49	0.86	1.24	0.08	0.74	1.52	1.64	0.41	0.03	0.49	0.16	0.98	1.42	1.91	1.43
OP1	0.17	0.39	0.07	0.12	0.05	0.28	0.16	0.81	0.03	0.47	0.21	0.36	0.16	0.45	0.12	0.36	0.04	0.11	0.95	0.76	0.82	0.87
OP2	0.04	0.41	0.06	0.02	0.45	0.06	0.56	0.20	0.56	0.53	0.50	0.36	0.62	0.60	0.39	0.50	0.01	0.11	0.31	0.30	0.11	0.08
P	0.23	0.24	0.14	0.02	0.07	0.11	0.05	0.41	0.04	0.22	0.15	0.23	0.06	0.21	0.02	0.45	0.00	0.03	0.45	0.10	0.23	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.23	0.02	0.15	0.21	0.04	0.02
C2	0.03	0.00	0.16	0.14	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.25	0.25	0.13	0.06	0.09	0.38	0.26
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.19	0.06	0.19	0.07	0.20	0.11	0.19	0.03	0.01	0.00	0.02	0.42	0.65	0.56	0.47
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.18	0.01	0.23	0.01	0.21	0.27	0.18	0.12	0.24	0.27	0.20	0.04	0.00	0.04	0.02	0.38	0.11	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.18	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.32	0.12	0.06	0.06	0.11	0.33	0.26
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.12	0.01	0.09	0.22	0.03	0.06	0.14	0.21	0.09	0.32	0.03	0.01	0.02	0.19	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.07	0.23	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.52	0.04	0.04	0.18	0.32	0.52	0.43
C5'	0.08	0.03	0.19	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.11	0.19	0.05	0.07	0.19	0.22	0.04	0.11	0.22	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.21	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.57	0.10	0.01	0.19	0.36	0.58	0.46
C8	0.01	0.01	0.19	0.27	0.00	0.22	0.01	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.44	0.11	0.16	0.18	0.30	0.39	0.38
N1	0.02	0.01	0.07	0.18	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.44	0.18	0.06	0.14	0.25	0.51	0.39
N3	0.03	0.00	0.20	0.12	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.14	0.25	0.16	0.01	0.01	0.27	0.18
N6	0.02	0.02	0.11	0.24	0.00	0.14	0.00	0.19	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.66	0.05	0.06	0.28	0.52	0.71	0.58
N7	0.00	0.00	0.19	0.27	0.01	0.21	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.57	0.09	0.14	0.26	0.45	0.59	0.52
N9	0.00	0.00	0.03	0.20	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.04	0.02	0.03	0.06	0.21	0.20
O2'	0.01	0.25	0.01	0.04	0.32	0.32	0.52	0.11	0.57	0.44	0.44	0.14	0.66	0.57	0.27	0.00	0.04	0.21	0.30	0.59	0.68	0.42
O3'	0.23	0.25	0.00	0.00	0.12	0.03	0.04	0.22	0.10	0.11	0.18	0.25	0.05	0.09	0.04	0.04	0.00	0.11	0.20	0.14	0.04	0.08
O4'	0.02	0.13	0.02	0.04	0.06	0.01	0.04	0.02	0.01	0.16	0.06	0.16	0.06	0.14	0.02	0.21	0.11	0.00	0.02	0.01	0.17	0.16
O5'	0.15	0.06	0.42	0.02	0.06	0.02	0.18	0.00	0.19	0.18	0.14	0.01	0.28	0.26	0.03	0.30	0.20	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.21	0.09	0.65	0.38	0.11	0.19	0.32	0.08	0.36	0.30	0.25	0.01	0.52	0.45	0.06	0.59	0.14	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00
OP2	0.04	0.38	0.56	0.11	0.33	0.02	0.52	0.01	0.58	0.39	0.51	0.27	0.71	0.59	0.21	0.68	0.04	0.17	0.02	0.05	0.00	0.01
P	0.02	0.26	0.47	0.12	0.26	0.01	0.43	0.01	0.46	0.38	0.39	0.18	0.58	0.52	0.20	0.42	0.08	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00