Doublet Group distance statistics: 50243

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.000, 0.041, 0.082, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.041 std_dev=0.041
O6	A	0, 0.000, 0.052, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.052 std_dev=0.052
C2'	B	0, 0.000, 0.402, 0.804, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.402 std_dev=0.402
O2'	B	0, 0.000, 0.456, 0.911, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.456 std_dev=0.456
O4'	A	0, 0.000, 0.982, 1.964, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.982 std_dev=0.982
C2'	A	0, 0.000, 1.042, 2.085, 2.085 max_d=2.085 avg_d=1.042 std_dev=1.042
C3'	B	0, 0.000, 1.223, 2.447, 2.447 max_d=2.447 avg_d=1.223 std_dev=1.223
C3'	A	0, 0.000, 1.257, 2.514, 2.514 max_d=2.514 avg_d=1.257 std_dev=1.257
O3'	A	0, 0.000, 1.257, 2.514, 2.514 max_d=2.514 avg_d=1.257 std_dev=1.257
C4'	A	0, 0.000, 1.337, 2.674, 2.674 max_d=2.674 avg_d=1.337 std_dev=1.337
P	B	0, 0.000, 1.377, 2.753, 2.753 max_d=2.753 avg_d=1.377 std_dev=1.377
C1'	B	0, 0.000, 1.593, 3.187, 3.187 max_d=3.187 avg_d=1.593 std_dev=1.593
O2'	A	0, 0.000, 1.593, 3.187, 3.187 max_d=3.187 avg_d=1.593 std_dev=1.593
OP2	B	0, 0.000, 1.612, 3.223, 3.223 max_d=3.223 avg_d=1.612 std_dev=1.612
O5'	B	0, 0.000, 1.639, 3.279, 3.279 max_d=3.279 avg_d=1.639 std_dev=1.639
O3'	B	0, 0.000, 1.744, 3.488, 3.488 max_d=3.488 avg_d=1.744 std_dev=1.744
C4'	B	0, 0.000, 1.752, 3.504, 3.504 max_d=3.504 avg_d=1.752 std_dev=1.752
C5'	B	0, 0.000, 1.820, 3.639, 3.639 max_d=3.639 avg_d=1.820 std_dev=1.820
O4'	B	0, 0.000, 1.954, 3.908, 3.908 max_d=3.908 avg_d=1.954 std_dev=1.954
C5'	A	0, 0.000, 2.044, 4.089, 4.089 max_d=4.089 avg_d=2.044 std_dev=2.044
N9	B	0, 0.000, 2.395, 4.790, 4.790 max_d=4.790 avg_d=2.395 std_dev=2.395
OP1	B	0, 0.000, 2.522, 5.045, 5.045 max_d=5.045 avg_d=2.522 std_dev=2.522
O5'	A	0, 0.000, 2.556, 5.112, 5.112 max_d=5.112 avg_d=2.556 std_dev=2.556
C8	B	0, 0.000, 2.586, 5.172, 5.172 max_d=5.172 avg_d=2.586 std_dev=2.586
P	A	0, 0.000, 2.799, 5.598, 5.598 max_d=5.598 avg_d=2.799 std_dev=2.799
OP1	A	0, 0.000, 3.101, 6.202, 6.202 max_d=6.202 avg_d=3.101 std_dev=3.101
C4	B	0, 0.000, 3.554, 7.108, 7.108 max_d=7.108 avg_d=3.554 std_dev=3.554
N7	B	0, 0.000, 3.702, 7.403, 7.403 max_d=7.403 avg_d=3.702 std_dev=3.702
OP2	A	0, 0.000, 4.000, 7.999, 7.999 max_d=7.999 avg_d=4.000 std_dev=4.000
N3	B	0, 0.000, 4.012, 8.023, 8.023 max_d=8.023 avg_d=4.012 std_dev=4.012
C5	B	0, 0.000, 4.321, 8.641, 8.641 max_d=8.641 avg_d=4.321 std_dev=4.321
C2	B	0, 0.000, 5.271, 10.543, 10.543 max_d=10.543 avg_d=5.271 std_dev=5.271
C6	B	0, 0.000, 5.639, 11.279, 11.279 max_d=11.279 avg_d=5.639 std_dev=5.639
N1	B	0, 0.000, 6.078, 12.156, 12.156 max_d=12.156 avg_d=6.078 std_dev=6.078
N6	B	0, 0.000, 6.537, 13.074, 13.074 max_d=13.074 avg_d=6.537 std_dev=6.537

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.27	0.00	0.21	0.01	0.07	0.29	0.12
C2	0.01	0.00	0.46	0.31	0.01	0.09	0.01	0.23	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.41	0.02	0.31	0.34	0.02	0.20	0.69	0.28
C2'	0.00	0.46	0.00	0.00	0.24	0.01	0.12	0.23	0.21	0.22	0.36	0.57	0.45	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.16	0.34	0.10	0.29
C3'	0.00	0.31	0.00	0.00	0.25	0.01	0.27	0.00	0.31	0.14	0.33	0.33	0.27	0.22	0.16	0.00	0.01	0.02	0.03	0.32	0.01	0.02	0.08
C4	0.00	0.01	0.24	0.25	0.00	0.02	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.16	0.41	0.00	0.14	0.71	0.33
C4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.12	0.06	0.12	0.09	0.10	0.03	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.00
C5	0.01	0.01	0.12	0.27	0.00	0.03	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.02	0.06	0.54	0.01	0.11	0.94	0.47
C5'	0.11	0.23	0.23	0.00	0.17	0.00	0.13	0.00	0.16	0.02	0.21	0.25	0.23	0.05	0.11	0.02	0.21	0.00	0.00	0.14	0.06	0.02	0.00
C6	0.01	0.01	0.21	0.31	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.13	0.54	0.01	0.14	1.01	0.49
C8	0.00	0.02	0.22	0.14	0.01	0.12	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.45	0.03	0.20	0.59	0.03	0.02	0.86	0.49
N1	0.01	0.01	0.36	0.33	0.01	0.06	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.03	0.24	0.44	0.02	0.19	0.87	0.39
N2	0.02	0.00	0.57	0.33	0.01	0.12	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.60	0.01	0.37	0.27	0.04	0.22	0.61	0.22
N3	0.01	0.00	0.45	0.27	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.40	0.07	0.31	0.29	0.02	0.18	0.57	0.22
N7	0.00	0.01	0.10	0.22	0.00	0.10	0.00	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.38	0.02	0.10	0.64	0.03	0.05	1.05	0.57
N9	0.00	0.01	0.01	0.16	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.10	0.00	0.41	0.01	0.09	0.62	0.31
O2'	0.01	0.41	0.00	0.00	0.07	0.21	0.12	0.02	0.02	0.45	0.21	0.60	0.40	0.38	0.15	0.00	0.03	0.14	0.04	0.10	0.24	0.18	0.29
O3'	0.27	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.21	0.05	0.03	0.03	0.01	0.07	0.02	0.10	0.03	0.00	0.21	0.14	0.07	0.31	0.17	0.10
O4'	0.00	0.31	0.01	0.02	0.16	0.00	0.06	0.00	0.13	0.20	0.24	0.37	0.31	0.10	0.00	0.14	0.21	0.00	0.29	0.09	0.13	0.36	0.29
O5'	0.21	0.34	0.08	0.03	0.41	0.01	0.54	0.00	0.54	0.59	0.44	0.27	0.29	0.64	0.41	0.04	0.14	0.29	0.00	0.60	0.03	0.01	0.00
O6	0.01	0.02	0.16	0.32	0.00	0.02	0.01	0.14	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.10	0.07	0.09	0.60	0.00	0.12	1.15	0.57
OP1	0.07	0.20	0.34	0.01	0.14	0.06	0.11	0.06	0.14	0.02	0.19	0.22	0.18	0.05	0.09	0.24	0.31	0.13	0.03	0.12	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.69	0.10	0.02	0.71	0.01	0.94	0.02	1.01	0.86	0.87	0.61	0.57	1.05	0.62	0.18	0.17	0.36	0.01	1.15	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.28	0.29	0.08	0.33	0.00	0.47	0.00	0.49	0.49	0.39	0.22	0.22	0.57	0.31	0.29	0.10	0.29	0.00	0.57	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.05	1.77	0.16	0.18	1.37	0.88	1.29	0.71	1.46	0.93	1.67	1.65	1.41	1.04	1.11	0.23	0.07	1.38	0.92	1.34	0.36	0.83
C2	0.95	2.16	0.08	0.01	1.47	0.75	1.40	0.59	1.72	0.81	2.08	1.87	1.68	1.01	1.06	0.28	0.34	1.30	0.95	1.71	0.26	0.88
C2'	1.80	2.48	0.90	0.85	2.17	1.42	2.11	1.19	2.25	1.75	2.40	2.41	2.21	1.88	1.91	0.50	0.59	2.01	1.35	1.66	0.75	1.25
C3'	1.27	1.85	0.50	0.51	1.58	0.89	1.54	0.65	1.68	1.24	1.81	1.77	1.66	1.36	1.36	0.15	0.38	1.37	0.80	1.04	0.24	0.69
C4	0.95	2.02	0.09	0.01	1.42	0.77	1.33	0.62	1.60	0.81	1.91	1.79	1.54	0.98	1.05	0.27	0.36	1.32	0.96	1.62	0.30	0.89
C4'	0.64	0.93	0.07	0.15	0.75	0.62	0.71	0.49	0.79	0.54	0.88	0.89	0.76	0.59	0.64	0.49	0.06	0.90	0.65	0.92	0.21	0.56
C5	0.86	1.99	0.04	0.13	1.35	0.67	1.27	0.54	1.55	0.70	1.89	1.75	1.50	0.89	0.97	0.29	0.53	1.22	0.92	1.69	0.26	0.87
C5'	0.37	0.45	0.18	0.16	0.38	0.53	0.35	0.49	0.38	0.28	0.42	0.45	0.37	0.30	0.34	0.68	0.07	0.66	0.65	0.83	0.30	0.57
C6	0.81	2.05	0.02	0.17	1.35	0.60	1.27	0.47	1.59	0.65	1.96	1.76	1.54	0.85	0.93	0.30	0.57	1.15	0.86	1.73	0.19	0.83
C8	0.90	1.76	0.07	0.08	1.30	0.74	1.20	0.63	1.40	0.75	1.65	1.63	1.33	0.89	0.98	0.28	0.51	1.30	0.94	1.46	0.32	0.86
N1	0.88	2.14	0.05	0.10	1.42	0.67	1.35	0.52	1.69	0.72	2.07	1.84	1.65	0.93	1.00	0.29	0.47	1.22	0.90	1.74	0.21	0.85
N2	0.97	2.20	0.09	0.02	1.49	0.76	1.43	0.60	1.77	0.84	2.13	1.89	1.74	1.04	1.09	0.27	0.29	1.31	0.96	1.72	0.26	0.88
N3	0.99	2.09	0.11	0.05	1.46	0.80	1.39	0.64	1.67	0.86	2.00	1.84	1.63	1.03	1.09	0.26	0.27	1.34	0.97	1.64	0.30	0.89
N7	0.80	1.82	0.03	0.19	1.27	0.62	1.18	0.53	1.43	0.65	1.72	1.63	1.36	0.82	0.91	0.30	0.63	1.17	0.90	1.63	0.27	0.87
N9	0.98	1.88	0.11	0.04	1.38	0.82	1.29	0.67	1.50	0.84	1.76	1.72	1.44	0.98	1.06	0.26	0.31	1.36	0.95	1.48	0.34	0.87
O2'	2.08	3.07	1.10	0.98	2.66	1.58	2.66	1.39	2.85	2.21	3.01	2.92	2.82	2.41	2.32	0.67	0.70	2.27	1.56	1.94	1.04	1.53
O3'	1.12	1.95	0.35	0.37	1.58	0.70	1.59	0.50	1.79	1.21	1.94	1.78	1.80	1.38	1.30	0.02	0.27	1.20	0.73	1.04	0.17	0.66
O4'	0.42	0.88	0.38	0.21	0.58	0.45	0.50	0.34	0.62	0.26	0.79	0.80	0.58	0.32	0.40	0.78	0.38	0.78	0.54	0.92	0.09	0.46
O5'	0.29	0.41	0.12	0.05	0.31	0.17	0.28	0.01	0.32	0.19	0.37	0.40	0.30	0.20	0.25	0.40	0.01	0.34	0.08	0.16	0.30	0.04
O6	0.70	1.98	0.03	0.27	1.26	0.49	1.18	0.36	1.52	0.53	1.91	1.68	1.47	0.74	0.82	0.33	0.68	1.03	0.76	1.70	0.11	0.75
OP1	0.36	0.48	0.44	0.09	0.43	0.06	0.41	0.27	0.44	0.32	0.47	0.47	0.42	0.35	0.38	0.93	0.03	0.17	0.34	0.35	0.30	0.34
OP2	0.11	0.02	0.06	0.08	0.06	0.55	0.08	0.75	0.05	0.15	0.01	0.00	0.06	0.13	0.11	0.01	0.00	0.42	0.70	0.78	1.03	0.82
P	0.04	0.02	0.19	0.00	0.05	0.13	0.07	0.19	0.06	0.09	0.03	0.01	0.07	0.09	0.06	0.39	0.01	0.08	0.17	0.17	0.38	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.00	0.14	0.25	0.08	0.03
C2	0.04	0.00	0.38	0.14	0.00	0.28	0.00	0.38	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.47	0.19	0.45	0.29	0.42	0.59	0.57
C2'	0.00	0.38	0.00	0.00	0.19	0.02	0.08	0.18	0.16	0.22	0.29	0.37	0.10	0.11	0.01	0.00	0.04	0.02	0.17	0.23	0.15	0.00
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.13	0.00	0.17	0.00	0.18	0.12	0.17	0.11	0.19	0.16	0.09	0.01	0.00	0.01	0.33	0.37	0.18	0.26
C4	0.02	0.00	0.19	0.13	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.18	0.22	0.06	0.13	0.28	0.18
C4'	0.00	0.28	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.07	0.23	0.19	0.28	0.01	0.17	0.04	0.13	0.01	0.01	0.01	0.08	0.03	0.04
C5	0.00	0.00	0.08	0.17	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.14	0.08	0.28	0.45	0.15	0.03
C5'	0.06	0.38	0.18	0.00	0.16	0.00	0.03	0.00	0.12	0.25	0.28	0.37	0.05	0.19	0.01	0.05	0.16	0.00	0.01	0.14	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.16	0.18	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.14	0.18	0.14	0.24	0.28	0.13
C8	0.02	0.01	0.22	0.12	0.00	0.23	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.51	0.14	0.27	0.67	1.01	0.21	0.47
N1	0.03	0.00	0.29	0.17	0.00	0.19	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.16	0.34	0.12	0.18	0.49	0.41
N3	0.05	0.00	0.37	0.11	0.00	0.28	0.00	0.37	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.47	0.22	0.46	0.27	0.34	0.52	0.51
N6	0.01	0.01	0.10	0.19	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.12	0.11	0.26	0.43	0.19	0.01
N7	0.01	0.00	0.11	0.16	0.00	0.17	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.11	0.16	0.61	0.97	0.14	0.41
N9	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.20	0.01	0.29	0.44	0.07	0.07
O2'	0.01	0.47	0.00	0.01	0.11	0.13	0.10	0.05	0.03	0.51	0.28	0.47	0.08	0.41	0.15	0.00	0.03	0.08	0.23	0.26	0.06	0.05
O3'	0.30	0.19	0.04	0.00	0.18	0.01	0.14	0.16	0.14	0.14	0.16	0.22	0.12	0.11	0.20	0.03	0.00	0.20	0.34	0.34	0.47	0.38
O4'	0.00	0.45	0.02	0.01	0.22	0.01	0.08	0.00	0.18	0.27	0.34	0.46	0.11	0.16	0.01	0.08	0.20	0.00	0.01	0.11	0.07	0.14
O5'	0.14	0.29	0.17	0.33	0.06	0.01	0.28	0.01	0.14	0.67	0.12	0.27	0.26	0.61	0.29	0.23	0.34	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01
OP1	0.25	0.42	0.23	0.37	0.13	0.08	0.45	0.14	0.24	1.01	0.18	0.34	0.43	0.97	0.44	0.26	0.34	0.11	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.59	0.15	0.18	0.28	0.03	0.15	0.04	0.28	0.21	0.49	0.52	0.19	0.14	0.07	0.06	0.47	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.57	0.00	0.26	0.18	0.04	0.03	0.01	0.13	0.47	0.41	0.51	0.01	0.41	0.07	0.05	0.38	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00