Doublet Group distance statistics: 50244

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.000, 0.036, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.036
C4	A	0, 0.000, 0.038, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N1	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N7	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
C8	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
N9	A	0, 0.000, 0.053, 0.106, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.053 std_dev=0.053
N3	A	0, 0.000, 0.064, 0.128, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.064 std_dev=0.064
C1'	A	0, 0.000, 0.066, 0.132, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.066 std_dev=0.066
C2	A	0, 0.000, 0.067, 0.133, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.067 std_dev=0.067
C4'	B	0, 0.000, 0.092, 0.185, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.092 std_dev=0.092
N2	A	0, 0.000, 0.124, 0.247, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.124 std_dev=0.124
OP2	B	0, 0.000, 0.289, 0.579, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.289 std_dev=0.289
O4'	B	0, 0.000, 0.317, 0.634, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.317 std_dev=0.317
C5'	B	0, 0.000, 0.337, 0.674, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.337 std_dev=0.337
P	B	0, 0.000, 0.461, 0.921, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.461 std_dev=0.461
C1'	B	0, 0.000, 0.517, 1.033, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.517 std_dev=0.517
O4'	A	0, 0.000, 0.556, 1.113, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.556 std_dev=0.556
OP2	A	0, 0.000, 0.616, 1.232, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.616 std_dev=0.616
C3'	B	0, 0.000, 0.622, 1.243, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.622 std_dev=0.622
OP1	B	0, 0.000, 0.628, 1.257, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.628 std_dev=0.628
O5'	B	0, 0.000, 0.658, 1.316, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.658 std_dev=0.658
C2'	B	0, 0.000, 0.673, 1.345, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.673 std_dev=0.673
O2'	B	0, 0.000, 0.724, 1.447, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.724 std_dev=0.724
C2'	A	0, 0.000, 0.768, 1.537, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.768 std_dev=0.768
P	A	0, 0.000, 0.807, 1.614, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.807 std_dev=0.807
OP1	A	0, 0.000, 0.858, 1.716, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.858 std_dev=0.858
O3'	B	0, 0.000, 0.876, 1.752, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.876 std_dev=0.876
C4'	A	0, 0.000, 0.897, 1.794, 1.794 max_d=1.794 avg_d=0.897 std_dev=0.897
C3'	A	0, 0.000, 0.943, 1.887, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.943 std_dev=0.943
N9	B	0, 0.000, 0.993, 1.986, 1.986 max_d=1.986 avg_d=0.993 std_dev=0.993
O5'	A	0, 0.000, 1.026, 2.053, 2.053 max_d=2.053 avg_d=1.026 std_dev=1.026
O2'	A	0, 0.000, 1.122, 2.244, 2.244 max_d=2.244 avg_d=1.122 std_dev=1.122
N3	B	0, 0.000, 1.135, 2.270, 2.270 max_d=2.270 avg_d=1.135 std_dev=1.135
O3'	A	0, 0.000, 1.143, 2.285, 2.285 max_d=2.285 avg_d=1.143 std_dev=1.143
C5'	A	0, 0.000, 1.233, 2.466, 2.466 max_d=2.466 avg_d=1.233 std_dev=1.233
C4	B	0, 0.000, 1.295, 2.590, 2.590 max_d=2.590 avg_d=1.295 std_dev=1.295
C8	B	0, 0.000, 1.349, 2.699, 2.699 max_d=2.699 avg_d=1.349 std_dev=1.349
C2	B	0, 0.000, 1.513, 3.026, 3.026 max_d=3.026 avg_d=1.513 std_dev=1.513
C5	B	0, 0.000, 1.791, 3.582, 3.582 max_d=3.582 avg_d=1.791 std_dev=1.791
N7	B	0, 0.000, 1.820, 3.639, 3.639 max_d=3.639 avg_d=1.820 std_dev=1.820
N1	B	0, 0.000, 2.006, 4.011, 4.011 max_d=4.011 avg_d=2.006 std_dev=2.006
C6	B	0, 0.000, 2.166, 4.332, 4.332 max_d=4.332 avg_d=2.166 std_dev=2.166
N6	B	0, 0.000, 2.665, 5.330, 5.330 max_d=5.330 avg_d=2.665 std_dev=2.665

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.03	0.03	0.07	0.12	0.09	0.02	0.00	0.02	0.16	0.00	0.18	0.02	0.20	0.35	0.15
C2	0.09	0.00	0.37	0.44	0.03	0.18	0.01	0.08	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.29	0.00	0.06	0.00	0.06	0.21	0.03
C2'	0.00	0.37	0.00	0.00	0.14	0.01	0.01	0.16	0.09	0.23	0.25	0.48	0.37	0.17	0.03	0.00	0.02	0.00	0.41	0.04	0.57	0.70	0.48
C3'	0.02	0.44	0.00	0.00	0.28	0.01	0.24	0.02	0.31	0.03	0.40	0.51	0.40	0.10	0.15	0.02	0.00	0.02	0.10	0.29	0.26	0.23	0.13
C4	0.03	0.03	0.14	0.28	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.12	0.13	0.01	0.04	0.01	0.13	0.27	0.10
C4'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.02	0.15	0.23	0.17	0.00	0.04	0.24	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.09	0.02
C5	0.01	0.01	0.01	0.24	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.14	0.01	0.07	0.01	0.17	0.27	0.14
C5'	0.07	0.08	0.16	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.15	0.03	0.13	0.08	0.14	0.06	0.07	0.15	0.00	0.00	0.06	0.08	0.02	0.06
C6	0.03	0.00	0.09	0.31	0.01	0.09	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.20	0.22	0.01	0.03	0.00	0.15	0.23	0.12
C8	0.03	0.03	0.23	0.03	0.01	0.02	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.00	0.31	0.04	0.03	0.21	0.01	0.23	0.35	0.22
N1	0.07	0.00	0.25	0.40	0.02	0.15	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.29	0.01	0.03	0.00	0.10	0.21	0.07
N2	0.12	0.00	0.48	0.51	0.03	0.23	0.01	0.13	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.20	0.36	0.02	0.11	0.01	0.02	0.18	0.00
N3	0.09	0.01	0.37	0.40	0.01	0.17	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.22	0.00	0.04	0.00	0.06	0.22	0.03
N7	0.02	0.01	0.17	0.10	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.34	0.05	0.00	0.15	0.00	0.23	0.31	0.21
N9	0.00	0.05	0.03	0.15	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.04	0.06	0.04	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.12	0.01	0.17	0.31	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.12	0.24	0.24	0.07	0.20	0.31	0.07	0.20	0.08	0.34	0.16	0.00	0.04	0.18	0.31	0.25	0.54	0.81	0.45
O3'	0.16	0.29	0.02	0.00	0.13	0.01	0.14	0.15	0.22	0.04	0.29	0.36	0.22	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.11	0.23	0.01	0.06	0.07
O4'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.18	0.11	0.00	0.03	0.02	0.05	0.09	0.07
O5'	0.18	0.06	0.41	0.10	0.04	0.03	0.07	0.00	0.03	0.21	0.03	0.11	0.04	0.15	0.12	0.31	0.11	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.00
O6	0.02	0.00	0.04	0.29	0.01	0.07	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.23	0.02	0.04	0.00	0.16	0.20	0.14
OP1	0.20	0.06	0.57	0.26	0.13	0.02	0.17	0.08	0.15	0.23	0.10	0.02	0.06	0.23	0.17	0.54	0.01	0.05	0.02	0.16	0.00	0.00	0.00
OP2	0.35	0.21	0.70	0.23	0.27	0.09	0.27	0.02	0.23	0.35	0.21	0.18	0.22	0.31	0.31	0.81	0.06	0.09	0.05	0.20	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.03	0.48	0.13	0.10	0.02	0.14	0.06	0.12	0.22	0.07	0.00	0.03	0.21	0.13	0.45	0.07	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.39	0.42	0.34	0.38	0.02	0.43	0.04	0.46	0.37	0.43	0.36	0.49	0.41	0.34	0.45	0.16	0.02	0.24	0.12	0.13	0.11
C2	0.34	0.51	0.51	0.37	0.49	0.09	0.56	0.12	0.60	0.49	0.57	0.46	0.66	0.55	0.44	0.54	0.06	0.11	0.29	0.14	0.02	0.20
C2'	0.27	0.17	0.05	0.08	0.19	0.46	0.18	0.45	0.16	0.22	0.16	0.19	0.14	0.20	0.22	0.00	0.17	0.51	0.27	0.33	0.52	0.33
C3'	0.22	0.31	0.02	0.10	0.25	0.22	0.23	0.17	0.25	0.18	0.29	0.29	0.24	0.19	0.21	0.08	0.10	0.35	0.06	0.12	0.24	0.13
C4	0.32	0.46	0.49	0.37	0.46	0.08	0.53	0.12	0.56	0.47	0.52	0.42	0.61	0.52	0.42	0.52	0.05	0.10	0.30	0.16	0.04	0.19
C4'	0.04	0.04	0.13	0.24	0.07	0.01	0.10	0.04	0.09	0.10	0.06	0.04	0.11	0.11	0.08	0.04	0.24	0.05	0.13	0.00	0.20	0.04
C5	0.30	0.44	0.47	0.31	0.45	0.07	0.52	0.12	0.55	0.47	0.51	0.40	0.61	0.53	0.41	0.48	0.06	0.09	0.28	0.14	0.03	0.19
C5'	0.09	0.10	0.09	0.08	0.07	0.04	0.06	0.02	0.07	0.06	0.09	0.10	0.06	0.06	0.07	0.26	0.16	0.10	0.00	0.16	0.34	0.21
C6	0.29	0.44	0.45	0.28	0.44	0.05	0.52	0.11	0.56	0.46	0.51	0.39	0.62	0.53	0.40	0.46	0.11	0.08	0.26	0.11	0.01	0.19
C8	0.30	0.42	0.48	0.35	0.43	0.07	0.49	0.12	0.52	0.45	0.48	0.39	0.56	0.50	0.40	0.48	0.01	0.09	0.30	0.16	0.06	0.18
N1	0.31	0.48	0.47	0.31	0.46	0.07	0.54	0.11	0.58	0.47	0.55	0.42	0.64	0.54	0.42	0.50	0.04	0.09	0.27	0.12	0.01	0.19
N2	0.35	0.53	0.52	0.38	0.51	0.10	0.57	0.12	0.62	0.50	0.60	0.48	0.68	0.56	0.45	0.56	0.09	0.11	0.29	0.14	0.02	0.20
N3	0.34	0.50	0.52	0.40	0.49	0.10	0.55	0.13	0.59	0.49	0.56	0.46	0.64	0.55	0.44	0.55	0.11	0.11	0.31	0.17	0.02	0.21
N7	0.29	0.42	0.45	0.30	0.43	0.06	0.50	0.13	0.53	0.46	0.48	0.38	0.58	0.51	0.40	0.45	0.12	0.09	0.29	0.15	0.04	0.19
N9	0.31	0.44	0.48	0.38	0.44	0.07	0.50	0.11	0.53	0.44	0.49	0.40	0.57	0.49	0.40	0.50	0.09	0.09	0.29	0.16	0.07	0.17
O2'	0.14	0.08	0.09	0.01	0.01	0.46	0.02	0.53	0.03	0.13	0.07	0.04	0.03	0.09	0.09	0.23	0.07	0.47	0.30	0.37	0.62	0.37
O3'	0.15	0.31	0.03	0.20	0.22	0.09	0.21	0.06	0.25	0.14	0.30	0.27	0.24	0.16	0.16	0.06	0.24	0.24	0.03	0.04	0.16	0.05
O4'	0.41	0.51	0.50	0.48	0.52	0.23	0.56	0.26	0.58	0.51	0.55	0.48	0.61	0.55	0.48	0.48	0.35	0.24	0.40	0.23	0.03	0.21
O5'	0.17	0.21	0.12	0.05	0.18	0.12	0.17	0.08	0.18	0.15	0.20	0.21	0.17	0.16	0.17	0.26	0.07	0.21	0.06	0.19	0.33	0.22
O6	0.26	0.42	0.41	0.22	0.42	0.04	0.50	0.10	0.54	0.45	0.49	0.37	0.61	0.52	0.37	0.41	0.18	0.08	0.24	0.08	0.00	0.18
OP1	0.44	0.43	0.39	0.20	0.46	0.33	0.47	0.31	0.47	0.48	0.45	0.42	0.47	0.48	0.46	0.48	0.02	0.44	0.32	0.35	0.47	0.42
OP2	0.06	0.01	0.13	0.21	0.04	0.07	0.05	0.08	0.04	0.07	0.02	0.01	0.05	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.09	0.03	0.17	0.04
P	0.14	0.14	0.13	0.01	0.14	0.13	0.15	0.12	0.14	0.16	0.14	0.14	0.14	0.16	0.15	0.25	0.01	0.17	0.12	0.24	0.40	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.15	0.00	0.13	0.12	0.07	0.02
C2	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.22	0.03	0.14	0.29	0.03	0.12
C2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.08	0.12	0.08	0.10	0.04	0.00	0.10	0.11	0.05	0.01	0.02	0.01	0.18	0.05	0.08	0.01
C3'	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.22	0.34	0.27
C4	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.18	0.03	0.14	0.28	0.05	0.13
C4'	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.19	0.11
C5	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.15	0.03	0.14	0.38	0.14	0.21
C5'	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.08	0.08	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.18	0.03	0.15	0.41	0.16	0.23
C8	0.02	0.00	0.10	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.20	0.07	0.05	0.14	0.34	0.14	0.21
N1	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.20	0.03	0.14	0.36	0.10	0.18
N3	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.22	0.02	0.13	0.24	0.01	0.08
N6	0.03	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.25	0.16	0.02	0.16	0.48	0.23	0.29
N7	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.23	0.09	0.04	0.13	0.42	0.20	0.26
N9	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.13	0.13	0.02	0.14	0.23	0.03	0.10
O2'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.15	0.04	0.21	0.08	0.21	0.20	0.16	0.07	0.25	0.23	0.13	0.00	0.03	0.04	0.19	0.08	0.11	0.01
O3'	0.15	0.22	0.02	0.00	0.18	0.01	0.15	0.08	0.18	0.07	0.20	0.22	0.16	0.09	0.13	0.03	0.00	0.09	0.10	0.33	0.57	0.40
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.09	0.00	0.09	0.12	0.08	0.01
O5'	0.13	0.14	0.18	0.04	0.14	0.01	0.14	0.00	0.15	0.14	0.14	0.13	0.16	0.13	0.14	0.19	0.10	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.12	0.29	0.05	0.22	0.28	0.03	0.38	0.04	0.41	0.34	0.36	0.24	0.48	0.42	0.23	0.08	0.33	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.03	0.08	0.34	0.05	0.19	0.14	0.03	0.16	0.14	0.10	0.01	0.23	0.20	0.03	0.11	0.57	0.08	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.12	0.01	0.27	0.13	0.11	0.21	0.01	0.23	0.21	0.18	0.08	0.29	0.26	0.10	0.01	0.40	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00