Doublet Group distance statistics: 50251

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 11, 23, 15, 5, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.010, 0.016, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.012, 0.019, 0.026, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.012, 0.023, 0.035, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.015, 0.026, 0.038, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.012, 0.023, 0.035, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.023, 0.035, 0.048, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.035 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.023, 0.037, 0.052, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.037 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.021, 0.036, 0.050, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.036 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.029, 0.048, 0.067, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.048 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.021, 0.044, 0.068, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.044 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.033, 0.060, 0.087, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.060 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.019, 0.079, 0.140, 0.397 max_d=0.397 avg_d=0.079 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.103, 0.173, 0.244, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.173 std_dev=0.070
C4'	A	0, 0.049, 0.149, 0.250, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.149 std_dev=0.101
O2'	A	0, 0.195, 0.299, 0.403, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.299 std_dev=0.104
C3'	A	0, 0.088, 0.199, 0.311, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.199 std_dev=0.111
O2'	B	0, 0.117, 0.244, 0.371, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.244 std_dev=0.127
O3'	A	0, 0.111, 0.273, 0.436, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.273 std_dev=0.163
C5'	A	0, 0.089, 0.262, 0.435, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.262 std_dev=0.173
C3'	B	0, 0.230, 0.411, 0.592, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.411 std_dev=0.181
O5'	A	0, 0.198, 0.387, 0.577, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.387 std_dev=0.190
C2'	B	0, 0.142, 0.340, 0.537, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.340 std_dev=0.198
O3'	B	0, 0.194, 0.424, 0.654, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.424 std_dev=0.230
P	A	0, 0.129, 0.377, 0.625, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.377 std_dev=0.248
OP2	A	0, 0.161, 0.427, 0.693, 2.165 max_d=2.165 avg_d=0.427 std_dev=0.266
C5'	B	0, 0.304, 0.573, 0.843, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.573 std_dev=0.270
C4'	B	0, 0.219, 0.522, 0.825, 2.317 max_d=2.317 avg_d=0.522 std_dev=0.303
OP2	B	0, 0.341, 0.671, 1.001, 2.306 max_d=2.306 avg_d=0.671 std_dev=0.330
O5'	B	0, 0.247, 0.584, 0.920, 2.695 max_d=2.695 avg_d=0.584 std_dev=0.337
OP1	A	0, 0.060, 0.412, 0.763, 2.882 max_d=2.882 avg_d=0.412 std_dev=0.351
P	B	0, 0.204, 0.595, 0.985, 2.865 max_d=2.865 avg_d=0.595 std_dev=0.391
C1'	B	0, -0.008, 0.468, 0.944, 2.913 max_d=2.913 avg_d=0.468 std_dev=0.476
O4'	B	0, 0.082, 0.561, 1.039, 3.060 max_d=3.060 avg_d=0.561 std_dev=0.479
OP1	B	0, 0.089, 0.719, 1.349, 4.564 max_d=4.564 avg_d=0.719 std_dev=0.630
N1	B	0, -0.241, 0.512, 1.264, 4.714 max_d=4.714 avg_d=0.512 std_dev=0.752
C6	B	0, -0.284, 0.587, 1.457, 5.744 max_d=5.744 avg_d=0.587 std_dev=0.871
O2	B	0, -0.442, 0.545, 1.532, 5.844 max_d=5.844 avg_d=0.545 std_dev=0.987
C2	B	0, -0.459, 0.534, 1.527, 5.914 max_d=5.914 avg_d=0.534 std_dev=0.993
C5	B	0, -0.513, 0.686, 1.886, 7.652 max_d=7.652 avg_d=0.686 std_dev=1.199
N3	B	0, -0.667, 0.616, 1.899, 7.581 max_d=7.581 avg_d=0.616 std_dev=1.283
C4	B	0, -0.688, 0.696, 2.080, 8.389 max_d=8.389 avg_d=0.696 std_dev=1.384
N4	B	0, -0.879, 0.828, 2.535, 10.228 max_d=10.228 avg_d=0.828 std_dev=1.707

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.04
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.09	0.01	0.11	0.17	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.07	0.04
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.08	0.09	0.07	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.08	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.08	0.01	0.09	0.13	0.09
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.09	0.01	0.11	0.16	0.11
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.07	0.06	0.05	0.04	0.08	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.10	0.00	0.13	0.18	0.13
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.08	0.01	0.09	0.10	0.09
N1	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.10	0.00	0.13	0.18	0.12
N2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.02	0.09	0.01	0.12	0.17	0.11
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.08	0.01	0.09	0.14	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.11	0.14	0.11
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.07	0.10	0.07
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.03	0.07	0.06	0.03
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.10	0.12	0.08	0.06	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.08	0.11	0.09	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05
O5'	0.03	0.09	0.03	0.04	0.08	0.01	0.09	0.01	0.10	0.08	0.10	0.09	0.08	0.10	0.06	0.02	0.05	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.11	0.00	0.14	0.20	0.14
OP1	0.04	0.11	0.07	0.08	0.09	0.04	0.11	0.04	0.13	0.09	0.13	0.12	0.09	0.11	0.07	0.07	0.11	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.17	0.07	0.07	0.13	0.02	0.16	0.01	0.18	0.10	0.18	0.17	0.14	0.14	0.10	0.06	0.09	0.05	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.11	0.04	0.05	0.09	0.01	0.11	0.01	0.13	0.09	0.12	0.11	0.09	0.11	0.07	0.03	0.07	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.25	0.17	0.09	0.35	0.11	0.36	0.11	0.31	0.24	0.31	0.39	0.24	0.14	0.08	0.16	0.09	0.17	0.21	0.16
C2	0.37	0.69	0.23	0.13	0.93	0.18	0.81	0.17	0.64	0.57	0.88	1.08	0.62	0.15	0.09	0.32	0.17	0.23	0.20	0.16
C2'	0.14	0.22	0.17	0.08	0.38	0.08	0.41	0.09	0.34	0.23	0.30	0.44	0.20	0.14	0.05	0.12	0.12	0.09	0.20	0.11
C3'	0.08	0.13	0.15	0.06	0.29	0.05	0.35	0.07	0.29	0.15	0.19	0.35	0.17	0.15	0.05	0.07	0.13	0.07	0.20	0.08
C4	0.33	0.58	0.22	0.12	0.77	0.17	0.69	0.15	0.56	0.50	0.72	0.86	0.51	0.15	0.09	0.28	0.14	0.21	0.20	0.16
C4'	0.06	0.11	0.10	0.04	0.11	0.04	0.17	0.05	0.15	0.05	0.09	0.13	0.24	0.11	0.06	0.06	0.07	0.08	0.20	0.12
C5	0.39	0.72	0.24	0.14	0.95	0.19	0.85	0.17	0.68	0.61	0.90	1.06	0.63	0.15	0.10	0.34	0.17	0.22	0.20	0.16
C5'	0.10	0.17	0.09	0.04	0.08	0.05	0.12	0.05	0.11	0.08	0.13	0.09	0.31	0.12	0.06	0.09	0.07	0.07	0.20	0.11
C6	0.44	0.84	0.25	0.15	1.14	0.22	0.99	0.19	0.77	0.69	1.07	1.31	0.74	0.15	0.11	0.38	0.20	0.24	0.20	0.17
C8	0.29	0.47	0.22	0.12	0.60	0.15	0.57	0.13	0.49	0.43	0.56	0.64	0.39	0.14	0.09	0.24	0.12	0.18	0.21	0.17
N1	0.42	0.81	0.24	0.15	1.09	0.21	0.94	0.19	0.73	0.66	1.03	1.28	0.72	0.15	0.10	0.37	0.19	0.24	0.20	0.17
N2	0.37	0.68	0.23	0.13	0.93	0.18	0.81	0.17	0.63	0.56	0.87	1.09	0.62	0.15	0.09	0.32	0.17	0.23	0.20	0.16
N3	0.32	0.58	0.22	0.12	0.77	0.16	0.69	0.15	0.55	0.49	0.72	0.88	0.52	0.15	0.09	0.28	0.14	0.21	0.19	0.16
N7	0.38	0.67	0.24	0.14	0.87	0.19	0.80	0.16	0.67	0.59	0.81	0.93	0.57	0.14	0.10	0.32	0.16	0.21	0.20	0.16
N9	0.26	0.43	0.20	0.11	0.56	0.14	0.53	0.13	0.45	0.38	0.52	0.62	0.37	0.14	0.08	0.22	0.12	0.18	0.20	0.16
O2'	0.13	0.18	0.15	0.07	0.28	0.08	0.32	0.08	0.26	0.17	0.22	0.33	0.22	0.14	0.06	0.11	0.10	0.11	0.20	0.13
O3'	0.07	0.09	0.13	0.06	0.24	0.06	0.31	0.07	0.25	0.11	0.13	0.30	0.21	0.15	0.07	0.07	0.14	0.10	0.20	0.08
O4'	0.12	0.14	0.14	0.09	0.16	0.10	0.19	0.09	0.18	0.12	0.14	0.18	0.20	0.12	0.09	0.12	0.08	0.16	0.22	0.18
O5'	0.07	0.10	0.13	0.05	0.22	0.03	0.28	0.06	0.24	0.12	0.14	0.25	0.18	0.15	0.01	0.05	0.13	0.09	0.20	0.09
O6	0.48	0.93	0.25	0.16	1.30	0.24	1.12	0.21	0.85	0.76	1.19	1.51	0.81	0.14	0.12	0.42	0.22	0.25	0.21	0.17
OP1	0.11	0.14	0.04	0.02	0.09	0.08	0.17	0.08	0.13	0.05	0.09	0.11	0.28	0.09	0.01	0.12	0.16	0.24	0.17	0.08
OP2	0.04	0.12	0.07	0.03	0.34	0.05	0.41	0.06	0.34	0.17	0.21	0.39	0.10	0.11	0.02	0.04	0.21	0.20	0.20	0.10
P	0.05	0.07	0.06	0.01	0.17	0.04	0.24	0.05	0.21	0.06	0.07	0.20	0.19	0.09	0.00	0.05	0.16	0.17	0.18	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.13	0.18	0.11	0.13
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.13	0.03	0.13	0.23	0.16	0.10
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.02	0.05	0.06	0.08	0.00	0.01	0.01	0.15	0.25	0.24	0.26
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.15	0.06	0.07	0.13	0.07	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.20	0.10
C4	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.04	0.02	0.14	0.29	0.33	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.04	0.06	0.03	0.08	0.02	0.00	0.01	0.06	0.15	0.04
C5	0.01	0.00	0.05	0.16	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.15	0.30	0.34	0.14
C5'	0.03	0.08	0.06	0.01	0.12	0.00	0.14	0.00	0.12	0.08	0.10	0.13	0.06	0.03	0.06	0.02	0.00	0.11	0.17	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.15	0.27	0.22	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.14	0.23	0.13	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.09	0.03	0.14	0.26	0.25	0.10
N4	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.05	0.03	0.14	0.30	0.40	0.14
O2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.23	0.04	0.13	0.20	0.13	0.11
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.11	0.08	0.09	0.03	0.07	0.07	0.13	0.12	0.16	0.00	0.03	0.05	0.12	0.25	0.28	0.27
O3'	0.11	0.13	0.01	0.00	0.04	0.02	0.09	0.06	0.08	0.06	0.09	0.05	0.23	0.03	0.00	0.08	0.11	0.13	0.16	0.05
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.08	0.00	0.12	0.10	0.11	0.09
O5'	0.13	0.13	0.15	0.05	0.14	0.01	0.15	0.00	0.15	0.14	0.14	0.14	0.13	0.12	0.11	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.18	0.23	0.25	0.04	0.29	0.06	0.30	0.11	0.27	0.23	0.26	0.30	0.20	0.25	0.13	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.16	0.24	0.20	0.33	0.15	0.34	0.17	0.22	0.13	0.25	0.40	0.13	0.28	0.16	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.10	0.26	0.10	0.12	0.04	0.14	0.01	0.12	0.10	0.10	0.14	0.11	0.27	0.05	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00