Doublet Group distance statistics: 50254

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 8, 13, 13, 10, 6, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.012, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.008, 0.015, 0.021, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.016, 0.028, 0.039, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.028 std_dev=0.011
O6	A	0, 0.023, 0.037, 0.052, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.037 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.025 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.012, 0.031, 0.050, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.031 std_dev=0.019
C2'	A	0, 0.040, 0.069, 0.097, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.069 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.025, 0.057, 0.089, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.057 std_dev=0.032
O2'	A	0, 0.089, 0.140, 0.191, 0.282 max_d=0.282 avg_d=0.140 std_dev=0.051
C4'	A	0, 0.038, 0.101, 0.163, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.101 std_dev=0.062
C3'	A	0, 0.035, 0.104, 0.172, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.104 std_dev=0.069
C5'	A	0, 0.076, 0.166, 0.256, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.166 std_dev=0.090
O5'	A	0, 0.096, 0.204, 0.311, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.204 std_dev=0.107
P	A	0, 0.151, 0.265, 0.380, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.265 std_dev=0.115
O3'	B	0, 0.196, 0.318, 0.441, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.318 std_dev=0.123
OP2	A	0, 0.136, 0.259, 0.383, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.259 std_dev=0.123
O3'	A	0, 0.043, 0.173, 0.303, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.173 std_dev=0.130
O2'	B	0, 0.221, 0.380, 0.540, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.380 std_dev=0.160
C3'	B	0, 0.153, 0.328, 0.503, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.328 std_dev=0.175
OP1	A	0, 0.155, 0.331, 0.506, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.331 std_dev=0.175
C2'	B	0, 0.125, 0.333, 0.541, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.333 std_dev=0.208
C4'	B	0, 0.103, 0.326, 0.548, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.326 std_dev=0.222
C1'	B	0, 0.087, 0.343, 0.600, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.343 std_dev=0.256
O4'	B	0, 0.096, 0.365, 0.635, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.365 std_dev=0.270
C5'	B	0, 0.155, 0.458, 0.762, 2.254 max_d=2.254 avg_d=0.458 std_dev=0.303
N1	B	0, 0.014, 0.360, 0.707, 2.524 max_d=2.524 avg_d=0.360 std_dev=0.347
O5'	B	0, 0.214, 0.563, 0.912, 2.706 max_d=2.706 avg_d=0.563 std_dev=0.349
C6	B	0, 0.046, 0.420, 0.795, 2.725 max_d=2.725 avg_d=0.420 std_dev=0.374
O2	B	0, -0.064, 0.344, 0.752, 2.979 max_d=2.979 avg_d=0.344 std_dev=0.408
C2	B	0, -0.067, 0.362, 0.790, 3.156 max_d=3.156 avg_d=0.362 std_dev=0.428
P	B	0, 0.377, 0.831, 1.285, 3.702 max_d=3.702 avg_d=0.831 std_dev=0.454
C5	B	0, -0.010, 0.457, 0.925, 3.460 max_d=3.460 avg_d=0.457 std_dev=0.467
OP1	B	0, 1.039, 1.512, 1.986, 3.714 max_d=3.714 avg_d=1.512 std_dev=0.474
OP2	B	0, 1.830, 2.351, 2.871, 5.046 max_d=5.046 avg_d=2.351 std_dev=0.520
N3	B	0, -0.105, 0.430, 0.965, 3.993 max_d=3.993 avg_d=0.430 std_dev=0.535
C4	B	0, -0.090, 0.461, 1.013, 4.126 max_d=4.126 avg_d=0.461 std_dev=0.551
N4	B	0, -0.124, 0.535, 1.194, 4.962 max_d=4.962 avg_d=0.535 std_dev=0.659

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.04
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.07	0.01	0.05	0.10	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.08	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.05	0.07	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.07	0.01	0.05	0.09	0.05
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.10	0.01	0.07	0.10	0.07
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.06	0.05	0.03	0.03	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.10	0.00	0.08	0.11	0.08
C8	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.06	0.09	0.06
N1	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.09	0.01	0.07	0.11	0.07
N2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.06	0.01	0.05	0.09	0.05
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.06	0.01	0.05	0.09	0.05
N7	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.11	0.01	0.08	0.11	0.08
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.05	0.08	0.05
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.05	0.08	0.09	0.07	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.07	0.06	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.02	0.06	0.07	0.06
O5'	0.04	0.07	0.03	0.04	0.07	0.01	0.10	0.01	0.10	0.10	0.09	0.06	0.06	0.11	0.07	0.03	0.05	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.12	0.00	0.10	0.13	0.09
OP1	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.07	0.04	0.08	0.06	0.07	0.05	0.05	0.08	0.05	0.05	0.07	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.10	0.08	0.07	0.09	0.04	0.10	0.02	0.11	0.09	0.11	0.09	0.09	0.11	0.08	0.06	0.06	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.02	0.07	0.01	0.08	0.06	0.07	0.05	0.05	0.08	0.05	0.03	0.05	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.28	0.17	0.13	0.31	0.11	0.27	0.10	0.23	0.23	0.31	0.33	0.27	0.12	0.10	0.14	0.12	0.11	0.14	0.11
C2	0.25	0.41	0.18	0.15	0.47	0.16	0.40	0.17	0.34	0.34	0.48	0.51	0.40	0.12	0.11	0.23	0.22	0.18	0.27	0.23
C2'	0.16	0.29	0.15	0.11	0.34	0.09	0.29	0.08	0.24	0.23	0.35	0.38	0.29	0.11	0.09	0.12	0.10	0.11	0.13	0.09
C3'	0.13	0.26	0.12	0.08	0.31	0.07	0.27	0.08	0.21	0.20	0.31	0.35	0.25	0.09	0.07	0.09	0.08	0.12	0.11	0.07
C4	0.24	0.38	0.18	0.15	0.42	0.15	0.37	0.15	0.32	0.31	0.43	0.44	0.36	0.12	0.11	0.21	0.20	0.16	0.23	0.20
C4'	0.09	0.18	0.09	0.06	0.22	0.07	0.19	0.09	0.15	0.14	0.22	0.25	0.18	0.09	0.06	0.07	0.07	0.13	0.09	0.07
C5	0.25	0.40	0.17	0.15	0.46	0.17	0.40	0.18	0.35	0.34	0.46	0.48	0.36	0.12	0.11	0.23	0.23	0.20	0.28	0.24
C5'	0.05	0.12	0.06	0.03	0.16	0.08	0.14	0.11	0.10	0.09	0.16	0.19	0.12	0.08	0.05	0.06	0.08	0.16	0.11	0.10
C6	0.26	0.43	0.17	0.16	0.51	0.18	0.45	0.21	0.38	0.36	0.52	0.56	0.39	0.13	0.11	0.25	0.26	0.24	0.32	0.28
C8	0.19	0.29	0.16	0.14	0.33	0.14	0.31	0.14	0.28	0.26	0.33	0.35	0.26	0.12	0.10	0.17	0.18	0.16	0.20	0.18
N1	0.26	0.43	0.17	0.15	0.51	0.17	0.44	0.19	0.37	0.35	0.52	0.56	0.41	0.12	0.10	0.25	0.25	0.22	0.31	0.27
N2	0.26	0.41	0.18	0.15	0.47	0.16	0.40	0.17	0.34	0.34	0.48	0.52	0.40	0.12	0.11	0.23	0.22	0.17	0.27	0.23
N3	0.24	0.39	0.19	0.15	0.43	0.15	0.37	0.15	0.32	0.32	0.44	0.47	0.38	0.12	0.11	0.21	0.19	0.15	0.23	0.20
N7	0.22	0.34	0.16	0.15	0.40	0.17	0.38	0.19	0.33	0.31	0.39	0.42	0.29	0.13	0.11	0.21	0.23	0.21	0.26	0.24
N9	0.21	0.32	0.18	0.14	0.35	0.13	0.32	0.13	0.28	0.28	0.36	0.37	0.31	0.11	0.11	0.18	0.17	0.14	0.19	0.16
O2'	0.16	0.28	0.16	0.11	0.32	0.09	0.27	0.09	0.22	0.22	0.33	0.35	0.28	0.12	0.08	0.12	0.09	0.11	0.11	0.08
O3'	0.11	0.26	0.11	0.07	0.33	0.07	0.28	0.09	0.21	0.20	0.33	0.38	0.25	0.08	0.07	0.07	0.07	0.14	0.11	0.07
O4'	0.12	0.19	0.13	0.11	0.22	0.09	0.20	0.09	0.17	0.16	0.22	0.24	0.19	0.10	0.10	0.10	0.09	0.11	0.10	0.08
O5'	0.08	0.17	0.09	0.05	0.20	0.02	0.18	0.05	0.15	0.14	0.20	0.22	0.16	0.08	0.01	0.04	0.06	0.11	0.10	0.06
O6	0.26	0.43	0.16	0.16	0.55	0.20	0.48	0.23	0.39	0.36	0.54	0.61	0.37	0.14	0.11	0.26	0.28	0.27	0.36	0.32
OP1	0.07	0.06	0.03	0.06	0.08	0.13	0.09	0.17	0.08	0.06	0.07	0.09	0.06	0.05	0.01	0.12	0.16	0.22	0.22	0.19
OP2	0.06	0.09	0.07	0.04	0.12	0.07	0.13	0.12	0.11	0.08	0.11	0.13	0.10	0.08	0.02	0.07	0.12	0.15	0.11	0.12
P	0.02	0.07	0.03	0.01	0.09	0.04	0.09	0.07	0.07	0.05	0.09	0.11	0.07	0.04	0.00	0.02	0.07	0.11	0.11	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.05	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.09	0.10	0.13	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.06	0.05	0.03
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.14	0.17	0.21	0.17
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.15	0.17	0.21	0.17
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.07	0.10	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.13	0.13	0.15	0.13
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.09	0.09	0.11	0.09
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.12	0.13	0.18	0.14
N4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.15	0.19	0.24	0.19
O2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02	0.07	0.08	0.11	0.09
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.00	0.04	0.03	0.03	0.07	0.05	0.03
O3'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.05	0.07	0.05	0.04	0.00	0.01	0.06	0.11	0.09	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.07	0.06
O5'	0.04	0.09	0.02	0.03	0.14	0.01	0.15	0.00	0.13	0.09	0.12	0.15	0.07	0.03	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.10	0.06	0.07	0.17	0.05	0.17	0.04	0.13	0.09	0.13	0.19	0.08	0.07	0.11	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.13	0.05	0.06	0.21	0.02	0.21	0.02	0.15	0.11	0.18	0.24	0.11	0.05	0.09	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.11	0.03	0.04	0.17	0.01	0.17	0.01	0.13	0.09	0.14	0.19	0.09	0.03	0.07	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00