Doublet Group distance statistics: 50255

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 12, 6, 12, 8, 4, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.003
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.016 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.016, 0.027, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.027 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.012, 0.023, 0.035, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.025 std_dev=0.017
O4'	A	0, 0.049, 0.104, 0.158, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.104 std_dev=0.054
O3'	A	0, 0.144, 0.212, 0.280, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.212 std_dev=0.068
C4'	A	0, 0.097, 0.166, 0.235, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.166 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.038, 0.111, 0.183, 0.320 max_d=0.320 avg_d=0.111 std_dev=0.073
C3'	A	0, 0.055, 0.132, 0.209, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.132 std_dev=0.077
O2'	A	0, 0.070, 0.198, 0.326, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.198 std_dev=0.128
C5'	A	0, 0.141, 0.278, 0.416, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.278 std_dev=0.137
C4'	B	0, 0.168, 0.342, 0.516, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.342 std_dev=0.174
O4'	B	0, 0.179, 0.357, 0.536, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.357 std_dev=0.179
C3'	B	0, 0.194, 0.379, 0.564, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.379 std_dev=0.185
O3'	B	0, 0.154, 0.366, 0.578, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.366 std_dev=0.212
C2'	B	0, 0.210, 0.431, 0.652, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.431 std_dev=0.221
O2'	B	0, 0.222, 0.444, 0.666, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.444 std_dev=0.222
C5'	B	0, 0.084, 0.350, 0.615, 1.893 max_d=1.893 avg_d=0.350 std_dev=0.265
C1'	B	0, 0.126, 0.414, 0.702, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.414 std_dev=0.288
O5'	A	0, 0.035, 0.399, 0.763, 1.968 max_d=1.968 avg_d=0.399 std_dev=0.364
O5'	B	0, 0.020, 0.390, 0.760, 2.731 max_d=2.731 avg_d=0.390 std_dev=0.370
N1	B	0, 0.052, 0.505, 0.957, 3.363 max_d=3.363 avg_d=0.505 std_dev=0.452
C6	B	0, 0.036, 0.566, 1.097, 3.994 max_d=3.994 avg_d=0.566 std_dev=0.531
OP1	B	0, 0.095, 0.631, 1.167, 3.861 max_d=3.861 avg_d=0.631 std_dev=0.536
P	B	0, -0.086, 0.491, 1.067, 4.276 max_d=4.276 avg_d=0.491 std_dev=0.577
P	A	0, -0.226, 0.385, 0.996, 4.481 max_d=4.481 avg_d=0.385 std_dev=0.611
C2	B	0, -0.049, 0.570, 1.188, 4.618 max_d=4.618 avg_d=0.570 std_dev=0.619
OP1	A	0, -0.063, 0.594, 1.251, 4.888 max_d=4.888 avg_d=0.594 std_dev=0.657
O2	B	0, -0.099, 0.567, 1.233, 4.958 max_d=4.958 avg_d=0.567 std_dev=0.666
C5	B	0, -0.049, 0.680, 1.408, 5.487 max_d=5.487 avg_d=0.680 std_dev=0.729
OP2	A	0, -0.271, 0.471, 1.213, 5.474 max_d=5.474 avg_d=0.471 std_dev=0.742
N3	B	0, -0.106, 0.677, 1.459, 5.862 max_d=5.862 avg_d=0.677 std_dev=0.783
C4	B	0, -0.102, 0.727, 1.557, 6.223 max_d=6.223 avg_d=0.727 std_dev=0.829
OP2	B	0, -0.405, 0.553, 1.510, 7.121 max_d=7.121 avg_d=0.553 std_dev=0.957
N4	B	0, -0.175, 0.853, 1.881, 7.679 max_d=7.679 avg_d=0.853 std_dev=1.028

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.18	0.01	0.21	0.14	0.15
C2	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.06	0.06	0.25	0.01	0.27	0.16	0.23
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.03	0.18	0.20	0.16
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.12	0.24	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.03	0.28	0.01	0.31	0.20	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.18	0.18	0.06
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.02	0.34	0.01	0.41	0.29	0.37
C5'	0.04	0.06	0.04	0.02	0.07	0.00	0.09	0.00	0.09	0.10	0.08	0.06	0.06	0.10	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.10	0.11	0.14	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.34	0.00	0.41	0.29	0.37
C8	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.03	0.35	0.01	0.44	0.33	0.40
N1	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.04	0.30	0.00	0.34	0.22	0.31
N2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.07	0.07	0.22	0.01	0.23	0.13	0.18
N3	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.06	0.05	0.23	0.01	0.24	0.14	0.20
N7	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.02	0.37	0.01	0.49	0.37	0.44
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.28	0.01	0.31	0.21	0.27
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.05	0.06	0.07	0.12	0.09	0.06	0.03	0.00	0.04	0.01	0.14	0.06	0.17	0.21	0.17
O3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.04	0.03	0.04	0.00	0.03	0.07	0.04	0.20	0.33	0.14
O4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.14	0.02	0.23	0.11	0.10
O5'	0.18	0.25	0.15	0.06	0.28	0.01	0.34	0.01	0.34	0.35	0.30	0.22	0.23	0.37	0.28	0.14	0.07	0.14	0.00	0.36	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02	0.36	0.00	0.47	0.35	0.42
OP1	0.21	0.27	0.18	0.12	0.31	0.18	0.41	0.11	0.41	0.44	0.34	0.23	0.24	0.49	0.31	0.17	0.20	0.23	0.01	0.47	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.16	0.20	0.24	0.20	0.18	0.29	0.14	0.29	0.33	0.22	0.13	0.14	0.37	0.21	0.21	0.33	0.11	0.02	0.35	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.23	0.16	0.06	0.28	0.06	0.37	0.01	0.37	0.40	0.31	0.18	0.20	0.44	0.27	0.17	0.14	0.10	0.00	0.42	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.43	0.17	0.09	0.39	0.10	0.29	0.27	0.25	0.32	0.46	0.42	0.50	0.21	0.11	0.13	0.28	0.23	0.61	0.37
C2	0.30	0.60	0.17	0.08	0.60	0.08	0.46	0.25	0.38	0.43	0.67	0.66	0.67	0.16	0.09	0.17	0.22	0.33	0.56	0.34
C2'	0.27	0.42	0.20	0.13	0.41	0.15	0.33	0.25	0.29	0.33	0.45	0.44	0.44	0.25	0.14	0.16	0.22	0.14	0.47	0.28
C3'	0.21	0.34	0.15	0.11	0.32	0.14	0.24	0.26	0.20	0.25	0.36	0.34	0.38	0.21	0.13	0.12	0.27	0.14	0.54	0.33
C4	0.29	0.53	0.16	0.07	0.49	0.08	0.38	0.26	0.32	0.38	0.57	0.53	0.61	0.17	0.09	0.16	0.24	0.30	0.58	0.35
C4'	0.17	0.28	0.10	0.08	0.21	0.11	0.13	0.28	0.11	0.18	0.28	0.23	0.35	0.16	0.10	0.07	0.35	0.22	0.67	0.43
C5	0.30	0.54	0.17	0.08	0.48	0.08	0.37	0.25	0.31	0.39	0.56	0.51	0.64	0.15	0.09	0.17	0.22	0.32	0.54	0.33
C5'	0.09	0.15	0.05	0.08	0.09	0.12	0.07	0.28	0.06	0.08	0.14	0.09	0.23	0.10	0.07	0.06	0.37	0.19	0.66	0.43
C6	0.30	0.59	0.18	0.10	0.55	0.09	0.43	0.23	0.36	0.42	0.64	0.59	0.69	0.14	0.10	0.19	0.19	0.35	0.50	0.31
C8	0.27	0.41	0.16	0.08	0.34	0.08	0.25	0.27	0.22	0.30	0.41	0.35	0.49	0.17	0.10	0.14	0.26	0.26	0.57	0.35
N1	0.30	0.61	0.17	0.09	0.61	0.09	0.47	0.24	0.38	0.44	0.69	0.66	0.70	0.15	0.09	0.19	0.20	0.35	0.52	0.32
N2	0.30	0.62	0.17	0.08	0.64	0.09	0.50	0.25	0.40	0.44	0.71	0.71	0.68	0.17	0.09	0.17	0.21	0.33	0.56	0.34
N3	0.29	0.56	0.16	0.07	0.55	0.08	0.42	0.26	0.35	0.41	0.62	0.60	0.63	0.17	0.09	0.16	0.24	0.30	0.58	0.36
N7	0.29	0.46	0.17	0.09	0.39	0.07	0.29	0.25	0.26	0.34	0.46	0.40	0.56	0.14	0.10	0.17	0.23	0.30	0.53	0.33
N9	0.28	0.46	0.16	0.07	0.41	0.09	0.31	0.27	0.26	0.34	0.48	0.43	0.54	0.19	0.10	0.14	0.26	0.26	0.59	0.36
O2'	0.35	0.53	0.27	0.18	0.56	0.18	0.48	0.24	0.42	0.44	0.58	0.61	0.54	0.32	0.17	0.22	0.18	0.13	0.39	0.23
O3'	0.24	0.40	0.17	0.11	0.39	0.14	0.29	0.26	0.24	0.30	0.43	0.42	0.44	0.24	0.13	0.13	0.28	0.16	0.57	0.35
O4'	0.22	0.35	0.14	0.11	0.28	0.11	0.19	0.29	0.16	0.24	0.35	0.29	0.43	0.19	0.14	0.10	0.36	0.28	0.72	0.46
O5'	0.21	0.16	0.27	0.33	0.20	0.39	0.25	0.53	0.26	0.21	0.16	0.19	0.13	0.19	0.32	0.32	0.56	0.34	0.76	0.57
O6	0.30	0.59	0.19	0.12	0.56	0.11	0.43	0.21	0.36	0.42	0.64	0.60	0.69	0.14	0.11	0.21	0.17	0.37	0.45	0.29
OP1	0.58	0.54	0.61	0.70	0.67	0.73	0.75	0.90	0.75	0.63	0.57	0.68	0.43	0.45	0.57	0.70	1.06	0.78	1.26	1.08
OP2	0.63	0.60	0.70	0.75	0.70	0.71	0.77	0.80	0.77	0.67	0.62	0.70	0.51	0.52	0.66	0.70	0.94	0.67	1.03	0.93
P	0.56	0.52	0.62	0.69	0.60	0.69	0.66	0.79	0.66	0.59	0.53	0.59	0.45	0.48	0.64	0.65	0.89	0.59	1.01	0.87

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.05	0.11	0.10	0.05
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.04	0.09	0.17	0.20	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.03	0.04	0.07	0.00	0.02	0.01	0.08	0.15	0.14	0.10
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02	0.09	0.23	0.27	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.06	0.09	0.02	0.00	0.02	0.07	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.06	0.04	0.09	0.23	0.27	0.10
C5'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.03	0.04	0.04	0.08	0.06	0.05	0.02	0.01	0.06	0.13	0.02
C6	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.05	0.04	0.09	0.19	0.23	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.07	0.16	0.18	0.07
N3	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.09	0.20	0.24	0.08
N4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.05	0.02	0.09	0.25	0.30	0.09
O2	0.02	0.00	0.07	0.04	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.07	0.07	0.11	0.15	0.17	0.10
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.09	0.09	0.14	0.06	0.13	0.05	0.05	0.11	0.12	0.00	0.05	0.05	0.05	0.15	0.09	0.07
O3'	0.04	0.05	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.05	0.03	0.04	0.05	0.07	0.05	0.00	0.02	0.10	0.14	0.18	0.08
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.07	0.05	0.02	0.00	0.06	0.14	0.07	0.06
O5'	0.05	0.09	0.08	0.04	0.09	0.02	0.09	0.01	0.09	0.07	0.09	0.09	0.11	0.05	0.10	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.17	0.15	0.13	0.23	0.07	0.23	0.06	0.19	0.16	0.20	0.25	0.15	0.15	0.14	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.20	0.14	0.06	0.27	0.08	0.27	0.13	0.23	0.18	0.24	0.30	0.17	0.09	0.18	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.10	0.04	0.09	0.02	0.10	0.02	0.09	0.07	0.08	0.09	0.10	0.07	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00