Doublet Group distance statistics: 50268

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.003, 0.028, 0.054, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.028 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.012, 0.041, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.041 std_dev=0.029
C3'	B	0, 0.105, 0.365, 0.626, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.365 std_dev=0.261
C2'	B	0, 0.201, 0.498, 0.795, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.498 std_dev=0.297
O4'	A	0, 0.256, 0.607, 0.958, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.607 std_dev=0.351
O2'	B	0, 0.255, 0.617, 0.979, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.617 std_dev=0.362
C2'	A	0, 0.266, 0.642, 1.018, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.642 std_dev=0.376
O3'	B	0, 0.176, 0.569, 0.963, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.569 std_dev=0.393
P	A	0, 0.303, 0.722, 1.140, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.722 std_dev=0.419
OP2	A	0, 0.320, 0.758, 1.196, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.758 std_dev=0.438
C1'	B	0, 0.198, 0.680, 1.162, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.680 std_dev=0.482
C4'	B	0, 0.072, 0.561, 1.050, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.561 std_dev=0.489
OP1	A	0, 0.359, 0.849, 1.340, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.849 std_dev=0.491
C5'	B	0, 0.159, 0.668, 1.178, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.668 std_dev=0.510
O5'	A	0, 0.413, 0.979, 1.545, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.979 std_dev=0.566
O4'	B	0, 0.145, 0.760, 1.375, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.760 std_dev=0.615
O2'	A	0, 0.474, 1.122, 1.770, 1.537 max_d=1.537 avg_d=1.122 std_dev=0.648
C4'	A	0, 0.479, 1.140, 1.802, 1.584 max_d=1.584 avg_d=1.140 std_dev=0.661
C5'	A	0, 0.491, 1.171, 1.851, 1.652 max_d=1.652 avg_d=1.171 std_dev=0.680
N1	B	0, 0.121, 0.829, 1.536, 1.957 max_d=1.957 avg_d=0.829 std_dev=0.708
O2	B	0, 0.095, 0.815, 1.534, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.815 std_dev=0.719
C2	B	0, 0.049, 0.833, 1.617, 2.121 max_d=2.121 avg_d=0.833 std_dev=0.784
C3'	A	0, 0.581, 1.380, 2.179, 1.891 max_d=1.891 avg_d=1.380 std_dev=0.799
C6	B	0, 0.090, 1.024, 1.959, 2.547 max_d=2.547 avg_d=1.024 std_dev=0.934
N3	B	0, -0.070, 0.963, 1.996, 2.706 max_d=2.706 avg_d=0.963 std_dev=1.033
O5'	B	0, -0.102, 0.980, 2.063, 2.814 max_d=2.814 avg_d=0.980 std_dev=1.082
C5	B	0, 0.011, 1.158, 2.306, 3.067 max_d=3.067 avg_d=1.158 std_dev=1.148
P	B	0, -0.126, 1.033, 2.192, 3.000 max_d=3.000 avg_d=1.033 std_dev=1.159
C4	B	0, -0.079, 1.093, 2.265, 3.070 max_d=3.070 avg_d=1.093 std_dev=1.172
OP2	B	0, -0.028, 1.147, 2.322, 3.114 max_d=3.114 avg_d=1.147 std_dev=1.175
OP1	B	0, 0.033, 1.295, 2.557, 3.387 max_d=3.387 avg_d=1.295 std_dev=1.262
N4	B	0, -0.169, 1.224, 2.618, 3.594 max_d=3.594 avg_d=1.224 std_dev=1.394
O3'	A	0, 1.018, 2.414, 3.810, 3.295 max_d=3.295 avg_d=2.414 std_dev=1.396

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.00	0.01	0.02	0.18	0.00	0.15	0.01	0.13	0.37	0.21
C2	0.03	0.00	0.14	0.11	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.14	0.07	0.21	0.02	0.12	0.27	0.14
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.11	0.07	0.05	0.11	0.17	0.14	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.05	0.23	0.49	0.30
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.13	0.01	0.19	0.02	0.20	0.20	0.15	0.09	0.09	0.23	0.13	0.03	0.01	0.01	0.04	0.23	0.04	0.42	0.21
C4	0.02	0.00	0.08	0.13	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.04	0.22	0.01	0.13	0.30	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.07	0.13	0.02	0.07	0.04	0.13	0.05	0.15	0.03	0.00	0.01	0.10	0.03	0.24	0.11
C5	0.00	0.01	0.04	0.19	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.05	0.03	0.30	0.01	0.12	0.22	0.10
C5'	0.05	0.07	0.11	0.02	0.09	0.01	0.15	0.00	0.16	0.18	0.11	0.05	0.05	0.20	0.09	0.06	0.09	0.01	0.00	0.20	0.12	0.04	0.02
C6	0.01	0.02	0.07	0.20	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.17	0.04	0.04	0.31	0.00	0.11	0.17	0.08
C8	0.01	0.00	0.05	0.20	0.01	0.13	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.12	0.04	0.31	0.03	0.12	0.28	0.12
N1	0.02	0.01	0.11	0.15	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.17	0.05	0.06	0.27	0.02	0.12	0.21	0.10
N2	0.05	0.00	0.17	0.09	0.01	0.07	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.21	0.09	0.18	0.04	0.13	0.29	0.15
N3	0.04	0.00	0.14	0.09	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.17	0.07	0.18	0.02	0.14	0.32	0.17
N7	0.00	0.01	0.02	0.23	0.00	0.13	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.14	0.02	0.35	0.03	0.12	0.18	0.08
N9	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.05	0.01	0.21	0.02	0.13	0.33	0.17
O2'	0.02	0.17	0.00	0.03	0.12	0.15	0.15	0.06	0.17	0.15	0.17	0.21	0.16	0.17	0.10	0.00	0.05	0.13	0.17	0.18	0.16	0.46	0.22
O3'	0.18	0.14	0.02	0.01	0.06	0.03	0.05	0.09	0.04	0.12	0.05	0.21	0.17	0.14	0.05	0.05	0.00	0.14	0.18	0.09	0.18	0.45	0.24
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.09	0.07	0.02	0.01	0.13	0.14	0.00	0.08	0.04	0.10	0.29	0.18
O5'	0.15	0.21	0.24	0.04	0.22	0.01	0.30	0.00	0.31	0.31	0.27	0.18	0.18	0.35	0.21	0.17	0.18	0.08	0.00	0.36	0.02	0.00	0.01
O6	0.01	0.02	0.05	0.23	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.18	0.09	0.04	0.36	0.00	0.11	0.10	0.06
OP1	0.13	0.12	0.23	0.04	0.13	0.03	0.12	0.12	0.11	0.12	0.12	0.13	0.14	0.12	0.13	0.16	0.18	0.10	0.02	0.11	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	0.27	0.49	0.42	0.30	0.24	0.22	0.04	0.17	0.28	0.21	0.29	0.32	0.18	0.33	0.46	0.45	0.29	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.14	0.30	0.21	0.15	0.11	0.10	0.02	0.08	0.12	0.10	0.15	0.17	0.08	0.17	0.22	0.24	0.18	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.43	0.08	0.06	0.55	0.05	0.53	0.09	0.45	0.40	0.51	0.56	0.35	0.09	0.34	0.16	0.33	0.71	0.42	0.39
C2	0.24	0.32	0.07	0.08	0.79	0.16	0.82	0.20	0.64	0.42	0.52	0.93	0.12	0.18	0.30	0.36	0.82	1.01	0.88	0.82
C2'	0.21	0.37	0.12	0.14	0.48	0.15	0.45	0.21	0.37	0.34	0.44	0.51	0.33	0.08	0.34	0.16	0.25	0.75	0.44	0.40
C3'	0.16	0.29	0.11	0.06	0.36	0.13	0.37	0.18	0.31	0.26	0.33	0.38	0.31	0.05	0.30	0.06	0.18	0.67	0.26	0.29
C4	0.18	0.24	0.05	0.09	0.56	0.10	0.62	0.14	0.51	0.33	0.36	0.59	0.12	0.17	0.32	0.27	0.64	0.91	0.69	0.66
C4'	0.24	0.41	0.21	0.06	0.41	0.05	0.38	0.08	0.34	0.34	0.43	0.41	0.45	0.10	0.20	0.10	0.11	0.62	0.22	0.23
C5	0.10	0.10	0.12	0.10	0.26	0.11	0.46	0.16	0.37	0.15	0.04	0.28	0.30	0.19	0.27	0.25	0.73	0.99	0.78	0.76
C5'	0.23	0.36	0.26	0.15	0.34	0.03	0.33	0.05	0.30	0.31	0.36	0.34	0.41	0.15	0.04	0.08	0.08	0.60	0.16	0.19
C6	0.12	0.18	0.14	0.09	0.22	0.15	0.51	0.21	0.40	0.14	0.16	0.27	0.40	0.20	0.24	0.31	0.87	1.07	0.94	0.89
C8	0.03	0.04	0.09	0.13	0.15	0.08	0.26	0.11	0.22	0.08	0.04	0.17	0.17	0.17	0.32	0.11	0.43	0.82	0.47	0.49
N1	0.18	0.13	0.11	0.08	0.56	0.17	0.72	0.23	0.55	0.29	0.21	0.70	0.24	0.20	0.27	0.36	0.89	1.07	0.96	0.90
N2	0.29	0.41	0.08	0.07	0.91	0.18	0.91	0.21	0.71	0.49	0.64	1.10	0.17	0.18	0.31	0.40	0.85	1.03	0.92	0.85
N3	0.25	0.41	0.05	0.08	0.78	0.12	0.78	0.15	0.62	0.45	0.60	0.87	0.20	0.16	0.33	0.32	0.69	0.93	0.75	0.70
N7	0.07	0.26	0.15	0.13	0.11	0.09	0.18	0.13	0.15	0.05	0.26	0.15	0.38	0.20	0.26	0.16	0.61	0.94	0.65	0.66
N9	0.17	0.26	0.01	0.08	0.45	0.06	0.50	0.10	0.42	0.31	0.34	0.46	0.14	0.14	0.34	0.19	0.47	0.81	0.53	0.51
O2'	0.29	0.49	0.18	0.08	0.57	0.09	0.52	0.20	0.45	0.43	0.57	0.59	0.46	0.10	0.24	0.20	0.29	0.80	0.53	0.46
O3'	0.20	0.39	0.18	0.02	0.33	0.13	0.27	0.21	0.24	0.27	0.41	0.34	0.51	0.14	0.25	0.06	0.16	0.65	0.22	0.26
O4'	0.24	0.44	0.15	0.04	0.47	0.05	0.44	0.07	0.39	0.38	0.48	0.47	0.44	0.04	0.32	0.12	0.19	0.59	0.27	0.25
O5'	0.28	0.35	0.31	0.22	0.35	0.03	0.36	0.03	0.35	0.33	0.34	0.35	0.38	0.18	0.02	0.15	0.12	0.72	0.26	0.31
O6	0.11	0.38	0.17	0.09	0.15	0.17	0.29	0.25	0.25	0.11	0.48	0.21	0.55	0.21	0.20	0.30	0.95	1.13	1.03	0.99
OP1	0.28	0.28	0.11	0.18	0.40	0.46	0.47	0.53	0.44	0.34	0.32	0.41	0.23	0.07	0.00	0.43	0.76	0.21	0.51	0.44
OP2	0.05	0.23	0.04	0.06	0.33	0.12	0.29	0.15	0.21	0.13	0.31	0.38	0.24	0.07	0.02	0.14	0.30	1.06	0.29	0.53
P	0.02	0.12	0.04	0.00	0.20	0.12	0.23	0.14	0.19	0.10	0.16	0.23	0.15	0.05	0.00	0.07	0.17	0.62	0.05	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.24	0.06	0.33	0.16
C2	0.02	0.00	0.05	0.14	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.15	0.02	0.30	0.03	0.31	0.12
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.06	0.02	0.05	0.03	0.11	0.01	0.01	0.02	0.19	0.27	0.22	0.05
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.15	0.01	0.13	0.01	0.12	0.09	0.16	0.15	0.17	0.02	0.00	0.01	0.17	0.44	0.15	0.06
C4	0.03	0.01	0.03	0.15	0.00	0.08	0.00	0.23	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.19	0.08	0.41	0.04	0.18	0.03
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.05	0.09	0.08	0.09	0.04	0.01	0.01	0.04	0.25	0.28	0.09
C5	0.05	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.22	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.17	0.11	0.43	0.06	0.20	0.05
C5'	0.03	0.18	0.00	0.01	0.23	0.01	0.22	0.00	0.19	0.15	0.22	0.23	0.16	0.05	0.03	0.02	0.01	0.41	0.28	0.03
C6	0.05	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.13	0.11	0.40	0.06	0.30	0.09
N1	0.02	0.01	0.02	0.09	0.02	0.05	0.02	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.09	0.04	0.31	0.02	0.33	0.14
N3	0.02	0.01	0.05	0.16	0.00	0.09	0.00	0.22	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.19	0.04	0.35	0.03	0.24	0.07
N4	0.03	0.01	0.03	0.15	0.00	0.08	0.02	0.23	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.21	0.10	0.45	0.08	0.07	0.08
O2	0.04	0.00	0.11	0.17	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.18	0.03	0.25	0.06	0.33	0.16
O2'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.04	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.04	0.03	0.08	0.00	0.05	0.06	0.08	0.21	0.26	0.13
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.19	0.01	0.17	0.03	0.13	0.09	0.19	0.21	0.18	0.05	0.00	0.01	0.06	0.58	0.08	0.12
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.11	0.04	0.04	0.10	0.03	0.06	0.01	0.00	0.22	0.04	0.32	0.17
O5'	0.24	0.30	0.19	0.17	0.41	0.04	0.43	0.01	0.40	0.31	0.35	0.45	0.25	0.08	0.06	0.22	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.03	0.27	0.44	0.04	0.25	0.06	0.41	0.06	0.02	0.03	0.08	0.06	0.21	0.58	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.33	0.31	0.22	0.15	0.18	0.28	0.20	0.28	0.30	0.33	0.24	0.07	0.33	0.26	0.08	0.32	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.16	0.12	0.05	0.06	0.03	0.09	0.05	0.03	0.09	0.14	0.07	0.08	0.16	0.13	0.12	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00