Doublet Group distance statistics: 50269

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.020 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.007, 0.031, 0.054, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.031 std_dev=0.024
C5	A	0, -0.003, 0.023, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.023 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.001, 0.035, 0.069, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.035 std_dev=0.034
C4	A	0, 0.002, 0.037, 0.072, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.037 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.005, 0.041, 0.077, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.041 std_dev=0.036
N1	A	0, 0.013, 0.052, 0.090, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.052 std_dev=0.038
N9	A	0, 0.014, 0.055, 0.095, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.055 std_dev=0.040
N3	A	0, 0.012, 0.061, 0.110, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.061 std_dev=0.049
C2	A	0, 0.014, 0.063, 0.112, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.063 std_dev=0.049
C1'	A	0, 0.018, 0.079, 0.140, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.079 std_dev=0.061
N2	A	0, 0.019, 0.129, 0.239, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.129 std_dev=0.110
O4'	A	0, 0.064, 0.266, 0.468, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.266 std_dev=0.202
C2'	A	0, 0.110, 0.391, 0.672, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.391 std_dev=0.281
O2'	A	0, 0.098, 0.400, 0.702, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.400 std_dev=0.302
C4'	A	0, 0.139, 0.492, 0.845, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.492 std_dev=0.353
C3'	A	0, 0.158, 0.568, 0.979, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.568 std_dev=0.411
C2'	B	0, 0.154, 0.601, 1.048, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.601 std_dev=0.447
O2'	B	0, 0.153, 0.650, 1.147, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.650 std_dev=0.497
C3'	B	0, 0.216, 0.783, 1.349, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.783 std_dev=0.566
C5'	A	0, 0.199, 0.766, 1.334, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.766 std_dev=0.568
O3'	A	0, 0.241, 0.855, 1.469, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.855 std_dev=0.614
O3'	B	0, 0.299, 1.031, 1.764, 1.627 max_d=1.627 avg_d=1.031 std_dev=0.732
O5'	A	0, 0.380, 1.325, 2.271, 2.144 max_d=2.144 avg_d=1.325 std_dev=0.946
P	A	0, 0.408, 1.422, 2.435, 2.291 max_d=2.291 avg_d=1.422 std_dev=1.013
OP2	A	0, 0.441, 1.537, 2.633, 2.477 max_d=2.477 avg_d=1.537 std_dev=1.096
C1'	B	0, 0.458, 1.640, 2.821, 2.737 max_d=2.737 avg_d=1.640 std_dev=1.181
C4'	B	0, 0.475, 1.675, 2.875, 2.748 max_d=2.748 avg_d=1.675 std_dev=1.200
OP1	A	0, 0.498, 1.745, 2.993, 2.843 max_d=2.843 avg_d=1.745 std_dev=1.248
O4'	B	0, 0.440, 1.698, 2.955, 3.006 max_d=3.006 avg_d=1.698 std_dev=1.258
O5'	B	0, 0.555, 1.959, 3.363, 3.216 max_d=3.216 avg_d=1.959 std_dev=1.404
C6	B	0, 0.602, 2.102, 3.602, 3.401 max_d=3.401 avg_d=2.102 std_dev=1.500
N1	B	0, 0.721, 2.493, 4.266, 3.962 max_d=3.962 avg_d=2.493 std_dev=1.772
C5'	B	0, 0.732, 2.514, 4.295, 3.911 max_d=3.911 avg_d=2.514 std_dev=1.781
C5	B	0, 0.944, 3.249, 5.555, 5.106 max_d=5.106 avg_d=3.249 std_dev=2.305
P	B	0, 0.995, 3.529, 6.063, 5.834 max_d=5.834 avg_d=3.529 std_dev=2.534
OP2	B	0, 1.088, 3.887, 6.686, 6.477 max_d=6.477 avg_d=3.887 std_dev=2.799
C2	B	0, 1.173, 4.012, 6.850, 6.141 max_d=6.141 avg_d=4.012 std_dev=2.838
O2	B	0, 1.290, 4.403, 7.517, 6.630 max_d=6.630 avg_d=4.403 std_dev=3.114
C4	B	0, 1.383, 4.744, 8.106, 7.376 max_d=7.376 avg_d=4.744 std_dev=3.362
OP1	B	0, 1.388, 4.782, 8.175, 7.526 max_d=7.526 avg_d=4.782 std_dev=3.394
N3	B	0, 1.487, 5.087, 8.688, 7.818 max_d=7.818 avg_d=5.087 std_dev=3.601
N4	B	0, 1.728, 5.925, 10.121, 9.191 max_d=9.191 avg_d=5.925 std_dev=4.197

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.09	0.07	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.09	0.04	0.10	0.11	0.11
C2	0.07	0.00	0.16	0.18	0.02	0.11	0.02	0.15	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.22	0.05	0.14	0.02	0.13	0.24	0.19
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.02	0.07	0.00	0.10	0.03	0.14	0.19	0.16	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.04	0.05	0.04
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.15	0.13	0.17	0.21	0.17	0.13	0.09	0.00	0.00	0.00	0.09	0.15	0.06	0.10	0.07
C4	0.03	0.02	0.09	0.12	0.00	0.08	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.14	0.02	0.07	0.02	0.09	0.16	0.13
C4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.09	0.06	0.11	0.13	0.11	0.06	0.06	0.06	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.10	0.03
C5	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.16	0.02	0.06	0.01	0.08	0.18	0.13
C5'	0.03	0.15	0.00	0.00	0.13	0.01	0.13	0.00	0.14	0.13	0.16	0.16	0.14	0.13	0.11	0.05	0.04	0.02	0.00	0.15	0.05	0.12	0.02
C6	0.04	0.02	0.10	0.15	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.08	0.19	0.02	0.09	0.00	0.10	0.23	0.15
C8	0.03	0.01	0.03	0.13	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.15	0.05	0.05	0.02	0.04	0.08	0.06
N1	0.06	0.01	0.14	0.17	0.02	0.11	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.12	0.22	0.04	0.13	0.00	0.13	0.26	0.18
N2	0.09	0.01	0.19	0.21	0.02	0.13	0.03	0.16	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.18	0.27	0.08	0.16	0.04	0.15	0.26	0.20
N3	0.07	0.00	0.16	0.17	0.01	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.20	0.06	0.12	0.01	0.12	0.19	0.17
N7	0.02	0.02	0.04	0.13	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.05	0.02	0.02	0.05	0.13	0.08
N9	0.00	0.02	0.03	0.09	0.01	0.06	0.02	0.11	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.04	0.03	0.07	0.10	0.10
O2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.06	0.05	0.05	0.08	0.02	0.12	0.18	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.04	0.08	0.02	0.11	0.03
O3'	0.02	0.22	0.01	0.00	0.14	0.01	0.16	0.04	0.19	0.15	0.22	0.27	0.20	0.17	0.09	0.02	0.00	0.00	0.20	0.20	0.13	0.25	0.18
O4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.04	0.08	0.06	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.17	0.03	0.15	0.19	0.17
O5'	0.09	0.14	0.03	0.09	0.07	0.01	0.06	0.00	0.09	0.05	0.13	0.16	0.12	0.02	0.04	0.04	0.20	0.17	0.00	0.08	0.02	0.00	0.01
O6	0.04	0.02	0.10	0.15	0.02	0.09	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.08	0.20	0.03	0.08	0.00	0.10	0.25	0.16
OP1	0.10	0.13	0.04	0.06	0.09	0.04	0.08	0.05	0.10	0.04	0.13	0.15	0.12	0.05	0.07	0.02	0.13	0.15	0.02	0.10	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.24	0.05	0.10	0.16	0.10	0.18	0.12	0.23	0.08	0.26	0.26	0.19	0.13	0.10	0.11	0.25	0.19	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.19	0.04	0.07	0.13	0.03	0.13	0.02	0.15	0.06	0.18	0.20	0.17	0.08	0.10	0.03	0.18	0.17	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.36	0.62	0.21	0.16	0.46	0.10	0.28	0.27	0.26	0.41	0.62	0.48	0.81	0.31	0.16	0.21	0.27	0.48	0.42	0.20
C2	0.31	0.75	0.30	0.20	0.79	0.33	0.59	0.46	0.48	0.52	0.88	0.89	0.84	0.36	0.16	0.22	0.36	0.44	0.65	0.29
C2'	0.21	0.37	0.18	0.07	0.23	0.06	0.13	0.20	0.14	0.23	0.36	0.22	0.54	0.30	0.08	0.13	0.21	0.34	0.47	0.12
C3'	0.14	0.17	0.17	0.04	0.06	0.14	0.13	0.18	0.09	0.06	0.12	0.09	0.33	0.26	0.09	0.18	0.18	0.21	0.47	0.07
C4	0.31	0.72	0.25	0.16	0.68	0.26	0.48	0.40	0.40	0.48	0.80	0.74	0.86	0.31	0.13	0.15	0.30	0.42	0.57	0.22
C4'	0.30	0.35	0.07	0.05	0.13	0.15	0.04	0.13	0.03	0.22	0.28	0.11	0.54	0.20	0.08	0.32	0.18	0.34	0.35	0.06
C5	0.31	0.74	0.28	0.18	0.75	0.37	0.56	0.47	0.47	0.51	0.84	0.82	0.84	0.31	0.12	0.25	0.35	0.39	0.60	0.25
C5'	0.37	0.33	0.06	0.12	0.20	0.32	0.20	0.22	0.14	0.25	0.26	0.22	0.50	0.09	0.11	0.45	0.17	0.24	0.34	0.03
C6	0.32	0.76	0.31	0.20	0.85	0.44	0.67	0.54	0.54	0.54	0.92	0.96	0.80	0.33	0.12	0.35	0.40	0.40	0.66	0.30
C8	0.34	0.67	0.22	0.15	0.56	0.23	0.40	0.36	0.35	0.46	0.69	0.59	0.83	0.26	0.11	0.16	0.28	0.39	0.49	0.18
N1	0.31	0.76	0.31	0.20	0.85	0.40	0.66	0.51	0.53	0.53	0.92	0.97	0.81	0.34	0.14	0.30	0.39	0.42	0.68	0.31
N2	0.31	0.75	0.31	0.20	0.80	0.32	0.60	0.46	0.48	0.51	0.89	0.91	0.83	0.37	0.17	0.22	0.36	0.47	0.67	0.31
N3	0.31	0.73	0.26	0.17	0.70	0.24	0.50	0.39	0.41	0.49	0.82	0.78	0.86	0.33	0.15	0.14	0.30	0.43	0.60	0.24
N7	0.33	0.72	0.27	0.17	0.69	0.37	0.52	0.46	0.45	0.51	0.79	0.74	0.83	0.29	0.10	0.25	0.34	0.37	0.56	0.23
N9	0.34	0.68	0.22	0.15	0.57	0.18	0.38	0.33	0.33	0.45	0.71	0.61	0.84	0.29	0.13	0.14	0.27	0.42	0.50	0.19
O2'	0.26	0.43	0.15	0.04	0.25	0.07	0.11	0.20	0.12	0.26	0.40	0.24	0.61	0.29	0.05	0.21	0.22	0.39	0.38	0.09
O3'	0.14	0.14	0.23	0.15	0.27	0.25	0.31	0.27	0.23	0.13	0.19	0.33	0.21	0.27	0.17	0.24	0.21	0.08	0.50	0.14
O4'	0.39	0.57	0.20	0.18	0.37	0.07	0.19	0.23	0.20	0.38	0.54	0.36	0.78	0.30	0.21	0.28	0.28	0.54	0.34	0.24
O5'	0.09	0.07	0.17	0.05	0.22	0.12	0.30	0.18	0.24	0.06	0.10	0.27	0.22	0.23	0.04	0.14	0.26	0.30	0.36	0.09
O6	0.35	0.77	0.33	0.21	0.94	0.51	0.76	0.58	0.61	0.57	0.97	1.07	0.76	0.31	0.12	0.45	0.44	0.39	0.69	0.34
OP1	0.27	0.18	0.08	0.14	0.37	0.41	0.42	0.31	0.28	0.17	0.25	0.47	0.26	0.02	0.02	0.40	0.24	0.21	0.17	0.05
OP2	0.15	0.45	0.26	0.07	0.69	0.11	0.67	0.15	0.54	0.40	0.60	0.77	0.33	0.22	0.02	0.03	0.15	0.39	0.68	0.40
P	0.07	0.15	0.12	0.02	0.39	0.16	0.44	0.11	0.33	0.16	0.26	0.46	0.14	0.13	0.01	0.15	0.19	0.20	0.37	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.17	0.01	0.09	0.12	0.29	0.18
C2	0.02	0.00	0.06	0.11	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.19	0.11	0.05	0.04	0.09	0.10	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.07	0.09	0.08	0.01	0.03	0.03	0.13	0.01	0.01	0.01	0.20	0.31	0.67	0.44
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.23	0.00	0.28	0.01	0.25	0.13	0.16	0.25	0.10	0.02	0.01	0.01	0.09	0.13	0.45	0.18
C4	0.04	0.01	0.03	0.23	0.00	0.10	0.00	0.15	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.22	0.11	0.08	0.13	0.03	0.36	0.08
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.12	0.05	0.05	0.12	0.04	0.21	0.01	0.01	0.02	0.11	0.28	0.07
C5	0.04	0.02	0.07	0.28	0.00	0.13	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.18	0.21	0.07	0.15	0.06	0.46	0.13
C5'	0.05	0.05	0.09	0.01	0.15	0.01	0.17	0.00	0.13	0.06	0.10	0.18	0.04	0.10	0.16	0.02	0.01	0.11	0.15	0.02
C6	0.04	0.01	0.08	0.25	0.02	0.12	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.14	0.17	0.06	0.10	0.00	0.24	0.04
N1	0.01	0.00	0.01	0.13	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.12	0.02	0.03	0.04	0.07	0.06	0.10
N3	0.02	0.01	0.03	0.16	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.04	0.07	0.08	0.04	0.17	0.05
N4	0.04	0.02	0.03	0.25	0.00	0.12	0.02	0.18	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.24	0.14	0.09	0.17	0.08	0.49	0.14
O2	0.05	0.00	0.13	0.10	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.22	0.28	0.04	0.06	0.13	0.24	0.19
O2'	0.01	0.19	0.01	0.02	0.22	0.21	0.18	0.10	0.14	0.12	0.22	0.24	0.22	0.00	0.01	0.13	0.11	0.23	0.77	0.41
O3'	0.17	0.11	0.01	0.01	0.11	0.01	0.21	0.16	0.17	0.02	0.04	0.14	0.28	0.01	0.00	0.10	0.25	0.24	0.33	0.03
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.07	0.09	0.04	0.13	0.10	0.00	0.03	0.03	0.13	0.05
O5'	0.09	0.04	0.20	0.09	0.13	0.02	0.15	0.01	0.10	0.04	0.08	0.17	0.06	0.11	0.25	0.03	0.00	0.00	0.05	0.01
OP1	0.12	0.09	0.31	0.13	0.03	0.11	0.06	0.11	0.00	0.07	0.04	0.08	0.13	0.23	0.24	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.10	0.67	0.45	0.36	0.28	0.46	0.15	0.24	0.06	0.17	0.49	0.24	0.77	0.33	0.13	0.05	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.12	0.44	0.18	0.08	0.07	0.13	0.02	0.04	0.10	0.05	0.14	0.19	0.41	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00