Doublet Group distance statistics: 50270

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.004, 0.025, 0.047, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.025 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.007, 0.032, 0.056, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.032 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.005, 0.030, 0.055, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.016, 0.063, 0.109, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.063 std_dev=0.046
C2'	A	0, 0.067, 0.238, 0.408, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.238 std_dev=0.170
O4'	A	0, 0.054, 0.226, 0.398, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.226 std_dev=0.172
C3'	A	0, 0.093, 0.323, 0.552, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.323 std_dev=0.229
O2'	B	0, 0.075, 0.323, 0.572, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.323 std_dev=0.249
C4'	A	0, 0.102, 0.359, 0.616, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.359 std_dev=0.257
O2'	A	0, 0.129, 0.448, 0.766, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.448 std_dev=0.319
O3'	A	0, 0.144, 0.498, 0.851, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.498 std_dev=0.354
C5'	A	0, 0.196, 0.695, 1.194, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.695 std_dev=0.499
C2'	B	0, 0.178, 0.705, 1.232, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.705 std_dev=0.527
N3	B	0, 0.168, 0.777, 1.385, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.777 std_dev=0.609
N1	B	0, 0.247, 0.856, 1.465, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.856 std_dev=0.609
C2	B	0, 0.249, 0.871, 1.493, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.871 std_dev=0.622
C6	B	0, 0.209, 0.866, 1.524, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.866 std_dev=0.657
C4	B	0, 0.020, 0.720, 1.421, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.720 std_dev=0.700
C1'	B	0, 0.286, 1.018, 1.750, 1.688 max_d=1.688 avg_d=1.018 std_dev=0.732
O2	B	0, 0.306, 1.058, 1.810, 1.681 max_d=1.681 avg_d=1.058 std_dev=0.752
C5	B	0, 0.133, 0.889, 1.645, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.889 std_dev=0.756
N4	B	0, 0.024, 0.824, 1.624, 1.907 max_d=1.907 avg_d=0.824 std_dev=0.800
O4'	B	0, 0.483, 1.653, 2.823, 2.536 max_d=2.536 avg_d=1.653 std_dev=1.170
C3'	B	0, 0.505, 1.799, 3.092, 2.986 max_d=2.986 avg_d=1.799 std_dev=1.293
OP2	B	0, 0.543, 1.917, 3.291, 3.148 max_d=3.148 avg_d=1.917 std_dev=1.374
O5'	A	0, 0.548, 1.963, 3.377, 3.278 max_d=3.278 avg_d=1.963 std_dev=1.414
C4'	B	0, 0.580, 1.997, 3.413, 3.143 max_d=3.143 avg_d=1.997 std_dev=1.417
C5'	B	0, 0.639, 2.218, 3.797, 3.551 max_d=3.551 avg_d=2.218 std_dev=1.579
O5'	B	0, 0.646, 2.227, 3.807, 3.509 max_d=3.509 avg_d=2.227 std_dev=1.581
O3'	B	0, 0.688, 2.439, 4.189, 4.027 max_d=4.027 avg_d=2.439 std_dev=1.751
P	A	0, 0.663, 2.452, 4.242, 4.219 max_d=4.219 avg_d=2.452 std_dev=1.789
P	B	0, 0.727, 2.535, 4.343, 4.089 max_d=4.089 avg_d=2.535 std_dev=1.808
OP2	A	0, 0.701, 2.623, 4.545, 4.551 max_d=4.551 avg_d=2.623 std_dev=1.922
OP1	A	0, 0.835, 3.062, 5.289, 5.230 max_d=5.230 avg_d=3.062 std_dev=2.227
OP1	B	0, 0.973, 3.324, 5.676, 5.062 max_d=5.062 avg_d=3.324 std_dev=2.352

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.07	0.09	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.23	0.00	0.32	0.16	0.17
C2	0.07	0.00	0.11	0.08	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.24	0.10	0.05	0.45	0.03	0.60	0.57	0.46
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.07	0.04	0.11	0.13	0.09	0.05	0.01	0.00	0.03	0.02	0.21	0.06	0.46	0.20	0.25
C3'	0.03	0.08	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.11	0.11	0.07	0.08	0.08	0.11	0.09	0.04	0.01	0.02	0.22	0.12	0.55	0.16	0.29
C4	0.02	0.02	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.11	0.09	0.00	0.48	0.00	0.59	0.53	0.47
C4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.03	0.13	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.23	0.13	0.04
C5	0.00	0.01	0.05	0.11	0.00	0.09	0.00	0.22	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.12	0.04	0.62	0.01	0.73	0.73	0.63
C5'	0.03	0.07	0.01	0.02	0.14	0.01	0.22	0.00	0.22	0.24	0.13	0.02	0.05	0.28	0.13	0.04	0.05	0.01	0.01	0.27	0.22	0.24	0.03
C6	0.02	0.02	0.07	0.11	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.15	0.12	0.02	0.63	0.01	0.79	0.81	0.68
C8	0.03	0.01	0.04	0.11	0.01	0.13	0.01	0.24	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.06	0.64	0.02	0.66	0.58	0.57
N1	0.07	0.00	0.11	0.07	0.04	0.01	0.02	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.22	0.10	0.03	0.55	0.02	0.71	0.71	0.59
N2	0.09	0.01	0.13	0.08	0.02	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.29	0.12	0.08	0.40	0.03	0.57	0.53	0.42
N3	0.06	0.01	0.09	0.08	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.20	0.09	0.04	0.39	0.02	0.53	0.46	0.38
N7	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.13	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.06	0.70	0.02	0.78	0.78	0.70
N9	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.45	0.01	0.52	0.41	0.40
O2'	0.04	0.24	0.00	0.04	0.11	0.04	0.10	0.04	0.15	0.00	0.22	0.29	0.20	0.05	0.03	0.00	0.12	0.08	0.05	0.13	0.25	0.08	0.10
O3'	0.00	0.10	0.03	0.01	0.09	0.02	0.12	0.05	0.12	0.10	0.10	0.12	0.09	0.12	0.08	0.12	0.00	0.01	0.10	0.14	0.57	0.13	0.26
O4'	0.00	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.03	0.08	0.04	0.06	0.02	0.08	0.01	0.00	0.09	0.05	0.13	0.16	0.05
O5'	0.23	0.45	0.21	0.22	0.48	0.01	0.62	0.01	0.63	0.64	0.55	0.40	0.39	0.70	0.45	0.05	0.10	0.09	0.00	0.70	0.01	0.03	0.00
O6	0.00	0.03	0.06	0.12	0.00	0.12	0.01	0.27	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.13	0.14	0.05	0.70	0.00	0.87	0.92	0.77
OP1	0.32	0.60	0.46	0.55	0.59	0.23	0.73	0.22	0.79	0.66	0.71	0.57	0.53	0.78	0.52	0.25	0.57	0.13	0.01	0.87	0.00	0.02	0.00
OP2	0.16	0.57	0.20	0.16	0.53	0.13	0.73	0.24	0.81	0.58	0.71	0.53	0.46	0.78	0.41	0.08	0.13	0.16	0.03	0.92	0.02	0.00	0.00
P	0.17	0.46	0.25	0.29	0.47	0.04	0.63	0.03	0.68	0.57	0.59	0.42	0.38	0.70	0.40	0.10	0.26	0.05	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.38	0.17	0.31	0.27	0.18	0.31	0.10	0.31	0.11	0.21	0.17	0.28	0.26	0.32	0.18	0.40	0.44	0.31	0.24	0.13
C2	0.35	0.32	0.31	0.31	0.07	0.24	0.09	0.26	0.09	0.25	0.18	0.20	0.49	0.29	0.22	0.33	0.42	0.34	0.39	0.20
C2'	0.33	0.15	0.29	0.25	0.16	0.28	0.09	0.26	0.04	0.16	0.15	0.27	0.25	0.30	0.19	0.35	0.33	0.32	0.34	0.11
C3'	0.17	0.03	0.24	0.21	0.11	0.18	0.14	0.18	0.11	0.07	0.08	0.17	0.11	0.28	0.21	0.18	0.21	0.34	0.38	0.16
C4	0.35	0.30	0.33	0.33	0.05	0.27	0.06	0.27	0.08	0.24	0.14	0.19	0.46	0.31	0.26	0.32	0.42	0.31	0.36	0.17
C4'	0.14	0.14	0.25	0.21	0.16	0.19	0.13	0.20	0.11	0.02	0.21	0.21	0.23	0.33	0.15	0.18	0.28	0.38	0.27	0.13
C5	0.32	0.37	0.36	0.43	0.13	0.31	0.07	0.33	0.10	0.26	0.31	0.15	0.50	0.31	0.41	0.28	0.44	0.40	0.43	0.28
C5'	0.11	0.26	0.25	0.19	0.29	0.19	0.34	0.17	0.31	0.23	0.27	0.30	0.33	0.34	0.16	0.11	0.16	0.41	0.36	0.19
C6	0.32	0.41	0.37	0.46	0.18	0.33	0.08	0.36	0.11	0.28	0.37	0.17	0.54	0.31	0.44	0.27	0.46	0.47	0.47	0.35
C8	0.28	0.25	0.34	0.39	0.12	0.28	0.08	0.28	0.09	0.21	0.17	0.16	0.33	0.30	0.38	0.25	0.39	0.30	0.36	0.18
N1	0.32	0.36	0.33	0.38	0.05	0.27	0.04	0.30	0.07	0.25	0.27	0.10	0.52	0.28	0.34	0.28	0.43	0.42	0.44	0.29
N2	0.35	0.30	0.29	0.27	0.12	0.23	0.12	0.24	0.10	0.24	0.17	0.25	0.48	0.27	0.17	0.35	0.41	0.33	0.39	0.18
N3	0.36	0.28	0.30	0.27	0.13	0.25	0.11	0.25	0.10	0.24	0.14	0.26	0.45	0.29	0.17	0.35	0.41	0.29	0.35	0.14
N7	0.28	0.37	0.37	0.48	0.25	0.34	0.16	0.36	0.14	0.26	0.36	0.26	0.43	0.29	0.49	0.25	0.44	0.41	0.43	0.30
N9	0.33	0.21	0.30	0.29	0.10	0.25	0.08	0.25	0.07	0.21	0.05	0.22	0.34	0.30	0.23	0.31	0.40	0.26	0.32	0.10
O2'	0.48	0.26	0.39	0.38	0.22	0.46	0.09	0.44	0.15	0.27	0.26	0.34	0.36	0.37	0.33	0.54	0.49	0.45	0.21	0.22
O3'	0.11	0.07	0.22	0.19	0.12	0.16	0.16	0.15	0.14	0.04	0.11	0.16	0.15	0.26	0.22	0.12	0.15	0.39	0.41	0.20
O4'	0.30	0.13	0.29	0.26	0.18	0.29	0.06	0.30	0.07	0.12	0.22	0.25	0.15	0.32	0.22	0.33	0.45	0.36	0.18	0.18
O5'	0.21	0.53	0.25	0.13	0.65	0.06	0.65	0.06	0.52	0.40	0.61	0.71	0.60	0.34	0.01	0.14	0.04	0.46	0.61	0.28
O6	0.31	0.46	0.39	0.53	0.30	0.38	0.15	0.43	0.15	0.30	0.47	0.32	0.57	0.31	0.54	0.27	0.51	0.57	0.52	0.45
OP1	0.18	0.34	0.06	0.12	0.50	0.17	0.57	0.22	0.43	0.20	0.41	0.60	0.52	0.18	0.03	0.20	0.12	0.73	0.55	0.37
OP2	0.23	0.18	0.20	0.15	0.64	0.17	0.73	0.21	0.52	0.18	0.41	0.78	0.18	0.28	0.01	0.21	0.21	0.54	0.56	0.34
P	0.18	0.29	0.06	0.07	0.51	0.10	0.59	0.13	0.44	0.20	0.38	0.60	0.42	0.08	0.01	0.17	0.10	0.57	0.56	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.04	0.21	0.01	0.25	0.17	0.37	0.18
C2	0.04	0.00	0.26	0.21	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.23	0.10	0.32	0.14	0.31	0.03
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.31	0.03	0.31	0.13	0.28	0.25	0.30	0.33	0.21	0.01	0.01	0.04	0.36	0.22	0.36	0.24
C3'	0.04	0.21	0.00	0.00	0.41	0.03	0.51	0.06	0.46	0.25	0.30	0.45	0.16	0.03	0.02	0.04	0.12	0.23	0.43	0.08
C4	0.03	0.00	0.31	0.41	0.00	0.19	0.01	0.26	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.33	0.03	0.53	0.35	0.35	0.29
C4'	0.02	0.06	0.03	0.03	0.19	0.00	0.29	0.01	0.29	0.12	0.10	0.21	0.14	0.03	0.10	0.01	0.04	0.20	0.36	0.07
C5	0.02	0.01	0.31	0.51	0.01	0.29	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.17	0.43	0.04	0.59	0.39	0.36	0.34
C5'	0.02	0.06	0.13	0.06	0.26	0.01	0.36	0.00	0.30	0.11	0.15	0.31	0.06	0.10	0.05	0.03	0.02	0.22	0.24	0.03
C6	0.02	0.02	0.28	0.46	0.01	0.29	0.01	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.35	0.06	0.50	0.25	0.28	0.16
N1	0.01	0.00	0.25	0.25	0.02	0.12	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.14	0.03	0.33	0.14	0.31	0.01
N3	0.04	0.00	0.30	0.30	0.01	0.10	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.25	0.09	0.41	0.24	0.31	0.16
N4	0.03	0.00	0.33	0.45	0.00	0.21	0.00	0.31	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.22	0.39	0.03	0.59	0.45	0.43	0.40
O2	0.05	0.00	0.21	0.16	0.01	0.14	0.02	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.40	0.15	0.26	0.09	0.33	0.08
O2'	0.04	0.21	0.01	0.03	0.20	0.03	0.17	0.10	0.12	0.13	0.22	0.22	0.22	0.00	0.08	0.03	0.34	0.22	0.34	0.25
O3'	0.21	0.23	0.01	0.02	0.33	0.10	0.43	0.05	0.35	0.14	0.25	0.39	0.40	0.08	0.00	0.21	0.05	0.42	0.56	0.24
O4'	0.01	0.10	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.03	0.09	0.03	0.15	0.03	0.21	0.00	0.14	0.15	0.38	0.15
O5'	0.25	0.32	0.36	0.12	0.53	0.04	0.59	0.02	0.50	0.33	0.41	0.59	0.26	0.34	0.05	0.14	0.00	0.02	0.02	0.02
OP1	0.17	0.14	0.22	0.23	0.35	0.20	0.39	0.22	0.25	0.14	0.24	0.45	0.09	0.22	0.42	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	0.31	0.36	0.43	0.35	0.36	0.36	0.24	0.28	0.31	0.31	0.43	0.33	0.34	0.56	0.38	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.03	0.24	0.08	0.29	0.07	0.34	0.03	0.16	0.01	0.16	0.40	0.08	0.25	0.24	0.15	0.02	0.00	0.00	0.00