Doublet Group distance statistics: 50279

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N7	A	0, 0.000, 0.052, 0.104, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.052 std_dev=0.052
C8	A	0, 0.000, 0.054, 0.108, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.054 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.000, 0.169, 0.338, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.169 std_dev=0.169
O4'	A	0, 0.000, 0.178, 0.355, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.178 std_dev=0.178
C2'	B	0, 0.000, 0.190, 0.380, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.190 std_dev=0.190
C4'	A	0, 0.000, 0.243, 0.486, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.243 std_dev=0.243
O2'	A	0, 0.000, 0.245, 0.491, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.245 std_dev=0.245
C3'	A	0, 0.000, 0.281, 0.562, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.281 std_dev=0.281
P	A	0, 0.000, 0.297, 0.595, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.297 std_dev=0.297
C3'	B	0, 0.000, 0.395, 0.790, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.395 std_dev=0.395
O3'	A	0, 0.000, 0.396, 0.792, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.396 std_dev=0.396
O5'	A	0, 0.000, 0.409, 0.819, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.409 std_dev=0.409
C5'	A	0, 0.000, 0.444, 0.888, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.444 std_dev=0.444
O3'	B	0, 0.000, 0.480, 0.961, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.480 std_dev=0.480
OP1	A	0, 0.000, 0.514, 1.027, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.514 std_dev=0.513
OP2	A	0, 0.000, 0.535, 1.071, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.535 std_dev=0.535
O2'	B	0, 0.000, 0.997, 1.993, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.997 std_dev=0.997
C1'	B	0, 0.000, 1.137, 2.275, 2.275 max_d=2.275 avg_d=1.137 std_dev=1.137
C4'	B	0, 0.000, 1.314, 2.628, 2.628 max_d=2.628 avg_d=1.314 std_dev=1.314
O5'	B	0, 0.000, 1.528, 3.055, 3.055 max_d=3.055 avg_d=1.528 std_dev=1.528
N1	B	0, 0.000, 1.549, 3.097, 3.097 max_d=3.097 avg_d=1.549 std_dev=1.549
O4'	B	0, 0.000, 1.697, 3.395, 3.395 max_d=3.395 avg_d=1.697 std_dev=1.697
C5'	B	0, 0.000, 1.830, 3.661, 3.661 max_d=3.661 avg_d=1.830 std_dev=1.830
C6	B	0, 0.000, 1.939, 3.878, 3.878 max_d=3.878 avg_d=1.939 std_dev=1.939
C2	B	0, 0.000, 1.944, 3.888, 3.888 max_d=3.888 avg_d=1.944 std_dev=1.944
O2	B	0, 0.000, 1.992, 3.984, 3.984 max_d=3.984 avg_d=1.992 std_dev=1.992
P	B	0, 0.000, 2.354, 4.707, 4.707 max_d=4.707 avg_d=2.354 std_dev=2.354
C5	B	0, 0.000, 2.486, 4.971, 4.971 max_d=4.971 avg_d=2.486 std_dev=2.486
N3	B	0, 0.000, 2.534, 5.068, 5.068 max_d=5.068 avg_d=2.534 std_dev=2.534
OP1	B	0, 0.000, 2.692, 5.383, 5.383 max_d=5.383 avg_d=2.692 std_dev=2.692
C4	B	0, 0.000, 2.722, 5.445, 5.445 max_d=5.445 avg_d=2.722 std_dev=2.722
OP2	B	0, 0.000, 2.772, 5.544, 5.544 max_d=5.544 avg_d=2.772 std_dev=2.772
N4	B	0, 0.000, 3.359, 6.717, 6.717 max_d=6.717 avg_d=3.359 std_dev=3.359

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.18	0.13
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.07	0.01	0.12	0.29	0.17
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.06	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.03
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.12	0.04	0.09	0.06	0.09	0.04	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.09	0.11	0.05
C4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.28	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03
C5	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.11	0.33	0.16
C5'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.02	0.05	0.03	0.06	0.03	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01
C6	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.13	0.35	0.17
C8	0.00	0.01	0.05	0.12	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.01	0.09	0.01	0.04	0.26	0.11
N1	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.06	0.01	0.13	0.33	0.17
N2	0.03	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.12	0.03	0.07	0.01	0.11	0.27	0.16
N3	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.06	0.01	0.09	0.26	0.16
N7	0.00	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.32	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.05	0.24	0.14
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.07	0.06	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01	0.11	0.03	0.00
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.12	0.04	0.12	0.07	0.11	0.05	0.02	0.00	0.00	0.07	0.02	0.16	0.25	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.19	0.15
O5'	0.00	0.07	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.09	0.06	0.07	0.06	0.05	0.02	0.06	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.15	0.38	0.17
OP1	0.03	0.12	0.05	0.09	0.09	0.05	0.11	0.07	0.13	0.04	0.13	0.11	0.09	0.08	0.05	0.11	0.16	0.04	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.29	0.02	0.11	0.28	0.00	0.33	0.04	0.35	0.26	0.33	0.27	0.26	0.32	0.24	0.03	0.25	0.19	0.01	0.38	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.17	0.03	0.05	0.15	0.03	0.16	0.01	0.17	0.11	0.17	0.16	0.16	0.13	0.14	0.00	0.13	0.15	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.97	0.01	0.17	0.91	0.33	0.54	0.67	0.35	0.53	1.14	1.06	1.21	0.36	0.29	0.41	0.35	0.61	0.96	0.71
C2	0.24	0.91	0.03	0.12	0.75	0.31	0.31	0.58	0.15	0.43	1.04	0.88	1.20	0.17	0.15	0.38	0.41	0.78	1.09	0.75
C2'	0.27	1.00	0.09	0.23	0.98	0.28	0.60	0.58	0.39	0.56	1.19	1.14	1.21	0.32	0.20	0.36	0.30	0.53	0.85	0.63
C3'	0.26	0.95	0.17	0.30	0.94	0.22	0.60	0.47	0.40	0.54	1.12	1.08	1.14	0.26	0.10	0.29	0.23	0.39	0.66	0.49
C4	0.23	0.86	0.03	0.13	0.69	0.31	0.29	0.59	0.14	0.41	0.97	0.80	1.16	0.18	0.17	0.37	0.36	0.64	0.99	0.67
C4'	0.27	0.97	0.12	0.28	0.98	0.24	0.67	0.51	0.47	0.58	1.15	1.12	1.15	0.39	0.22	0.32	0.23	0.38	0.65	0.51
C5	0.19	0.74	0.02	0.08	0.49	0.28	0.10	0.49	0.02	0.30	0.79	0.57	1.06	0.07	0.10	0.31	0.29	0.54	0.87	0.53
C5'	0.25	0.88	0.22	0.33	0.88	0.16	0.62	0.36	0.45	0.54	1.02	0.98	1.04	0.31	0.12	0.24	0.13	0.20	0.41	0.34
C6	0.18	0.71	0.02	0.07	0.44	0.26	0.03	0.43	0.07	0.27	0.76	0.52	1.05	0.02	0.07	0.29	0.30	0.58	0.86	0.52
C8	0.19	0.73	0.02	0.11	0.50	0.30	0.15	0.54	0.04	0.31	0.77	0.57	1.04	0.12	0.15	0.32	0.23	0.39	0.73	0.45
N1	0.21	0.81	0.03	0.09	0.59	0.29	0.15	0.49	0.03	0.34	0.90	0.69	1.13	0.08	0.10	0.33	0.36	0.71	0.99	0.65
N2	0.26	0.96	0.04	0.14	0.84	0.32	0.38	0.60	0.20	0.47	1.12	1.00	1.24	0.19	0.16	0.40	0.44	0.85	1.15	0.81
N3	0.25	0.94	0.03	0.14	0.82	0.32	0.39	0.62	0.21	0.47	1.09	0.96	1.21	0.22	0.19	0.40	0.41	0.75	1.09	0.77
N7	0.16	0.63	0.02	0.07	0.35	0.26	0.01	0.43	0.09	0.23	0.65	0.41	0.97	0.01	0.07	0.27	0.20	0.37	0.68	0.37
N9	0.24	0.87	0.02	0.14	0.72	0.32	0.34	0.62	0.19	0.43	0.98	0.83	1.15	0.23	0.21	0.38	0.33	0.56	0.92	0.64
O2'	0.32	1.09	0.10	0.25	1.15	0.32	0.77	0.65	0.53	0.65	1.33	1.35	1.24	0.38	0.22	0.43	0.35	0.62	0.95	0.72
O3'	0.25	0.94	0.21	0.32	0.99	0.18	0.67	0.42	0.46	0.56	1.14	1.15	1.08	0.26	0.05	0.25	0.20	0.34	0.60	0.45
O4'	0.27	0.98	0.02	0.19	0.94	0.31	0.60	0.65	0.41	0.56	1.14	1.07	1.20	0.42	0.34	0.41	0.31	0.51	0.83	0.63
O5'	0.16	0.71	0.22	0.29	0.61	0.04	0.35	0.17	0.21	0.37	0.78	0.69	0.91	0.12	0.01	0.10	0.00	0.03	0.20	0.14
O6	0.15	0.62	0.02	0.04	0.29	0.23	0.11	0.31	0.18	0.19	0.63	0.35	0.97	0.06	0.01	0.24	0.24	0.50	0.70	0.39
OP1	0.12	0.30	0.19	0.07	0.27	0.41	0.12	0.37	0.02	0.08	0.36	0.33	0.39	0.03	0.02	0.34	0.42	0.51	0.40	0.37
OP2	0.28	0.11	0.00	0.19	0.10	0.63	0.35	0.79	0.43	0.20	0.12	0.06	0.37	0.13	0.03	0.55	0.78	0.83	0.82	0.80
P	0.09	0.32	0.10	0.02	0.19	0.32	0.02	0.32	0.11	0.05	0.35	0.24	0.51	0.01	0.01	0.25	0.41	0.43	0.32	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.33	0.16	0.12
C2	0.00	0.00	0.02	0.30	0.00	0.30	0.01	0.48	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.21	0.20	0.14	0.14	0.29	0.24
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.26	0.39	0.15	0.21
C3'	0.01	0.30	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.17	0.04	0.26	0.09	0.54	0.03	0.01	0.01	0.31	0.36	0.14	0.22
C4	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.06	0.04	0.19	0.59	0.16	0.18
C4'	0.00	0.30	0.01	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.20	0.04	0.26	0.10	0.52	0.07	0.05	0.00	0.01	0.11	0.06	0.00
C5	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.13	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.12	0.52	1.00	0.64	0.61
C5'	0.00	0.48	0.00	0.00	0.15	0.00	0.22	0.00	0.32	0.06	0.44	0.18	0.80	0.06	0.05	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.20	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.12	0.18	0.57	0.97	0.69	0.65
N1	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.19	0.48	0.19	0.18
N3	0.01	0.00	0.01	0.26	0.00	0.26	0.01	0.44	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.19	0.16	0.09	0.23	0.25	0.19
N4	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.07	0.05	0.18	0.59	0.13	0.16
O2	0.01	0.01	0.05	0.54	0.01	0.52	0.01	0.80	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.38	0.39	0.33	0.44	0.19	0.69	0.59
O2'	0.01	0.21	0.01	0.03	0.08	0.07	0.05	0.06	0.10	0.03	0.19	0.09	0.38	0.00	0.03	0.07	0.05	0.17	0.01	0.04
O3'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.06	0.05	0.09	0.05	0.12	0.03	0.19	0.07	0.39	0.03	0.00	0.04	0.17	0.19	0.00	0.11
O4'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.18	0.01	0.16	0.05	0.33	0.07	0.04	0.00	0.00	0.20	0.14	0.03
O5'	0.13	0.14	0.26	0.31	0.19	0.01	0.52	0.01	0.57	0.19	0.09	0.18	0.44	0.05	0.17	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00
OP1	0.33	0.14	0.39	0.36	0.59	0.11	1.00	0.09	0.97	0.48	0.23	0.59	0.19	0.17	0.19	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.16	0.29	0.15	0.14	0.16	0.06	0.64	0.07	0.69	0.19	0.25	0.13	0.69	0.01	0.00	0.14	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.24	0.21	0.22	0.18	0.00	0.61	0.02	0.65	0.18	0.19	0.16	0.59	0.04	0.11	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00