Doublet Group distance statistics: 50287

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 6, 7, 6, 11, 5, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.014, 0.024, 0.035, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.014, 0.027, 0.039, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.011, 0.024, 0.038, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.014, 0.029, 0.043, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.029 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.007, 0.026, 0.046, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.026 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.012, 0.035, 0.058, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.035 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.012, 0.043, 0.075, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.043 std_dev=0.031
O2'	B	0, 0.292, 0.486, 0.680, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.486 std_dev=0.194
O4'	A	0, 0.007, 0.214, 0.421, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.214 std_dev=0.207
C2'	B	0, 0.278, 0.498, 0.719, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.498 std_dev=0.221
C2'	A	0, -0.006, 0.218, 0.442, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.218 std_dev=0.224
C3'	B	0, 0.316, 0.553, 0.790, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.553 std_dev=0.237
O3'	B	0, 0.196, 0.441, 0.687, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.441 std_dev=0.246
C4'	A	0, 0.013, 0.348, 0.683, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.348 std_dev=0.335
C4'	B	0, 0.445, 0.782, 1.120, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.782 std_dev=0.337
C3'	A	0, 0.022, 0.364, 0.706, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.364 std_dev=0.342
O2'	A	0, -0.051, 0.296, 0.643, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.296 std_dev=0.347
O5'	A	0, -0.021, 0.357, 0.735, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.357 std_dev=0.378
P	A	0, 0.017, 0.416, 0.816, 2.091 max_d=2.091 avg_d=0.416 std_dev=0.399
O4'	B	0, 0.522, 0.923, 1.324, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.923 std_dev=0.401
C5'	A	0, 0.052, 0.477, 0.901, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.477 std_dev=0.425
C1'	B	0, 0.314, 0.740, 1.165, 2.217 max_d=2.217 avg_d=0.740 std_dev=0.425
OP2	A	0, 0.121, 0.570, 1.019, 2.416 max_d=2.416 avg_d=0.570 std_dev=0.449
C5'	B	0, 0.554, 1.037, 1.521, 2.408 max_d=2.408 avg_d=1.037 std_dev=0.483
O3'	A	0, 0.074, 0.558, 1.042, 2.609 max_d=2.609 avg_d=0.558 std_dev=0.484
O5'	B	0, 0.552, 1.070, 1.587, 3.004 max_d=3.004 avg_d=1.070 std_dev=0.518
OP1	A	0, -0.164, 0.443, 1.049, 3.082 max_d=3.082 avg_d=0.443 std_dev=0.606
O2	B	0, 0.147, 0.798, 1.450, 2.954 max_d=2.954 avg_d=0.798 std_dev=0.651
N1	B	0, 0.033, 0.732, 1.432, 3.526 max_d=3.526 avg_d=0.732 std_dev=0.699
C2	B	0, -0.022, 0.710, 1.442, 3.438 max_d=3.438 avg_d=0.710 std_dev=0.732
OP2	B	0, 0.384, 1.131, 1.878, 4.783 max_d=4.783 avg_d=1.131 std_dev=0.747
P	B	0, 0.525, 1.289, 2.052, 4.261 max_d=4.261 avg_d=1.289 std_dev=0.763
OP1	B	0, 0.781, 1.682, 2.584, 4.673 max_d=4.673 avg_d=1.682 std_dev=0.901
N3	B	0, -0.311, 0.752, 1.816, 4.995 max_d=4.995 avg_d=0.752 std_dev=1.064
C6	B	0, -0.169, 0.900, 1.968, 5.479 max_d=5.479 avg_d=0.900 std_dev=1.068
C4	B	0, -0.558, 0.871, 2.300, 6.905 max_d=6.905 avg_d=0.871 std_dev=1.429
C5	B	0, -0.458, 0.982, 2.422, 7.187 max_d=7.187 avg_d=0.982 std_dev=1.440
O4	B	0, -0.754, 0.991, 2.737, 8.398 max_d=8.398 avg_d=0.991 std_dev=1.745

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.11	0.01	0.23	0.28	0.18
C2	0.03	0.00	0.20	0.22	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.08	0.09	0.01	0.15	0.17	0.11
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.11	0.09	0.10	0.16	0.24	0.19	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.08	0.43	0.53	0.40
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.19	0.00	0.21	0.01	0.24	0.14	0.25	0.22	0.19	0.19	0.13	0.02	0.01	0.01	0.03	0.26	0.29	0.24	0.18
C4	0.01	0.01	0.10	0.19	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.04	0.09	0.01	0.15	0.17	0.10
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.09	0.08	0.06	0.05	0.10	0.05	0.15	0.01	0.00	0.01	0.10	0.15	0.12	0.07
C5	0.01	0.00	0.06	0.21	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.13	0.01	0.11	0.01	0.15	0.18	0.13
C5'	0.05	0.05	0.11	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.06	0.05	0.09	0.05	0.05	0.11	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.24	0.01	0.09	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.17	0.03	0.12	0.00	0.17	0.21	0.15
C8	0.01	0.01	0.10	0.14	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.08	0.07	0.12	0.01	0.13	0.17	0.11
N1	0.02	0.00	0.16	0.25	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.06	0.11	0.01	0.16	0.19	0.14
N2	0.03	0.00	0.24	0.22	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.10	0.08	0.01	0.16	0.17	0.11
N3	0.03	0.00	0.19	0.19	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.11	0.08	0.08	0.01	0.16	0.18	0.11
N7	0.01	0.01	0.06	0.19	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.13	0.05	0.13	0.01	0.15	0.19	0.14
N9	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.04	0.01	0.09	0.01	0.15	0.20	0.11
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.10	0.15	0.16	0.05	0.15	0.19	0.10	0.11	0.07	0.21	0.11	0.00	0.04	0.11	0.17	0.18	0.40	0.62	0.39
O3'	0.13	0.14	0.02	0.01	0.09	0.01	0.13	0.11	0.17	0.08	0.16	0.15	0.11	0.13	0.04	0.04	0.00	0.09	0.12	0.20	0.21	0.17	0.10
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.06	0.10	0.08	0.05	0.01	0.11	0.09	0.00	0.06	0.02	0.11	0.13	0.07
O5'	0.11	0.09	0.24	0.03	0.09	0.01	0.11	0.01	0.12	0.12	0.11	0.08	0.08	0.13	0.09	0.17	0.12	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.26	0.01	0.10	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.20	0.02	0.14	0.00	0.20	0.25	0.19
OP1	0.23	0.15	0.43	0.29	0.15	0.15	0.15	0.08	0.17	0.13	0.16	0.16	0.16	0.15	0.15	0.40	0.21	0.11	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.17	0.53	0.24	0.17	0.12	0.18	0.03	0.21	0.17	0.19	0.17	0.18	0.19	0.20	0.62	0.17	0.13	0.01	0.25	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.11	0.40	0.18	0.10	0.07	0.13	0.01	0.15	0.11	0.14	0.11	0.11	0.14	0.11	0.39	0.10	0.07	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.41	0.16	0.09	0.30	0.09	0.19	0.15	0.17	0.23	0.42	0.57	0.14	0.15	0.33	0.12	0.27	0.29	0.31	0.34
C2	0.36	0.69	0.22	0.10	0.78	0.10	0.64	0.17	0.52	0.52	0.82	0.74	0.13	0.12	0.87	0.26	0.36	0.41	0.47	0.50
C2'	0.22	0.33	0.17	0.31	0.23	0.26	0.15	0.34	0.17	0.19	0.35	0.48	0.24	0.30	0.28	0.22	0.44	0.38	0.48	0.48
C3'	0.16	0.32	0.16	0.08	0.20	0.07	0.12	0.09	0.13	0.16	0.32	0.48	0.19	0.10	0.24	0.11	0.14	0.27	0.20	0.18
C4	0.32	0.62	0.21	0.09	0.64	0.09	0.53	0.16	0.44	0.46	0.70	0.70	0.14	0.11	0.70	0.23	0.34	0.36	0.41	0.45
C4'	0.17	0.26	0.16	0.07	0.16	0.13	0.21	0.17	0.22	0.17	0.23	0.41	0.20	0.12	0.16	0.11	0.16	0.31	0.23	0.22
C5	0.39	0.70	0.24	0.12	0.80	0.13	0.71	0.20	0.60	0.57	0.82	0.72	0.15	0.13	0.87	0.28	0.38	0.43	0.47	0.52
C5'	0.28	0.29	0.18	0.09	0.28	0.12	0.34	0.18	0.34	0.28	0.27	0.37	0.28	0.10	0.27	0.17	0.17	0.34	0.27	0.23
C6	0.44	0.77	0.25	0.14	0.97	0.15	0.86	0.24	0.72	0.64	0.95	0.73	0.15	0.14	1.07	0.32	0.42	0.51	0.54	0.58
C8	0.31	0.53	0.22	0.08	0.52	0.09	0.46	0.15	0.41	0.41	0.56	0.60	0.17	0.12	0.55	0.21	0.32	0.32	0.36	0.40
N1	0.41	0.75	0.24	0.13	0.92	0.13	0.79	0.21	0.65	0.60	0.92	0.74	0.14	0.13	1.03	0.30	0.40	0.48	0.53	0.56
N2	0.35	0.69	0.21	0.09	0.78	0.10	0.63	0.17	0.51	0.51	0.82	0.75	0.12	0.12	0.88	0.25	0.36	0.42	0.47	0.50
N3	0.31	0.62	0.20	0.08	0.64	0.09	0.51	0.15	0.42	0.44	0.71	0.71	0.13	0.12	0.71	0.22	0.33	0.36	0.41	0.45
N7	0.40	0.67	0.25	0.13	0.75	0.14	0.69	0.21	0.61	0.57	0.75	0.67	0.17	0.14	0.79	0.29	0.38	0.42	0.45	0.50
N9	0.26	0.52	0.19	0.07	0.47	0.08	0.37	0.13	0.32	0.36	0.55	0.63	0.14	0.12	0.51	0.18	0.30	0.30	0.35	0.39
O2'	0.19	0.33	0.15	0.31	0.23	0.26	0.14	0.37	0.15	0.18	0.35	0.48	0.19	0.28	0.28	0.20	0.50	0.44	0.60	0.55
O3'	0.15	0.31	0.19	0.07	0.19	0.10	0.12	0.15	0.12	0.15	0.31	0.46	0.20	0.09	0.22	0.10	0.13	0.40	0.25	0.21
O4'	0.18	0.31	0.21	0.13	0.17	0.21	0.14	0.20	0.14	0.17	0.28	0.48	0.18	0.21	0.18	0.17	0.18	0.28	0.22	0.24
O5'	0.27	0.28	0.22	0.11	0.14	0.10	0.14	0.06	0.16	0.20	0.23	0.41	0.34	0.01	0.14	0.19	0.10	0.24	0.19	0.15
O6	0.48	0.82	0.25	0.17	1.13	0.18	1.02	0.29	0.85	0.72	1.05	0.70	0.15	0.16	1.26	0.36	0.46	0.59	0.62	0.65
OP1	0.23	0.19	0.05	0.06	0.27	0.10	0.32	0.30	0.29	0.18	0.21	0.26	0.15	0.01	0.30	0.17	0.40	0.71	0.59	0.54
OP2	0.09	0.34	0.14	0.05	0.58	0.06	0.61	0.12	0.50	0.31	0.47	0.31	0.11	0.02	0.65	0.06	0.21	0.49	0.31	0.29
P	0.13	0.17	0.09	0.01	0.24	0.02	0.26	0.14	0.21	0.09	0.20	0.26	0.15	0.01	0.28	0.08	0.20	0.43	0.32	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.18	0.01	0.00	0.05	0.28	0.14	0.11
C2	0.02	0.00	0.10	0.09	0.01	0.11	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.14	0.01	0.10	0.31	0.75	0.19	0.46
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.09	0.11	0.10	0.02	0.07	0.18	0.01	0.02	0.06	0.02	0.22	0.31	0.14	0.26
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.19	0.00	0.27	0.02	0.26	0.11	0.11	0.19	0.01	0.01	0.20	0.01	0.03	0.09	0.07	0.04
C4	0.01	0.01	0.05	0.19	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.12	0.00	0.02	0.18	0.39	0.53	0.17
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.20	0.05	0.07	0.23	0.14	0.02	0.08	0.00	0.02	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.27	0.00	0.18	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.14	0.01	0.09	0.46	0.16	0.89	0.46
C5'	0.04	0.26	0.11	0.02	0.09	0.01	0.27	0.00	0.29	0.04	0.19	0.49	0.05	0.13	0.09	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.26	0.01	0.20	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.12	0.01	0.12	0.46	0.13	0.78	0.44
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.01	0.08	0.35	0.29	0.12
N3	0.02	0.00	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.12	0.01	0.07	0.20	0.71	0.19	0.37
O2	0.03	0.00	0.18	0.19	0.01	0.23	0.01	0.49	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.20	0.02	0.16	0.65	1.06	0.56	0.85
O2'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.16	0.14	0.15	0.05	0.12	0.10	0.16	0.16	0.00	0.04	0.18	0.10	0.19	0.25	0.17	0.25
O3'	0.18	0.14	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.13	0.12	0.09	0.12	0.20	0.04	0.00	0.14	0.13	0.13	0.27	0.18	0.17
O4	0.01	0.01	0.06	0.20	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.14	0.00	0.02	0.19	0.42	0.57	0.18
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.07	0.16	0.10	0.13	0.02	0.00	0.07	0.23	0.16	0.08
O5'	0.05	0.31	0.22	0.03	0.18	0.02	0.46	0.01	0.46	0.08	0.20	0.65	0.19	0.13	0.19	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.28	0.75	0.31	0.09	0.39	0.08	0.16	0.06	0.13	0.35	0.71	1.06	0.25	0.27	0.42	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.19	0.14	0.07	0.53	0.03	0.89	0.10	0.78	0.29	0.19	0.56	0.17	0.18	0.57	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.46	0.26	0.04	0.17	0.02	0.46	0.01	0.44	0.12	0.37	0.85	0.25	0.17	0.18	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00