Doublet Group distance statistics: 50301

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.004, 0.006, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.009
O6	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2'	B	0, 0.128, 0.448, 0.769, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.448 std_dev=0.320
O2'	B	0, 0.156, 0.492, 0.829, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.492 std_dev=0.336
C3'	B	0, 0.009, 0.472, 0.935, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.472 std_dev=0.463
C5'	B	0, -0.133, 0.526, 1.186, 2.084 max_d=2.084 avg_d=0.526 std_dev=0.660
C4'	B	0, -0.176, 0.539, 1.254, 2.239 max_d=2.239 avg_d=0.539 std_dev=0.715
O4'	A	0, -0.359, 0.375, 1.109, 2.164 max_d=2.164 avg_d=0.375 std_dev=0.734
O5'	B	0, -0.195, 0.567, 1.330, 2.382 max_d=2.382 avg_d=0.567 std_dev=0.763
C2'	A	0, -0.383, 0.382, 1.147, 2.249 max_d=2.249 avg_d=0.382 std_dev=0.765
O3'	B	0, -0.259, 0.605, 1.469, 2.675 max_d=2.675 avg_d=0.605 std_dev=0.864
P	B	0, -0.240, 0.647, 1.533, 2.756 max_d=2.756 avg_d=0.647 std_dev=0.887
O3'	A	0, -0.455, 0.502, 1.459, 2.828 max_d=2.828 avg_d=0.502 std_dev=0.957
C3'	A	0, -0.491, 0.475, 1.440, 2.832 max_d=2.832 avg_d=0.475 std_dev=0.965
C4'	A	0, -0.462, 0.534, 1.531, 2.956 max_d=2.956 avg_d=0.534 std_dev=0.996
C1'	B	0, -0.282, 0.734, 1.751, 3.160 max_d=3.160 avg_d=0.734 std_dev=1.017
O4'	B	0, -0.349, 0.717, 1.782, 3.278 max_d=3.278 avg_d=0.717 std_dev=1.065
O2'	A	0, -0.569, 0.557, 1.684, 3.308 max_d=3.308 avg_d=0.557 std_dev=1.126
OP1	B	0, -0.444, 0.808, 2.060, 3.832 max_d=3.832 avg_d=0.808 std_dev=1.252
OP2	B	0, -0.490, 0.956, 2.402, 4.429 max_d=4.429 avg_d=0.956 std_dev=1.446
C5'	A	0, -0.759, 0.879, 2.516, 4.858 max_d=4.858 avg_d=0.879 std_dev=1.638
N1	B	0, -0.601, 1.087, 2.774, 5.158 max_d=5.158 avg_d=1.087 std_dev=1.687
P	A	0, -0.814, 1.046, 2.906, 5.573 max_d=5.573 avg_d=1.046 std_dev=1.860
C6	B	0, -0.512, 1.359, 3.229, 5.755 max_d=5.755 avg_d=1.359 std_dev=1.871
O5'	A	0, -1.008, 0.956, 2.919, 5.759 max_d=5.759 avg_d=0.956 std_dev=1.964
OP1	A	0, -0.848, 1.311, 3.470, 6.532 max_d=6.532 avg_d=1.311 std_dev=2.159
O2	B	0, -0.933, 1.366, 3.665, 6.945 max_d=6.945 avg_d=1.366 std_dev=2.299
C2	B	0, -1.015, 1.295, 3.605, 6.923 max_d=6.923 avg_d=1.295 std_dev=2.310
OP2	A	0, -1.127, 1.434, 3.995, 7.663 max_d=7.663 avg_d=1.434 std_dev=2.561
C5	B	0, -0.845, 1.754, 4.353, 7.934 max_d=7.934 avg_d=1.754 std_dev=2.599
N3	B	0, -1.362, 1.639, 4.641, 8.956 max_d=8.956 avg_d=1.639 std_dev=3.001
C4	B	0, -1.305, 1.881, 5.067, 9.603 max_d=9.603 avg_d=1.881 std_dev=3.186
O4	B	0, -1.640, 2.239, 6.119, 11.653 max_d=11.653 avg_d=2.239 std_dev=3.879

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.22	0.01	0.15	0.63	0.30
C2	0.01	0.00	0.46	0.32	0.00	0.16	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.43	0.19	0.36	0.25	0.01	0.28	1.04	0.42
C2'	0.00	0.46	0.00	0.00	0.23	0.02	0.10	0.15	0.20	0.23	0.35	0.55	0.45	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.14	0.40	0.11	0.19
C3'	0.01	0.32	0.00	0.00	0.25	0.01	0.25	0.00	0.30	0.12	0.33	0.33	0.28	0.19	0.15	0.02	0.01	0.03	0.06	0.30	0.19	0.08	0.15
C4	0.01	0.00	0.23	0.25	0.00	0.05	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.12	0.19	0.37	0.00	0.21	1.13	0.52
C4'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.04	0.14	0.11	0.21	0.15	0.10	0.03	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.06
C5	0.00	0.01	0.10	0.25	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.15	0.09	0.51	0.00	0.23	1.43	0.69
C5'	0.07	0.30	0.15	0.00	0.18	0.00	0.14	0.00	0.18	0.12	0.26	0.36	0.28	0.10	0.09	0.09	0.19	0.01	0.01	0.16	0.09	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.20	0.30	0.00	0.04	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.16	0.49	0.00	0.23	1.47	0.68
C8	0.01	0.01	0.23	0.12	0.00	0.14	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.44	0.05	0.20	0.63	0.01	0.29	1.43	0.78
N1	0.01	0.00	0.35	0.33	0.00	0.11	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.24	0.21	0.28	0.37	0.01	0.25	1.27	0.55
N2	0.02	0.00	0.55	0.33	0.00	0.21	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.61	0.21	0.43	0.17	0.01	0.33	0.90	0.34
N3	0.01	0.00	0.45	0.28	0.00	0.15	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.42	0.15	0.35	0.23	0.00	0.26	0.92	0.38
N7	0.01	0.01	0.12	0.19	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.37	0.10	0.10	0.65	0.01	0.30	1.61	0.83
N9	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.07	0.00	0.42	0.00	0.19	1.07	0.54
O2'	0.02	0.43	0.00	0.02	0.10	0.24	0.10	0.09	0.01	0.44	0.24	0.61	0.42	0.37	0.13	0.00	0.09	0.15	0.09	0.08	0.32	0.06	0.18
O3'	0.18	0.19	0.05	0.01	0.12	0.02	0.15	0.19	0.20	0.05	0.21	0.21	0.15	0.10	0.07	0.09	0.00	0.11	0.05	0.21	0.03	0.25	0.16
O4'	0.00	0.36	0.01	0.03	0.19	0.00	0.09	0.01	0.16	0.20	0.28	0.43	0.35	0.10	0.00	0.15	0.11	0.00	0.28	0.11	0.22	0.68	0.47
O5'	0.22	0.25	0.08	0.06	0.37	0.01	0.51	0.01	0.49	0.63	0.37	0.17	0.23	0.65	0.42	0.09	0.05	0.28	0.00	0.56	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.14	0.30	0.00	0.01	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.21	0.11	0.56	0.00	0.24	1.62	0.76
OP1	0.15	0.28	0.40	0.19	0.21	0.08	0.23	0.09	0.23	0.29	0.25	0.33	0.26	0.30	0.19	0.32	0.03	0.22	0.02	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.63	1.04	0.11	0.08	1.13	0.15	1.43	0.03	1.47	1.43	1.27	0.90	0.92	1.61	1.07	0.06	0.25	0.68	0.02	1.62	0.01	0.00	0.00
P	0.30	0.42	0.19	0.15	0.52	0.06	0.69	0.01	0.68	0.78	0.55	0.34	0.38	0.83	0.54	0.18	0.16	0.47	0.00	0.76	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.74	0.94	0.07	0.11	0.77	0.66	0.63	0.45	0.60	0.75	0.92	1.11	0.23	0.33	0.79	1.04	0.37	0.84	0.21	0.43
C2	0.55	0.86	0.11	0.25	0.74	0.45	0.59	0.26	0.53	0.62	0.89	1.06	0.28	0.46	0.80	0.80	0.15	0.95	0.35	0.26
C2'	1.61	1.83	0.82	0.69	1.65	1.34	1.47	1.01	1.44	1.64	1.80	1.97	0.57	0.40	1.66	1.84	0.89	1.16	0.52	0.86
C3'	1.28	1.45	0.61	0.56	1.28	1.02	1.12	0.68	1.10	1.28	1.42	1.60	0.38	0.37	1.29	1.41	0.75	0.87	0.54	0.72
C4	0.57	0.87	0.10	0.26	0.77	0.46	0.63	0.29	0.56	0.65	0.89	1.03	0.28	0.51	0.82	0.84	0.16	0.89	0.31	0.27
C4'	0.52	0.54	0.16	0.13	0.43	0.60	0.38	0.47	0.39	0.47	0.50	0.64	0.40	0.17	0.42	0.80	0.66	0.88	0.69	0.72
C5	0.46	0.80	0.13	0.35	0.76	0.31	0.63	0.17	0.55	0.58	0.85	0.92	0.31	0.61	0.83	0.68	0.08	0.80	0.55	0.14
C5'	0.30	0.19	0.22	0.18	0.22	0.55	0.27	0.55	0.29	0.25	0.18	0.17	0.58	0.14	0.21	0.59	0.93	1.01	1.12	1.02
C6	0.40	0.76	0.14	0.37	0.74	0.25	0.61	0.13	0.51	0.53	0.82	0.90	0.32	0.62	0.81	0.60	0.12	0.78	0.68	0.11
C8	0.53	0.83	0.11	0.34	0.80	0.37	0.69	0.25	0.62	0.66	0.87	0.91	0.31	0.66	0.85	0.80	0.12	0.70	0.37	0.20
N1	0.47	0.81	0.13	0.32	0.73	0.34	0.59	0.18	0.51	0.57	0.85	0.98	0.30	0.54	0.80	0.68	0.07	0.88	0.53	0.16
N2	0.57	0.88	0.11	0.22	0.73	0.48	0.58	0.29	0.51	0.62	0.89	1.10	0.26	0.40	0.79	0.82	0.19	0.99	0.30	0.30
N3	0.61	0.90	0.09	0.21	0.76	0.51	0.60	0.32	0.55	0.66	0.91	1.09	0.26	0.42	0.80	0.87	0.22	0.96	0.25	0.33
N7	0.41	0.76	0.13	0.40	0.78	0.22	0.67	0.13	0.57	0.57	0.83	0.84	0.32	0.70	0.85	0.62	0.16	0.66	0.63	0.12
N9	0.63	0.89	0.09	0.23	0.79	0.52	0.65	0.35	0.60	0.70	0.91	1.03	0.27	0.51	0.83	0.92	0.23	0.83	0.22	0.32
O2'	1.86	2.26	0.93	0.72	2.07	1.42	1.83	1.12	1.76	1.98	2.26	2.42	0.71	0.41	2.10	2.06	0.88	1.23	0.48	0.87
O3'	1.31	1.60	0.61	0.55	1.43	0.95	1.23	0.63	1.17	1.36	1.59	1.78	0.40	0.40	1.47	1.41	0.72	0.84	0.55	0.70
O4'	0.17	0.23	0.52	0.46	0.16	0.27	0.25	0.21	0.25	0.15	0.20	0.39	0.75	0.68	0.16	0.49	0.31	0.73	0.35	0.42
O5'	0.20	0.20	0.08	0.09	0.14	0.17	0.11	0.11	0.11	0.16	0.18	0.24	0.33	0.01	0.14	0.27	0.47	0.37	0.66	0.51
O6	0.31	0.69	0.16	0.42	0.71	0.15	0.60	0.11	0.48	0.47	0.78	0.81	0.33	0.66	0.80	0.46	0.24	0.65	0.89	0.17
OP1	0.31	0.45	0.23	0.17	0.29	0.11	0.16	0.17	0.15	0.30	0.41	0.59	0.65	0.03	0.29	0.21	0.79	0.50	1.23	0.89
OP2	0.17	0.11	0.08	0.17	0.15	0.66	0.26	1.01	0.28	0.16	0.10	0.21	0.09	0.01	0.14	0.49	0.52	0.86	0.36	0.53
P	0.08	0.08	0.12	0.01	0.09	0.21	0.10	0.30	0.11	0.09	0.08	0.11	0.28	0.00	0.08	0.13	0.18	0.09	0.42	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.20	0.01	0.00	0.24	0.47	0.25	0.34
C2	0.01	0.00	0.11	0.06	0.00	0.04	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.18	0.00	0.10	0.33	0.57	0.42	0.49
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.13	0.14	0.16	0.01	0.07	0.23	0.00	0.01	0.04	0.01	0.08	0.17	0.09	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.05	0.06	0.08	0.02	0.00	0.08	0.03	0.05	0.14	0.08	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.01	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.10	0.00	0.01	0.48	0.69	0.70	0.69
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.03	0.07	0.19	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.02	0.06
C5	0.01	0.01	0.13	0.09	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.30	0.06	0.00	0.08	0.53	0.70	0.75	0.73
C5'	0.05	0.12	0.14	0.01	0.13	0.00	0.13	0.00	0.13	0.10	0.13	0.12	0.06	0.12	0.14	0.01	0.01	0.11	0.11	0.01
C6	0.01	0.00	0.16	0.09	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.07	0.00	0.11	0.50	0.65	0.64	0.65
N1	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.13	0.01	0.00	0.37	0.57	0.45	0.51
N3	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.15	0.00	0.07	0.40	0.64	0.55	0.59
O2	0.02	0.00	0.23	0.08	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.36	0.24	0.00	0.16	0.24	0.52	0.28	0.39
O2'	0.04	0.16	0.00	0.02	0.19	0.19	0.30	0.06	0.29	0.09	0.13	0.36	0.00	0.06	0.20	0.11	0.10	0.29	0.12	0.09
O3'	0.20	0.18	0.01	0.00	0.10	0.02	0.06	0.12	0.07	0.13	0.15	0.24	0.06	0.00	0.10	0.14	0.03	0.10	0.12	0.04
O4	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.10	0.00	0.01	0.50	0.72	0.76	0.74
O4'	0.00	0.10	0.01	0.03	0.01	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.07	0.16	0.11	0.14	0.01	0.00	0.30	0.52	0.36	0.42
O5'	0.24	0.33	0.08	0.05	0.48	0.01	0.53	0.01	0.50	0.37	0.40	0.24	0.10	0.03	0.50	0.30	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.47	0.57	0.17	0.14	0.69	0.19	0.70	0.11	0.65	0.57	0.64	0.52	0.29	0.10	0.72	0.52	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.42	0.09	0.08	0.70	0.02	0.75	0.11	0.64	0.45	0.55	0.28	0.12	0.12	0.76	0.36	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.34	0.49	0.07	0.04	0.69	0.06	0.73	0.01	0.65	0.51	0.59	0.39	0.09	0.04	0.74	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00