Doublet Group distance statistics: 50302

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.012, 0.022, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.006, 0.027, 0.047, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.027 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.008, 0.035, 0.061, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.041, 0.078, 0.115, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.078 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.026, 0.073, 0.120, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.073 std_dev=0.047
C2'	A	0, 0.018, 0.084, 0.150, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.084 std_dev=0.066
C4'	A	0, 0.033, 0.140, 0.248, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.140 std_dev=0.107
C3'	A	0, 0.029, 0.159, 0.290, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.159 std_dev=0.131
O5'	A	0, 0.070, 0.207, 0.345, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.207 std_dev=0.138
O2'	A	0, 0.039, 0.181, 0.323, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.181 std_dev=0.142
C5'	A	0, 0.057, 0.201, 0.345, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.201 std_dev=0.144
P	A	0, 0.101, 0.248, 0.396, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.248 std_dev=0.147
O3'	B	0, 0.088, 0.252, 0.416, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.252 std_dev=0.164
C3'	B	0, 0.086, 0.265, 0.445, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.265 std_dev=0.179
O2'	B	0, 0.099, 0.281, 0.464, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.281 std_dev=0.182
C2'	B	0, 0.083, 0.269, 0.456, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.269 std_dev=0.186
O3'	A	0, 0.044, 0.243, 0.442, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.243 std_dev=0.199
OP2	A	0, 0.102, 0.303, 0.504, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.303 std_dev=0.201
C4'	B	0, 0.084, 0.287, 0.490, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.287 std_dev=0.203
C1'	B	0, 0.089, 0.302, 0.515, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.302 std_dev=0.213
O5'	B	0, 0.108, 0.333, 0.559, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.333 std_dev=0.225
OP1	A	0, 0.094, 0.326, 0.557, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.326 std_dev=0.232
N1	B	0, 0.081, 0.313, 0.546, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.313 std_dev=0.232
O4'	B	0, 0.070, 0.310, 0.550, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.310 std_dev=0.240
O2	B	0, 0.106, 0.347, 0.589, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.347 std_dev=0.241
C5'	B	0, 0.105, 0.347, 0.589, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.347 std_dev=0.242
C6	B	0, 0.116, 0.360, 0.604, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.360 std_dev=0.244
C2	B	0, 0.073, 0.325, 0.576, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.325 std_dev=0.251
C5	B	0, 0.118, 0.371, 0.625, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.371 std_dev=0.253
N3	B	0, 0.102, 0.379, 0.656, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.379 std_dev=0.277
C4	B	0, 0.087, 0.369, 0.650, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.369 std_dev=0.282
P	B	0, 0.122, 0.424, 0.726, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.424 std_dev=0.302
O4	B	0, 0.090, 0.418, 0.745, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.418 std_dev=0.327
OP2	B	0, 0.098, 0.430, 0.761, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.430 std_dev=0.331
OP1	B	0, 0.136, 0.490, 0.844, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.490 std_dev=0.354

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.05	0.08	0.04
C2	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.09	0.02	0.06	0.11	0.06
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.03	0.10	0.05
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.10	0.09	0.09	0.07	0.07	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.05	0.11	0.05	0.09	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.09	0.02	0.06	0.10	0.06
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.03	0.02	0.06	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.11	0.02	0.07	0.11	0.07
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.06	0.06	0.04	0.03	0.07	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.12	0.02	0.12	0.01	0.08	0.13	0.08
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.10	0.04	0.07	0.08	0.06
N1	0.02	0.00	0.05	0.09	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.12	0.02	0.11	0.02	0.07	0.13	0.08
N2	0.03	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.10	0.03	0.09	0.02	0.06	0.13	0.06
N3	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.08	0.02	0.08	0.01	0.06	0.11	0.06
N7	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.02	0.11	0.05	0.08	0.11	0.08
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.03	0.06	0.09	0.05
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.04	0.06	0.04	0.06	0.05	0.03	0.08	0.12	0.08	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.06	0.08	0.03
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.12	0.10	0.12	0.10	0.08	0.11	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.14	0.07	0.10	0.07
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.03	0.06	0.06	0.04
O5'	0.06	0.09	0.05	0.05	0.09	0.01	0.11	0.01	0.12	0.10	0.11	0.09	0.08	0.11	0.08	0.04	0.07	0.06	0.00	0.14	0.01	0.03	0.00
O6	0.03	0.02	0.04	0.11	0.02	0.07	0.02	0.09	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.03	0.05	0.14	0.03	0.14	0.00	0.10	0.16	0.11
OP1	0.05	0.06	0.03	0.05	0.06	0.02	0.07	0.02	0.08	0.07	0.07	0.06	0.06	0.08	0.06	0.06	0.07	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.11	0.10	0.09	0.10	0.04	0.11	0.02	0.13	0.08	0.13	0.13	0.11	0.11	0.09	0.08	0.10	0.06	0.03	0.16	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.06	0.05	0.05	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.06	0.08	0.06	0.06	0.08	0.05	0.03	0.07	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.11	0.12	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.14	0.09	0.14	0.18	0.19	0.08	0.11	0.11	0.08	0.06	0.04	0.07
C2	0.12	0.12	0.10	0.06	0.11	0.07	0.06	0.07	0.12	0.07	0.17	0.18	0.17	0.10	0.15	0.10	0.08	0.09	0.09	0.09
C2'	0.13	0.13	0.13	0.07	0.10	0.07	0.08	0.07	0.13	0.09	0.17	0.20	0.19	0.07	0.14	0.10	0.06	0.07	0.05	0.06
C3'	0.10	0.15	0.11	0.07	0.13	0.07	0.05	0.08	0.11	0.07	0.20	0.22	0.17	0.07	0.16	0.08	0.05	0.09	0.07	0.05
C4	0.13	0.13	0.11	0.07	0.10	0.08	0.07	0.08	0.12	0.09	0.16	0.20	0.19	0.10	0.14	0.10	0.08	0.08	0.07	0.08
C4'	0.11	0.11	0.11	0.07	0.08	0.08	0.06	0.09	0.12	0.07	0.14	0.16	0.18	0.07	0.11	0.09	0.07	0.04	0.09	0.06
C5	0.13	0.14	0.11	0.06	0.11	0.06	0.07	0.07	0.12	0.09	0.18	0.21	0.19	0.10	0.15	0.10	0.08	0.09	0.09	0.09
C5'	0.09	0.12	0.10	0.06	0.09	0.08	0.05	0.10	0.10	0.06	0.15	0.17	0.15	0.07	0.11	0.08	0.07	0.05	0.11	0.06
C6	0.12	0.15	0.09	0.05	0.13	0.05	0.06	0.05	0.10	0.08	0.19	0.22	0.17	0.10	0.17	0.08	0.08	0.10	0.12	0.09
C8	0.15	0.14	0.14	0.08	0.09	0.08	0.08	0.08	0.14	0.10	0.16	0.21	0.22	0.10	0.12	0.11	0.09	0.08	0.06	0.09
N1	0.12	0.13	0.09	0.05	0.12	0.06	0.06	0.06	0.11	0.08	0.18	0.20	0.16	0.09	0.17	0.09	0.08	0.11	0.12	0.10
N2	0.12	0.11	0.09	0.06	0.11	0.07	0.06	0.07	0.11	0.07	0.17	0.18	0.16	0.09	0.16	0.10	0.08	0.10	0.10	0.09
N3	0.13	0.12	0.10	0.07	0.10	0.08	0.06	0.08	0.12	0.08	0.16	0.19	0.18	0.09	0.14	0.11	0.08	0.08	0.08	0.08
N7	0.14	0.16	0.13	0.07	0.11	0.07	0.07	0.07	0.13	0.10	0.18	0.23	0.21	0.11	0.14	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09
N9	0.14	0.13	0.12	0.07	0.09	0.08	0.08	0.08	0.13	0.09	0.15	0.19	0.20	0.09	0.12	0.11	0.08	0.07	0.06	0.08
O2'	0.10	0.13	0.09	0.04	0.11	0.06	0.05	0.11	0.10	0.06	0.17	0.19	0.16	0.05	0.14	0.07	0.07	0.05	0.11	0.06
O3'	0.10	0.17	0.11	0.08	0.15	0.09	0.06	0.10	0.11	0.07	0.22	0.22	0.17	0.08	0.18	0.08	0.07	0.10	0.11	0.07
O4'	0.13	0.09	0.12	0.08	0.07	0.08	0.09	0.08	0.14	0.09	0.12	0.15	0.19	0.07	0.09	0.11	0.09	0.05	0.06	0.07
O5'	0.05	0.18	0.08	0.03	0.13	0.02	0.04	0.08	0.07	0.06	0.21	0.24	0.11	0.01	0.15	0.02	0.06	0.08	0.06	0.06
O6	0.11	0.17	0.07	0.04	0.16	0.03	0.06	0.04	0.09	0.08	0.22	0.24	0.15	0.09	0.20	0.07	0.07	0.12	0.14	0.10
OP1	0.06	0.12	0.02	0.03	0.09	0.10	0.05	0.15	0.07	0.06	0.14	0.16	0.04	0.01	0.09	0.10	0.11	0.06	0.14	0.08
OP2	0.06	0.20	0.09	0.03	0.15	0.03	0.05	0.07	0.07	0.07	0.23	0.25	0.09	0.01	0.16	0.06	0.10	0.19	0.06	0.12
P	0.03	0.16	0.05	0.02	0.12	0.04	0.03	0.08	0.06	0.05	0.18	0.21	0.06	0.01	0.12	0.04	0.06	0.09	0.06	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.09	0.04
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.02	0.03	0.09	0.10	0.19	0.11
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.09	0.14	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.07	0.10	0.06
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.10	0.13	0.02	0.01	0.06	0.02	0.05	0.08	0.06	0.06
C4	0.03	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.02	0.12	0.18	0.27	0.17
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.14	0.19	0.28	0.18
C5'	0.03	0.06	0.01	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.12	0.07	0.07	0.04	0.05	0.04	0.11	0.01	0.01	0.10	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.02	0.03	0.13	0.15	0.22	0.14
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.09	0.09	0.16	0.09
N3	0.02	0.01	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.13	0.02	0.03	0.11	0.14	0.23	0.14
O2	0.02	0.01	0.14	0.13	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.14	0.17	0.03	0.05	0.08	0.09	0.17	0.09
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.05	0.01	0.05	0.03	0.01	0.08	0.14	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02	0.05	0.05	0.02
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.08	0.02	0.03	0.04	0.06	0.03	0.13	0.17	0.02	0.00	0.08	0.02	0.05	0.07	0.04	0.05
O4	0.03	0.02	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.11	0.02	0.03	0.02	0.03	0.06	0.08	0.00	0.02	0.13	0.21	0.30	0.20
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.06	0.11	0.04	0.07
O5'	0.04	0.09	0.06	0.05	0.12	0.01	0.14	0.01	0.13	0.09	0.11	0.08	0.02	0.05	0.13	0.06	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.06	0.10	0.07	0.08	0.18	0.07	0.19	0.10	0.15	0.09	0.14	0.09	0.05	0.07	0.21	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.19	0.10	0.06	0.27	0.02	0.28	0.01	0.22	0.16	0.23	0.17	0.05	0.04	0.30	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.11	0.06	0.06	0.17	0.02	0.18	0.01	0.14	0.09	0.14	0.09	0.02	0.05	0.20	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00