Doublet Group distance statistics: 50307

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.005, 0.026, 0.046, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.009, 0.036, 0.062, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.036 std_dev=0.027
C4	A	0, 0.011, 0.038, 0.064, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.038 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.012, 0.041, 0.070, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.041 std_dev=0.029
C2	A	0, 0.013, 0.044, 0.075, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.044 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.012, 0.044, 0.076, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.044 std_dev=0.032
N3	A	0, 0.014, 0.049, 0.084, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.049 std_dev=0.035
C1'	A	0, 0.014, 0.050, 0.086, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.050 std_dev=0.036
O6	A	0, 0.016, 0.054, 0.093, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.054 std_dev=0.038
N2	A	0, 0.027, 0.095, 0.164, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.095 std_dev=0.068
C2'	A	0, 0.011, 0.153, 0.295, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.153 std_dev=0.142
O2'	A	0, 0.029, 0.191, 0.353, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.191 std_dev=0.162
O4'	A	0, 0.052, 0.242, 0.431, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.242 std_dev=0.190
O3'	B	0, 0.082, 0.302, 0.522, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.302 std_dev=0.220
C3'	B	0, 0.082, 0.342, 0.601, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.342 std_dev=0.260
C3'	A	0, 0.100, 0.371, 0.641, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.371 std_dev=0.271
C2'	B	0, 0.045, 0.321, 0.596, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.321 std_dev=0.275
O2'	B	0, 0.104, 0.385, 0.666, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.385 std_dev=0.281
P	A	0, 0.124, 0.423, 0.723, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.423 std_dev=0.300
C4'	A	0, 0.117, 0.428, 0.738, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.428 std_dev=0.310
OP2	A	0, 0.124, 0.442, 0.761, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.442 std_dev=0.319
O3'	A	0, 0.150, 0.524, 0.899, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.524 std_dev=0.375
OP1	A	0, 0.149, 0.528, 0.906, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.528 std_dev=0.378
O5'	A	0, 0.185, 0.637, 1.090, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.637 std_dev=0.453
C1'	B	0, 0.116, 0.587, 1.058, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.587 std_dev=0.471
C5'	A	0, 0.185, 0.741, 1.298, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.741 std_dev=0.557
C4'	B	0, 0.181, 0.750, 1.320, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.750 std_dev=0.570
O4'	B	0, 0.175, 0.752, 1.328, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.752 std_dev=0.577
N1	B	0, 0.265, 1.096, 1.927, 2.010 max_d=2.010 avg_d=1.096 std_dev=0.831
O5'	B	0, 0.185, 1.093, 2.001, 2.223 max_d=2.223 avg_d=1.093 std_dev=0.908
O2	B	0, 0.347, 1.327, 2.308, 2.339 max_d=2.339 avg_d=1.327 std_dev=0.981
C2	B	0, 0.333, 1.328, 2.324, 2.397 max_d=2.397 avg_d=1.328 std_dev=0.995
C5'	B	0, 0.309, 1.316, 2.322, 2.445 max_d=2.445 avg_d=1.316 std_dev=1.007
P	B	0, 0.384, 1.409, 2.435, 2.410 max_d=2.410 avg_d=1.409 std_dev=1.026
OP2	B	0, 0.421, 1.454, 2.487, 2.310 max_d=2.310 avg_d=1.454 std_dev=1.033
C6	B	0, 0.385, 1.453, 2.521, 2.538 max_d=2.538 avg_d=1.453 std_dev=1.068
OP1	B	0, 0.477, 1.629, 2.782, 2.453 max_d=2.453 avg_d=1.629 std_dev=1.152
N3	B	0, 0.457, 1.749, 3.041, 3.083 max_d=3.083 avg_d=1.749 std_dev=1.292
C5	B	0, 0.499, 1.856, 3.214, 3.208 max_d=3.208 avg_d=1.856 std_dev=1.357
C4	B	0, 0.530, 1.991, 3.453, 3.468 max_d=3.468 avg_d=1.991 std_dev=1.462
O4	B	0, 0.641, 2.376, 4.111, 4.094 max_d=4.094 avg_d=2.376 std_dev=1.735

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.02	0.11	0.10	0.04
C2	0.04	0.00	0.03	0.09	0.01	0.04	0.02	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.03	0.17	0.01	0.10	0.06	0.04
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.18	0.08
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.09	0.11	0.10	0.09	0.08	0.11	0.06	0.05	0.01	0.01	0.11	0.10	0.02	0.21	0.13
C4	0.02	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.18	0.01	0.09	0.07	0.04
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.06	0.03	0.03	0.07	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.08	0.11	0.08	0.03
C5	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.22	0.01	0.10	0.05	0.08
C5'	0.01	0.11	0.01	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.15	0.09	0.14	0.09	0.09	0.13	0.06	0.03	0.03	0.00	0.01	0.17	0.10	0.02	0.00
C6	0.02	0.01	0.02	0.09	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.11	0.02	0.23	0.00	0.12	0.06	0.10
C8	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.03	0.19	0.02	0.07	0.08	0.05
N1	0.02	0.00	0.02	0.10	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.21	0.01	0.12	0.04	0.08
N2	0.05	0.01	0.03	0.09	0.02	0.03	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.12	0.05	0.15	0.01	0.09	0.07	0.03
N3	0.04	0.00	0.03	0.08	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.15	0.01	0.09	0.08	0.03
N7	0.02	0.02	0.05	0.11	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.23	0.02	0.10	0.06	0.09
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.16	0.01	0.08	0.09	0.03
O2'	0.00	0.06	0.00	0.05	0.04	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.08	0.05	0.04	0.03	0.00	0.08	0.02	0.06	0.06	0.11	0.14	0.06
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.08	0.02	0.11	0.03	0.11	0.12	0.11	0.12	0.09	0.13	0.06	0.08	0.00	0.02	0.20	0.13	0.06	0.26	0.18
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.02	0.15	0.07	0.07
O5'	0.11	0.17	0.04	0.11	0.18	0.03	0.22	0.01	0.23	0.19	0.21	0.15	0.15	0.23	0.16	0.06	0.20	0.14	0.00	0.25	0.02	0.00	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.13	0.02	0.25	0.00	0.14	0.10	0.13
OP1	0.11	0.10	0.04	0.02	0.09	0.11	0.10	0.10	0.12	0.07	0.12	0.09	0.09	0.10	0.08	0.11	0.06	0.15	0.02	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.06	0.18	0.21	0.07	0.08	0.05	0.02	0.06	0.08	0.04	0.07	0.08	0.06	0.09	0.14	0.26	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.04	0.08	0.13	0.04	0.03	0.08	0.00	0.10	0.05	0.08	0.03	0.03	0.09	0.03	0.06	0.18	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.38	0.26	0.17	0.45	0.18	0.45	0.22	0.44	0.39	0.43	0.33	0.21	0.04	0.46	0.27	0.19	0.22	0.11	0.16
C2	0.29	0.34	0.18	0.17	0.65	0.27	0.66	0.44	0.56	0.41	0.49	0.17	0.17	0.04	0.74	0.35	0.39	0.29	0.32	0.35
C2'	0.27	0.34	0.22	0.11	0.41	0.10	0.40	0.13	0.37	0.34	0.40	0.32	0.20	0.11	0.44	0.20	0.11	0.21	0.13	0.14
C3'	0.13	0.22	0.13	0.03	0.27	0.06	0.23	0.06	0.21	0.18	0.28	0.24	0.16	0.18	0.31	0.06	0.05	0.22	0.14	0.13
C4	0.29	0.31	0.21	0.18	0.53	0.26	0.57	0.40	0.51	0.39	0.42	0.17	0.18	0.03	0.56	0.33	0.35	0.27	0.25	0.30
C4'	0.14	0.22	0.14	0.06	0.25	0.05	0.23	0.05	0.22	0.19	0.26	0.25	0.16	0.11	0.28	0.08	0.03	0.21	0.10	0.10
C5	0.26	0.19	0.18	0.18	0.46	0.32	0.56	0.49	0.50	0.33	0.30	0.11	0.16	0.01	0.49	0.35	0.43	0.32	0.33	0.37
C5'	0.02	0.18	0.03	0.03	0.16	0.13	0.11	0.13	0.09	0.07	0.21	0.26	0.11	0.17	0.19	0.07	0.11	0.21	0.12	0.11
C6	0.24	0.17	0.15	0.18	0.51	0.34	0.61	0.54	0.52	0.32	0.29	0.11	0.14	0.03	0.57	0.37	0.49	0.36	0.42	0.44
C8	0.27	0.17	0.21	0.19	0.29	0.27	0.38	0.37	0.40	0.29	0.23	0.16	0.19	0.02	0.28	0.31	0.32	0.25	0.20	0.26
N1	0.27	0.26	0.17	0.18	0.61	0.32	0.66	0.51	0.56	0.37	0.40	0.07	0.16	0.01	0.70	0.37	0.47	0.35	0.40	0.42
N2	0.29	0.37	0.17	0.15	0.69	0.26	0.69	0.42	0.57	0.42	0.53	0.20	0.17	0.06	0.80	0.34	0.38	0.28	0.32	0.34
N3	0.30	0.37	0.21	0.17	0.62	0.25	0.62	0.38	0.54	0.42	0.50	0.23	0.18	0.05	0.68	0.33	0.33	0.26	0.26	0.29
N7	0.23	0.11	0.17	0.19	0.29	0.32	0.43	0.49	0.43	0.26	0.20	0.19	0.15	0.02	0.28	0.34	0.43	0.31	0.31	0.36
N9	0.30	0.30	0.23	0.18	0.43	0.23	0.48	0.32	0.46	0.37	0.37	0.21	0.20	0.04	0.44	0.30	0.28	0.24	0.18	0.23
O2'	0.34	0.44	0.29	0.16	0.48	0.14	0.45	0.14	0.43	0.41	0.48	0.42	0.25	0.05	0.51	0.26	0.12	0.23	0.11	0.14
O3'	0.12	0.20	0.13	0.05	0.24	0.11	0.18	0.14	0.16	0.15	0.27	0.23	0.18	0.20	0.29	0.05	0.13	0.27	0.19	0.18
O4'	0.23	0.27	0.21	0.14	0.31	0.11	0.32	0.14	0.32	0.28	0.30	0.27	0.19	0.05	0.32	0.19	0.11	0.22	0.07	0.12
O5'	0.18	0.20	0.20	0.15	0.20	0.08	0.20	0.04	0.22	0.19	0.23	0.24	0.20	0.01	0.21	0.13	0.06	0.22	0.16	0.14
O6	0.21	0.10	0.11	0.18	0.42	0.37	0.58	0.60	0.48	0.26	0.20	0.19	0.11	0.05	0.49	0.37	0.55	0.42	0.49	0.51
OP1	0.12	0.22	0.04	0.09	0.25	0.23	0.24	0.41	0.21	0.17	0.25	0.24	0.10	0.01	0.27	0.21	0.32	0.33	0.30	0.29
OP2	0.09	0.36	0.05	0.02	0.35	0.10	0.22	0.15	0.15	0.21	0.40	0.39	0.06	0.01	0.38	0.08	0.18	0.26	0.17	0.19
P	0.02	0.22	0.04	0.00	0.18	0.04	0.10	0.11	0.06	0.10	0.25	0.27	0.10	0.00	0.21	0.05	0.05	0.19	0.13	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.21	0.55	0.32
C2	0.01	0.00	0.08	0.17	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.20	0.01	0.01	0.14	0.31	0.57	0.34
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.15	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.09	0.38	0.21
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.08	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.15	0.23	0.04	0.01	0.09	0.01	0.04	0.10	0.23	0.11
C4	0.02	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.00	0.07	0.21	0.36	0.50	0.31
C4'	0.00	0.06	0.03	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.10	0.00	0.03	0.13	0.05	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.23	0.11
C5	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.09	0.25	0.36	0.51	0.32
C5'	0.02	0.02	0.01	0.02	0.13	0.01	0.19	0.00	0.17	0.05	0.05	0.08	0.05	0.04	0.14	0.00	0.01	0.08	0.06	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.04	0.02	0.10	0.01	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.08	0.22	0.33	0.56	0.32
N1	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.03	0.15	0.30	0.58	0.34
N3	0.01	0.00	0.06	0.15	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.21	0.01	0.04	0.16	0.34	0.54	0.33
O2	0.02	0.00	0.15	0.23	0.01	0.13	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.28	0.02	0.02	0.15	0.30	0.58	0.35
O2'	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.05	0.01	0.03	0.09	0.00	0.10	0.01	0.03	0.11	0.04	0.39	0.23
O3'	0.01	0.20	0.02	0.01	0.14	0.01	0.05	0.04	0.04	0.07	0.21	0.28	0.10	0.00	0.16	0.01	0.02	0.19	0.10	0.05
O4	0.02	0.01	0.02	0.09	0.00	0.04	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.00	0.08	0.22	0.37	0.46	0.31
O4'	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.08	0.00	0.11	0.21	0.53	0.32
O5'	0.11	0.14	0.08	0.04	0.21	0.02	0.25	0.01	0.22	0.15	0.16	0.15	0.11	0.02	0.22	0.11	0.00	0.03	0.00	0.01
OP1	0.21	0.31	0.09	0.10	0.36	0.03	0.36	0.08	0.33	0.30	0.34	0.30	0.04	0.19	0.37	0.21	0.03	0.00	0.00	0.00
OP2	0.55	0.57	0.38	0.23	0.50	0.23	0.51	0.06	0.56	0.58	0.54	0.58	0.39	0.10	0.46	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.32	0.34	0.21	0.11	0.31	0.11	0.32	0.02	0.32	0.34	0.33	0.35	0.23	0.05	0.31	0.32	0.01	0.00	0.00	0.00