Doublet Group distance statistics: 50308

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.006, 0.026, 0.047, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.004, 0.026, 0.048, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.022
C5	A	0, -0.001, 0.032, 0.065, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.032 std_dev=0.033
N3	A	0, 0.003, 0.037, 0.071, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.037 std_dev=0.034
N1	A	0, 0.005, 0.045, 0.086, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.045 std_dev=0.040
O6	A	0, -0.002, 0.041, 0.084, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.041 std_dev=0.043
C4	A	0, 0.001, 0.047, 0.093, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.047 std_dev=0.046
N9	A	0, 0.003, 0.056, 0.108, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.056 std_dev=0.052
N7	A	0, 0.003, 0.078, 0.153, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.078 std_dev=0.075
C8	A	0, 0.005, 0.098, 0.192, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.098 std_dev=0.094
O2'	B	0, 0.114, 0.477, 0.839, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.477 std_dev=0.363
O2'	A	0, -0.003, 0.386, 0.775, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.386 std_dev=0.389
C2'	B	0, -0.054, 0.407, 0.869, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.407 std_dev=0.461
C2'	A	0, 0.012, 0.555, 1.097, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.555 std_dev=0.542
O4'	A	0, 0.039, 0.664, 1.289, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.664 std_dev=0.625
C3'	B	0, 0.035, 0.674, 1.314, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.674 std_dev=0.640
O3'	B	0, 0.120, 0.873, 1.627, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.873 std_dev=0.753
O4'	B	0, -0.191, 0.710, 1.612, 1.983 max_d=1.983 avg_d=0.710 std_dev=0.902
O5'	A	0, 0.383, 1.328, 2.273, 2.124 max_d=2.124 avg_d=1.328 std_dev=0.945
C3'	A	0, 0.083, 1.083, 2.084, 2.413 max_d=2.413 avg_d=1.083 std_dev=1.000
C4'	B	0, -0.171, 0.833, 1.836, 2.244 max_d=2.244 avg_d=0.833 std_dev=1.003
C4'	A	0, 0.117, 1.130, 2.143, 2.458 max_d=2.458 avg_d=1.130 std_dev=1.013
C1'	B	0, -0.173, 0.874, 1.921, 2.346 max_d=2.346 avg_d=0.874 std_dev=1.047
P	A	0, 0.447, 1.526, 2.606, 2.314 max_d=2.314 avg_d=1.526 std_dev=1.080
O3'	A	0, 0.057, 1.453, 2.848, 3.336 max_d=3.336 avg_d=1.453 std_dev=1.395
OP2	A	0, 0.579, 2.079, 3.578, 3.482 max_d=3.482 avg_d=2.079 std_dev=1.500
OP1	A	0, 0.636, 2.171, 3.706, 3.272 max_d=3.272 avg_d=2.171 std_dev=1.535
C5'	A	0, 0.210, 1.793, 3.377, 3.851 max_d=3.851 avg_d=1.793 std_dev=1.583
C5'	B	0, -0.379, 1.607, 3.594, 4.406 max_d=4.406 avg_d=1.607 std_dev=1.986
N1	B	0, -0.263, 1.809, 3.880, 4.709 max_d=4.709 avg_d=1.809 std_dev=2.072
O5'	B	0, -0.219, 2.187, 4.594, 5.540 max_d=5.540 avg_d=2.187 std_dev=2.407
C6	B	0, -0.231, 2.359, 4.949, 5.965 max_d=5.965 avg_d=2.359 std_dev=2.590
C2	B	0, -0.292, 2.473, 5.238, 6.332 max_d=6.332 avg_d=2.473 std_dev=2.765
O2	B	0, -0.217, 2.608, 5.432, 6.532 max_d=6.532 avg_d=2.608 std_dev=2.825
P	B	0, -0.321, 3.112, 6.544, 7.894 max_d=7.894 avg_d=3.112 std_dev=3.432
C5	B	0, -0.316, 3.211, 6.738, 8.123 max_d=8.123 avg_d=3.211 std_dev=3.527
N3	B	0, -0.371, 3.281, 6.934, 8.377 max_d=8.377 avg_d=3.281 std_dev=3.653
OP1	B	0, -0.184, 3.524, 7.233, 8.650 max_d=8.650 avg_d=3.524 std_dev=3.708
C4	B	0, -0.410, 3.628, 7.666, 9.261 max_d=9.261 avg_d=3.628 std_dev=4.038
OP2	B	0, -0.601, 3.454, 7.510, 9.146 max_d=9.146 avg_d=3.454 std_dev=4.056
O4	B	0, -0.479, 4.429, 9.337, 11.272 max_d=11.272 avg_d=4.429 std_dev=4.908

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.01	0.08	0.40	0.20
C2	0.01	0.00	0.35	0.54	0.01	0.29	0.01	0.41	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.65	0.05	0.34	0.00	0.36	0.76	0.43
C2'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.19	0.01	0.12	0.02	0.19	0.09	0.29	0.40	0.34	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.37	0.17	0.30	0.38	0.23
C3'	0.00	0.54	0.00	0.00	0.29	0.00	0.22	0.01	0.34	0.14	0.48	0.62	0.47	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.48	0.31	0.54	0.32	0.33
C4	0.00	0.01	0.19	0.29	0.00	0.17	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.31	0.03	0.37	0.01	0.30	0.71	0.39
C4'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.17	0.00	0.15	0.01	0.22	0.07	0.28	0.33	0.25	0.07	0.06	0.06	0.03	0.00	0.02	0.21	0.18	0.24	0.08
C5	0.00	0.01	0.12	0.22	0.00	0.15	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.25	0.03	0.46	0.01	0.39	0.82	0.46
C5'	0.03	0.41	0.02	0.01	0.26	0.01	0.26	0.00	0.35	0.10	0.42	0.45	0.34	0.14	0.11	0.07	0.05	0.01	0.01	0.35	0.38	0.35	0.01
C6	0.01	0.00	0.19	0.34	0.01	0.22	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.41	0.04	0.46	0.00	0.46	0.87	0.50
C8	0.00	0.01	0.09	0.14	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.01	0.51	0.01	0.27	0.67	0.39
N1	0.01	0.00	0.29	0.48	0.01	0.28	0.01	0.42	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.58	0.05	0.40	0.00	0.43	0.84	0.48
N2	0.01	0.00	0.40	0.62	0.01	0.33	0.00	0.45	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.78	0.06	0.30	0.00	0.35	0.74	0.42
N3	0.01	0.00	0.34	0.47	0.00	0.25	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.54	0.04	0.30	0.00	0.29	0.68	0.37
N7	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.53	0.01	0.38	0.81	0.47
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.36	0.01	0.21	0.59	0.32
O2'	0.01	0.23	0.00	0.03	0.11	0.06	0.08	0.07	0.13	0.05	0.20	0.29	0.21	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.20	0.12	0.21	0.29	0.14
O3'	0.01	0.65	0.00	0.01	0.31	0.03	0.25	0.05	0.41	0.14	0.58	0.78	0.54	0.04	0.06	0.04	0.00	0.02	0.44	0.38	0.71	0.31	0.40
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.06	0.04	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.04	0.14	0.37	0.27
O5'	0.19	0.34	0.37	0.48	0.37	0.02	0.46	0.01	0.46	0.51	0.40	0.30	0.30	0.53	0.36	0.20	0.44	0.08	0.00	0.49	0.01	0.04	0.00
O6	0.01	0.00	0.17	0.31	0.01	0.21	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.38	0.04	0.49	0.00	0.51	0.90	0.53
OP1	0.08	0.36	0.30	0.54	0.30	0.18	0.39	0.38	0.46	0.27	0.43	0.35	0.29	0.38	0.21	0.21	0.71	0.14	0.01	0.51	0.00	0.00	0.00
OP2	0.40	0.76	0.38	0.32	0.71	0.24	0.82	0.35	0.87	0.67	0.84	0.74	0.68	0.81	0.59	0.29	0.31	0.37	0.04	0.90	0.00	0.00	0.00
P	0.20	0.43	0.23	0.33	0.39	0.08	0.46	0.01	0.50	0.39	0.48	0.42	0.37	0.47	0.32	0.14	0.40	0.27	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.39	1.07	0.02	0.36	0.79	0.72	0.41	1.19	0.28	0.58	1.09	1.44	0.14	0.37	0.87	0.14	0.93	1.63	1.09	1.22
C2	0.75	1.95	0.27	0.16	2.12	0.39	1.60	0.64	1.22	1.33	2.29	2.15	0.15	0.31	2.39	0.24	0.21	0.85	0.12	0.35
C2'	0.53	1.13	0.22	0.13	0.88	0.51	0.53	0.97	0.42	0.70	1.15	1.44	0.38	0.18	0.95	0.01	0.71	1.42	0.92	1.02
C3'	0.60	0.95	0.31	0.07	0.66	0.24	0.41	0.63	0.38	0.65	0.91	1.22	0.48	0.01	0.68	0.21	0.45	1.03	0.76	0.73
C4	0.66	1.65	0.22	0.18	1.63	0.46	1.20	0.72	0.94	1.11	1.83	1.90	0.16	0.30	1.79	0.14	0.32	0.91	0.23	0.48
C4'	0.40	0.69	0.06	0.20	0.26	0.41	0.09	0.88	0.07	0.35	0.57	1.04	0.21	0.20	0.24	0.10	0.82	1.42	1.24	1.13
C5	0.75	1.82	0.31	0.12	1.91	0.29	1.52	0.42	1.22	1.31	2.05	1.96	0.15	0.24	2.08	0.27	0.13	0.45	0.29	0.13
C5'	0.43	0.46	0.10	0.09	0.05	0.16	0.16	0.47	0.07	0.26	0.29	0.75	0.20	0.10	0.10	0.28	0.51	0.88	1.00	0.75
C6	0.82	2.08	0.36	0.14	2.38	0.18	1.93	0.24	1.52	1.52	2.47	2.12	0.13	0.23	2.64	0.39	0.31	0.23	0.62	0.28
C8	0.53	1.19	0.17	0.17	1.07	0.49	0.79	0.68	0.64	0.82	1.24	1.39	0.15	0.24	1.14	0.03	0.32	0.73	0.26	0.44
N1	0.81	2.09	0.33	0.13	2.40	0.26	1.89	0.39	1.46	1.49	2.51	2.18	0.14	0.27	2.71	0.35	0.18	0.47	0.43	0.14
N2	0.75	2.00	0.26	0.17	2.21	0.41	1.64	0.69	1.24	1.35	2.38	2.19	0.15	0.32	2.52	0.24	0.25	0.97	0.13	0.43
N3	0.66	1.74	0.21	0.20	1.75	0.50	1.26	0.81	0.96	1.15	1.97	2.00	0.16	0.33	1.96	0.14	0.41	1.10	0.34	0.61
N7	0.70	1.56	0.31	0.12	1.58	0.27	1.30	0.34	1.09	1.18	1.69	1.65	0.14	0.20	1.68	0.23	0.16	0.29	0.32	0.13
N9	0.52	1.31	0.13	0.24	1.15	0.58	0.77	0.90	0.60	0.83	1.38	1.60	0.15	0.31	1.25	0.01	0.55	1.13	0.55	0.74
O2'	0.42	1.06	0.11	0.27	0.76	0.67	0.38	1.24	0.28	0.58	1.08	1.44	0.30	0.27	0.83	0.13	1.03	1.89	1.34	1.43
O3'	0.62	0.89	0.36	0.15	0.57	0.15	0.34	0.55	0.34	0.62	0.82	1.16	0.54	0.09	0.56	0.26	0.42	1.01	0.82	0.73
O4'	0.31	0.79	0.11	0.43	0.39	0.68	0.13	1.18	0.11	0.36	0.72	1.19	0.11	0.42	0.41	0.13	1.04	1.70	1.33	1.34
O5'	0.48	0.47	0.28	0.01	0.08	0.18	0.21	0.62	0.13	0.28	0.29	0.77	0.60	0.01	0.09	0.18	0.65	1.06	1.17	0.94
O6	0.86	2.19	0.41	0.19	2.71	0.07	2.26	0.06	1.78	1.66	2.72	2.06	0.11	0.20	3.02	0.50	0.59	0.20	1.04	0.63
OP1	0.27	0.63	0.35	0.25	1.16	0.33	1.24	0.70	1.02	0.67	0.89	0.40	0.31	0.01	1.29	0.31	1.02	0.97	1.70	1.23
OP2	0.35	0.04	0.33	0.22	0.28	0.16	0.23	0.11	0.07	0.11	0.16	0.14	0.68	0.01	0.42	0.24	0.17	0.21	0.45	0.21
P	0.20	0.07	0.16	0.00	0.44	0.09	0.50	0.35	0.36	0.11	0.24	0.19	0.40	0.00	0.54	0.06	0.45	0.50	0.93	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.01	0.00	0.14	0.14	0.18	0.16
C2	0.01	0.00	0.15	0.19	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.09	0.01	0.11	0.14	0.16	0.27	0.19
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.17	0.12	0.02	0.13	0.23	0.00	0.02	0.08	0.01	0.36	0.41	0.35	0.38
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.34	0.00	0.34	0.02	0.28	0.19	0.28	0.11	0.01	0.00	0.38	0.02	0.06	0.13	0.17	0.06
C4	0.00	0.00	0.06	0.34	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.21	0.00	0.04	0.18	0.24	0.36	0.25
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.14	0.05	0.03	0.07	0.24	0.00	0.11	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02
C5	0.00	0.00	0.07	0.34	0.00	0.14	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.27	0.00	0.04	0.19	0.25	0.35	0.25
C5'	0.07	0.11	0.17	0.02	0.14	0.01	0.15	0.00	0.13	0.09	0.12	0.14	0.08	0.18	0.16	0.01	0.00	0.07	0.03	0.02
C6	0.00	0.00	0.12	0.28	0.00	0.14	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.19	0.01	0.08	0.15	0.18	0.27	0.19
N1	0.00	0.00	0.02	0.19	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.02	0.01	0.02	0.13	0.15	0.24	0.17
N3	0.01	0.00	0.13	0.28	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.08	0.00	0.09	0.15	0.20	0.32	0.22
O2	0.01	0.00	0.23	0.11	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.25	0.01	0.16	0.15	0.16	0.25	0.19
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.27	0.24	0.34	0.08	0.32	0.17	0.18	0.12	0.00	0.04	0.29	0.16	0.25	0.28	0.37	0.30
O3'	0.23	0.09	0.02	0.00	0.21	0.00	0.27	0.18	0.19	0.02	0.08	0.25	0.04	0.00	0.27	0.16	0.23	0.29	0.50	0.31
O4	0.01	0.01	0.08	0.38	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.29	0.27	0.00	0.05	0.20	0.28	0.39	0.28
O4'	0.00	0.11	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.09	0.16	0.16	0.16	0.05	0.00	0.02	0.06	0.04	0.02
O5'	0.14	0.14	0.36	0.06	0.18	0.01	0.19	0.00	0.15	0.13	0.15	0.15	0.25	0.23	0.20	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00
OP1	0.14	0.16	0.41	0.13	0.24	0.02	0.25	0.07	0.18	0.15	0.20	0.16	0.28	0.29	0.28	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.27	0.35	0.17	0.36	0.06	0.35	0.03	0.27	0.24	0.32	0.25	0.37	0.50	0.39	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.19	0.38	0.06	0.25	0.02	0.25	0.02	0.19	0.17	0.22	0.19	0.30	0.31	0.28	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00