Doublet Group distance statistics: 50310

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C1'	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.010, 0.036, 0.061, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.036 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.010, 0.036, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.036 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.015, 0.052, 0.088, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.052 std_dev=0.037
O6	A	0, 0.013, 0.051, 0.089, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.051 std_dev=0.038
O2'	B	0, 0.148, 0.531, 0.913, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.531 std_dev=0.382
C2'	B	0, 0.164, 0.584, 1.003, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.584 std_dev=0.420
P	B	0, 0.207, 0.711, 1.214, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.711 std_dev=0.503
O4'	A	0, 0.258, 0.885, 1.511, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.885 std_dev=0.626
O5'	B	0, 0.269, 0.928, 1.586, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.928 std_dev=0.658
C2'	A	0, 0.285, 0.973, 1.661, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.973 std_dev=0.688
O2'	A	0, 0.348, 1.190, 2.031, 1.788 max_d=1.788 avg_d=1.190 std_dev=0.841
OP2	B	0, 0.360, 1.229, 2.099, 1.880 max_d=1.880 avg_d=1.229 std_dev=0.870
C4'	A	0, 0.376, 1.286, 2.197, 1.982 max_d=1.982 avg_d=1.286 std_dev=0.911
C3'	B	0, 0.382, 1.322, 2.262, 2.103 max_d=2.103 avg_d=1.322 std_dev=0.940
C3'	A	0, 0.424, 1.449, 2.474, 2.214 max_d=2.214 avg_d=1.449 std_dev=1.025
O3'	A	0, 0.573, 1.960, 3.346, 2.991 max_d=2.991 avg_d=1.960 std_dev=1.386
C1'	B	0, 0.644, 2.198, 3.752, 3.313 max_d=3.313 avg_d=2.198 std_dev=1.554
C5'	A	0, 0.645, 2.209, 3.772, 3.397 max_d=3.397 avg_d=2.209 std_dev=1.563
OP1	B	0, 0.700, 2.388, 4.077, 3.600 max_d=3.600 avg_d=2.388 std_dev=1.689
C4'	B	0, 0.707, 2.421, 4.136, 3.743 max_d=3.743 avg_d=2.421 std_dev=1.715
C5'	B	0, 0.748, 2.558, 4.368, 3.911 max_d=3.911 avg_d=2.558 std_dev=1.810
O3'	B	0, 0.750, 2.565, 4.381, 3.939 max_d=3.939 avg_d=2.565 std_dev=1.816
O4'	B	0, 0.827, 2.827, 4.827, 4.308 max_d=4.308 avg_d=2.827 std_dev=2.000
O5'	A	0, 0.858, 2.929, 5.000, 4.409 max_d=4.409 avg_d=2.929 std_dev=2.071
N1	B	0, 0.986, 3.366, 5.746, 5.080 max_d=5.080 avg_d=3.366 std_dev=2.380
C6	B	0, 1.000, 3.418, 5.835, 5.205 max_d=5.205 avg_d=3.418 std_dev=2.418
P	A	0, 1.036, 3.540, 6.043, 5.389 max_d=5.389 avg_d=3.540 std_dev=2.504
OP1	A	0, 1.097, 3.756, 6.416, 5.798 max_d=5.798 avg_d=3.756 std_dev=2.660
OP2	A	0, 1.202, 4.105, 7.009, 6.232 max_d=6.232 avg_d=4.105 std_dev=2.904
O2	B	0, 1.356, 4.657, 7.958, 7.271 max_d=7.271 avg_d=4.657 std_dev=3.301
C2	B	0, 1.371, 4.688, 8.005, 7.181 max_d=7.181 avg_d=4.688 std_dev=3.317
C5	B	0, 1.436, 4.904, 8.373, 7.442 max_d=7.442 avg_d=4.904 std_dev=3.468
N3	B	0, 1.799, 6.146, 10.493, 9.327 max_d=9.327 avg_d=6.146 std_dev=4.347
C4	B	0, 1.874, 6.398, 10.923, 9.605 max_d=9.605 avg_d=6.398 std_dev=4.524
O4	B	0, 2.309, 7.883, 13.456, 11.849 max_d=11.849 avg_d=7.883 std_dev=5.574

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.01	0.58	0.10	0.08
C2	0.01	0.00	0.26	0.19	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.26	0.16	0.56	0.02	0.14	0.14	0.27
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.13	0.01	0.06	0.02	0.12	0.13	0.20	0.31	0.25	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.23	0.09	0.54	0.07	0.04
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.11	0.16	0.24	0.18	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.08	0.41	0.10	0.01
C4	0.00	0.00	0.13	0.09	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.12	0.10	0.58	0.01	0.12	0.27	0.33
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.04	0.02	0.02	0.05	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.05	0.61	0.13	0.24
C5	0.00	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.06	0.69	0.01	0.18	0.51	0.57
C5'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.14	0.07	0.14	0.14	0.11	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.19	0.01
C6	0.00	0.01	0.12	0.09	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.12	0.13	0.09	0.72	0.00	0.25	0.52	0.61
C8	0.02	0.01	0.13	0.11	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.11	0.05	0.65	0.02	0.14	0.58	0.56
N1	0.01	0.01	0.20	0.16	0.01	0.04	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.22	0.22	0.13	0.66	0.02	0.08	0.33	0.45
N2	0.01	0.00	0.31	0.24	0.01	0.02	0.02	0.14	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.36	0.33	0.18	0.51	0.03	0.24	0.08	0.16
N3	0.01	0.00	0.25	0.18	0.00	0.02	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.26	0.23	0.15	0.49	0.01	0.27	0.09	0.17
N7	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.73	0.02	0.33	0.70	0.71
N9	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.51	0.01	0.21	0.27	0.28
O2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.12	0.04	0.06	0.03	0.12	0.11	0.22	0.36	0.26	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.87	0.39	0.36
O3'	0.00	0.26	0.01	0.00	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.11	0.22	0.33	0.23	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.53	0.11	0.19
O4'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.10	0.00	0.06	0.01	0.09	0.05	0.13	0.18	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.20	0.07	0.61	0.12	0.16
O5'	0.29	0.56	0.23	0.16	0.58	0.02	0.69	0.01	0.72	0.65	0.66	0.51	0.49	0.73	0.51	0.03	0.06	0.20	0.00	0.76	0.00	0.00	0.00
O6	0.01	0.02	0.09	0.08	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.09	0.12	0.07	0.76	0.00	0.41	0.64	0.73
OP1	0.58	0.14	0.54	0.41	0.12	0.61	0.18	0.16	0.25	0.14	0.08	0.24	0.27	0.33	0.21	0.87	0.53	0.61	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.14	0.07	0.10	0.27	0.13	0.51	0.19	0.52	0.58	0.33	0.08	0.09	0.70	0.27	0.39	0.11	0.12	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.27	0.04	0.01	0.33	0.24	0.57	0.01	0.61	0.56	0.45	0.16	0.17	0.71	0.28	0.36	0.19	0.16	0.00	0.73	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	1.08	0.09	0.27	1.26	0.33	0.94	0.33	0.68	0.71	1.34	1.13	0.19	0.37	1.42	0.07	0.06	0.32	0.28	0.09
C2	0.32	1.40	0.03	0.42	1.95	0.60	1.47	0.63	0.99	0.93	1.91	1.33	0.11	0.68	2.34	0.11	0.14	0.57	0.39	0.15
C2'	0.21	0.44	0.50	0.56	0.65	0.67	0.39	0.64	0.15	0.13	0.69	0.45	0.56	0.52	0.82	0.41	0.38	0.53	0.18	0.36
C3'	0.27	0.23	0.55	0.53	0.29	0.59	0.11	0.56	0.07	0.10	0.36	0.30	0.53	0.44	0.40	0.40	0.40	0.51	0.27	0.40
C4	0.32	1.34	0.03	0.41	1.77	0.56	1.33	0.57	0.92	0.89	1.77	1.27	0.11	0.65	2.05	0.10	0.12	0.48	0.37	0.13
C4'	0.29	0.67	0.13	0.16	0.63	0.12	0.45	0.16	0.35	0.43	0.75	0.80	0.11	0.15	0.70	0.16	0.09	0.28	0.14	0.13
C5	0.31	1.37	0.06	0.46	1.90	0.67	1.46	0.68	1.00	0.93	1.85	1.25	0.07	0.76	2.22	0.18	0.16	0.54	0.40	0.15
C5'	0.41	0.59	0.08	0.07	0.43	0.08	0.29	0.07	0.27	0.41	0.56	0.75	0.16	0.06	0.44	0.31	0.10	0.25	0.15	0.14
C6	0.31	1.41	0.08	0.48	2.06	0.72	1.58	0.76	1.06	0.95	1.95	1.27	0.06	0.80	2.46	0.21	0.18	0.61	0.43	0.17
C8	0.31	1.22	0.03	0.41	1.50	0.57	1.17	0.54	0.85	0.84	1.54	1.13	0.09	0.66	1.66	0.12	0.11	0.40	0.35	0.12
N1	0.32	1.43	0.05	0.46	2.07	0.67	1.57	0.71	1.05	0.96	1.98	1.33	0.08	0.76	2.49	0.17	0.17	0.61	0.42	0.17
N2	0.33	1.41	0.04	0.41	1.97	0.58	1.47	0.62	0.99	0.93	1.93	1.34	0.12	0.66	2.38	0.10	0.14	0.58	0.38	0.16
N3	0.33	1.35	0.04	0.38	1.80	0.52	1.35	0.55	0.92	0.89	1.80	1.30	0.13	0.60	2.12	0.08	0.11	0.50	0.36	0.13
N7	0.29	1.28	0.07	0.47	1.76	0.70	1.38	0.69	0.97	0.89	1.71	1.14	0.05	0.78	1.99	0.21	0.16	0.50	0.40	0.14
N9	0.32	1.23	0.04	0.36	1.52	0.48	1.15	0.47	0.82	0.82	1.57	1.21	0.13	0.55	1.72	0.07	0.09	0.40	0.34	0.11
O2'	0.20	0.42	0.50	0.49	0.65	0.58	0.39	0.55	0.15	0.13	0.68	0.42	0.57	0.40	0.83	0.35	0.33	0.48	0.16	0.31
O3'	0.49	0.36	0.72	0.57	0.28	0.62	0.29	0.60	0.36	0.40	0.32	0.41	0.63	0.37	0.28	0.54	0.50	0.54	0.41	0.49
O4'	0.63	1.24	0.16	0.02	1.23	0.03	0.98	0.03	0.81	0.91	1.37	1.36	0.10	0.14	1.32	0.41	0.18	0.16	0.36	0.15
O5'	0.11	0.33	0.35	0.37	0.21	0.28	0.20	0.41	0.17	0.13	0.32	0.56	0.27	0.33	0.25	0.07	0.44	0.70	0.52	0.54
O6	0.31	1.40	0.12	0.49	2.13	0.77	1.66	0.82	1.10	0.96	1.96	1.24	0.07	0.84	2.57	0.26	0.20	0.64	0.47	0.18
OP1	0.18	0.55	0.38	0.69	0.19	0.47	0.23	0.77	0.22	0.15	0.49	0.95	0.16	0.74	0.25	0.10	0.89	1.42	1.08	1.11
OP2	0.77	0.72	1.23	1.22	1.07	0.96	1.25	1.13	1.20	0.94	0.83	0.41	0.90	0.94	1.09	0.75	1.35	1.54	1.56	1.46
P	0.27	0.19	0.77	0.91	0.45	0.68	0.64	0.88	0.63	0.35	0.27	0.39	0.56	0.86	0.47	0.34	1.01	1.32	1.15	1.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.07	0.01	0.19	0.00	0.00	0.10	0.09	0.15	0.11
C2	0.04	0.00	0.11	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.15	0.01	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.09	0.12	0.11	0.01	0.07	0.19	0.00	0.01	0.03	0.00	0.24	0.24	0.31	0.26
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.27	0.01	0.30	0.01	0.26	0.16	0.21	0.14	0.02	0.01	0.30	0.02	0.05	0.04	0.07	0.05
C4	0.00	0.01	0.03	0.27	0.00	0.13	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.14	0.00	0.03	0.19	0.20	0.19	0.18
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.18	0.00	0.17	0.07	0.06	0.07	0.19	0.00	0.14	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01
C5	0.02	0.01	0.09	0.30	0.00	0.18	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.21	0.01	0.07	0.22	0.20	0.16	0.19
C5'	0.03	0.02	0.12	0.01	0.16	0.00	0.20	0.00	0.16	0.04	0.08	0.06	0.06	0.14	0.18	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00
C6	0.03	0.00	0.11	0.26	0.01	0.17	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.16	0.01	0.09	0.13	0.09	0.01	0.07
N1	0.00	0.01	0.01	0.16	0.00	0.07	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.02
N3	0.02	0.00	0.07	0.21	0.00	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.10	0.01	0.05	0.10	0.11	0.10	0.10
O2	0.07	0.00	0.19	0.14	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.31	0.01	0.12	0.05	0.05	0.05	0.05
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.24	0.19	0.26	0.06	0.22	0.13	0.21	0.21	0.00	0.01	0.25	0.14	0.16	0.18	0.36	0.22
O3'	0.19	0.15	0.01	0.01	0.14	0.00	0.21	0.14	0.16	0.04	0.10	0.31	0.01	0.00	0.18	0.13	0.20	0.35	0.27	0.27
O4	0.00	0.01	0.03	0.30	0.00	0.14	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.18	0.00	0.03	0.23	0.26	0.27	0.25
O4'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.03	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.05	0.12	0.14	0.13	0.03	0.00	0.04	0.02	0.08	0.04
O5'	0.10	0.02	0.24	0.05	0.19	0.00	0.22	0.00	0.13	0.01	0.10	0.05	0.16	0.20	0.23	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.09	0.02	0.24	0.04	0.20	0.03	0.20	0.02	0.09	0.00	0.11	0.05	0.18	0.35	0.26	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.02	0.31	0.07	0.19	0.01	0.16	0.01	0.01	0.07	0.10	0.05	0.36	0.27	0.27	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.01	0.26	0.05	0.18	0.01	0.19	0.00	0.07	0.02	0.10	0.05	0.22	0.27	0.25	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00