Doublet Group distance statistics: 50314

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N1	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N9	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N7	A	0, 0.000, 0.049, 0.098, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.049 std_dev=0.049
N2	A	0, 0.000, 0.058, 0.117, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.058 std_dev=0.058
C8	A	0, 0.000, 0.061, 0.122, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.061 std_dev=0.061
C2'	B	0, 0.000, 0.329, 0.659, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.329 std_dev=0.329
C3'	B	0, 0.000, 0.357, 0.714, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.357 std_dev=0.357
O4'	A	0, 0.000, 0.370, 0.740, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.370 std_dev=0.370
P	A	0, 0.000, 0.383, 0.767, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.383 std_dev=0.383
C2'	A	0, 0.000, 0.437, 0.874, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.437 std_dev=0.437
O3'	B	0, 0.000, 0.513, 1.026, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.513 std_dev=0.513
O2'	B	0, 0.000, 0.564, 1.128, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.564 std_dev=0.564
OP2	A	0, 0.000, 0.570, 1.140, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.570 std_dev=0.570
C4'	A	0, 0.000, 0.571, 1.142, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.571 std_dev=0.571
O2'	A	0, 0.000, 0.589, 1.178, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.589 std_dev=0.589
C1'	B	0, 0.000, 0.608, 1.217, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.608 std_dev=0.608
C3'	A	0, 0.000, 0.652, 1.304, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.652 std_dev=0.652
C4'	B	0, 0.000, 0.685, 1.370, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.685 std_dev=0.685
OP1	A	0, 0.000, 0.692, 1.385, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.692 std_dev=0.692
O5'	B	0, 0.000, 0.696, 1.393, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.696 std_dev=0.696
O4'	B	0, 0.000, 0.743, 1.485, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.743 std_dev=0.743
C5'	B	0, 0.000, 0.778, 1.555, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.778 std_dev=0.778
N1	B	0, 0.000, 0.787, 1.575, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.787 std_dev=0.787
C6	B	0, 0.000, 0.832, 1.664, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.832 std_dev=0.832
O3'	A	0, 0.000, 0.909, 1.817, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.909 std_dev=0.909
O5'	A	0, 0.000, 1.017, 2.034, 2.034 max_d=2.034 avg_d=1.017 std_dev=1.017
P	B	0, 0.000, 1.061, 2.122, 2.122 max_d=2.122 avg_d=1.061 std_dev=1.061
C5'	A	0, 0.000, 1.091, 2.182, 2.182 max_d=2.182 avg_d=1.091 std_dev=1.091
C2	B	0, 0.000, 1.092, 2.184, 2.184 max_d=2.184 avg_d=1.092 std_dev=1.092
C5	B	0, 0.000, 1.112, 2.223, 2.223 max_d=2.223 avg_d=1.112 std_dev=1.112
O2	B	0, 0.000, 1.150, 2.300, 2.300 max_d=2.300 avg_d=1.150 std_dev=1.150
OP2	B	0, 0.000, 1.195, 2.391, 2.391 max_d=2.391 avg_d=1.195 std_dev=1.195
N3	B	0, 0.000, 1.418, 2.835, 2.835 max_d=2.835 avg_d=1.418 std_dev=1.418
C4	B	0, 0.000, 1.446, 2.893, 2.893 max_d=2.893 avg_d=1.446 std_dev=1.446
OP1	B	0, 0.000, 1.618, 3.237, 3.237 max_d=3.237 avg_d=1.618 std_dev=1.618
O4	B	0, 0.000, 1.829, 3.659, 3.659 max_d=3.659 avg_d=1.829 std_dev=1.829

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.05	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.26	0.00	0.32	0.09	0.19
C2	0.03	0.00	0.12	0.15	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.19	0.05	0.42	0.01	0.23	0.07	0.20
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.11	0.06	0.15	0.14	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.13	0.01	0.09	0.45	0.08
C3'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.01	0.19	0.07	0.20	0.16	0.16	0.05	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.02	0.59	0.22
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.37	0.00	0.23	0.07	0.20
C4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.06	0.16	0.01	0.06	0.05	0.14	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.21	0.30	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.35	0.01	0.16	0.16	0.19
C5'	0.05	0.06	0.00	0.03	0.12	0.01	0.21	0.00	0.19	0.30	0.12	0.02	0.04	0.30	0.16	0.07	0.10	0.01	0.00	0.22	0.27	0.14	0.01
C6	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.37	0.01	0.13	0.19	0.19
C8	0.00	0.01	0.11	0.19	0.00	0.16	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.19	0.03	0.24	0.01	0.18	0.12	0.18
N1	0.03	0.00	0.06	0.07	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.03	0.41	0.01	0.17	0.13	0.19
N2	0.05	0.00	0.15	0.20	0.02	0.06	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.10	0.27	0.07	0.43	0.02	0.24	0.04	0.20
N3	0.03	0.01	0.14	0.16	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.19	0.04	0.40	0.00	0.26	0.03	0.21
N7	0.00	0.01	0.09	0.16	0.00	0.14	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.17	0.02	0.27	0.01	0.12	0.21	0.17
N9	0.00	0.02	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.31	0.00	0.25	0.03	0.20
O2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.10	0.10	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.13	0.51	0.08
O3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.05	0.02	0.04	0.10	0.00	0.19	0.11	0.27	0.19	0.17	0.05	0.02	0.00	0.01	0.14	0.03	0.17	0.83	0.40
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.28	0.01	0.48	0.08	0.33
O5'	0.26	0.42	0.13	0.04	0.37	0.01	0.35	0.00	0.37	0.24	0.41	0.43	0.40	0.27	0.31	0.06	0.14	0.28	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00
O6	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.36	0.00	0.09	0.25	0.18
OP1	0.32	0.23	0.09	0.02	0.23	0.21	0.16	0.27	0.13	0.18	0.17	0.24	0.26	0.12	0.25	0.13	0.17	0.48	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.07	0.45	0.59	0.07	0.30	0.16	0.14	0.19	0.12	0.13	0.04	0.03	0.21	0.03	0.51	0.83	0.08	0.01	0.25	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.20	0.08	0.22	0.20	0.02	0.19	0.01	0.19	0.18	0.19	0.20	0.21	0.17	0.20	0.08	0.40	0.33	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.42	0.09	0.15	0.42	0.22	0.17	0.24	0.03	0.13	0.53	0.56	0.25	0.27	0.56	0.14	0.02	0.24	0.22	0.06
C2	0.10	0.62	0.03	0.01	0.68	0.04	0.39	0.04	0.21	0.32	0.77	0.74	0.12	0.08	0.86	0.04	0.19	0.45	0.06	0.26
C2'	0.13	0.53	0.13	0.09	0.51	0.00	0.29	0.03	0.18	0.28	0.62	0.66	0.01	0.02	0.62	0.06	0.17	0.35	0.09	0.20
C3'	0.30	0.69	0.35	0.28	0.64	0.13	0.44	0.06	0.33	0.45	0.75	0.82	0.23	0.20	0.73	0.20	0.27	0.40	0.04	0.27
C4	0.07	0.58	0.01	0.03	0.60	0.07	0.32	0.09	0.16	0.28	0.71	0.71	0.13	0.12	0.75	0.00	0.13	0.39	0.11	0.20
C4'	0.19	0.63	0.24	0.12	0.61	0.05	0.39	0.11	0.27	0.37	0.71	0.78	0.07	0.04	0.70	0.06	0.11	0.33	0.12	0.17
C5	0.12	0.60	0.05	0.01	0.61	0.00	0.34	0.02	0.19	0.31	0.72	0.72	0.06	0.04	0.75	0.06	0.19	0.43	0.06	0.24
C5'	0.42	0.88	0.53	0.34	0.84	0.08	0.62	0.02	0.50	0.62	0.95	1.02	0.33	0.12	0.92	0.23	0.23	0.44	0.02	0.29
C6	0.16	0.63	0.07	0.05	0.66	0.05	0.39	0.05	0.23	0.35	0.76	0.74	0.04	0.00	0.81	0.11	0.26	0.49	0.01	0.31
C8	0.07	0.53	0.03	0.04	0.49	0.09	0.24	0.13	0.11	0.24	0.62	0.68	0.09	0.13	0.60	0.02	0.06	0.32	0.16	0.12
N1	0.14	0.64	0.06	0.03	0.69	0.02	0.41	0.02	0.23	0.34	0.78	0.75	0.07	0.03	0.86	0.08	0.25	0.49	0.01	0.30
N2	0.10	0.63	0.03	0.01	0.70	0.04	0.40	0.05	0.22	0.32	0.79	0.74	0.13	0.09	0.89	0.03	0.20	0.46	0.07	0.26
N3	0.07	0.59	0.00	0.04	0.63	0.09	0.35	0.10	0.17	0.28	0.73	0.71	0.15	0.13	0.80	0.01	0.14	0.40	0.11	0.21
N7	0.13	0.58	0.07	0.03	0.55	0.01	0.30	0.02	0.17	0.30	0.67	0.71	0.03	0.02	0.67	0.07	0.17	0.40	0.08	0.21
N9	0.03	0.52	0.01	0.08	0.51	0.13	0.25	0.16	0.10	0.22	0.63	0.66	0.16	0.18	0.65	0.05	0.06	0.32	0.17	0.13
O2'	0.01	0.38	0.02	0.00	0.38	0.08	0.18	0.09	0.06	0.16	0.47	0.50	0.13	0.06	0.49	0.04	0.11	0.30	0.12	0.15
O3'	0.37	0.70	0.44	0.36	0.65	0.21	0.47	0.14	0.38	0.49	0.75	0.82	0.35	0.30	0.73	0.28	0.32	0.41	0.00	0.30
O4'	0.12	0.42	0.13	0.25	0.42	0.36	0.16	0.38	0.00	0.11	0.54	0.58	0.32	0.44	0.55	0.24	0.16	0.14	0.34	0.06
O5'	0.34	0.67	0.46	0.15	0.52	0.06	0.32	0.27	0.25	0.43	0.67	0.86	0.54	0.03	0.57	0.12	0.13	0.05	0.43	0.13
O6	0.19	0.63	0.09	0.08	0.66	0.11	0.40	0.12	0.25	0.36	0.75	0.72	0.01	0.05	0.81	0.15	0.32	0.53	0.08	0.36
OP1	0.06	0.16	0.16	0.06	0.10	0.09	0.02	0.17	0.01	0.08	0.15	0.23	0.25	0.01	0.11	0.02	0.09	0.05	0.22	0.09
OP2	0.22	0.03	0.02	0.21	0.17	0.49	0.37	0.75	0.42	0.20	0.00	0.24	0.17	0.03	0.13	0.43	0.62	0.67	0.97	0.73
P	0.02	0.24	0.15	0.02	0.12	0.21	0.03	0.35	0.08	0.07	0.23	0.39	0.26	0.00	0.15	0.12	0.23	0.16	0.46	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.07	0.27	0.12	0.11
C2	0.00	0.00	0.09	0.17	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.01	0.00	0.11	0.49	0.31	0.30
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.18	0.00	0.05	0.03	0.00	0.04	0.26	0.04	0.09
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.08	0.00	0.02	0.03	0.06	0.05	0.16	0.26	0.01	0.01	0.11	0.01	0.02	0.21	0.02	0.07
C4	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.06	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.01	0.05	0.53	0.35	0.29
C4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.12	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.12	0.03	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.07	0.47	0.27	0.18
C5'	0.01	0.11	0.02	0.03	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.12	0.14	0.00	0.01	0.11	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02
C6	0.00	0.01	0.07	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.01	0.13	0.41	0.20	0.11
N1	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.41	0.22	0.19
N3	0.00	0.00	0.07	0.16	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.01	0.00	0.12	0.54	0.36	0.34
O2	0.00	0.00	0.18	0.26	0.01	0.12	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.23	0.01	0.01	0.17	0.49	0.31	0.34
O2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.09	0.02	0.03	0.02	0.23	0.04	0.09
O3'	0.05	0.15	0.05	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.07	0.02	0.15	0.23	0.09	0.00	0.12	0.04	0.07	0.19	0.03	0.10
O4	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.01	0.09	0.54	0.40	0.32
O4'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.10	0.14	0.09	0.05
O5'	0.07	0.11	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.00	0.13	0.02	0.12	0.17	0.02	0.07	0.09	0.10	0.00	0.01	0.02	0.02
OP1	0.27	0.49	0.26	0.21	0.53	0.12	0.47	0.00	0.41	0.41	0.54	0.49	0.23	0.19	0.54	0.14	0.01	0.00	0.00	0.02
OP2	0.12	0.31	0.04	0.02	0.35	0.03	0.27	0.01	0.20	0.22	0.36	0.31	0.04	0.03	0.40	0.09	0.02	0.00	0.00	0.02
P	0.11	0.30	0.09	0.07	0.29	0.06	0.18	0.02	0.11	0.19	0.34	0.34	0.09	0.10	0.32	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00