Doublet Group distance statistics: 50317

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.000, 0.033, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
C2'	B	0, 0.000, 0.473, 0.947, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.473 std_dev=0.473
O4'	A	0, 0.000, 0.689, 1.378, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.689 std_dev=0.689
C3'	B	0, 0.000, 0.767, 1.534, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.767 std_dev=0.767
O2'	B	0, 0.000, 0.788, 1.575, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.788 std_dev=0.788
C2'	A	0, 0.000, 0.894, 1.788, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.894 std_dev=0.894
C3'	A	0, 0.000, 0.933, 1.866, 1.866 max_d=1.866 avg_d=0.933 std_dev=0.933
C4'	A	0, 0.000, 0.976, 1.951, 1.951 max_d=1.951 avg_d=0.976 std_dev=0.976
O3'	A	0, 0.000, 1.025, 2.051, 2.051 max_d=2.051 avg_d=1.025 std_dev=1.025
O3'	B	0, 0.000, 1.213, 2.425, 2.425 max_d=2.425 avg_d=1.213 std_dev=1.213
C6	B	0, 0.000, 1.283, 2.565, 2.565 max_d=2.565 avg_d=1.283 std_dev=1.283
C5	B	0, 0.000, 1.319, 2.639, 2.639 max_d=2.639 avg_d=1.319 std_dev=1.319
C1'	B	0, 0.000, 1.423, 2.847, 2.847 max_d=2.847 avg_d=1.423 std_dev=1.423
O2'	A	0, 0.000, 1.472, 2.943, 2.943 max_d=2.943 avg_d=1.472 std_dev=1.472
C4'	B	0, 0.000, 1.558, 3.116, 3.116 max_d=3.116 avg_d=1.558 std_dev=1.558
O5'	A	0, 0.000, 1.593, 3.185, 3.185 max_d=3.185 avg_d=1.593 std_dev=1.593
N1	B	0, 0.000, 1.594, 3.189, 3.189 max_d=3.189 avg_d=1.594 std_dev=1.594
C5'	A	0, 0.000, 1.638, 3.275, 3.275 max_d=3.275 avg_d=1.638 std_dev=1.638
OP2	A	0, 0.000, 1.754, 3.509, 3.509 max_d=3.509 avg_d=1.754 std_dev=1.754
O4'	B	0, 0.000, 1.862, 3.724, 3.724 max_d=3.724 avg_d=1.862 std_dev=1.862
C4	B	0, 0.000, 1.926, 3.852, 3.852 max_d=3.852 avg_d=1.926 std_dev=1.926
P	A	0, 0.000, 2.078, 4.155, 4.155 max_d=4.155 avg_d=2.078 std_dev=2.078
O4	B	0, 0.000, 2.126, 4.251, 4.251 max_d=4.251 avg_d=2.126 std_dev=2.126
OP1	A	0, 0.000, 2.299, 4.598, 4.598 max_d=4.598 avg_d=2.299 std_dev=2.299
C5'	B	0, 0.000, 2.513, 5.025, 5.025 max_d=5.025 avg_d=2.513 std_dev=2.513
C2	B	0, 0.000, 2.578, 5.157, 5.157 max_d=5.157 avg_d=2.578 std_dev=2.578
N3	B	0, 0.000, 2.710, 5.419, 5.419 max_d=5.419 avg_d=2.710 std_dev=2.710
O5'	B	0, 0.000, 3.367, 6.735, 6.735 max_d=6.735 avg_d=3.367 std_dev=3.367
O2	B	0, 0.000, 3.401, 6.803, 6.803 max_d=6.803 avg_d=3.401 std_dev=3.401
OP1	B	0, 0.000, 4.370, 8.739, 8.739 max_d=8.739 avg_d=4.370 std_dev=4.370
P	B	0, 0.000, 4.533, 9.066, 9.066 max_d=9.066 avg_d=4.533 std_dev=4.533
OP2	B	0, 0.000, 4.998, 9.996, 9.996 max_d=9.996 avg_d=4.998 std_dev=4.998

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.25	0.00	0.24	0.01	0.08	0.30	0.18
C2	0.01	0.00	0.36	0.21	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.10	0.25	0.20	0.01	0.12	0.17	0.04
C2'	0.00	0.36	0.00	0.01	0.16	0.01	0.04	0.11	0.12	0.24	0.25	0.45	0.36	0.16	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.06	0.21	0.00	0.13
C3'	0.00	0.21	0.01	0.00	0.17	0.00	0.16	0.03	0.19	0.07	0.21	0.23	0.19	0.10	0.11	0.04	0.01	0.01	0.19	0.18	0.46	0.15	0.28
C4	0.00	0.01	0.16	0.17	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.16	0.33	0.00	0.15	0.33	0.24
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.04	0.08	0.11	0.08	0.01	0.00	0.26	0.03	0.00	0.01	0.05	0.33	0.18	0.10
C5	0.01	0.00	0.04	0.16	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.07	0.12	0.43	0.00	0.35	0.43	0.39
C5'	0.03	0.17	0.11	0.03	0.10	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.16	0.19	0.14	0.05	0.04	0.13	0.18	0.01	0.00	0.13	0.24	0.35	0.00
C6	0.00	0.01	0.12	0.19	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.16	0.39	0.00	0.28	0.39	0.33
C8	0.02	0.00	0.24	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.44	0.09	0.05	0.56	0.01	0.59	0.57	0.58
N1	0.00	0.01	0.25	0.21	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.07	0.22	0.29	0.01	0.06	0.27	0.17
N2	0.01	0.00	0.45	0.23	0.00	0.11	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.09	0.28	0.12	0.01	0.30	0.07	0.09
N3	0.01	0.00	0.36	0.19	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.12	0.23	0.20	0.01	0.12	0.18	0.05
N7	0.02	0.00	0.16	0.10	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.41	0.07	0.02	0.55	0.00	0.60	0.56	0.58
N9	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.13	0.05	0.39	0.01	0.27	0.41	0.34
O2'	0.01	0.27	0.00	0.04	0.00	0.26	0.19	0.13	0.10	0.44	0.10	0.44	0.29	0.41	0.18	0.00	0.04	0.16	0.04	0.18	0.02	0.23	0.07
O3'	0.25	0.10	0.01	0.01	0.11	0.03	0.07	0.18	0.05	0.09	0.07	0.09	0.12	0.07	0.13	0.04	0.00	0.18	0.22	0.03	0.73	0.22	0.40
O4'	0.00	0.25	0.02	0.01	0.16	0.00	0.12	0.01	0.16	0.05	0.22	0.28	0.23	0.02	0.05	0.16	0.18	0.00	0.36	0.14	0.14	0.47	0.29
O5'	0.24	0.20	0.11	0.19	0.33	0.01	0.43	0.00	0.39	0.56	0.29	0.12	0.20	0.55	0.39	0.04	0.22	0.36	0.00	0.44	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.18	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.03	0.14	0.44	0.00	0.39	0.44	0.42
OP1	0.08	0.12	0.21	0.46	0.15	0.33	0.35	0.24	0.28	0.59	0.06	0.30	0.12	0.60	0.27	0.02	0.73	0.14	0.01	0.39	0.00	0.02	0.01
OP2	0.30	0.17	0.00	0.15	0.33	0.18	0.43	0.35	0.39	0.57	0.27	0.07	0.18	0.56	0.41	0.23	0.22	0.47	0.01	0.44	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.04	0.13	0.28	0.24	0.10	0.39	0.00	0.33	0.58	0.17	0.09	0.05	0.58	0.34	0.07	0.40	0.29	0.00	0.42	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.55	0.48	0.04	0.15	0.37	0.66	0.36	0.79	0.41	0.48	0.42	0.53	0.12	0.06	0.34	0.88	0.52	0.47	0.63	0.58
C2	0.39	0.06	0.06	0.30	0.22	0.88	0.47	1.28	0.54	0.34	0.04	0.15	0.31	0.18	0.17	0.95	1.14	1.36	1.43	1.45
C2'	1.27	1.27	0.72	0.71	1.01	1.20	0.93	1.24	1.00	1.19	1.16	1.41	0.62	0.41	0.96	1.49	0.98	0.77	1.09	0.96
C3'	0.82	0.86	0.35	0.27	0.46	0.73	0.29	0.71	0.37	0.67	0.71	1.14	0.43	0.04	0.40	0.97	0.40	0.12	0.45	0.30
C4	0.41	0.10	0.05	0.29	0.21	0.87	0.41	1.22	0.49	0.34	0.07	0.07	0.31	0.16	0.16	0.97	1.07	1.17	1.29	1.30
C4'	0.34	0.36	0.08	0.12	0.03	0.35	0.11	0.36	0.04	0.20	0.24	0.59	0.01	0.31	0.01	0.53	0.06	0.19	0.05	0.13
C5	0.32	0.13	0.08	0.37	0.10	0.97	0.42	1.42	0.52	0.24	0.15	0.42	0.38	0.29	0.04	0.99	1.37	1.52	1.65	1.67
C5'	0.17	0.14	0.18	0.22	0.26	0.25	0.43	0.23	0.34	0.03	0.01	0.42	0.03	0.34	0.31	0.36	0.23	0.39	0.25	0.34
C6	0.28	0.24	0.09	0.41	0.06	1.00	0.45	1.52	0.55	0.20	0.26	0.60	0.39	0.35	0.01	0.97	1.52	1.78	1.88	1.92
C8	0.40	0.03	0.06	0.33	0.13	0.93	0.34	1.23	0.44	0.29	0.01	0.15	0.35	0.22	0.08	1.01	1.13	1.10	1.30	1.29
N1	0.32	0.12	0.08	0.36	0.13	0.95	0.47	1.43	0.55	0.26	0.14	0.42	0.36	0.28	0.07	0.96	1.38	1.66	1.73	1.76
N2	0.41	0.11	0.05	0.27	0.26	0.85	0.48	1.24	0.54	0.36	0.09	0.08	0.29	0.14	0.21	0.94	1.07	1.32	1.36	1.38
N3	0.43	0.18	0.04	0.25	0.27	0.82	0.43	1.15	0.50	0.38	0.15	0.04	0.27	0.10	0.22	0.94	0.96	1.10	1.19	1.19
N7	0.29	0.22	0.10	0.40	0.03	1.02	0.37	1.46	0.48	0.19	0.23	0.53	0.40	0.34	0.03	1.01	1.45	1.52	1.69	1.72
N9	0.46	0.22	0.03	0.24	0.24	0.82	0.37	1.07	0.45	0.38	0.17	0.13	0.27	0.09	0.20	0.96	0.89	0.89	1.05	1.04
O2'	1.52	1.77	0.86	0.74	1.58	1.20	1.41	1.23	1.40	1.58	1.73	1.90	0.65	0.32	1.57	1.65	0.99	0.77	1.16	0.98
O3'	0.77	0.92	0.25	0.09	0.45	0.58	0.21	0.53	0.29	0.65	0.77	1.27	0.37	0.21	0.40	0.90	0.17	0.17	0.21	0.03
O4'	0.12	0.06	0.33	0.23	0.09	0.27	0.13	0.39	0.08	0.02	0.01	0.16	0.42	0.38	0.12	0.42	0.01	0.03	0.08	0.06
O5'	0.51	0.38	0.77	0.87	0.77	0.54	0.99	0.57	0.96	0.64	0.50	0.04	0.52	0.89	0.78	0.44	0.95	1.09	0.96	1.06
O6	0.20	0.43	0.12	0.45	0.04	1.03	0.45	1.63	0.55	0.12	0.44	0.86	0.43	0.43	0.11	0.94	1.73	2.06	2.17	2.21
OP1	1.36	1.09	1.52	1.81	1.37	1.70	1.58	1.75	1.60	1.37	1.14	0.80	1.29	1.83	1.34	1.47	2.26	2.06	2.28	2.26
OP2	0.77	0.41	0.96	1.41	0.88	1.24	1.25	1.47	1.26	0.83	0.51	0.03	0.61	1.65	0.87	0.95	2.06	2.22	2.15	2.29
P	1.08	0.82	1.28	1.61	1.22	1.36	1.50	1.45	1.50	1.16	0.92	0.45	0.94	1.75	1.21	1.15	1.95	1.98	1.98	2.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.34	0.11	0.35	0.25
C2	0.00	0.00	0.16	0.11	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.17	0.00	0.10	0.51	0.13	0.64	0.42
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.01	0.16	0.00	0.12	0.28	0.01	0.04	0.02	0.00	0.14	0.25	0.19	0.02
C3'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.17	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.27	0.05	0.09
C4	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.80	0.03	1.14	0.72
C4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.04	0.07	0.00	0.01	0.09	0.07	0.01
C5	0.02	0.01	0.12	0.06	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.02	0.11	0.12	0.01	0.16	0.89	0.01	1.26	0.81
C5'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.14	0.01	0.03	0.14	0.01	0.00	0.08	0.00	0.01	0.03	0.21	0.01
C6	0.02	0.00	0.16	0.10	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.15	0.02	0.20	0.80	0.03	1.00	0.67
N1	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.56	0.11	0.66	0.44
N3	0.01	0.00	0.12	0.10	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.14	0.00	0.04	0.65	0.09	0.88	0.56
O2	0.01	0.00	0.28	0.17	0.01	0.05	0.02	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.30	0.28	0.01	0.20	0.36	0.16	0.43	0.28
O2'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.01	0.13	0.01	0.12	0.30	0.00	0.07	0.02	0.00	0.05	0.23	0.00	0.11
O3'	0.05	0.17	0.04	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.15	0.02	0.14	0.28	0.07	0.00	0.03	0.04	0.29	0.41	0.25	0.41
O4	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.07	0.85	0.00	1.27	0.80
O4'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.20	0.03	0.04	0.20	0.00	0.04	0.07	0.00	0.33	0.00	0.23	0.28
O5'	0.34	0.51	0.14	0.04	0.80	0.01	0.89	0.01	0.80	0.56	0.65	0.36	0.05	0.29	0.85	0.33	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.11	0.13	0.25	0.27	0.03	0.09	0.01	0.03	0.03	0.11	0.09	0.16	0.23	0.41	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.35	0.64	0.19	0.05	1.14	0.07	1.26	0.21	1.00	0.66	0.88	0.43	0.00	0.25	1.27	0.23	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.25	0.42	0.02	0.09	0.72	0.01	0.81	0.01	0.67	0.44	0.56	0.28	0.11	0.41	0.80	0.28	0.00	0.01	0.01	0.00