Doublet Group distance statistics: 50318

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N1	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.000, 0.038, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N9	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N2	A	0, 0.000, 0.065, 0.130, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.065 std_dev=0.065
N3	B	0, 0.000, 0.122, 0.244, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.122 std_dev=0.122
C2	B	0, 0.000, 0.217, 0.434, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.217 std_dev=0.217
O3'	B	0, 0.000, 0.272, 0.544, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.272 std_dev=0.272
C2'	B	0, 0.000, 0.321, 0.643, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.321 std_dev=0.321
O2	B	0, 0.000, 0.326, 0.652, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.326 std_dev=0.326
C3'	B	0, 0.000, 0.377, 0.754, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.377 std_dev=0.377
N1	B	0, 0.000, 0.391, 0.782, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.391 std_dev=0.391
C4	B	0, 0.000, 0.405, 0.809, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.405 std_dev=0.405
O4	B	0, 0.000, 0.511, 1.023, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.511 std_dev=0.511
C1'	B	0, 0.000, 0.534, 1.068, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.534 std_dev=0.534
C6	B	0, 0.000, 0.558, 1.116, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.558 std_dev=0.558
C5	B	0, 0.000, 0.588, 1.175, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.588 std_dev=0.588
O2'	B	0, 0.000, 0.614, 1.228, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.614 std_dev=0.614
O4'	B	0, 0.000, 0.753, 1.507, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.753 std_dev=0.753
C4'	B	0, 0.000, 0.838, 1.675, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.838 std_dev=0.838
O5'	B	0, 0.000, 0.921, 1.843, 1.843 max_d=1.843 avg_d=0.921 std_dev=0.921
OP2	B	0, 0.000, 0.929, 1.858, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.929 std_dev=0.929
C5'	B	0, 0.000, 1.204, 2.409, 2.409 max_d=2.409 avg_d=1.204 std_dev=1.204
O4'	A	0, 0.000, 1.337, 2.675, 2.675 max_d=2.675 avg_d=1.337 std_dev=1.337
C2'	A	0, 0.000, 1.402, 2.804, 2.804 max_d=2.804 avg_d=1.402 std_dev=1.402
P	B	0, 0.000, 1.459, 2.919, 2.919 max_d=2.919 avg_d=1.459 std_dev=1.459
C4'	A	0, 0.000, 1.906, 3.812, 3.812 max_d=3.812 avg_d=1.906 std_dev=1.906
C3'	A	0, 0.000, 1.969, 3.938, 3.938 max_d=3.938 avg_d=1.969 std_dev=1.969
O2'	A	0, 0.000, 1.974, 3.948, 3.948 max_d=3.948 avg_d=1.974 std_dev=1.974
O3'	A	0, 0.000, 2.133, 4.266, 4.266 max_d=4.266 avg_d=2.133 std_dev=2.133
OP1	B	0, 0.000, 2.442, 4.883, 4.883 max_d=4.883 avg_d=2.442 std_dev=2.442
C5'	A	0, 0.000, 3.351, 6.701, 6.701 max_d=6.701 avg_d=3.351 std_dev=3.351
O5'	A	0, 0.000, 3.797, 7.595, 7.595 max_d=7.595 avg_d=3.797 std_dev=3.797
P	A	0, 0.000, 5.303, 10.607, 10.607 max_d=10.607 avg_d=5.303 std_dev=5.303
OP2	A	0, 0.000, 5.619, 11.238, 11.238 max_d=11.238 avg_d=5.619 std_dev=5.619
OP1	A	0, 0.000, 6.201, 12.402, 12.402 max_d=12.402 avg_d=6.201 std_dev=6.201

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.07
C2	0.00	0.00	0.07	0.13	0.02	0.65	0.02	1.23	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.23	0.06	0.57	1.32	0.02	1.84	1.41	1.40
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.16	0.06	0.02	0.08	0.04	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.16	0.19	0.06
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.25	0.02	0.19	0.46	0.03	0.31	0.16	0.44	0.20	0.02	0.00	0.01	0.32	0.26	0.07	0.42	0.23
C4	0.00	0.02	0.05	0.08	0.00	0.25	0.00	0.52	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.29	0.45	0.01	0.64	0.31	0.33
C4'	0.00	0.65	0.00	0.00	0.25	0.00	0.02	0.01	0.17	0.45	0.43	0.89	0.62	0.33	0.06	0.24	0.03	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.04
C5	0.01	0.02	0.05	0.25	0.00	0.02	0.00	0.18	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.14	0.11	0.04	0.00	0.21	0.19	0.15
C5'	0.07	1.23	0.16	0.02	0.52	0.01	0.18	0.00	0.44	0.57	0.90	1.63	1.14	0.39	0.02	0.08	0.14	0.01	0.00	0.28	0.00	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.19	0.00	0.17	0.01	0.44	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.07	0.15	0.23	0.35	0.00	0.64	0.17	0.20
C8	0.02	0.03	0.02	0.46	0.01	0.45	0.01	0.57	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.35	0.17	0.32	0.80	0.02	0.80	1.06	1.07
N1	0.02	0.00	0.08	0.03	0.03	0.43	0.03	0.90	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.10	0.07	0.41	0.91	0.01	1.39	0.93	0.92
N2	0.04	0.01	0.04	0.31	0.00	0.89	0.01	1.63	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.31	0.17	0.72	1.82	0.00	2.60	2.12	2.08
N3	0.00	0.00	0.07	0.16	0.01	0.62	0.00	1.14	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.24	0.12	0.57	1.19	0.02	1.51	1.16	1.18
N7	0.02	0.03	0.04	0.44	0.01	0.33	0.01	0.39	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.23	0.18	0.64	0.02	0.62	1.01	0.96
N9	0.00	0.03	0.02	0.20	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.14	0.02	0.00	0.10	0.01	0.03	0.25	0.26
O2'	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.24	0.14	0.08	0.07	0.35	0.10	0.31	0.24	0.32	0.14	0.00	0.03	0.17	0.22	0.14	0.04	0.27	0.19
O3'	0.24	0.06	0.02	0.00	0.00	0.03	0.14	0.14	0.15	0.17	0.07	0.17	0.12	0.23	0.02	0.03	0.00	0.19	0.42	0.21	0.29	0.52	0.32
O4'	0.00	0.57	0.01	0.01	0.29	0.00	0.11	0.01	0.23	0.32	0.41	0.72	0.57	0.18	0.00	0.17	0.19	0.00	0.15	0.15	0.01	0.17	0.04
O5'	0.02	1.32	0.07	0.32	0.45	0.01	0.04	0.00	0.35	0.80	0.91	1.82	1.19	0.64	0.10	0.22	0.42	0.15	0.00	0.14	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.02	0.05	0.26	0.01	0.07	0.00	0.28	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.14	0.21	0.15	0.14	0.00	0.41	0.11	0.05
OP1	0.04	1.84	0.16	0.07	0.64	0.01	0.21	0.00	0.64	0.80	1.39	2.60	1.51	0.62	0.03	0.04	0.29	0.01	0.02	0.41	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	1.41	0.19	0.42	0.31	0.05	0.19	0.01	0.17	1.06	0.93	2.12	1.16	1.01	0.25	0.27	0.52	0.17	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00
P	0.07	1.40	0.06	0.23	0.33	0.04	0.15	0.02	0.20	1.07	0.92	2.08	1.18	0.96	0.26	0.19	0.32	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.08	0.13	0.13	0.09	0.33	0.06	0.27	0.02	0.10	0.00	0.12	0.22	0.14	0.16	0.28	0.09	0.87	0.45	0.28
C2	0.14	0.06	0.11	0.02	0.15	0.10	0.17	0.16	0.09	0.04	0.02	0.14	0.26	0.06	0.22	0.13	0.31	1.48	0.55	0.67
C2'	0.15	0.28	0.08	0.08	0.57	0.03	0.61	0.19	0.49	0.31	0.40	0.16	0.10	0.11	0.67	0.16	0.68	1.49	1.25	0.98
C3'	0.55	0.42	0.66	0.66	0.04	0.64	0.01	0.44	0.14	0.38	0.26	0.57	0.83	0.86	0.08	0.49	0.13	0.89	0.90	0.48
C4	0.13	0.04	0.09	0.01	0.16	0.11	0.17	0.13	0.10	0.02	0.04	0.11	0.23	0.05	0.22	0.13	0.32	1.38	0.57	0.63
C4'	1.21	1.18	1.23	1.24	0.95	1.26	0.91	1.14	1.01	1.15	1.10	1.25	1.26	1.25	0.86	1.18	0.69	0.00	0.06	0.42
C5	0.09	0.03	0.08	0.03	0.17	0.00	0.21	0.31	0.14	0.01	0.04	0.12	0.24	0.02	0.23	0.05	0.43	1.45	0.61	0.75
C5'	1.94	2.02	2.04	2.01	1.74	1.83	1.63	1.57	1.71	1.92	1.95	2.13	2.02	2.00	1.65	1.77	1.13	0.35	0.37	0.73
C6	0.09	0.05	0.10	0.04	0.17	0.05	0.22	0.39	0.16	0.00	0.03	0.15	0.27	0.02	0.23	0.02	0.45	1.54	0.62	0.81
C8	0.10	0.03	0.08	0.00	0.16	0.09	0.17	0.16	0.11	0.01	0.04	0.10	0.21	0.04	0.21	0.10	0.38	1.15	0.58	0.59
N1	0.12	0.07	0.12	0.00	0.15	0.02	0.19	0.29	0.12	0.03	0.01	0.16	0.28	0.05	0.22	0.08	0.38	1.54	0.58	0.76
N2	0.13	0.04	0.10	0.00	0.17	0.10	0.19	0.15	0.10	0.03	0.05	0.12	0.25	0.04	0.25	0.13	0.30	1.49	0.55	0.67
N3	0.15	0.06	0.11	0.04	0.14	0.15	0.15	0.06	0.07	0.05	0.02	0.13	0.24	0.07	0.21	0.17	0.26	1.37	0.53	0.59
N7	0.06	0.02	0.07	0.06	0.18	0.05	0.22	0.37	0.16	0.03	0.05	0.10	0.22	0.00	0.22	0.01	0.47	1.32	0.62	0.73
N9	0.14	0.04	0.10	0.05	0.14	0.19	0.14	0.01	0.06	0.04	0.03	0.10	0.22	0.07	0.20	0.18	0.27	1.18	0.54	0.52
O2'	0.83	0.98	0.76	0.73	1.23	0.63	1.24	0.70	1.14	0.99	1.09	0.87	0.59	0.51	1.30	0.80	1.22	1.76	1.71	1.39
O3'	0.14	0.00	0.26	0.27	0.37	0.28	0.41	0.13	0.26	0.04	0.16	0.15	0.43	0.48	0.50	0.11	0.46	0.95	1.21	0.70
O4'	1.07	1.00	0.98	1.00	0.86	1.17	0.88	1.14	0.96	1.02	0.94	1.01	0.97	0.91	0.79	1.13	0.78	0.01	0.33	0.56
O5'	2.23	2.32	2.39	2.31	1.97	2.05	1.82	1.66	1.92	2.19	2.21	2.47	2.42	2.40	1.87	2.02	1.23	0.33	0.47	0.77
O6	0.05	0.04	0.09	0.07	0.18	0.14	0.24	0.51	0.19	0.03	0.03	0.15	0.27	0.01	0.23	0.05	0.51	1.55	0.64	0.87
OP1	3.36	3.73	3.62	3.32	3.29	2.78	2.99	2.20	3.05	3.44	3.64	3.94	3.55	3.19	3.20	2.90	1.87	0.97	1.00	1.29
OP2	3.09	3.28	3.34	3.00	2.76	2.59	2.51	1.97	2.62	3.02	3.13	3.54	3.51	3.10	2.66	2.69	1.62	0.60	0.82	1.05
P	3.16	3.31	3.40	3.19	2.83	2.77	2.61	2.19	2.73	3.11	3.16	3.52	3.45	3.28	2.71	2.81	1.79	0.79	0.93	1.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.04	0.35	0.03	0.09
C2	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.73	0.03	0.22
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.22	0.15	0.01
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.05	0.01	0.00	0.06	0.02	0.18	0.04	0.25	0.10
C4	0.05	0.02	0.06	0.04	0.00	0.00	0.00	0.11	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.07	0.95	0.00	0.28
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01
C5	0.03	0.01	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.12	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.06	0.02	0.04	0.09	0.92	0.03	0.28
C5'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.09	0.09	0.13	0.09	0.05	0.04	0.11	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01
C6	0.02	0.02	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.09	0.73	0.04	0.23
N1	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.02	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.62	0.03	0.19
N3	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.13	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.89	0.02	0.27
O2	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.02	0.00	0.06	0.65	0.02	0.19
O2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.05	0.05	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.09	0.03
O3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.04	0.05	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.01	0.23	0.18	0.32	0.18
O4	0.06	0.03	0.07	0.06	0.01	0.01	0.02	0.11	0.03	0.05	0.02	0.02	0.07	0.07	0.00	0.06	0.05	1.00	0.03	0.28
O4'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.20	0.08	0.06
O5'	0.04	0.08	0.09	0.18	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.08	0.09	0.06	0.07	0.23	0.05	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.35	0.73	0.22	0.04	0.95	0.01	0.92	0.09	0.73	0.62	0.89	0.65	0.09	0.18	1.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.03	0.15	0.25	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.09	0.32	0.03	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.22	0.01	0.10	0.28	0.01	0.28	0.01	0.23	0.19	0.27	0.19	0.03	0.18	0.28	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00