Doublet Group distance statistics: 50320

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N3	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C2	A	0, 0.000, 0.032, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
C1'	A	0, 0.000, 0.041, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.041 std_dev=0.041
N2	A	0, 0.000, 0.053, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.053 std_dev=0.053
P	A	0, 0.000, 0.075, 0.150, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.075 std_dev=0.075
C5'	A	0, 0.000, 0.086, 0.172, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.086 std_dev=0.086
C4'	A	0, 0.000, 0.110, 0.219, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.110 std_dev=0.110
C2'	A	0, 0.000, 0.120, 0.240, 0.240 max_d=0.240 avg_d=0.120 std_dev=0.120
OP2	A	0, 0.000, 0.170, 0.340, 0.340 max_d=0.340 avg_d=0.170 std_dev=0.170
O2'	A	0, 0.000, 0.185, 0.370, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.185 std_dev=0.185
C3'	A	0, 0.000, 0.225, 0.450, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.225 std_dev=0.225
C2'	B	0, 0.000, 0.315, 0.631, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.315 std_dev=0.315
O5'	A	0, 0.000, 0.350, 0.701, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.350 std_dev=0.350
OP1	A	0, 0.000, 0.358, 0.715, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.358 std_dev=0.358
O3'	A	0, 0.000, 0.382, 0.764, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.382 std_dev=0.382
O2'	B	0, 0.000, 0.445, 0.891, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.445 std_dev=0.445
O3'	B	0, 0.000, 0.514, 1.028, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.514 std_dev=0.514
C1'	B	0, 0.000, 0.708, 1.416, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.708 std_dev=0.708
C3'	B	0, 0.000, 0.710, 1.419, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.710 std_dev=0.710
C6	B	0, 0.000, 0.820, 1.640, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.820 std_dev=0.820
O4'	B	0, 0.000, 1.008, 2.016, 2.016 max_d=2.016 avg_d=1.008 std_dev=1.008
N1	B	0, 0.000, 1.190, 2.380, 2.380 max_d=2.380 avg_d=1.190 std_dev=1.190
C4'	B	0, 0.000, 1.384, 2.769, 2.769 max_d=2.769 avg_d=1.384 std_dev=1.384
C5	B	0, 0.000, 1.662, 3.324, 3.324 max_d=3.324 avg_d=1.662 std_dev=1.662
C5'	B	0, 0.000, 2.228, 4.457, 4.457 max_d=4.457 avg_d=2.228 std_dev=2.228
O5'	B	0, 0.000, 2.293, 4.586, 4.586 max_d=4.586 avg_d=2.293 std_dev=2.293
C2	B	0, 0.000, 2.430, 4.860, 4.860 max_d=4.860 avg_d=2.430 std_dev=2.430
C4	B	0, 0.000, 2.842, 5.685, 5.685 max_d=5.685 avg_d=2.842 std_dev=2.842
O2	B	0, 0.000, 2.945, 5.889, 5.889 max_d=5.889 avg_d=2.945 std_dev=2.945
P	B	0, 0.000, 3.092, 6.185, 6.185 max_d=6.185 avg_d=3.092 std_dev=3.092
N3	B	0, 0.000, 3.136, 6.273, 6.273 max_d=6.273 avg_d=3.136 std_dev=3.136
OP1	B	0, 0.000, 3.238, 6.475, 6.475 max_d=6.475 avg_d=3.238 std_dev=3.238
OP2	B	0, 0.000, 3.317, 6.633, 6.633 max_d=6.633 avg_d=3.317 std_dev=3.317
O4	B	0, 0.000, 3.694, 7.388, 7.388 max_d=7.388 avg_d=3.694 std_dev=3.694

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.00	0.05
C2	0.05	0.00	0.07	0.11	0.01	0.07	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.06	0.02	0.11	0.03	0.02
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.00	0.07	0.02	0.07	0.08	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.14	0.03	0.02
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.13	0.08	0.12	0.10	0.09	0.11	0.06	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.19	0.07	0.03
C4	0.03	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.02	0.09	0.00	0.07	0.03	0.03
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.07	0.07	0.06	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.03	0.00
C5	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.14	0.01	0.12	0.00	0.04	0.04	0.03
C5'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.05	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.00
C6	0.03	0.01	0.07	0.13	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.01	0.11	0.00	0.05	0.05	0.02
C8	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.04	0.04
N1	0.04	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.16	0.02	0.09	0.01	0.09	0.04	0.02
N2	0.05	0.00	0.08	0.10	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.04	0.04	0.02	0.13	0.02	0.02
N3	0.05	0.00	0.07	0.09	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.04	0.06	0.01	0.11	0.02	0.03
N7	0.01	0.00	0.04	0.11	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.00	0.15	0.00	0.01	0.05	0.03
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.04	0.02	0.04
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.05	0.06	0.04	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.18	0.04	0.01
O3'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.10	0.01	0.14	0.00	0.16	0.09	0.16	0.13	0.10	0.13	0.06	0.02	0.00	0.01	0.06	0.18	0.29	0.13	0.09
O4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.05
O5'	0.04	0.06	0.02	0.03	0.09	0.00	0.12	0.00	0.11	0.15	0.09	0.04	0.06	0.15	0.09	0.01	0.06	0.06	0.00	0.13	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.18	0.01	0.13	0.00	0.04	0.07	0.01
OP1	0.05	0.11	0.14	0.19	0.07	0.11	0.04	0.08	0.05	0.01	0.09	0.13	0.11	0.01	0.04	0.18	0.29	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.00
OP2	0.00	0.03	0.03	0.07	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.04	0.04	0.02	0.02	0.05	0.02	0.04	0.13	0.00	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.09	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.79	0.15	0.34	0.66	0.26	0.34	0.55	0.20	0.40	0.87	1.03	0.16	0.31	0.76	0.01	0.84	0.66	0.98	0.93
C2	0.30	1.43	0.07	0.47	1.36	0.58	0.70	1.12	0.38	0.71	1.70	1.76	0.04	0.34	1.63	0.12	1.39	1.33	1.78	1.63
C2'	0.17	0.82	0.20	0.30	0.79	0.31	0.46	0.57	0.28	0.43	0.95	0.99	0.21	0.25	0.93	0.07	0.77	0.49	0.91	0.82
C3'	0.14	0.69	0.28	0.19	0.76	0.25	0.51	0.40	0.33	0.41	0.84	0.77	0.30	0.16	0.89	0.08	0.51	0.16	0.55	0.49
C4	0.29	1.27	0.10	0.45	1.13	0.49	0.59	0.95	0.34	0.64	1.45	1.60	0.06	0.35	1.32	0.07	1.23	1.13	1.48	1.41
C4'	0.07	0.41	0.24	0.16	0.43	0.12	0.28	0.21	0.18	0.23	0.48	0.46	0.28	0.17	0.50	0.04	0.39	0.10	0.43	0.38
C5	0.31	1.42	0.04	0.48	1.29	0.57	0.67	1.09	0.38	0.71	1.64	1.76	0.01	0.36	1.49	0.10	1.38	1.34	1.64	1.59
C5'	0.00	0.21	0.27	0.04	0.31	0.04	0.25	0.02	0.17	0.14	0.29	0.17	0.34	0.08	0.36	0.06	0.14	0.16	0.12	0.09
C6	0.32	1.57	0.01	0.49	1.52	0.64	0.79	1.25	0.43	0.78	1.89	1.90	0.04	0.35	1.80	0.14	1.51	1.56	1.91	1.81
C8	0.27	1.06	0.11	0.43	0.86	0.38	0.45	0.75	0.27	0.55	1.13	1.36	0.06	0.37	0.96	0.03	1.04	0.96	1.12	1.16
N1	0.31	1.54	0.03	0.49	1.51	0.64	0.78	1.24	0.42	0.76	1.86	1.88	0.01	0.35	1.81	0.14	1.49	1.51	1.93	1.78
N2	0.30	1.43	0.07	0.47	1.39	0.59	0.71	1.14	0.38	0.71	1.72	1.77	0.05	0.34	1.68	0.12	1.40	1.35	1.84	1.66
N3	0.29	1.29	0.11	0.44	1.18	0.50	0.61	0.98	0.34	0.64	1.50	1.61	0.09	0.33	1.40	0.08	1.25	1.14	1.57	1.45
N7	0.30	1.34	0.03	0.48	1.14	0.52	0.60	1.00	0.35	0.68	1.49	1.68	0.03	0.37	1.28	0.08	1.30	1.26	1.42	1.47
N9	0.26	1.05	0.13	0.41	0.89	0.37	0.46	0.74	0.27	0.54	1.15	1.34	0.11	0.34	1.01	0.03	1.03	0.90	1.18	1.16
O2'	0.16	0.71	0.19	0.27	0.66	0.23	0.37	0.46	0.22	0.37	0.82	0.88	0.21	0.21	0.78	0.03	0.71	0.42	0.88	0.77
O3'	0.11	0.62	0.31	0.11	0.77	0.21	0.55	0.29	0.36	0.38	0.79	0.64	0.32	0.07	0.91	0.09	0.35	0.08	0.38	0.29
O4'	0.13	0.51	0.17	0.27	0.41	0.14	0.21	0.33	0.12	0.26	0.55	0.67	0.21	0.28	0.47	0.01	0.61	0.42	0.69	0.67
O5'	0.16	0.53	0.44	0.03	0.66	0.11	0.55	0.13	0.41	0.40	0.65	0.49	0.49	0.01	0.74	0.03	0.12	0.15	0.07	0.07
O6	0.32	1.66	0.03	0.48	1.69	0.68	0.87	1.34	0.47	0.82	2.05	1.95	0.09	0.34	2.02	0.16	1.58	1.74	2.09	1.96
OP1	0.46	0.35	0.03	0.02	0.03	0.28	0.04	0.05	0.05	0.27	0.20	0.56	0.09	0.01	0.04	0.51	0.20	0.57	0.37	0.35
OP2	0.10	0.43	0.22	0.05	0.75	0.55	0.63	0.47	0.41	0.29	0.65	0.31	0.22	0.03	0.88	0.41	0.10	0.17	0.10	0.03
P	0.18	0.12	0.19	0.00	0.37	0.28	0.34	0.11	0.21	0.08	0.27	0.02	0.22	0.00	0.45	0.31	0.04	0.32	0.17	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.28	0.01	0.00	0.10	0.67	0.04	0.30
C2	0.01	0.00	0.12	0.16	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.17	0.02	0.08	0.05	0.79	0.30	0.26
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.19	0.13	0.00	0.09	0.22	0.00	0.03	0.01	0.02	0.40	0.66	0.33	0.57
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.26	0.00	0.25	0.01	0.20	0.15	0.23	0.10	0.00	0.00	0.29	0.01	0.08	0.09	0.01	0.11
C4	0.01	0.01	0.00	0.26	0.00	0.09	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.02	0.00	0.01	0.21	0.84	0.56	0.16
C4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.10	0.04	0.04	0.03	0.23	0.01	0.09	0.00	0.01	0.22	0.01	0.06
C5	0.00	0.01	0.09	0.25	0.00	0.11	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.33	0.07	0.01	0.05	0.22	0.87	0.54	0.17
C5'	0.08	0.05	0.19	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.04	0.18	0.05	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00
C6	0.00	0.00	0.13	0.20	0.00	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.02	0.01	0.08	0.13	0.87	0.35	0.25
N1	0.00	0.00	0.00	0.15	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.12	0.01	0.00	0.03	0.80	0.23	0.28
N3	0.01	0.00	0.09	0.23	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.08	0.01	0.06	0.14	0.82	0.45	0.21
O2	0.02	0.00	0.22	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.30	0.02	0.12	0.01	0.75	0.23	0.27
O2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.30	0.23	0.33	0.04	0.28	0.17	0.22	0.01	0.00	0.01	0.32	0.15	0.34	0.54	0.37	0.53
O3'	0.28	0.17	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.18	0.02	0.12	0.08	0.30	0.01	0.00	0.06	0.19	0.11	0.26	0.18	0.14
O4	0.01	0.02	0.01	0.29	0.00	0.09	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.32	0.06	0.00	0.01	0.26	0.81	0.66	0.11
O4'	0.00	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.06	0.12	0.15	0.19	0.01	0.00	0.07	0.53	0.15	0.10
O5'	0.10	0.05	0.40	0.08	0.21	0.01	0.22	0.01	0.13	0.03	0.14	0.01	0.34	0.11	0.26	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.67	0.79	0.66	0.09	0.84	0.22	0.87	0.09	0.87	0.80	0.82	0.75	0.54	0.26	0.81	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.30	0.33	0.01	0.56	0.01	0.54	0.11	0.35	0.23	0.45	0.23	0.37	0.18	0.66	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.30	0.26	0.57	0.11	0.16	0.06	0.17	0.00	0.25	0.28	0.21	0.27	0.53	0.14	0.11	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00